Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,502,680 |
C→T |
A352V (GCA→GTA) |
b4279 → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,502,680 | 0 | C | T | 99.3%
| 1033.8
/ NA
| 302 | A352V (GCA→GTA) | b4279 | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (153/145); minor base G (2/0); total (156/146) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT > NC_000913/4502590‑4502769
|
gTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTaa > 2:8293449/1‑93 (MQ=255)
gTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTaa < 1:7075925/93‑1 (MQ=255)
tATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAc < 1:5269813/93‑1 (MQ=255)
tATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAc > 2:4005247/1‑93 (MQ=255)
tATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAc < 2:778602/93‑1 (MQ=255)
tATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAc > 2:2453248/1‑93 (MQ=255)
aTTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACt < 2:6934285/93‑1 (MQ=255)
ttGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTg < 2:8694466/93‑1 (MQ=255)
cAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggag > 1:7102590/1‑93 (MQ=255)
cAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggag < 1:3150785/93‑1 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTATATATGATTACGTTCCAACAAAATTAATAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa < 1:7249015/93‑1 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt > 1:1614136/1‑93 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt > 1:4627187/1‑93 (MQ=255)
tggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATgg < 2:6394482/93‑1 (MQ=255)
tggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATgg > 1:4084931/1‑93 (MQ=255)
tggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATgg > 2:5797033/1‑93 (MQ=255)
gttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGcc > 2:3091612/1‑93 (MQ=255)
tCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGc > 1:4831995/1‑93 (MQ=255)
ccAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCa < 1:6370221/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAcc < 1:1996183/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAcc < 1:5178840/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCt < 1:7970224/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCt < 1:3040095/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCt < 2:4361918/93‑1 (MQ=255)
tttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTa > 1:5333079/1‑93 (MQ=255)
tttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTa > 1:5645209/1‑93 (MQ=255)
tttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTa < 2:3501088/93‑1 (MQ=255)
ttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGAAt > 2:7608205/1‑93 (MQ=255)
tatataTGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTAtt > 1:3603131/1‑93 (MQ=255)
atatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa < 1:4987508/93‑1 (MQ=255)
atatacGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa > 2:8727889/1‑93 (MQ=255)
tatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCt > 1:5789724/1‑93 (MQ=255)
tatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCt > 2:12745/1‑93 (MQ=255)
tatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCt > 1:8702974/1‑93 (MQ=255)
atGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCta < 1:1695029/93‑1 (MQ=255)
atGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCta > 2:577465/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtac > 1:6560174/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtac < 1:8000813/93‑1 (MQ=255)
gATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtaca > 2:3907085/1‑93 (MQ=255)
gATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtaca > 2:1913629/1‑93 (MQ=255)
gATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtaca < 2:5105978/93‑1 (MQ=255)
gATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtaca < 2:5416321/93‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATCACTTAGGGGTAACTGGAGGAGTGGCCGCACCTGTAGTAGCtacat > 1:4181648/1‑93 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacat > 2:8086134/1‑93 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacat > 2:4473980/1‑93 (MQ=255)
ttACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacata < 2:7076612/93‑1 (MQ=255)
tACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacatac > 2:4908377/1‑93 (MQ=255)
tACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacatac < 1:6893759/93‑1 (MQ=255)
tcTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacataca < 1:6147380/92‑1 (MQ=255)
cTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTacatacat > 1:5052933/1‑93 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt < 1:2698196/93‑1 (MQ=255)
ttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAttt < 2:6743656/93‑1 (MQ=255)
caacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAg > 2:4297709/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg > 2:3454844/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg > 2:4243536/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg < 2:2067377/93‑1 (MQ=255)
acaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGa < 2:7940432/93‑1 (MQ=255)
caaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGat < 1:2268522/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGatat < 1:8559402/93‑1 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 2:8520123/93‑1 (MQ=255)
atAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 1:6628683/92‑1 (MQ=255)
tAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATg < 1:1011903/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATgg > 2:8623131/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATgg > 1:1870561/1‑93 (MQ=255)
agagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGc > 1:997453/1‑93 (MQ=255)
agagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGc > 2:4107053/1‑93 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt < 2:7433964/93‑1 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt < 1:6868815/93‑1 (MQ=255)
agGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCtt > 2:1871287/1‑93 (MQ=255)
agGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCtt < 2:8127809/93‑1 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa < 2:3824313/93‑1 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa > 1:2518681/1‑93 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa > 1:4271992/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgt < 1:7713916/93‑1 (MQ=255)
ttAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgt < 1:7376185/93‑1 (MQ=255)
tAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtg > 1:3796966/1‑93 (MQ=255)
aGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtgt > 2:3303949/1‑93 (MQ=255)
aGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtgt < 1:819220/93‑1 (MQ=255)
gACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTc < 1:3328663/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCa < 2:7863463/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatta < 1:1454289/93‑1 (MQ=255)
gTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattat > 1:8295525/1‑93 (MQ=255)
tttatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTc < 1:714847/92‑1 (MQ=255)
cTTATTTATAATTTAGGGGAAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTc > 2:8491180/1‑93 (MQ=255)
ttatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCa > 1:5398175/1‑93 (MQ=255)
ttttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCTCCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAtt < 1:1255641/92‑1 (MQ=255)
atttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAtt < 1:4721621/93‑1 (MQ=255)
atttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAtt > 1:4557758/1‑93 (MQ=255)
tttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTg < 2:2664198/93‑1 (MQ=255)
tataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGtt < 2:3191970/93‑1 (MQ=255)
tataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGtt > 1:3851951/1‑93 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 1:6010568/93‑1 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 1:5884175/93‑1 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 2:475940/93‑1 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 2:614243/93‑1 (MQ=255)
taACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAc < 1:7851302/93‑1 (MQ=255)
ttATGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt > 2:2247507/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt > 2:7293605/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt < 2:1665304/93‑1 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt < 1:760236/93‑1 (MQ=255)
|
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT > NC_000913/4502590‑4502769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > NC_000913/4502587‑4502773
|
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT < SRR4302541.5840413/94‑1 (MQ=60)
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT < SRR4302541.580491/94‑1 (MQ=60)
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT > SRR4302541.3470524/1‑94 (MQ=60)
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT < SRR4302541.300180/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGATGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA > SRR4302541.6560051/1‑94 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA < SRR4302541.1063420/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA > SRR4302541.5985381/1‑94 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA > SRR4302541.4925946/1‑94 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA < SRR4302541.2690737/94‑1 (MQ=60)
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGTACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAC < SRR4302541.3029460/94‑1 (MQ=60)
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAC < SRR4302541.7151180/94‑1 (MQ=60)
TATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACT < SRR4302541.5324108/94‑1 (MQ=60)
TATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACT < SRR4302541.5857053/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG < SRR4302541.6892375/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG < SRR4302541.4165399/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG > SRR4302541.7178182/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG < SRR4302541.2117283/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGG < SRR4302541.6683393/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGG < SRR4302541.3182585/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGG < SRR4302541.7439/94‑1 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA > SRR4302541.7986056/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA < SRR4302541.2328082/94‑1 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACCTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA > SRR4302541.7447205/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT > SRR4302541.1630168/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT > SRR4302541.4674256/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT < SRR4302541.1592194/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACGTTCCAACAAAATTAATAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT < SRR4302541.7326333/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTTCAAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTCGGGAGCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGcaag > SRR4302541.4674255/1‑90 (MQ=60)
TTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGG > SRR4302541.4125246/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGC > SRR4302541.3296650/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGC > SRR4302541.3954619/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGC > SRR4302541.8349155/1‑94 (MQ=60)
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TTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGC > SRR4302541.4881252/1‑94 (MQ=60)
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ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAG > SRR4302541.3864587/1‑94 (MQ=60)
ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAC > SRR4302541.2517974/1‑94 (MQ=60)
ATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCT > SRR4302541.8796100/1‑94 (MQ=60)
ATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCT > SRR4302541.5848559/1‑94 (MQ=60)
TATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTA > SRR4302541.3716350/1‑94 (MQ=60)
TATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTA > SRR4302541.7159980/1‑94 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC < SRR4302541.3102167/94‑1 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC > SRR4302541.6627250/1‑94 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC < SRR4302541.1711658/94‑1 (MQ=60)
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TGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACA > SRR4302541.5846985/1‑94 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATCACTTAGGGGTAACTGGAGGAGTGGCCGCACCTGTAGTAGCTACAT > SRR4302541.4223128/1‑94 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACAT < SRR4302541.723742/94‑1 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGGAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACAT > SRR4302541.4223127/1‑94 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA > SRR4302541.343329/1‑94 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA < SRR4302541.7736528/94‑1 (MQ=60)
TTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATAC > SRR4302541.5141205/1‑94 (MQ=60)
TACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACA < SRR4302541.6967322/94‑1 (MQ=60)
TCTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAT < SRR4302541.6210186/94‑1 (MQ=60)
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TTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTT < SRR4302541.2724994/94‑1 (MQ=60)
TCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCA < SRR4302541.995342/94‑1 (MQ=60)
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CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG > SRR4302541.3913111/1‑94 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG < SRR4302541.5387185/94‑1 (MQ=60)
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TTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATG < SRR4302541.5101611/94‑1 (MQ=60)
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AGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTT > SRR4302541.1031877/1‑94 (MQ=60)
GGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTT < SRR4302541.514098/94‑1 (MQ=60)
GGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTT > SRR4302541.3681836/1‑94 (MQ=60)
GGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTT < SRR4302541.3839974/94‑1 (MQ=60)
GACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCA < SRR4302541.7641926/94‑1 (MQ=60)
GACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCA < SRR4302541.3362011/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCAT > SRR4302541.8055114/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATT > SRR4302541.5580520/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATT < SRR4302541.7310594/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTA > SRR4302541.4906844/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302541.8385735/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302541.8385736/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT < SRR4302541.1468487/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT < SRR4302541.1468486/94‑1 (MQ=60)
GTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATT > SRR4302541.1988203/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA < SRR4302541.721593/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302541.1716889/1‑94 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302541.6847440/1‑94 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302541.5453566/1‑94 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302541.5453567/1‑94 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT > SRR4302541.1371095/1‑94 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT < SRR4302541.7223854/94‑1 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT > SRR4302541.2819466/1‑94 (MQ=60)
TATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATT > SRR4302541.4603886/1‑94 (MQ=60)
TATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATT < SRR4302541.221768/94‑1 (MQ=60)
TTTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCTCCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG < SRR4302541.1268106/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG < SRR4302541.4769777/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG < SRR4302541.4625226/94‑1 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT > SRR4302541.4289499/1‑94 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT < SRR4302541.6942637/94‑1 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT > SRR4302541.3890721/1‑94 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT > SRR4302541.4289498/1‑94 (MQ=60)
TATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTA < SRR4302541.1808476/94‑1 (MQ=60)
TATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTA < SRR4302541.5922313/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.5944059/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.5944053/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.4502065/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.4707571/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.5080421/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302541.6072154/94‑1 (MQ=60)
TAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACG < SRR4302541.7937487/94‑1 (MQ=60)
AACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGT > SRR4302541.1689157/1‑94 (MQ=60)
AACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGG > SRR4302541.6337181/1‑94 (MQ=60)
AACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGG < SRR4302541.7878049/94‑1 (MQ=60)
CTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTT > SRR4302541.5974196/1‑94 (MQ=60)
CTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTT > SRR4302541.6573543/1‑94 (MQ=60)
TTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTG < SRR4302541.767376/94‑1 (MQ=60)
TTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTG > SRR4302541.6232916/1‑94 (MQ=60)
GGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC > SRR4302541.3665164/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCT < SRR4302541.3052413/94‑1 (MQ=60)
GTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCT < SRR4302541.7242863/94‑1 (MQ=60)
TAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > SRR4302541.2063510/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > SRR4302541.2955757/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > SRR4302541.5685988/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC < SRR4302541.7244721/94‑1 (MQ=60)
|
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > NC_000913/4502587‑4502773
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
