Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,384,043 |
A→G |
V969A (GTG→GCG) |
yjeP ← |
putative periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,384,043 | 0 | A | G | 100.0%
| 1183.6
/ NA
| 342 | V969A (GTG→GCG) | yjeP | putative periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (171/171); total (171/171) |
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACC > NC_000913/4383953‑4384132
|
gCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGcgcg < 1:4605262/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGa < 2:8461458/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAt < 2:7008750/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAt < 2:1227213/93‑1 (MQ=255)
ggggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAtt > 1:6050445/1‑93 (MQ=255)
gggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTa < 1:3752201/93‑1 (MQ=255)
gggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTa < 1:3218071/93‑1 (MQ=255)
gggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAAAGCCTTGTTCGGCGCGCTTa > 2:2971358/1‑93 (MQ=255)
ggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAt < 2:3365338/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAt < 1:3337241/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAtc < 1:6246411/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATctct > 2:1420209/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt > 2:1956438/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt > 1:582045/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt > 1:8352691/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt > 1:2601919/1‑93 (MQ=255)
tATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCttt > 2:4651943/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTa > 1:3931322/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTa < 2:5989297/93‑1 (MQ=255)
aTCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTa < 2:5094167/93‑1 (MQ=255)
tCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGt > 2:3033599/1‑93 (MQ=255)
aaCACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTcc > 2:226834/1‑93 (MQ=255)
aaCACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTcc > 1:5900190/1‑93 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc > 1:8049373/1‑93 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc > 1:5661269/1‑93 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc > 1:5028445/1‑93 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc < 1:8701628/93‑1 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc < 2:2733499/93‑1 (MQ=255)
ccacGCGCGTGACCGAGTCATAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGt < 2:8229645/93‑1 (MQ=255)
acGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATATACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCg < 1:191472/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGc > 2:5181969/1‑93 (MQ=255)
cgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTg < 2:8410612/93‑1 (MQ=255)
gcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGa < 2:3724960/93‑1 (MQ=255)
gTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtg < 1:8410520/93‑1 (MQ=255)
tGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtgg < 2:3961945/93‑1 (MQ=255)
gACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggt < 1:226468/93‑1 (MQ=255)
gACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggt < 2:4483368/93‑1 (MQ=255)
gACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggt < 1:535968/93‑1 (MQ=255)
gACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggt > 1:7473346/1‑93 (MQ=255)
gACCGAGTCAGAGAGCCACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggt < 1:7408374/93‑1 (MQ=255)
aCCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGGTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtg < 1:6405771/93‑1 (MQ=255)
ccGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtgg < 2:4084048/93‑1 (MQ=255)
ccGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtgg < 2:5240185/93‑1 (MQ=255)
gAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtg < 2:5515294/93‑1 (MQ=255)
gAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtg < 2:6813619/93‑1 (MQ=255)
gAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtg > 1:1220563/1‑93 (MQ=255)
aGTCAGAGAGCGACCAGTTGATATACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtgg < 2:4743777/93‑1 (MQ=255)
aGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtgg < 2:7707767/93‑1 (MQ=255)
tCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGgcg < 2:1789699/93‑1 (MQ=255)
tCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGgcg > 2:1868505/1‑93 (MQ=255)
gagagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCgg > 1:2247950/1‑93 (MQ=255)
agagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCggg > 1:8163607/1‑93 (MQ=255)
gagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgt < 1:8563908/93‑1 (MQ=255)
gACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTa > 1:169343/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAtt > 2:7200721/1‑93 (MQ=255)
aGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAttt > 1:4850392/1‑93 (MQ=255)
aGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAttt > 2:8145668/1‑93 (MQ=255)
aGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAttt < 1:7726180/93‑1 (MQ=255)
gTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGTGATTTTCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAtttt > 2:7797557/1‑93 (MQ=255)
gTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAtttt > 2:4282827/1‑93 (MQ=255)
ttGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTc > 1:8796069/1‑93 (MQ=255)
gATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGt < 1:3500694/93‑1 (MQ=255)
gATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGt > 1:6922585/1‑93 (MQ=255)
gATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGAGCGGGTGTTAATTTTCGt < 1:1790187/93‑1 (MQ=255)
aTAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTc < 1:4448541/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc > 2:5777870/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc < 2:8702817/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc < 1:1862484/93‑1 (MQ=255)
cTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCt < 1:4718787/93‑1 (MQ=255)
cTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCt > 1:6695156/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTa > 1:2783764/1‑93 (MQ=255)
cTCGGTAATAAACCCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTAcc < 2:3611401/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCTCGGGTGGTAATTTTCGTCACGCTACCg > 1:7791213/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCg > 2:7564320/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCg > 1:4039429/1‑93 (MQ=255)
ggTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGt < 2:6929839/93‑1 (MQ=255)
gTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTg > 2:64388/1‑93 (MQ=255)
taataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTga < 1:7107021/93‑1 (MQ=255)
aataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTgag < 1:2149356/93‑1 (MQ=255)
ataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTgaga > 2:2383378/1‑93 (MQ=255)
ataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTgaga < 1:1651914/93‑1 (MQ=255)
taaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAt < 2:6319930/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATc < 2:5674822/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATc > 1:7320715/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcg > 2:7937581/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcg > 1:4285396/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcg > 1:2957612/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGGTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcg > 1:6465306/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcgc < 2:6355518/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcgcg > 1:7640595/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGa > 1:5554100/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAt < 2:7313381/93‑1 (MQ=255)
cTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAt > 1:5100387/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAtt > 1:3113093/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAAGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTAACCGTGAGATCGCGAAtt > 2:6105183/1‑93 (MQ=255)
tccgtCGGCGCAATTATCTCTTTACAGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGTCGCGGGTTTTAATTTTCTTCACGCTACCGGTGAGATCGCCAAtt < 2:1573760/89‑1 (MQ=255)
tGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTg < 1:1447078/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTc < 2:2026645/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCAcc > 2:111130/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCAcc < 2:3808013/93‑1 (MQ=255)
|
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACC > NC_000913/4383953‑4384132
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGTA > NC_000913/4383950‑4384135
|
TCGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCG < SRR4302541.7615337/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGA > SRR4302541.368647/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGA < SRR4302541.4652010/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAT > SRR4302541.4951467/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAT < SRR4302541.7770789/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATTGTCAACTCCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT < SRR4302541.6025057/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT < SRR4302541.340268/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT > SRR4302541.6112310/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTA < SRR4302541.4613536/94‑1 (MQ=60)
GGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTA > SRR4302541.5571028/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTA > SRR4302541.2561879/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAT < SRR4302541.3250583/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAT < SRR4302541.3789942/94‑1 (MQ=60)
GGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAT < SRR4302541.1769561/94‑1 (MQ=60)
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CCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGT < SRR4302541.5731921/94‑1 (MQ=60)
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GGGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGGTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTCATGGTGGGGG > SRR4302541.1588905/1‑94 (MQ=60)
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CAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCG > SRR4302541.2236145/1‑94 (MQ=60)
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AGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGT < SRR4302541.7342771/94‑1 (MQ=60)
GAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTG < SRR4302541.8655910/94‑1 (MQ=60)
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GCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGGCCCAGTCGCTGATGGTGGTGCCGCGGGTGTT > SRR4302541.6050392/1‑94 (MQ=60)
CGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTA > SRR4302541.170607/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATT > SRR4302541.1967407/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTT < SRR4302541.4869162/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTT < SRR4302541.402618/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTT > SRR4302541.4899845/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTT > SRR4302541.4899846/1‑94 (MQ=60)
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AGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTT < SRR4302541.7808377/94‑1 (MQ=60)
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TGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGT > SRR4302541.5182082/1‑94 (MQ=60)
TGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGT > SRR4302541.8897666/1‑94 (MQ=60)
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ATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCA < SRR4302541.4493285/94‑1 (MQ=60)
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aaaagcgaccgtaaaAAACGCCGTGTGCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGGGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACG < SRR4302541.3047526/79‑1 (MQ=60)
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AAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACG < SRR4302541.4700014/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGC > SRR4302541.7528064/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT < SRR4302541.1880448/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT > SRR4302541.6764951/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT < SRR4302541.3367092/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT < SRR4302541.1919594/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT > SRR4302541.290055/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT < SRR4302541.5122320/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302541.3367523/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302541.8385533/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA < SRR4302541.4766905/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302541.2811840/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302541.6015529/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGGTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302541.1601839/1‑94 (MQ=60)
GCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACC > SRR4302541.4010448/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTGCGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACC < SRR4302541.8133952/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCTCGGGTGGTAATTTTCGTCACGCTACCG > SRR4302541.7874660/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG > SRR4302541.6967822/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG < SRR4302541.6321901/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG > SRR4302541.4079319/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGG < SRR4302541.4013809/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGG < SRR4302541.3095837/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGT > SRR4302541.7419287/1‑94 (MQ=60)
GGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTG > SRR4302541.2177189/1‑94 (MQ=60)
TAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAG > SRR4302541.8182440/1‑94 (MQ=60)
TAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAG < SRR4302541.7182689/94‑1 (MQ=60)
TAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTGTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAG < SRR4302541.35521/94‑1 (MQ=60)
AATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGA > SRR4302541.6495229/1‑94 (MQ=60)
AATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGA > SRR4302541.2697633/1‑94 (MQ=60)
AATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGA < SRR4302541.2170143/94‑1 (MQ=60)
ATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAT < SRR4302541.7496178/94‑1 (MQ=60)
ATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAT < SRR4302541.1668229/94‑1 (MQ=60)
ATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAT > SRR4302541.4592827/1‑94 (MQ=60)
TAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATC > SRR4302541.8772302/1‑94 (MQ=60)
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TAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATC > SRR4302541.8772303/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTGCCGGTGAGATCG < SRR4302541.4169994/94‑1 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCG > SRR4302541.1437421/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCG > SRR4302541.4328201/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCG > SRR4302541.6374978/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCG > SRR4302541.2987352/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAGCG > SRR4302541.6763012/1‑94 (MQ=60)
AAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGGTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCG > SRR4302541.6531189/1‑94 (MQ=60)
AACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGC > SRR4302541.2845066/1‑94 (MQ=60)
AACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGC < SRR4302541.7021324/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGC < SRR4302541.592411/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGC > SRR4302541.2600950/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCG > SRR4302541.7722058/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGA > SRR4302541.1695496/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGA > SRR4302541.5610950/1‑94 (MQ=60)
GCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAA > SRR4302541.2270856/1‑94 (MQ=60)
CCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAT < SRR4302541.8543444/94‑1 (MQ=60)
CCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAT > SRR4302541.1927419/1‑94 (MQ=60)
CCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAT > SRR4302541.5152793/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT < SRR4302541.8478493/94‑1 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT > SRR4302541.8467882/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT > SRR4302541.3144610/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT > SRR4302541.6209798/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGT < SRR4302541.1461160/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTC > SRR4302541.8800473/1‑94 (MQ=60)
TCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCAC > SRR4302541.5481137/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACC < SRR4302541.2270035/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCG < SRR4302541.5616632/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCG > SRR4302541.3668688/1‑94 (MQ=60)
GCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGT > SRR4302541.3495969/1‑94 (MQ=60)
CGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGTA > SRR4302541.6921126/1‑94 (MQ=60)
CGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGTA < SRR4302541.4824145/94‑1 (MQ=60)
|
TCGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGTA > NC_000913/4383950‑4384135
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
