Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 230 total aligned reads displayed.
AGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGA > NC_000913/3806900‑3807086
|
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GAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGT < SRR4302541.3283468/94‑1 (MQ=60)
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AGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTG < SRR4302541.5666128/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTG < SRR4302541.3398273/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGC > SRR4302541.2590267/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCG < SRR4302541.8805004/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGA > SRR4302541.4823031/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGA > SRR4302541.4512581/1‑94 (MQ=60)
GGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATT > SRR4302541.7307501/1‑94 (MQ=60)
GTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTA < SRR4302541.6842506/94‑1 (MQ=60)
GTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTA > SRR4302541.1891598/1‑94 (MQ=60)
TGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAC > SRR4302541.5010916/1‑94 (MQ=60)
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ATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCAGGTGGCGATTAACC > SRR4302541.2663249/1‑94 (MQ=60)
TCGCCGCACATCAGGAATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGCATGCGTTTAACCT > SRR4302541.7623443/1‑94 (MQ=60)
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CGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTT > SRR4302541.7749133/1‑94 (MQ=60)
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CCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGT < SRR4302541.3151429/94‑1 (MQ=60)
CCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGT < SRR4302541.495258/94‑1 (MQ=60)
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CGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTC > SRR4302541.7273555/1‑94 (MQ=60)
CGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTC < SRR4302541.5387796/94‑1 (MQ=60)
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GCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCC < SRR4302541.160323/94‑1 (MQ=60)
CCACATCATGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTTCCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCC < SRR4302541.1382472/94‑1 (MQ=60)
CACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCG > SRR4302541.4457599/1‑94 (MQ=60)
CACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCG < SRR4302541.2554315/94‑1 (MQ=60)
ACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGC > SRR4302541.7439292/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGCATTGTTACAGCAATTGCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGCCCGCA > SRR4302541.255258/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCC > SRR4302541.2457134/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCC > SRR4302541.2457132/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCA > SRR4302541.5750149/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCA < SRR4302541.8407055/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCA > SRR4302541.635337/1‑94 (MQ=60)
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CAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGG < SRR4302541.5029178/94‑1 (MQ=60)
CAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGG < SRR4302541.8424669/94‑1 (MQ=60)
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GGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCT < SRR4302541.512814/94‑1 (MQ=60)
GCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTCCCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTG < SRR4302541.4271483/94‑1 (MQ=60)
GCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTG > SRR4302541.6265510/1‑94 (MQ=60)
GCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTG < SRR4302541.5092404/94‑1 (MQ=60)
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CATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGG > SRR4302541.1219588/1‑94 (MQ=60)
TTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGAC < SRR4302541.2770418/94‑1 (MQ=60)
TTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGATGGAT > SRR4302541.7688487/1‑94 (MQ=60)
TGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACT < SRR4302541.2117344/94‑1 (MQ=60)
GTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTA < SRR4302541.4733448/94‑1 (MQ=60)
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TTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAA > SRR4302541.7877453/1‑94 (MQ=60)
TACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAG < SRR4302541.2995766/94‑1 (MQ=60)
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TACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAG < SRR4302541.2881958/94‑1 (MQ=60)
TACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAG > SRR4302541.2178398/1‑94 (MQ=60)
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CAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCT > SRR4302541.4145131/1‑94 (MQ=60)
CAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCT > SRR4302541.2140089/1‑94 (MQ=60)
CAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCT < SRR4302541.3847301/94‑1 (MQ=60)
CAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCT < SRR4302541.3169187/94‑1 (MQ=60)
CAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCT > SRR4302541.2076262/1‑94 (MQ=60)
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GCAATTCCCGAATTTATTGCTCCTCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTAT < SRR4302541.721353/94‑1 (MQ=60)
GCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTAT > SRR4302541.5519038/1‑94 (MQ=60)
CAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATA > SRR4302541.2256971/1‑94 (MQ=60)
CAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATA > SRR4302541.1899534/1‑94 (MQ=60)
CAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATA < SRR4302541.2455074/94‑1 (MQ=60)
AATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATAT > SRR4302541.2552943/1‑94 (MQ=60)
AATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATAT > SRR4302541.1542501/1‑94 (MQ=60)
AATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATAT > SRR4302541.2730311/1‑94 (MQ=60)
AATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATAT > SRR4302541.6930216/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGACATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATC > SRR4302541.5725714/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCA > SRR4302541.8407979/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCA < SRR4302541.6339865/94‑1 (MQ=60)
TTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCA > SRR4302541.5490827/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCA < SRR4302541.2961912/94‑1 (MQ=60)
TCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCAC < SRR4302541.4129965/94‑1 (MQ=60)
TCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCAC < SRR4302541.1515651/94‑1 (MQ=60)
CCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACA > SRR4302541.389938/1‑94 (MQ=60)
CCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACA > SRR4302541.4070762/1‑94 (MQ=60)
CCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACAC < SRR4302541.4707582/94‑1 (MQ=60)
CCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACAC < SRR4302541.5490830/94‑1 (MQ=60)
CGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACG < SRR4302541.2692620/94‑1 (MQ=60)
GAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGC > SRR4302541.3626816/1‑94 (MQ=60)
AATTTATTGGTCATCCTGGTGCCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCT < SRR4302541.5024644/94‑1 (MQ=60)
AATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCT > SRR4302541.7186994/1‑94 (MQ=60)
AATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCT > SRR4302541.4648039/1‑94 (MQ=60)
AATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCT > SRR4302541.4648040/1‑94 (MQ=60)
ATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTC > SRR4302541.8417670/1‑94 (MQ=60)
ATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTC < SRR4302541.101193/94‑1 (MQ=60)
ATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTC > SRR4302541.3598520/1‑94 (MQ=60)
ATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTC > SRR4302541.7828852/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTT < SRR4302541.7483681/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTT > SRR4302541.3224134/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTT > SRR4302541.1264406/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAGGCTATATGACACGCTCTTCA > SRR4302541.3565868/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCA > SRR4302541.2135705/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACATTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCG > SRR4302541.3565869/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCA < SRR4302541.3446439/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAG > SRR4302541.7842597/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAG > SRR4302541.7842596/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAG < SRR4302541.4857886/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAG > SRR4302541.4309776/1‑94 (MQ=60)
TGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGG > SRR4302541.8908997/1‑94 (MQ=60)
TGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGG > SRR4302541.4240600/1‑94 (MQ=60)
TGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGG < SRR4302541.5871526/94‑1 (MQ=60)
GCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGG > SRR4302541.1351874/1‑94 (MQ=60)
GCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGG < SRR4302541.42731/94‑1 (MQ=60)
CTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGG > SRR4302541.1796052/1‑94 (MQ=60)
CTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGG > SRR4302541.5290340/1‑94 (MQ=60)
CTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGG > SRR4302541.4184766/1‑94 (MQ=60)
TCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGA > SRR4302541.282298/1‑94 (MQ=60)
TCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGA > SRR4302541.6936133/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAA < SRR4302541.353688/94‑1 (MQ=60)
CATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAA < SRR4302541.5930690/94‑1 (MQ=60)
CATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAA > SRR4302541.4785753/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAA > SRR4302541.4785754/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAA < SRR4302541.5178945/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG > SRR4302541.3294025/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG > SRR4302541.6556482/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG < SRR4302541.7635291/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG < SRR4302541.1226222/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG > SRR4302541.1703950/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAG > SRR4302541.1687964/1‑94 (MQ=60)
TCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGT > SRR4302541.3841738/1‑94 (MQ=60)
TCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCATGTGAAGT > SRR4302541.4221297/1‑94 (MQ=60)
TCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGT > SRR4302541.4221298/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTC < SRR4302541.2801437/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGGC > SRR4302541.6276381/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTC > SRR4302541.1555865/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCC > SRR4302541.8894270/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCC > SRR4302541.3082942/1‑94 (MQ=60)
TGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCC < SRR4302541.1003670/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCC < SRR4302541.1952618/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCC > SRR4302541.1319238/1‑94 (MQ=60)
GGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCC > SRR4302541.3800162/1‑94 (MQ=60)
GTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCT > SRR4302541.4815858/1‑94 (MQ=60)
TACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTC > SRR4302541.3553215/1‑94 (MQ=60)
ACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCC > SRR4302541.7770512/1‑94 (MQ=60)
ACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCC < SRR4302541.1463978/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCA > SRR4302541.5655213/1‑94 (MQ=60)
CCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCA < SRR4302541.5704318/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCA > SRR4302541.5431421/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCATCCGGAGCGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCAC < SRR4302541.1066622/94‑1 (MQ=60)
CCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCAC > SRR4302541.727026/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCAC > SRR4302541.5196235/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGCGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGCCCCCTCCAC > SRR4302541.3476123/1‑94 (MQ=60)
CCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACC < SRR4302541.141898/94‑1 (MQ=60)
CCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACC > SRR4302541.7468648/1‑94 (MQ=60)
CCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTACCCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACC < SRR4302541.3558753/94‑1 (MQ=60)
CCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACC < SRR4302541.6336270/94‑1 (MQ=60)
CCGGCATCCGGAACGCTTCCCGGGGGCGATTAACCTTGTCCGCCAGCCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCTTCCACG > SRR4302541.1261590/1‑94 (MQ=60)
CGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCA > SRR4302541.4019866/1‑94 (MQ=60)
GTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAG > SRR4302541.5319546/1‑94 (MQ=60)
GTCATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAG > SRR4302541.7364708/1‑94 (MQ=60)
GTCATCCGGAACGCTTCACGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAG > SRR4302541.8292700/1‑94 (MQ=60)
CATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAAGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCA > SRR4302541.4790055/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCAC > SRR4302541.1414607/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCAC > SRR4302541.115366/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCAC < SRR4302541.6230560/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCAC > SRR4302541.8767770/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCAC > SRR4302541.1081934/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACG < SRR4302541.4786829/94‑1 (MQ=60)
CGGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCA > SRR4302541.8363977/1‑94 (MQ=60)
CGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACACTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCG > SRR4302541.8598402/1‑94 (MQ=60)
GGAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAG > SRR4302541.6002950/1‑94 (MQ=60)
GAACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGG < SRR4302541.5460797/94‑1 (MQ=60)
AACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGT > SRR4302541.7352938/1‑94 (MQ=60)
AACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGT < SRR4302541.2538942/94‑1 (MQ=60)
AACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGT > SRR4302541.5171089/1‑94 (MQ=60)
AACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGT < SRR4302541.2028425/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTT < SRR4302541.1855689/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCATACGCTCTTCAGGGGAAATCCCCTCCACCAGAATGCGGGTTG > SRR4302541.2521321/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTG > SRR4302541.6084204/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTG > SRR4302541.3317466/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTG > SRR4302541.6290639/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTG > SRR4302541.7648599/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTG > SRR4302541.5161043/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTG > SRR4302541.6534156/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGG < SRR4302541.478427/94‑1 (MQ=60)
TTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGG > SRR4302541.3974268/1‑94 (MQ=60)
TCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGT > SRR4302541.1166053/1‑94 (MQ=60)
CCCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTG > SRR4302541.2497297/1‑94 (MQ=60)
CCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTT > SRR4302541.7735456/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTG < SRR4302541.5587547/94‑1 (MQ=60)
CCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTG < SRR4302541.1942888/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCGTCCACCAGCACGCAGGTcggggctggc > SRR4302541.2577214/1‑84 (MQ=60)
GGGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGC < SRR4302541.6572163/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCG > SRR4302541.3943444/1‑94 (MQ=60)
GATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCG > SRR4302541.2789015/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTAGCCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTATTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGA > SRR4302541.1484477/1‑94 (MQ=60)
|
AGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGA > NC_000913/3806900‑3807086
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |