Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,502,680 |
C→T |
A352V (GCA→GTA) |
b4279 → |
putative transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,502,680 | 0 | C | T | 99.4%
| 591.8
/ NA
| 163 | A352V (GCA→GTA) | b4279 | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (93/68); total (95/68) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT > NC_000913/4502590‑4502769
|
ttGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTg < 2:3935868/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTgga > 2:5865552/1‑93 (MQ=255)
cAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggag > 1:6052171/1‑93 (MQ=255)
gggTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggagga > 1:5782032/1‑93 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa > 1:4392227/1‑93 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa < 2:6076873/93‑1 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt > 2:1648307/1‑93 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt < 2:6017650/93‑1 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt < 2:3001464/93‑1 (MQ=255)
tggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATgg > 1:1533270/1‑93 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc < 2:1707638/93‑1 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc > 2:5307537/1‑93 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc > 2:3326137/1‑93 (MQ=255)
gttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGcc < 2:4015444/93‑1 (MQ=255)
gttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGcc < 2:4103906/93‑1 (MQ=255)
gttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGcc > 2:5270820/1‑93 (MQ=255)
gttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGcc < 2:709573/93‑1 (MQ=255)
ttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTATGGGTAACTGGAGGAATGGCCg > 1:3390050/1‑93 (MQ=255)
ttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCg > 2:6167390/1‑93 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAc > 2:2063167/1‑93 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAc > 2:951056/1‑93 (MQ=255)
cAAAATTGATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAc > 1:6359980/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAcc < 1:3190790/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAcc < 2:6331361/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCt > 2:896559/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTg > 2:2931599/1‑93 (MQ=255)
tatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAg < 1:1254575/93‑1 (MQ=255)
tatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAg > 1:3774485/1‑93 (MQ=255)
atatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGc < 2:1021484/93‑1 (MQ=255)
atatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGc < 1:6160458/93‑1 (MQ=255)
atatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGc > 1:5284490/1‑93 (MQ=255)
tatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCt < 2:2632629/93‑1 (MQ=255)
tatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCt > 1:5193252/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtac < 1:515713/93‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacat > 2:1906859/1‑93 (MQ=255)
ttACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacata > 1:828281/1‑93 (MQ=255)
tACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacatac > 1:557968/1‑93 (MQ=255)
tACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacatac < 2:5402815/93‑1 (MQ=255)
tACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacatac > 1:4637533/1‑93 (MQ=255)
aCTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacataca > 2:3641312/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTacatacat < 2:4994891/93‑1 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt < 1:4568405/93‑1 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt > 2:2648285/1‑93 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt > 2:2755440/1‑93 (MQ=255)
ttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAttt > 2:3592526/1‑93 (MQ=255)
tCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTc > 1:5167503/1‑93 (MQ=255)
caacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAg > 2:4003241/1‑93 (MQ=255)
caacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAg > 1:364987/1‑93 (MQ=255)
caacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAg > 2:5953073/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg > 1:3552739/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg < 1:3462157/93‑1 (MQ=255)
caaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGat > 2:253861/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGCAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGata < 2:3447079/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGatat < 2:173957/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGatat < 1:2969337/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGatat < 1:5672266/93‑1 (MQ=255)
aaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtatt > 1:3313127/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtatt < 1:1021658/93‑1 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 2:4208885/93‑1 (MQ=255)
tAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATg < 1:2645996/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATgg > 2:4521168/1‑93 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt < 1:1330502/93‑1 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt < 1:418855/93‑1 (MQ=255)
agGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCtt > 2:4083001/1‑93 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa > 1:2207415/1‑93 (MQ=255)
gATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAg > 1:1334623/1‑93 (MQ=255)
aTTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAgg < 2:1389586/93‑1 (MQ=255)
ttAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgt > 1:5075202/1‑93 (MQ=255)
tAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtg < 1:4104336/93‑1 (MQ=255)
aGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtgt > 1:4603291/1‑93 (MQ=255)
gggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGtt > 1:2552429/1‑93 (MQ=255)
gggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGtt > 2:6135249/1‑93 (MQ=255)
gggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGtt > 1:5198909/1‑93 (MQ=255)
ggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGttt > 1:648604/1‑93 (MQ=255)
ggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGttt > 1:5912087/1‑93 (MQ=255)
ccGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCat > 1:283791/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatt > 2:36543/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatt < 2:3411678/93‑1 (MQ=255)
tCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattatt < 1:1579585/93‑1 (MQ=255)
tCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattatt > 2:1598403/1‑93 (MQ=255)
tCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattatt > 1:6007689/1‑93 (MQ=255)
ttatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCa > 1:3750798/1‑93 (MQ=255)
tatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAt < 2:6118618/93‑1 (MQ=255)
tatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAt > 1:2250424/1‑93 (MQ=255)
atttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAtt > 2:4465570/1‑93 (MQ=255)
tttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTg > 1:2418505/1‑93 (MQ=255)
ttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGt < 2:2059205/93‑1 (MQ=255)
ttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGt < 1:2896353/93‑1 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa > 1:4445438/1‑93 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa > 2:1127147/1‑93 (MQ=255)
taACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAc > 2:4582941/1‑93 (MQ=255)
aaCTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg > 1:2938289/1‑93 (MQ=255)
aCTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACgg < 1:1353980/93‑1 (MQ=255)
tAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTg < 1:3988326/93‑1 (MQ=255)
tAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTg > 2:2716318/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGc < 2:4839503/93‑1 (MQ=255)
ggggTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCa < 1:1732664/93‑1 (MQ=255)
ggggTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCa > 1:5647724/1‑93 (MQ=255)
gggTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAt > 1:2382171/1‑93 (MQ=255)
gggTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAt < 2:3028835/93‑1 (MQ=255)
|
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT > NC_000913/4502590‑4502769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > NC_000913/4502588‑4502773
|
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA < SRR4302534.4885383/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAA > SRR4302534.2670547/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG > SRR4302534.6216749/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA > SRR4302534.5938875/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA < SRR4302534.1929682/94‑1 (MQ=60)
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAA > SRR4302534.4510681/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAA > SRR4302534.6285055/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAA > SRR4302534.5308553/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT < SRR4302534.77813/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGG < SRR4302534.2438875/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGG > SRR4302534.1573485/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCC > SRR4302534.3537140/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTATGGGTAACTGGAGGAATGGCCG > SRR4302534.3480979/1‑94 (MQ=60)
TCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCA < SRR4302534.3417135/94‑1 (MQ=60)
CCAAAATTGATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAC > SRR4302534.6531738/1‑94 (MQ=60)
AAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCT < SRR4302534.3275273/94‑1 (MQ=60)
AATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGT < SRR4302534.5883619/94‑1 (MQ=60)
AATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGT < SRR4302534.5413249/94‑1 (MQ=60)
ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAG > SRR4302534.3875825/1‑94 (MQ=60)
TATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGC > SRR4302534.5427149/1‑94 (MQ=60)
TATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGC < SRR4302534.1287642/94‑1 (MQ=60)
ATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCT > SRR4302534.5333268/1‑94 (MQ=60)
ATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCT < SRR4302534.6328017/94‑1 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGGCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC > SRR4302534.5662033/1‑94 (MQ=60)
TGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACA < SRR4302534.528540/94‑1 (MQ=60)
TGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACA > SRR4302534.5817043/1‑94 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA < SRR4302534.4096839/94‑1 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA > SRR4302534.849125/1‑94 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA < SRR4302534.1467812/94‑1 (MQ=60)
TTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATAC > SRR4302534.4763361/1‑94 (MQ=60)
TTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATAC > SRR4302534.571726/1‑94 (MQ=60)
TTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATAC < SRR4302534.4621946/94‑1 (MQ=60)
TACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACA < SRR4302534.3670246/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATT < SRR4302534.296826/94‑1 (MQ=60)
TTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTT < SRR4302534.4692260/94‑1 (MQ=60)
TTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTC > SRR4302534.5306789/1‑94 (MQ=60)
TCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCA < SRR4302534.3912673/94‑1 (MQ=60)
CCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAG > SRR4302534.374303/1‑94 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG > SRR4302534.3648283/1‑94 (MQ=60)
AACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGA < SRR4302534.3555232/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATT < SRR4302534.3047092/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATT < SRR4302534.3818639/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATT < SRR4302534.5825847/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATT > SRR4302534.3401637/1‑94 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA > SRR4302534.2560287/1‑94 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA < SRR4302534.1047969/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTAT > SRR4302534.1385423/1‑94 (MQ=60)
TAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGG > SRR4302534.300257/1‑94 (MQ=60)
TAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGG < SRR4302534.2715965/94‑1 (MQ=60)
GAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTT < SRR4302534.429567/94‑1 (MQ=60)
GAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTT < SRR4302534.1365575/94‑1 (MQ=60)
AGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTA < SRR4302534.1641779/94‑1 (MQ=60)
AGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTA > SRR4302534.2265850/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTA > SRR4302534.6108731/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTA > SRR4302534.519642/1‑94 (MQ=60)
GGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAG > SRR4302534.1369797/1‑94 (MQ=60)
ATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGT > SRR4302534.5212200/1‑94 (MQ=60)
TAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGT < SRR4302534.4214715/94‑1 (MQ=60)
TAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGT > SRR4302534.4728216/1‑94 (MQ=60)
AGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTT > SRR4302534.2620095/1‑94 (MQ=60)
AGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTT > SRR4302534.5339147/1‑94 (MQ=60)
GGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTT > SRR4302534.664331/1‑94 (MQ=60)
GGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTT > SRR4302534.6072634/1‑94 (MQ=60)
GGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATATATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTC < SRR4302534.3208255/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCAT > SRR4302534.291124/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATT > SRR4302534.5241051/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTA > SRR4302534.6527553/1‑94 (MQ=60)
GTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATT > SRR4302534.6170912/1‑94 (MQ=60)
TCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTC < SRR4302534.1620906/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302534.3851534/1‑94 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302534.468520/1‑94 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT > SRR4302534.2310077/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG > SRR4302534.2482824/1‑94 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT < SRR4302534.2972378/94‑1 (MQ=60)
TTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTT < SRR4302534.884075/94‑1 (MQ=60)
TATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTA > SRR4302534.4565547/1‑94 (MQ=60)
TAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACG > SRR4302534.3015406/1‑94 (MQ=60)
AACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGG > SRR4302534.4310687/1‑94 (MQ=60)
ACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGT < SRR4302534.1389669/94‑1 (MQ=60)
TTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTG < SRR4302534.1317188/94‑1 (MQ=60)
TAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGC < SRR4302534.4095032/94‑1 (MQ=60)
AGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCA > SRR4302534.5800609/1‑94 (MQ=60)
GGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT > SRR4302534.2445468/1‑94 (MQ=60)
GGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAT < SRR4302534.1777667/94‑1 (MQ=60)
GGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC < SRR4302534.4819158/94‑1 (MQ=60)
GTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCT > SRR4302534.5350280/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCT > SRR4302534.503335/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > SRR4302534.5148351/1‑94 (MQ=60)
|
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTC > NC_000913/4502588‑4502773
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |