Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTG > NC_000913/4185035‑4185220
|
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TGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTG < SRR4302541.2216258/94‑1 (MQ=60)
GAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGG < SRR4302541.8057216/94‑1 (MQ=60)
GAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGG < SRR4302541.4032155/94‑1 (MQ=60)
GAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGG > SRR4302541.5654000/1‑94 (MQ=60)
AAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGC < SRR4302541.1152816/94‑1 (MQ=60)
AAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGC > SRR4302541.1731212/1‑94 (MQ=60)
CCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACA < SRR4302541.7168243/94‑1 (MQ=60)
CGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAG > SRR4302541.5089084/1‑94 (MQ=60)
CGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAG > SRR4302541.8310742/1‑94 (MQ=60)
GTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGA < SRR4302541.8782335/94‑1 (MQ=60)
GTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGA > SRR4302541.2288512/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGAT > SRR4302541.6549991/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGAT < SRR4302541.8732547/94‑1 (MQ=60)
GATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATT > SRR4302541.498998/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTC > SRR4302541.275833/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTC > SRR4302541.3869417/1‑94 (MQ=60)
TTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCG < SRR4302541.173079/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCG > SRR4302541.704990/1‑94 (MQ=60)
TAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGT < SRR4302541.999142/94‑1 (MQ=60)
TAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGT < SRR4302541.666130/94‑1 (MQ=60)
TAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGT < SRR4302541.5983395/94‑1 (MQ=60)
AACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTC > SRR4302541.6971014/1‑94 (MQ=60)
AACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTC > SRR4302541.3792757/1‑94 (MQ=60)
AACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTC > SRR4302541.3415531/1‑94 (MQ=60)
AACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTC > SRR4302541.96553/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCA < SRR4302541.6085911/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCA < SRR4302541.3345755/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCA < SRR4302541.3046064/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCA > SRR4302541.2101259/1‑94 (MQ=60)
CCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAG < SRR4302541.962065/94‑1 (MQ=60)
CGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCGGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCTGC > SRR4302541.4634107/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGC > SRR4302541.7843710/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGC > SRR4302541.8602987/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGC > SRR4302541.4633852/1‑94 (MQ=60)
CGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTAGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGC < SRR4302541.3743204/94‑1 (MQ=60)
GTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCT < SRR4302541.2028771/94‑1 (MQ=60)
TGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTT > SRR4302541.1860936/1‑94 (MQ=60)
GACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTG > SRR4302541.5172555/1‑94 (MQ=60)
GACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTG < SRR4302541.3218533/94‑1 (MQ=60)
GACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTG < SRR4302541.6977314/94‑1 (MQ=60)
GACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTG < SRR4302541.1086565/94‑1 (MQ=60)
CGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCT > SRR4302541.202513/1‑94 (MQ=60)
CGCTCAGGAAGACAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCCACATGATGGCCCACTCCCGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCT < SRR4302541.6657309/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG > SRR4302541.1562212/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG > SRR4302541.5686535/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG < SRR4302541.2573388/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG > SRR4302541.377704/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG > SRR4302541.5691097/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTG < SRR4302541.2675274/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGG < SRR4302541.905944/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGG > SRR4302541.2046054/1‑94 (MQ=60)
TCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGT < SRR4302541.7142170/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGT < SRR4302541.4494281/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGT > SRR4302541.5912518/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTA < SRR4302541.3737478/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTA > SRR4302541.907029/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTAT > SRR4302541.2263146/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTAT > SRR4302541.5786831/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGC > SRR4302541.7078542/1‑94 (MQ=60)
AAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCG > SRR4302541.7326244/1‑94 (MQ=60)
AAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCG > SRR4302541.1877108/1‑94 (MQ=60)
AGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGT < SRR4302541.664907/94‑1 (MQ=60)
AGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCACGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGG > SRR4302541.4043821/1‑94 (MQ=60)
GAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTG < SRR4302541.7654174/94‑1 (MQ=60)
GAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGAG < SRR4302541.5766327/94‑1 (MQ=60)
AGAAGCAGGTTTCCTTAAACAGCATCCTCATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGG < SRR4302541.5144377/94‑1 (MQ=60)
GAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT > SRR4302541.6886435/1‑94 (MQ=60)
GAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGT < SRR4302541.4896576/94‑1 (MQ=60)
AAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTC > SRR4302541.4600059/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTC > SRR4302541.3423243/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCTCAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTC > SRR4302541.411151/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTC > SRR4302541.2802959/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCT > SRR4302541.920259/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGA < SRR4302541.7935395/94‑1 (MQ=60)
ctGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGTCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGAT < SRR4302541.591961/92‑1 (MQ=60)
AGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGAT < SRR4302541.4099647/94‑1 (MQ=60)
AGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGAT < SRR4302541.2577741/94‑1 (MQ=60)
AGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGAT < SRR4302541.591959/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGC < SRR4302541.3810094/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCG < SRR4302541.2462632/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCG < SRR4302541.852670/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCG < SRR4302541.852669/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATTCGTGGTCTGATGGCGA > SRR4302541.6528266/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGA < SRR4302541.8673556/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGA < SRR4302541.5818576/94‑1 (MQ=60)
TCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAA < SRR4302541.7491436/94‑1 (MQ=60)
CCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAG > SRR4302541.7651031/1‑94 (MQ=60)
CCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAA < SRR4302541.3520521/94‑1 (MQ=60)
CTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAG < SRR4302541.284649/94‑1 (MQ=60)
CTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAG > SRR4302541.5953918/1‑94 (MQ=60)
TTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGC > SRR4302541.5445982/1‑94 (MQ=60)
TCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCC < SRR4302541.743885/94‑1 (MQ=60)
TCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCC < SRR4302541.6701144/94‑1 (MQ=60)
TCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCC < SRR4302541.954038/94‑1 (MQ=60)
AACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGG > SRR4302541.3406812/1‑94 (MQ=60)
ACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGA > SRR4302541.109511/1‑94 (MQ=60)
CAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGAT < SRR4302541.4985774/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGAT > SRR4302541.4803750/1‑94 (MQ=60)
AGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATG > SRR4302541.6144864/1‑94 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC < SRR4302541.1705122/94‑1 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC > SRR4302541.2673523/1‑94 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC < SRR4302541.418693/94‑1 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC > SRR4302541.6322685/1‑94 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC < SRR4302541.5312777/94‑1 (MQ=60)
CATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGC > SRR4302541.133813/1‑94 (MQ=60)
ATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCT > SRR4302541.2814556/1‑94 (MQ=60)
ATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCT < SRR4302541.3531221/94‑1 (MQ=60)
CTACATGTTGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC > SRR4302541.8725984/1‑94 (MQ=60)
CTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC < SRR4302541.7327128/94‑1 (MQ=60)
CTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC < SRR4302541.7327129/94‑1 (MQ=60)
CTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC < SRR4302541.8616256/94‑1 (MQ=60)
CTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC > SRR4302541.433217/1‑94 (MQ=60)
CTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCC < SRR4302541.2297332/94‑1 (MQ=60)
TACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGCGTGGCTCCA > SRR4302541.504814/1‑94 (MQ=60)
TACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGGGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCA > SRR4302541.7887597/1‑94 (MQ=60)
TACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCA > SRR4302541.2050558/1‑94 (MQ=60)
CATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATC > SRR4302541.4776015/1‑94 (MQ=60)
CATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATC > SRR4302541.3679022/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCA < SRR4302541.236669/94‑1 (MQ=60)
ATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCCTGCTGGTATGCGTGGCCTGATGGCGAAGCGGAATGGCTCCATCA > SRR4302541.2449058/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCC > SRR4302541.5743883/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCAT < SRR4302541.7397265/94‑1 (MQ=60)
GATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCGGCGGCACAGATTGGTCAGCTTGCTGGTAGGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATC < SRR4302541.8179117/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCG < SRR4302541.8243854/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCG < SRR4302541.3973268/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCG < SRR4302541.6018300/94‑1 (MQ=60)
GCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAA < SRR4302541.6238429/94‑1 (MQ=60)
CCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAC > SRR4302541.1679715/1‑94 (MQ=60)
CCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAC < SRR4302541.7939850/94‑1 (MQ=60)
CCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAC > SRR4302541.1955132/1‑94 (MQ=60)
CGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGTGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACG < SRR4302541.8871826/94‑1 (MQ=60)
CGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGCTGGCTCCATCATCGAAACG > SRR4302541.1192961/1‑94 (MQ=60)
CGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACG > SRR4302541.7314523/1‑94 (MQ=60)
CGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACG < SRR4302541.829642/94‑1 (MQ=60)
CGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACG > SRR4302541.4796357/1‑94 (MQ=60)
GACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGC > SRR4302541.7672047/1‑94 (MQ=60)
GACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGC > SRR4302541.6435989/1‑94 (MQ=60)
GACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGC > SRR4302541.38042/1‑94 (MQ=60)
ACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCC > SRR4302541.1899722/1‑94 (MQ=60)
ACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCC > SRR4302541.5373374/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAA < SRR4302541.1640923/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAAT < SRR4302541.46505/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAAT < SRR4302541.5663406/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAAT > SRR4302541.5699265/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATC < SRR4302541.7655074/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATC < SRR4302541.831360/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATC > SRR4302541.6862933/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCTGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCA < SRR4302541.6756034/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGCGTGGGTCTGCCGCACAGATTCGTCAGCTGGCTTGGATGTGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATTA < SRR4302541.2764629/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCCCCATCATCGAAACGCCAATCAC > SRR4302541.1050937/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACC < SRR4302541.1780722/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACC < SRR4302541.6524223/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACC < SRR4302541.8416703/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCG < SRR4302541.4466143/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCG < SRR4302541.196272/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTACTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGC < SRR4302541.3622131/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGC < SRR4302541.7709925/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGC > SRR4302541.8801126/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGC > SRR4302541.6558664/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCG > SRR4302541.6230361/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAA > SRR4302541.4371730/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAAC < SRR4302541.2955447/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAAC < SRR4302541.1893245/94‑1 (MQ=60)
GGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACT > SRR4302541.4676167/1‑94 (MQ=60)
TCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCC < SRR4302541.465523/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCG > SRR4302541.6271951/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCG < SRR4302541.7866703/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCG < SRR4302541.6559501/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGT > SRR4302541.7594958/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGGGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGT < SRR4302541.8567579/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGT > SRR4302541.1341070/1‑94 (MQ=60)
GTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTG < SRR4302541.782060/94‑1 (MQ=60)
GCGGCACAGCTTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTCCCGTG > SRR4302541.7656449/1‑94 (MQ=60)
GCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTG < SRR4302541.4378162/94‑1 (MQ=60)
|
CTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTG > NC_000913/4185035‑4185220
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
