Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,636,923 |
T→C |
W393R (TGG→CGG) |
creD → |
CreD |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,636,923 | 0 | T | C | 98.9%
| 1255.1
/ ‑3.7
| 370 | W393R (TGG→CGG) | creD | CreD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base C (208/155); total (213/157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.40e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
ATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGT > NC_000913/4636833‑4637012
|
aTGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCgg > 2:6748501/1‑93 (MQ=255)
tGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCggg < 2:668711/93‑1 (MQ=255)
tGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCggg < 2:7710726/93‑1 (MQ=255)
gAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCgggg > 1:3145867/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGa < 2:6809797/93‑1 (MQ=255)
aCGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAc < 2:3630871/93‑1 (MQ=255)
aCGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAc < 2:5774248/93‑1 (MQ=255)
aCGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAc < 2:7619246/93‑1 (MQ=255)
aCGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAc > 2:3074174/1‑93 (MQ=255)
gTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGc < 2:6426259/93‑1 (MQ=255)
tatttattTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGGGGGGACTGCt > 1:2607581/1‑93 (MQ=255)
atttatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTc > 1:2770350/1‑93 (MQ=255)
atttatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTc < 2:325831/93‑1 (MQ=255)
tttatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCa > 1:6191803/1‑93 (MQ=255)
ttatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACCGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCaa < 2:7314290/93‑1 (MQ=255)
ttatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCaa > 2:8118842/1‑93 (MQ=255)
tatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAAc < 1:1820075/93‑1 (MQ=255)
tatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAAc < 2:5150134/93‑1 (MQ=255)
tatttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAAc < 2:3546964/93‑1 (MQ=255)
atttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAAct < 1:3410188/93‑1 (MQ=255)
tttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAActc < 2:7472583/93‑1 (MQ=255)
tttGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAActc > 1:4966319/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTg > 1:540694/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTg > 2:6985830/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCg > 2:2521893/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCg > 2:6159685/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGa < 1:4850866/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGa < 1:7999620/93‑1 (MQ=255)
gCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGAt > 2:4416133/1‑93 (MQ=255)
gCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGAt > 1:3678253/1‑93 (MQ=255)
cGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATa < 2:5026275/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTGTGCGGATAgc > 1:2456400/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgc < 2:5984259/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgc > 1:5864966/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgc > 1:2383852/1‑93 (MQ=255)
tATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcg < 1:3779319/93‑1 (MQ=255)
ttGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcgcg > 2:8268691/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcgcg > 2:1488823/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcgcg > 1:4161508/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGAGAgcgcg > 2:1687097/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCt > 2:3403230/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtg > 2:3827643/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtg < 2:8154608/93‑1 (MQ=255)
aaGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgt > 1:1677915/1‑93 (MQ=255)
aaGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgt < 2:1429297/93‑1 (MQ=255)
aGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgtt > 1:1457394/1‑93 (MQ=255)
ggTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttg < 1:6513546/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttg < 1:7291438/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttg > 1:8725024/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttgt < 2:3205222/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTgg > 2:8777912/1‑93 (MQ=255)
ggTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTgg > 1:1602338/1‑93 (MQ=255)
gCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGaa > 1:6277345/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAAcc > 1:7077316/1‑93 (MQ=255)
aCAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCa < 1:3908441/93‑1 (MQ=255)
aCAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCa > 2:2819253/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAgt > 2:4994614/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTTGTTTACCCTCGCGCAGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAgt > 2:5526298/1‑93 (MQ=255)
gCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAgtg > 1:4548244/1‑93 (MQ=255)
acATTTTGTTTCCCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAgtg < 2:6605494/92‑1 (MQ=255)
cATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGGCTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAgtgt < 1:28692/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGtgtg > 1:7393149/1‑93 (MQ=255)
tgttgtTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGc > 2:2080883/1‑93 (MQ=255)
gttgttTACCCTCTCGCTGTTGTTGCGGGAGGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCt < 2:2657781/93‑1 (MQ=255)
gttgttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCt > 1:5187101/1‑93 (MQ=255)
ttgttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtg > 2:2763990/1‑93 (MQ=255)
ttgttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtg < 1:6359030/93‑1 (MQ=255)
tgttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGCACCAGTGTGCtgg > 2:3337769/1‑93 (MQ=255)
tgttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtgg < 1:8386103/93‑1 (MQ=255)
gttTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggt < 1:8062769/93‑1 (MQ=255)
tttACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGGGGGGACTGCTCAACTCTGCCGCTACCGCGCCGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtg > 2:223702/1‑93 (MQ=255)
tttACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGCGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggag > 1:4249566/1‑91 (MQ=255)
ttACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtgg < 2:8666408/93‑1 (MQ=255)
aCCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtggtg > 1:6085791/1‑93 (MQ=255)
cccTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGGCTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtggcgc > 2:7551246/1‑90 (MQ=255)
cccTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtggtgg > 1:2178416/1‑93 (MQ=255)
ccTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGgc < 1:335399/93‑1 (MQ=255)
cTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGgcg > 2:4749629/1‑93 (MQ=255)
cTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGGGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGGTGTTGGGAACCAGTGTGCtggtggtggtg > 1:3527312/1‑91 (MQ=255)
tCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGgcgc > 2:5730662/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGgcgc > 1:93159/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGgcgc > 1:5327544/1‑93 (MQ=255)
cgcgCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCt < 1:1025615/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGcc > 1:5582861/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGcc < 2:1616575/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGcc > 1:7725659/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGcc > 2:4096247/1‑93 (MQ=255)
gttgttGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCgg > 2:4885545/1‑93 (MQ=255)
gttgttGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCgg > 1:1152198/1‑93 (MQ=255)
tgttgCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCa < 1:6846078/93‑1 (MQ=255)
gttgCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCat > 2:1176959/1‑93 (MQ=255)
gttgCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCat > 2:5198253/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCatgat < 1:3039022/93‑1 (MQ=255)
tGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGt < 1:6980347/93‑1 (MQ=255)
tGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGt > 1:2685572/1‑93 (MQ=255)
tGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGt < 2:4311732/93‑1 (MQ=255)
gATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGttt < 1:5829875/93‑1 (MQ=255)
gtGGTCTGATGCGGGGACTGCTCAACTCGGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTtg < 2:7917837/92‑1 (MQ=255)
tgtgATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGAc < 2:4627763/93‑1 (MQ=255)
aTGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTTACCCGt > 1:8448131/1‑93 (MQ=255)
|
ATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGT > NC_000913/4636833‑4637012
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA > NC_000913/4636830‑4637016
|
ATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAATGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGC < SRR4302541.5061694/94‑1 (MQ=60)
ATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGC > SRR4302541.284299/1‑94 (MQ=60)
ATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGC > SRR4302541.2146905/1‑94 (MQ=60)
atatgaaccgttaTTATTTGCAAGCGGTAATGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCG < SRR4302541.318104/81‑1 (MQ=60)
TAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCG > SRR4302541.8802808/1‑94 (MQ=60)
TAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCG < SRR4302541.45750/94‑1 (MQ=60)
TAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCG > SRR4302541.7803514/1‑94 (MQ=60)
ATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGATATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGG < SRR4302541.5407011/94‑1 (MQ=60)
TGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGG < SRR4302541.2844853/94‑1 (MQ=60)
TGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGG > SRR4302541.3177636/1‑94 (MQ=60)
GAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGA > SRR4302541.591243/1‑94 (MQ=60)
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AACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAC > SRR4302541.4224539/1‑94 (MQ=60)
AACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAC > SRR4302541.2631401/1‑94 (MQ=60)
AACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAC > SRR4302541.5085826/1‑94 (MQ=60)
AACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAC > SRR4302541.8533909/1‑94 (MQ=60)
AACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGAC < SRR4302541.6379977/94‑1 (MQ=60)
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ATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCG < SRR4302541.2416137/94‑1 (MQ=60)
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AAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTT < SRR4302541.3732925/94‑1 (MQ=60)
AAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTT > SRR4302541.5969346/1‑94 (MQ=60)
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CATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTG > SRR4302541.7472207/1‑94 (MQ=60)
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GTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACCCTGCCGATAGCGCGCTGATGTTGGGTACCATTGTGCTG > SRR4302541.7583758/1‑94 (MQ=60)
TTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGG < SRR4302541.6424051/94‑1 (MQ=60)
TTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGG > SRR4302541.2661910/1‑94 (MQ=60)
TGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGT < SRR4302541.8476913/94‑1 (MQ=60)
TTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTA < SRR4302541.1707422/94‑1 (MQ=60)
GTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTG > SRR4302541.8089926/1‑94 (MQ=60)
GTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTG > SRR4302541.1483917/1‑94 (MQ=60)
GTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTG < SRR4302541.1175429/94‑1 (MQ=60)
GTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTG < SRR4302541.8151339/94‑1 (MQ=60)
GTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGCGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGAG > SRR4302541.4292028/1‑94 (MQ=60)
TTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGG < SRR4302541.5757723/94‑1 (MQ=60)
TTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGG > SRR4302541.1585988/1‑94 (MQ=60)
TTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGG > SRR4302541.2502217/1‑94 (MQ=60)
TACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTG > SRR4302541.6147913/1‑94 (MQ=60)
TACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTG < SRR4302541.4793314/94‑1 (MQ=60)
TACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTG > SRR4302541.4839676/1‑94 (MQ=60)
TCCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCTCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGG < SRR4302541.6074595/94‑1 (MQ=60)
ACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGG > SRR4302541.3644156/1‑94 (MQ=60)
ACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGG > SRR4302541.2199465/1‑94 (MQ=60)
ACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGG > SRR4302541.6175136/1‑94 (MQ=60)
ACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGGGG > SRR4302541.7621097/1‑94 (MQ=60)
CCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGG > SRR4302541.4939139/1‑94 (MQ=60)
CCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGGCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCG > SRR4302541.394217/1‑94 (MQ=60)
CCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCG > SRR4302541.3562817/1‑94 (MQ=60)
CCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCG < SRR4302541.338407/94‑1 (MQ=60)
CCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGGGGCG > SRR4302541.6529828/1‑94 (MQ=60)
CCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGGGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGGTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGTG > SRR4302541.3562821/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC > SRR4302541.3043363/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC > SRR4302541.5382360/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC < SRR4302541.2730269/94‑1 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC > SRR4302541.93968/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC > SRR4302541.7040515/1‑94 (MQ=60)
CTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGC > SRR4302541.5405687/1‑94 (MQ=60)
TCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCT < SRR4302541.8914299/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCT > SRR4302541.8570538/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCGGTGTGCTGGTGGTGGCGCTG < SRR4302541.1880789/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTG < SRR4302541.1035089/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGG > SRR4302541.2440100/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGCGCTGGTGGTGGCGCTGG > SRR4302541.4312237/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGC > SRR4302541.4221362/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCC > SRR4302541.5640010/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCC > SRR4302541.7807851/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCC > SRR4302541.6466521/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCG > SRR4302541.957838/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCG < SRR4302541.7614816/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCG < SRR4302541.3129989/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCG > SRR4302541.2994203/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGCTGGGTACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCG > SRR4302541.7885429/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGG < SRR4302541.7111938/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGG > SRR4302541.1163211/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCAT > SRR4302541.1091355/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCAT < SRR4302541.6919274/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCAT < SRR4302541.3349032/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCAT < SRR4302541.6154337/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGAT < SRR4302541.3878765/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATGGTGTGATGCGGGGACCGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGAT < SRR4302541.7399858/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATG < SRR4302541.3069726/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATG > SRR4302541.7197385/1‑94 (MQ=60)
CTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGT > SRR4302541.2712251/1‑94 (MQ=60)
CTGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGT > SRR4302541.1621879/1‑94 (MQ=60)
TGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTT < SRR4302541.7275809/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTT < SRR4302541.1299681/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTT < SRR4302541.7054714/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTT > SRR4302541.743674/1‑94 (MQ=60)
GATGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTG < SRR4302541.5889160/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTGATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTG < SRR4302541.6240112/94‑1 (MQ=60)
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GATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTTACCCGT > SRR4302541.8539338/1‑94 (MQ=60)
ATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTA > SRR4302541.4685660/1‑94 (MQ=60)
ATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTA > SRR4302541.5249012/1‑94 (MQ=60)
ATGCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTA > SRR4302541.628726/1‑94 (MQ=60)
GCGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAAT < SRR4302541.7247094/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA < SRR4302541.1417041/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA < SRR4302541.2268128/94‑1 (MQ=60)
CGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA > SRR4302541.7545482/1‑94 (MQ=60)
CGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGACGGCATGATGTTTGTGggccgtaatt > SRR4302541.3113313/1‑84 (MQ=60)
CGGGGACGGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA < SRR4302541.4324061/94‑1 (MQ=60)
|
ATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATA > NC_000913/4636830‑4637016
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |