Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,237,242 |
+C |
intergenic (+55/‑342) |
ygjT → / → ygjU |
putative transport protein/putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 100.0%
| 407.6
/ NA
| 120 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (84/36); total (84/36) |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑C‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325
|
cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct < 2:5720925/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct > 2:2949147/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct > 2:2997216/1‑93 (MQ=255)
gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc > 2:6374078/1‑93 (MQ=255)
gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc > 1:3657380/1‑93 (MQ=255)
gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc > 1:1900880/1‑93 (MQ=255)
ggTGAGTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc < 1:672603/93‑2 (MQ=255)
ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc > 2:2281753/1‑92 (MQ=255)
ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc > 1:912814/1‑92 (MQ=255)
ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc < 1:2147686/93‑2 (MQ=255)
ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc < 2:3818389/93‑2 (MQ=255)
ggTGAATTATCAGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc > 1:3952348/1‑92 (MQ=255)
gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccct > 1:2060476/1‑91 (MQ=255)
tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctc < 2:2726723/93‑4 (MQ=255)
tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctc < 2:5224530/93‑4 (MQ=255)
tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctc > 1:5700370/1‑90 (MQ=255)
gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctct < 2:3629392/93‑5 (MQ=255)
gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctct < 1:3983888/93‑5 (MQ=255)
ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑cc < 2:4602558/93‑2 (MQ=255)
ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑cc < 2:975691/93‑2 (MQ=255)
ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑cc > 2:4336970/1‑92 (MQ=255)
aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑cctt > 1:1006741/1‑90 (MQ=255)
aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑cctt > 1:1626104/1‑90 (MQ=255)
tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑ccttc < 2:3628059/93‑5 (MQ=255)
tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑c‑ccttc < 2:3570012/93‑5 (MQ=255)
gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAg < 1:4214941/93‑1 (MQ=255)
gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAg > 2:4766934/1‑93 (MQ=255)
gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAg < 1:5383870/93‑1 (MQ=255)
aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAggg > 2:3457148/1‑93 (MQ=255)
aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAggg > 2:1369306/1‑93 (MQ=255)
aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAggg < 2:5668104/93‑1 (MQ=255)
aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAggg > 1:3166999/1‑93 (MQ=255)
tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTGCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGga < 2:5964014/93‑1 (MQ=255)
tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGga > 1:6338043/1‑93 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGagag > 1:1809139/1‑93 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGagag < 1:1615308/93‑1 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGagag < 1:627278/93‑1 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGagag < 1:338584/93‑1 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGagag < 2:1542325/93‑1 (MQ=255)
tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGCGagag > 2:3571315/1‑93 (MQ=255)
agcagcGGGGTGGATAATTTTTACTCTGCCTAAGCCGTGTACCCGGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAggg < 2:872577/93‑1 (MQ=255)
agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAggg > 1:495063/1‑93 (MQ=255)
gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAggga > 1:6477598/1‑92 (MQ=255)
gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGt < 2:2550515/93‑1 (MQ=255)
gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGt > 2:2369892/1‑93 (MQ=255)
gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGt > 1:1709522/1‑93 (MQ=255)
acagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGt < 1:4919984/92‑1 (MQ=255)
cggcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTc < 2:2596970/91‑1 (MQ=255)
agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑CACTTCCAGGGAGAGGGTCg > 1:2079567/1‑93 (MQ=255)
gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 2:3209272/1‑93 (MQ=255)
gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 2:6451086/93‑1 (MQ=255)
gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 1:1092385/1‑93 (MQ=255)
cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 1:720092/93‑1 (MQ=255)
cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCggg > 2:4437917/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgggg < 1:1722079/93‑1 (MQ=255)
ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 2:50435/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:4364536/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 2:3831946/1‑93 (MQ=255)
gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 1:5012527/1‑92 (MQ=255)
gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 2:506478/93‑1 (MQ=255)
ggTGGATATTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCCCCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg < 1:4705968/93‑1 (MQ=255)
ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg < 1:1408103/93‑1 (MQ=255)
gTGGATATTTTTTAATCTGCCTAAGCCGGTTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:5672690/93‑1 (MQ=255)
gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTgg > 1:3343789/1‑92 (MQ=255)
gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:3148480/93‑1 (MQ=255)
ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:3237825/1‑93 (MQ=39)
gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 1:3916364/1‑93 (MQ=38)
aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGt > 2:4032086/1‑93 (MQ=38)
aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:632213/1‑93 (MQ=38)
tAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTc > 1:5812203/1‑93 (MQ=38)
aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTcc > 2:613532/1‑92 (MQ=37)
tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:1130690/1‑93 (MQ=38)
tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGCAATTTTTCGCAcc > 2:1918142/1‑93 (MQ=38)
ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 1:1151793/1‑93 (MQ=38)
ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 2:2948496/1‑93 (MQ=37)
cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 1:5695922/1‑93 (MQ=38)
aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:5259217/1‑93 (MQ=38)
aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:2931255/1‑93 (MQ=37)
aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCt > 2:4527483/1‑93 (MQ=38)
aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGAAATTTTTCGCACCGATGcg > 2:4292247/1‑92 (MQ=38)
aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCt > 1:5507222/1‑93 (MQ=38)
gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 2:4116955/1‑93 (MQ=38)
tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:4152894/1‑93 (MQ=37)
gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:6004925/1‑93 (MQ=37)
aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 2:2279925/1‑93 (MQ=37)
cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 2:4804220/1‑93 (MQ=38)
cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 2:3114435/1‑93 (MQ=37)
cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 1:3725374/1‑93 (MQ=37)
cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGAGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 1:5747398/1‑93 (MQ=37)
cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtcc > 1:3662333/1‑93 (MQ=37)
tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 1:6319542/1‑93 (MQ=37)
gTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCt > 2:1759268/1‑93 (MQ=37)
tCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccccc > 1:3984480/1‑91 (MQ=25)
ttAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTTAcc > 2:1913268/1‑93 (MQ=21)
aTGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAc > 2:906692/1‑93 (MQ=21)
gAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGGGTGTCGGGTTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAccc < 1:6062909/93‑1 (MQ=18)
gAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCtcaccctcaccc > 2:6182086/1‑93 (MQ=21)
ccGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCCCCCCCCAACCCTCTcc > 2:6073646/1‑93 (MQ=18)
gTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc > 2:1105308/1‑93 (MQ=18)
ttttCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCa > 1:848093/1‑93 (MQ=18)
|
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑C‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑C‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGC > NC_000913/3237149‑3237333
|
TGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CC > SRR4302534.3755677/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CC > SRR4302534.1950456/1‑94 (MQ=60)
GGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCC > SRR4302534.936029/1‑94 (MQ=60)
GGGTGAATTATCAGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCC > SRR4302534.4058148/1‑94 (MQ=60)
GGTGAGTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCct < SRR4302534.689002/94‑3 (MQ=60)
GGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCct < SRR4302534.2204361/94‑3 (MQ=60)
GGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCct > SRR4302534.2114342/1‑92 (MQ=60)
GTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACTTGAGCACCGTCTTCT‑CC‑CT‑C < SRR4302534.6493471/94‑1 (MQ=60)
GTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CC‑CT‑C > SRR4302534.5854785/1‑94 (MQ=60)
GAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑C > SRR4302534.5396966/1‑94 (MQ=60)
GAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑C < SRR4302534.4090503/94‑1 (MQ=60)
GAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑C > SRR4302534.2633310/1‑94 (MQ=60)
GAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑C < SRR4302534.2052205/94‑1 (MQ=60)
AATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCctcttc > SRR4302534.2974405/1‑88 (MQ=60)
TTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCctctccct < SRR4302534.4066216/94‑9 (MQ=60)
TATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCctctccctt > SRR4302534.1032570/1‑85 (MQ=60)
TATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCctctccctt > SRR4302534.1668530/1‑85 (MQ=60)
TATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCccctccctt < SRR4302534.321649/94‑10 (MQ=60)
TATCGGCATGATAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATTAGCACCGTTTTCT‑CCctctccctt > SRR4302534.1800782/1‑85 (MQ=60)
CGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCA < SRR4302534.4739798/94‑1 (MQ=60)
GGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAG > SRR4302534.1561340/1‑94 (MQ=60)
GCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGG < SRR4302534.5528890/94‑1 (MQ=60)
GCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGG < SRR4302534.4328623/94‑1 (MQ=60)
GCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGG < SRR4302534.6058574/94‑1 (MQ=60)
CATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGG > SRR4302534.3250526/1‑94 (MQ=60)
ATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGA > SRR4302534.6509248/1‑94 (MQ=60)
ATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAG > SRR4302534.1856111/1‑94 (MQ=60)
ATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAG < SRR4302534.3924457/94‑1 (MQ=60)
TAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGG < SRR4302534.642493/94‑1 (MQ=60)
TAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGG > SRR4302534.5870290/1‑94 (MQ=60)
TAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGG < SRR4302534.347249/94‑1 (MQ=60)
TAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGG < SRR4302534.1657457/94‑1 (MQ=60)
AAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGG > SRR4302534.507417/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGG > SRR4302534.3773635/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGT > SRR4302534.1753942/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGA > SRR4302534.6652155/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTC < SRR4302534.4091154/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTC < SRR4302534.856048/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTC < SRR4302534.3654113/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTC < SRR4302534.5053326/94‑1 (MQ=60)
CAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCT‑CACTTCCAGGGAGAGGGTCG > SRR4302534.2134028/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGG > SRR4302534.1792176/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGG > SRR4302534.1120801/1‑94 (MQ=60)
GCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGG < SRR4302534.6470383/94‑1 (MQ=60)
CGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGG > SRR4302534.4482215/1‑94 (MQ=60)
CGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGG < SRR4302534.2109805/94‑1 (MQ=60)
CGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGG > SRR4302534.5035834/1‑94 (MQ=60)
CGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGG > SRR4302534.2635123/1‑94 (MQ=60)
CGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGG < SRR4302534.737857/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGT < SRR4302534.1766823/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGG > SRR4302534.5148006/1‑94 (MQ=60)
GGTGGATATTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCCCCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGA < SRR4302534.4833717/94‑1 (MQ=60)
GGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGA < SRR4302534.1445143/94‑1 (MQ=60)
GGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGG > SRR4302534.3433287/1‑94 (MQ=60)
TGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG > SRR4302534.3323961/1‑94 (MQ=60)
TGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG < SRR4302534.682288/94‑1 (MQ=60)
GGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGG > SRR4302534.4021355/1‑94 (MQ=60)
AATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAT > SRR4302534.647553/1‑94 (MQ=60)
TTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTC > SRR4302534.5969956/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCA > SRR4302534.522509/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACC > SRR4302534.6352204/1‑94 (MQ=60)
TGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCG > SRR4302534.5107558/1‑94 (MQ=60)
GCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGA > SRR4302534.1181982/1‑94 (MQ=60)
CCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAT > SRR4302534.5850223/1‑94 (MQ=60)
CTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATG > SRR4302534.1147076/1‑94 (MQ=60)
TAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGC > SRR4302534.4350200/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCT > SRR4302534.3324678/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCT > SRR4302534.5655762/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTG > SRR4302534.984278/1‑94 (MQ=60)
GTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCT > SRR4302534.2121639/1‑94 (MQ=60)
GTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCT > SRR4302534.4265004/1‑94 (MQ=60)
TGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG > SRR4302534.6168051/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTC > SRR4302534.5807188/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTC > SRR4302534.3825511/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGAGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTC > SRR4302534.5903234/1‑94 (MQ=60)
CCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCC > SRR4302534.3760759/1‑94 (MQ=60)
CTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCC > SRR4302534.6490318/1‑94 (MQ=60)
GTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCCC > SRR4302534.4091105/1‑94 (MQ=60)
ATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGgtccacccccc > SRR4302534.3505907/1‑83 (MQ=60)
TAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCtcactcccc > SRR4302534.5106950/1‑85 (MQ=60)
GAGCACCGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGGGTGTCGGGTTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCT < SRR4302534.6227763/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTttcctcacccccctcccatcccc > SRR4302534.197531/1‑71 (MQ=60)
GTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > SRR4302534.869469/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTttcctccccccccccccccccccc > SRR4302534.2370354/1‑70 (MQ=60)
GTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTttcccccccccccccccccccccc > SRR4302534.122819/1‑70 (MQ=60)
GTTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGACGGGGAGAGGGAAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > SRR4302534.1695554/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTCCCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGGCGGGGGGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTcctgctcctgacaccagacctgtgccca > SRR4302534.1425027/1‑66 (MQ=41)
CCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTttcctcccccccccccccccccccccccccgc > SRR4302534.2320148/1‑62 (MQ=60)
CCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCTCcccccccccccccccccccaccacgc > SRR4302534.1326037/1‑68 (MQ=60)
CCTCTCC‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGC > SRR4302534.1082212/1‑94 (MQ=60)
|
TGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑C‑CTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGC > NC_000913/3237149‑3237333
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
