Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGCAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTCCA > NC_000913/4136429‑4136614
|
GCGCAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCA < SRR4302541.4598332/94‑1 (MQ=60)
GCAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGC > SRR4302541.7230277/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCG > SRR4302541.3658428/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCG < SRR4302541.5256022/94‑1 (MQ=60)
AATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGT < SRR4302541.3520799/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTT < SRR4302541.1557749/94‑1 (MQ=60)
TTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTC < SRR4302541.8364226/94‑1 (MQ=60)
TTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCT < SRR4302541.5814369/94‑1 (MQ=60)
TCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCCCCCACCACTAACCAGCGTTCTG < SRR4302541.2425046/94‑1 (MQ=60)
ACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCA < SRR4302541.9865/94‑1 (MQ=60)
CTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAG > SRR4302541.5066459/1‑94 (MQ=60)
TACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGC < SRR4302541.1970734/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCG < SRR4302541.390724/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCG > SRR4302541.4193809/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCG < SRR4302541.5024558/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGG < SRR4302541.3754713/94‑1 (MQ=60)
CAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGC > SRR4302541.1513976/1‑94 (MQ=60)
AGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCT > SRR4302541.4700175/1‑94 (MQ=60)
GTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTT > SRR4302541.185932/1‑94 (MQ=60)
GTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGCCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTT < SRR4302541.6627775/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCA < SRR4302541.8459041/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCA < SRR4302541.2893370/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAG < SRR4302541.647648/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAG < SRR4302541.7263953/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAG > SRR4302541.4125612/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAG < SRR4302541.8502386/94‑1 (MQ=60)
AGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGG < SRR4302541.5451188/94‑1 (MQ=60)
AGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGG > SRR4302541.3683520/1‑94 (MQ=60)
GCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGT < SRR4302541.3647589/94‑1 (MQ=60)
CATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTA < SRR4302541.2453833/94‑1 (MQ=60)
ATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGCAT > SRR4302541.2338435/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTAT < SRR4302541.448268/94‑1 (MQ=60)
TCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATT > SRR4302541.2273161/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATT < SRR4302541.8310997/94‑1 (MQ=60)
TCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATT > SRR4302541.3978641/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTC > SRR4302541.5062906/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTC < SRR4302541.4412576/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCG < SRR4302541.3990487/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCG < SRR4302541.3739124/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCG < SRR4302541.4429003/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCG < SRR4302541.4327507/94‑1 (MQ=60)
TTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGC > SRR4302541.2792597/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGC > SRR4302541.6060773/1‑94 (MQ=60)
TAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCC < SRR4302541.3839600/94‑1 (MQ=60)
AAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCC > SRR4302541.6869810/1‑94 (MQ=60)
AAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCA < SRR4302541.4729625/94‑1 (MQ=60)
AGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAG > SRR4302541.3167658/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGA < SRR4302541.7685889/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGA > SRR4302541.7379956/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTCTCGACAGTGGATCGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGA > SRR4302541.1662136/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCCCCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGAC < SRR4302541.6368296/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGAC < SRR4302541.6567182/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGAC > SRR4302541.3859697/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACG < SRR4302541.4840828/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGAT < SRR4302541.769705/94‑1 (MQ=60)
TCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATT < SRR4302541.3507319/94‑1 (MQ=60)
TCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATT < SRR4302541.1726578/94‑1 (MQ=60)
TCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATT < SRR4302541.8496276/94‑1 (MQ=60)
TCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATT < SRR4302541.4666135/94‑1 (MQ=60)
CTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTA > SRR4302541.7986834/1‑94 (MQ=60)
CTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTA < SRR4302541.7782189/94‑1 (MQ=60)
CTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTA < SRR4302541.2871945/94‑1 (MQ=60)
CGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAAT > SRR4302541.8871337/1‑94 (MQ=60)
CGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAAT > SRR4302541.8391796/1‑94 (MQ=60)
ACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCA > SRR4302541.6128259/1‑94 (MQ=60)
ACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCA < SRR4302541.2062221/94‑1 (MQ=60)
ACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCA < SRR4302541.2062220/94‑1 (MQ=60)
AGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACA > SRR4302541.8592414/1‑94 (MQ=60)
AGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACA > SRR4302541.6989077/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATC > SRR4302541.3395700/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATA > SRR4302541.6311833/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGACACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATC < SRR4302541.1862309/94‑1 (MQ=60)
GGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCA > SRR4302541.6917220/1‑94 (MQ=60)
GGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCA < SRR4302541.6138711/94‑1 (MQ=60)
GGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCA < SRR4302541.5000865/94‑1 (MQ=60)
GATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAG > SRR4302541.2937827/1‑94 (MQ=60)
GATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAG > SRR4302541.2290712/1‑94 (MQ=60)
GATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAG < SRR4302541.2045631/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACCTCAGCGCC > SRR4302541.5877373/1‑94 (MQ=60)
GAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCC < SRR4302541.4458756/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCC < SRR4302541.5823076/94‑1 (MQ=60)
AGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCC > SRR4302541.862373/1‑94 (MQ=60)
GCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCT < SRR4302541.5938556/94‑1 (MQ=60)
GCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCT < SRR4302541.992218/94‑1 (MQ=60)
GCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCT < SRR4302541.2258810/94‑1 (MQ=60)
CAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTG > SRR4302541.239012/1‑94 (MQ=60)
CAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTG < SRR4302541.3011237/94‑1 (MQ=60)
AAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCTCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGG > SRR4302541.8259021/1‑94 (MQ=60)
AAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGG > SRR4302541.4956723/1‑94 (MQ=60)
AAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGG > SRR4302541.5434852/1‑94 (MQ=60)
AAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGG < SRR4302541.5983926/94‑1 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT > SRR4302541.2503824/1‑94 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT < SRR4302541.6940829/94‑1 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT < SRR4302541.1898923/94‑1 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT > SRR4302541.3666595/1‑94 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGGATTCGCCCGGACGATTAATTACATCAGCGCCCTGGAT > SRR4302541.690933/1‑94 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT > SRR4302541.5040649/1‑94 (MQ=60)
AACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGAT > SRR4302541.43673/1‑94 (MQ=60)
ACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATG < SRR4302541.4633046/94‑1 (MQ=60)
ACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATG > SRR4302541.5241023/1‑94 (MQ=60)
CCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGT < SRR4302541.2332186/94‑1 (MQ=60)
CCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGT < SRR4302541.1721132/94‑1 (MQ=60)
CTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTA > SRR4302541.2320816/1‑94 (MQ=60)
CTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTA < SRR4302541.5466585/94‑1 (MQ=60)
CTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTA > SRR4302541.5234929/1‑94 (MQ=60)
TAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTAT < SRR4302541.3973395/94‑1 (MQ=60)
TAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTAT < SRR4302541.403734/94‑1 (MQ=60)
AAACAAATTTGTCCCCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTT < SRR4302541.2363525/94‑1 (MQ=60)
AAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTT > SRR4302541.1246628/1‑94 (MQ=60)
AAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTT > SRR4302541.4920812/1‑94 (MQ=60)
ACAAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTAC > SRR4302541.6098246/1‑94 (MQ=60)
ACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTAC < SRR4302541.1107301/94‑1 (MQ=60)
AAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCC < SRR4302541.6964500/94‑1 (MQ=60)
AAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCC < SRR4302541.5436865/94‑1 (MQ=60)
AAATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCC < SRR4302541.4963448/94‑1 (MQ=60)
AAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCC > SRR4302541.2156986/1‑94 (MQ=60)
AATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCG < SRR4302541.2966867/94‑1 (MQ=60)
AATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCG > SRR4302541.305947/1‑94 (MQ=60)
AATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCG > SRR4302541.3187161/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGG < SRR4302541.3919516/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTCCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGG < SRR4302541.4833324/94‑1 (MQ=60)
ATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGG < SRR4302541.1405912/94‑1 (MQ=60)
TTTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGT < SRR4302541.2446746/94‑1 (MQ=60)
TTGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTG < SRR4302541.4996226/94‑1 (MQ=60)
TTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTG < SRR4302541.3061105/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGA < SRR4302541.8414939/94‑1 (MQ=60)
TCACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATT < SRR4302541.983266/94‑1 (MQ=60)
TCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATT > SRR4302541.2061423/1‑94 (MQ=60)
CACCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTG > SRR4302541.2887011/1‑94 (MQ=60)
CACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTG > SRR4302541.3747990/1‑94 (MQ=60)
CCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAA > SRR4302541.183069/1‑94 (MQ=60)
CCCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAA < SRR4302541.5551836/94‑1 (MQ=60)
CCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAA < SRR4302541.1538908/94‑1 (MQ=60)
CCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAAT > SRR4302541.2558910/1‑94 (MQ=60)
CCACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAAT < SRR4302541.6999705/94‑1 (MQ=60)
CACCGCTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATGCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATA < SRR4302541.6556897/94‑1 (MQ=60)
CACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATA < SRR4302541.1227669/94‑1 (MQ=60)
CACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCAAATCAGCGCACTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATA > SRR4302541.5273815/1‑94 (MQ=60)
CACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATA < SRR4302541.7438639/94‑1 (MQ=60)
ACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAA > SRR4302541.5602737/1‑94 (MQ=60)
ACCACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAA > SRR4302541.6057394/1‑94 (MQ=60)
ACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTTAATAA > SRR4302541.6858156/1‑94 (MQ=60)
CCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAAT < SRR4302541.5450658/94‑1 (MQ=60)
CCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCGTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAAT < SRR4302541.5450659/94‑1 (MQ=60)
CACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATG < SRR4302541.1732044/94‑1 (MQ=60)
CACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATG < SRR4302541.4007742/94‑1 (MQ=60)
CACTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATG < SRR4302541.3843102/94‑1 (MQ=60)
CCTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTAAATAATGC < SRR4302541.8059416/94‑1 (MQ=60)
ACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGC > SRR4302541.129682/1‑94 (MQ=60)
CTAACCGGCTTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCG < SRR4302541.8257459/94‑1 (MQ=60)
CTAACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCG > SRR4302541.8101531/1‑94 (MQ=60)
TAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGG < SRR4302541.5854185/94‑1 (MQ=60)
AACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGT < SRR4302541.57366/94‑1 (MQ=60)
AACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGT > SRR4302541.2605157/1‑94 (MQ=60)
ACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTC < SRR4302541.3555165/94‑1 (MQ=60)
ACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTC < SRR4302541.3554916/94‑1 (MQ=60)
ACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTC > SRR4302541.5332050/1‑94 (MQ=60)
ACCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTC < SRR4302541.548968/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTC > SRR4302541.3732954/1‑94 (MQ=60)
CCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTCC < SRR4302541.7903594/94‑1 (MQ=60)
CCGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTCC > SRR4302541.5070473/1‑94 (MQ=60)
CGGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTCCA > SRR4302541.8907115/1‑94 (MQ=60)
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GCGCAATTTCTACTACCAGTCCAGCATCTTTAAAGCTTTTCTCGACAGTGGATTGAGCAAAACCTAAAACAAATTTGTCACCCACCACTAACCAGCGTTCTGCCAGCGGCTTCAGGTATTCGCCCAGACGATTAATCACATCAGCGCCCTGGATGTATTTACCCGGTGATTGAATAATGCGGTCCA > NC_000913/4136429‑4136614
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
