Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,384,043 |
A→G |
V969A (GTG→GCG) |
yjeP ← |
putative periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,384,043 | 0 | A | G | 100.0%
| 787.0
/ NA
| 227 | V969A (GTG→GCG) | yjeP | putative periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (104/123); total (104/123) |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACC > NC_000913/4383953‑4384132
|
gCAGGGGCCGGGATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGcgcg > 1:3923526/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGa < 2:3908893/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAt < 1:4182074/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAt > 1:5146676/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAt < 2:1561268/93‑1 (MQ=255)
ggggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAtt > 2:801190/1‑93 (MQ=255)
ggggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAtt > 1:2889426/1‑93 (MQ=255)
ggggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAtt > 1:1165607/1‑93 (MQ=255)
ggCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAt > 1:1694985/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAtc < 1:4422013/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAtc > 2:6203203/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATctct > 2:3154267/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATctct < 1:1543078/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATctct < 1:3651266/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATctct > 2:56041/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGA‑CAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt < 2:5153883/93‑1 (MQ=255)
gTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCtt < 2:14691/93‑1 (MQ=255)
tATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCttt < 2:4458749/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGGTTATCTCTTTAc > 2:5665532/1‑93 (MQ=255)
tCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAc > 2:6456499/1‑93 (MQ=255)
tCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAc > 1:3303083/1‑93 (MQ=255)
tCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAc > 2:3504648/1‑93 (MQ=255)
gTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAggg > 2:4932866/1‑93 (MQ=255)
gTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACgg < 2:2810912/93‑1 (MQ=255)
tCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGt < 2:2378234/93‑1 (MQ=255)
tCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGt > 1:1952220/1‑93 (MQ=255)
tCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGt < 1:1365278/93‑1 (MQ=255)
cAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTc < 2:31185/93‑1 (MQ=255)
aaCACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTcc < 1:1783657/93‑1 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc > 1:1033851/1‑93 (MQ=255)
acacCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTccc < 2:6078646/93‑1 (MQ=255)
caccacGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCa < 2:3381489/93‑1 (MQ=255)
cacGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTc > 2:691398/1‑93 (MQ=255)
acGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCg < 2:369247/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACTCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGc < 1:2551086/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGc < 2:1694985/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGc < 1:2469718/93‑1 (MQ=255)
gcgcgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCt < 2:5753596/93‑1 (MQ=255)
cgTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAt > 1:1596695/1‑93 (MQ=255)
tGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtgg < 1:2583138/93‑1 (MQ=255)
aCCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtg > 1:4567503/1‑93 (MQ=255)
aCCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtg > 1:1975991/1‑93 (MQ=255)
ccGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtgg < 1:4644169/93‑1 (MQ=255)
ccGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtgg < 2:6046638/93‑1 (MQ=255)
cGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggt > 2:2922287/1‑93 (MQ=255)
cGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggt < 2:5530078/93‑1 (MQ=255)
gAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAtggtggtg < 1:2059044/93‑1 (MQ=255)
gTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGgc < 1:2832119/93‑1 (MQ=255)
tCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGgcg < 2:2954381/93‑1 (MQ=255)
tCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGgcg < 2:4890738/93‑1 (MQ=255)
agagagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGcgcg > 1:2366019/1‑93 (MQ=255)
gagagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCgg > 2:3536394/1‑93 (MQ=255)
agagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCggg < 2:2488074/93‑1 (MQ=255)
gagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgt > 1:970140/1‑93 (MQ=255)
gagCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgt < 2:3532901/93‑1 (MQ=255)
agCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgtg < 1:5387865/93‑1 (MQ=255)
gCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgtgt < 2:5999049/93‑1 (MQ=255)
gCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGgtgt > 1:5800494/1‑93 (MQ=255)
gACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTa < 1:2416993/93‑1 (MQ=255)
aCCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTaa > 1:4105510/1‑93 (MQ=255)
aCCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTaa > 1:6130841/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAt > 1:6478101/1‑93 (MQ=255)
aGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAttt > 2:3919270/1‑93 (MQ=255)
ttGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTc > 2:1845035/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCa > 2:2564671/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCa > 2:1803661/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCCCg > 2:4098362/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACg > 2:5121899/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACg > 1:1213600/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACg < 1:5259491/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACg > 1:3484232/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc < 1:5722973/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc < 2:1632445/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGc < 1:486021/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTa > 1:1136829/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAGTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGCTGGTGGCGCGGGTGGTAATTTTCCTCACGCTa > 1:5841761/1‑93 (MQ=255)
gCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTAc < 2:5007142/93‑1 (MQ=255)
gCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTAc < 1:6061253/93‑1 (MQ=255)
cGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCgg < 2:1043978/93‑1 (MQ=255)
cGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCgg < 1:6033947/93‑1 (MQ=255)
ggTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGt < 2:1208741/93‑1 (MQ=255)
ataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTgaga < 1:326536/93‑1 (MQ=255)
ataaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTgaga < 1:4507768/93‑1 (MQ=255)
taaACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGAt < 2:4668313/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcg > 2:6336131/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCAAGCTACCGGTGAGATcg > 1:2244740/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcgc < 2:4287346/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATcgc < 2:131890/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGATGAGATcgc > 2:5353503/1‑93 (MQ=255)
cGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGGGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCAAGCTACCGGTGAGATcgcg > 1:3385896/1‑93 (MQ=255)
ccTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGaa < 2:5824888/93‑1 (MQ=255)
ccTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGaa > 1:141731/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAt < 1:56041/93‑1 (MQ=255)
cTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAt < 1:5022509/93‑1 (MQ=255)
ttGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAtt > 1:371712/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAtt > 1:2521041/1‑93 (MQ=255)
tGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTg < 1:3021866/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTc < 1:5905567/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCGCAATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTc > 1:6287492/1‑93 (MQ=255)
tCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTGCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCa > 1:6222937/1‑93 (MQ=255)
|
GCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACC > NC_000913/4383953‑4384132
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGT > NC_000913/4383951‑4384134
|
CGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGGAATAAACGCCTTGTTCGGCGC > SRR4302534.4416416/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGGGCCGGGATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCG > SRR4302534.4028644/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAT > SRR4302534.5285540/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGAT > SRR4302534.6560231/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT > SRR4302534.6038891/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT < SRR4302534.4295094/94‑1 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT > SRR4302534.2965242/1‑94 (MQ=60)
AGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATT > SRR4302534.1196213/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTAT > SRR4302534.1739042/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATC < SRR4302534.6325561/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCT < SRR4302534.3930524/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCT < SRR4302534.4541406/94‑1 (MQ=60)
CCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTC < SRR4302534.2433539/94‑1 (MQ=60)
CGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCT < SRR4302534.6179188/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTT < SRR4302534.3749397/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTT < SRR4302534.1583526/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTT > SRR4302534.5217429/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTT < SRR4302534.4594144/94‑1 (MQ=60)
GTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTT < SRR4302534.1837809/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTA < SRR4302534.6408579/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTA < SRR4302534.249537/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTA < SRR4302534.5614198/94‑1 (MQ=60)
ATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAC < SRR4302534.353553/94‑1 (MQ=60)
ATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTAC > SRR4302534.3391260/1‑94 (MQ=60)
GTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGT > SRR4302534.2003309/1‑94 (MQ=60)
TCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTC < SRR4302534.1401237/94‑1 (MQ=60)
CAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCC < SRR4302534.5808611/94‑1 (MQ=60)
AACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCC > SRR4302534.1060525/1‑94 (MQ=60)
AACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCC < SRR4302534.1829974/94‑1 (MQ=60)
ACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCA < SRR4302534.3721327/94‑1 (MQ=60)
CACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAG > SRR4302534.743397/1‑94 (MQ=60)
CACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAG < SRR4302534.140789/94‑1 (MQ=60)
CCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTC > SRR4302534.215523/1‑94 (MQ=60)
CACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCG > SRR4302534.3806725/1‑94 (MQ=60)
CGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACTCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCT < SRR4302534.2618725/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCT < SRR4302534.2535363/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCT < SRR4302534.3020826/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTG < SRR4302534.5014595/94‑1 (MQ=60)
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GCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGAT > SRR4302534.1638410/1‑94 (MQ=60)
GTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGG > SRR4302534.2255364/1‑94 (MQ=60)
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TGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGT > SRR4302534.2942058/1‑94 (MQ=60)
GACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTG > SRR4302534.4691331/1‑94 (MQ=60)
GACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTG > SRR4302534.2027730/1‑94 (MQ=60)
GACCGAGGCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTG < SRR4302534.1484847/94‑1 (MQ=60)
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CCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGT < SRR4302534.4770230/94‑1 (MQ=60)
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CGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTG < SRR4302534.1320274/94‑1 (MQ=60)
CGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTG > SRR4302534.2100002/1‑94 (MQ=60)
GAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGG < SRR4302534.1380008/94‑1 (MQ=60)
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GAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGACGTGG > SRR4302534.4983221/1‑94 (MQ=60)
GTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCG < SRR4302534.2906540/94‑1 (MQ=60)
GTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCG > SRR4302534.1856058/1‑94 (MQ=60)
GTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCG < SRR4302534.3456289/94‑1 (MQ=60)
CAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCG > SRR4302534.2428837/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGT < SRR4302534.5951060/94‑1 (MQ=60)
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AGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGT < SRR4302534.5532979/94‑1 (MQ=60)
AGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGT < SRR4302534.6202873/94‑1 (MQ=60)
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AGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGT < SRR4302534.4142115/94‑1 (MQ=60)
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GACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAA > SRR4302534.4215930/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAT > SRR4302534.891942/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAAT > SRR4302534.6652684/1‑94 (MQ=60)
GTTGATACACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTC < SRR4302534.5969180/94‑1 (MQ=60)
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TAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCAC > SRR4302534.2788296/1‑94 (MQ=60)
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AAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACG > SRR4302534.1245546/1‑94 (MQ=60)
AAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACG > SRR4302534.3577896/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGC < SRR4302534.5401607/94‑1 (MQ=60)
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ACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCT < SRR4302534.498187/94‑1 (MQ=60)
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CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA > SRR4302534.1166557/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTA < SRR4302534.3124987/94‑1 (MQ=60)
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GCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACC < SRR4302534.1635546/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGTTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG < SRR4302534.1129108/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG < SRR4302534.5299525/94‑1 (MQ=60)
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CTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCG > SRR4302534.4796266/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGG < SRR4302534.5507100/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGG < SRR4302534.4254530/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGT > SRR4302534.4668334/1‑94 (MQ=60)
CGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGT < SRR4302534.6197925/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGT > SRR4302534.6173109/1‑94 (MQ=60)
CGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGT > SRR4302534.255980/1‑94 (MQ=60)
GGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTG < SRR4302534.456355/94‑1 (MQ=60)
GGTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTG < SRR4302534.6306475/94‑1 (MQ=60)
GTAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGA < SRR4302534.1608652/94‑1 (MQ=60)
TAATAAACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAG < SRR4302534.2596516/94‑1 (MQ=60)
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AACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGC < SRR4302534.2012372/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGGGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCAAGCTACCGGTGAGATCGCG > SRR4302534.3476696/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGA > SRR4302534.4104912/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGA > SRR4302534.6266009/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGA > SRR4302534.2357443/1‑94 (MQ=60)
GCCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAA > SRR4302534.145443/1‑94 (MQ=60)
CCTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAT < SRR4302534.2580259/94‑1 (MQ=60)
CCTTGTTCGGCCCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAAT < SRR4302534.1762631/94‑1 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT > SRR4302534.381197/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATT < SRR4302534.5158190/94‑1 (MQ=60)
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TGTTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGT < SRR4302534.3101023/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGCGCAATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTC > SRR4302534.6457606/1‑94 (MQ=60)
TTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTGCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCA > SRR4302534.6391931/1‑94 (MQ=60)
TTCGGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCA < SRR4302534.6065923/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATAGTGGGGGCGCGGGGGTTAATTTTCattacgattacggtgagatttcgtattttccccg > SRR4302534.3434765/1‑60 (MQ=55)
GCGCGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGT < SRR4302534.6537636/94‑1 (MQ=60)
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CGGCAGGGGCCGGTATCGTCAACACCACGCGCGTGACCGAGTCAGAGAGCGACCAGTTGATAAACTGCTCGGTAATAAACGCCTTGTTCGGCACGATTATCTCTTTACGGTCCCAGTCGCTGATGGTGGTGGCGCGGGTGTTAATTTTCGTCACGCTACCGGTGAGATCGCGAATTGTCACCGT > NC_000913/4383951‑4384134
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
