Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,405,394 |
A→G |
T51A (ACG→GCG) |
b3258 → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,405,394 | 0 | A | G | 99.6%
| 745.8
/ ‑4.9
| 222 | T51A (ACG→GCG) | b3258 | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (96/125); total (97/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCG > NC_000913/3405304‑3405483
|
tttATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGgcgc < 2:90911/93‑1 (MQ=255)
tttATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGgcgc > 2:4806700/1‑93 (MQ=255)
tttATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGgcgc > 2:1428537/1‑93 (MQ=255)
ttATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCt < 2:5359972/93‑1 (MQ=255)
tATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTc > 1:5089814/1‑93 (MQ=255)
cgatgcgTAAACGGCGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACcg < 1:4914479/93‑1 (MQ=255)
cgatgcgTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACcg < 1:6033409/93‑1 (MQ=255)
gatgcgTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACcgc > 1:1223720/1‑93 (MQ=255)
gatgcgTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACcgc < 2:6472577/93‑1 (MQ=255)
gatgcgTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACcgc > 1:3957585/1‑93 (MQ=255)
cgTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGAcc > 1:3748616/1‑93 (MQ=255)
gTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGTTCACCGCCACCt > 2:2353922/1‑93 (MQ=255)
gTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCt < 2:4638777/93‑1 (MQ=255)
tAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCta < 1:1141445/93‑1 (MQ=255)
tAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCta < 1:5900908/93‑1 (MQ=255)
aCGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTatat < 2:3241688/93‑1 (MQ=255)
aCGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTatat > 2:6447106/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATc > 1:2759514/1‑93 (MQ=255)
ccGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCa < 1:3002104/93‑1 (MQ=255)
ccGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCa > 2:89413/1‑93 (MQ=255)
ggCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt > 1:4806791/1‑93 (MQ=255)
ggCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt < 2:1955061/93‑1 (MQ=255)
ggCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt < 2:1712283/93‑1 (MQ=255)
ggCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt < 2:5415359/93‑1 (MQ=255)
gCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGtt < 1:4776122/93‑1 (MQ=255)
gCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGtt < 1:3804120/93‑1 (MQ=255)
cccttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCg < 2:1789779/92‑1 (MQ=255)
aCCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCg > 1:276479/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCg > 2:3317472/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCg > 1:4710408/1‑93 (MQ=255)
ccttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGt > 1:2593827/1‑93 (MQ=255)
ccttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGt < 1:1788502/93‑1 (MQ=255)
cttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGtt < 1:4097363/93‑1 (MQ=255)
cttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGtt > 1:5474931/1‑93 (MQ=255)
cttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGtt < 2:4726913/93‑1 (MQ=255)
ttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGttt > 2:2434550/1‑93 (MQ=255)
ttccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGCATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGttt > 2:6052921/1‑93 (MQ=255)
tccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTa > 1:507385/1‑93 (MQ=255)
tccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTa < 1:6272525/93‑1 (MQ=255)
tccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTa < 1:2054599/93‑1 (MQ=255)
tccttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTa > 1:3375842/1‑93 (MQ=255)
cttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc > 2:5474865/1‑93 (MQ=255)
cttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc < 1:2474832/93‑1 (MQ=255)
cttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc > 2:2905363/1‑93 (MQ=255)
cttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc < 1:2634953/93‑1 (MQ=255)
cttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc < 1:3264606/93‑1 (MQ=255)
ttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcg < 2:933434/93‑1 (MQ=255)
ttAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcg < 2:2701115/93‑1 (MQ=255)
tAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcgg < 2:3907976/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcggc > 1:1531065/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCCGTGCCAGTTCGACTATcggcg > 2:1043114/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcggcg > 1:3845148/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcggcg < 2:365350/93‑1 (MQ=255)
aTGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcggcg > 1:5402990/1‑93 (MQ=255)
gTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGcc < 1:5684845/93‑1 (MQ=255)
tATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCa > 1:4415580/1‑93 (MQ=255)
tATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCa < 2:4120777/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAg < 2:2222486/93‑1 (MQ=255)
tttCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAgg > 2:5945597/1‑93 (MQ=255)
ttCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAggg > 1:134610/1‑92 (MQ=255)
tCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAg < 2:1976490/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgc < 2:4671911/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgc > 2:4318969/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgct < 2:2820594/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGGgctgct > 1:4950052/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCGGGAgatgct > 1:3207432/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCtt > 2:6230746/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCtt < 2:5772282/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTta < 2:3070588/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTtat < 1:5554942/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGGTtatt > 1:5897597/1‑92 (MQ=255)
gCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGGGCTGCTtata > 1:4349288/1‑93 (MQ=255)
ccGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATaa > 1:1087755/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATaaa < 2:3533929/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCGTATaaaa > 1:6292546/1‑92 (MQ=255)
tctATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGGGCTGCTTTTAAATaa > 1:1482207/1‑92 (MQ=255)
tctATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGGTGCTTATAAATaa > 2:5113190/1‑92 (MQ=255)
tctATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATaa > 1:855121/1‑92 (MQ=255)
tATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCTTATTAATACgg > 2:4978704/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggc < 2:5503237/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctg < 2:4564291/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctg < 1:4170134/93‑1 (MQ=255)
gCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctgg < 1:2454280/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCTTTTAAATACgggctgggc > 1:572653/1‑93 (MQ=255)
ggTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctgggc < 2:4071736/93‑1 (MQ=255)
gTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctgggct < 1:3539054/93‑1 (MQ=255)
gTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctgggct > 1:1727266/1‑93 (MQ=255)
tATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGCGCTGCTTATAAATACggggtgggcgg > 2:5736470/1‑91 (MQ=255)
tATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGggctgggctg < 1:2128007/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGAGCTGCTTATAAATACgggctgggcttg > 2:5624116/1‑91 (MQ=255)
aTTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGgctgggctgg < 1:1761178/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGgctgggctgg < 1:2341170/93‑1 (MQ=255)
ttGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTCTATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGTAACTGGTGCAGCTTATATATAACTGctgggcaggg > 1:3023921/1‑93 (MQ=255)
ttGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTTTTAATACCGGctgggccggg > 1:4602561/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTAtt < 2:1770464/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGGTGCTTTTCAATACGGGCTGGGGTGGGGAtttgt > 2:374061/1‑90 (MQ=255)
ggCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTATTGCt < 2:1084666/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTATTGCt < 1:1498906/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTATTGCt < 2:2572029/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGGTGGGGATTGCTTGCg > 1:201075/1‑93 (MQ=255)
|
GTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCG > NC_000913/3405304‑3405483
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCGATG > NC_000913/3405301‑3405486
|
TCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGG < SRR4302534.4540135/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGG < SRR4302534.3507856/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGC < SRR4302534.966543/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGC > SRR4302534.4071184/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGC < SRR4302534.388019/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGC < SRR4302534.1320509/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGC < SRR4302534.3542805/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGTCAGCCGCTCTATGGTCGGTATTGTGCTGGCGATGGCG > SRR4302534.1273630/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCG < SRR4302534.5895921/94‑1 (MQ=60)
TCTATGCGATGGGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTCTTGTGCTGGCGATGGCGCT < SRR4302534.1499504/94‑1 (MQ=60)
TTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTC > SRR4302534.5227199/1‑94 (MQ=60)
TTATGCGATGCGTAAACGCAGCACCGTCACCTTCCTTAATGAGTATTCCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTC < SRR4302534.4204598/94‑1 (MQ=60)
TATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCA > SRR4302534.3928792/1‑94 (MQ=60)
TATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCA > SRR4302534.1445355/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCAC > SRR4302534.1536935/1‑94 (MQ=60)
TGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACC < SRR4302534.1635971/94‑1 (MQ=60)
GCGATGCGTAATCGGAGCACCGGCACCTTTCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCAATGGCGCTCACCG < SRR4302534.5738194/94‑1 (MQ=60)
GCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCA < SRR4302534.3002533/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGTAAACGGCGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGC < SRR4302534.5047679/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGC < SRR4302534.6197370/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGC > SRR4302534.4063559/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGC > SRR4302534.302905/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGC > SRR4302534.1255945/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGA < SRR4302534.4477480/94‑1 (MQ=60)
GCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACC > SRR4302534.3849307/1‑94 (MQ=60)
GTAAAGGGAGCACCGGCCCCTTCCTTAAGGAGTACTCCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTA < SRR4302534.900314/94‑1 (MQ=60)
TAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTAT < SRR4302534.6061123/94‑1 (MQ=60)
TAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTAT < SRR4302534.1171331/94‑1 (MQ=60)
AAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATA < SRR4302534.188513/94‑1 (MQ=60)
ACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATC > SRR4302534.2832199/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCA > SRR4302534.5899426/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCA < SRR4302534.3099917/94‑1 (MQ=60)
GGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAG > SRR4302534.364989/1‑94 (MQ=60)
GGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAG > SRR4302534.6506743/1‑94 (MQ=60)
CACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCC > SRR4302534.1951658/1‑94 (MQ=60)
CCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAG < SRR4302534.3080627/94‑1 (MQ=60)
CGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGT > SRR4302534.4937288/1‑94 (MQ=60)
CGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGT > SRR4302534.4481244/1‑94 (MQ=60)
GCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTC < SRR4302534.4905821/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTC < SRR4302534.1567132/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTC < SRR4302534.3906266/94‑1 (MQ=60)
CACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCG > SRR4302534.4838296/1‑94 (MQ=60)
CACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCG > SRR4302534.283641/1‑94 (MQ=60)
CACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCAGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCG < SRR4302534.6643761/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGT < SRR4302534.4907304/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGT > SRR4302534.2662483/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTT < SRR4302534.1834954/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTT > SRR4302534.5622552/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTT < SRR4302534.604432/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTT < SRR4302534.5853127/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTT < SRR4302534.4207507/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTA > SRR4302534.4273317/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTA < SRR4302534.5210842/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTA > SRR4302534.3466324/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTA > SRR4302534.520011/1‑94 (MQ=60)
TCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTAT < SRR4302534.6442342/94‑1 (MQ=60)
TCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTAT < SRR4302534.2108282/94‑1 (MQ=60)
CCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATC < SRR4302534.2818904/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCG < SRR4302534.2704674/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCG < SRR4302534.3351549/94‑1 (MQ=60)
CTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCG < SRR4302534.2540589/94‑1 (MQ=60)
TAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGC > SRR4302534.1571237/1‑94 (MQ=60)
TAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGC < SRR4302534.1804664/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCG > SRR4302534.5548409/1‑94 (MQ=60)
AATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCG > SRR4302534.3948417/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGG < SRR4302534.2700636/94‑1 (MQ=60)
GAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGC < SRR4302534.4985321/94‑1 (MQ=60)
AGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGC > SRR4302534.5616171/1‑94 (MQ=60)
AGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCC < SRR4302534.5294656/94‑1 (MQ=60)
GTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCA > SRR4302534.4534776/1‑94 (MQ=60)
GTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCA < SRR4302534.2531036/94‑1 (MQ=60)
GTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCA < SRR4302534.5838786/94‑1 (MQ=60)
GTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCA < SRR4302534.5840811/94‑1 (MQ=60)
GTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCA < SRR4302534.356165/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGG < SRR4302534.382032/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGG < SRR4302534.3967624/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGG < SRR4302534.2678971/94‑1 (MQ=60)
AGTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGG < SRR4302534.3379417/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGG > SRR4302534.138147/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGA < SRR4302534.5663082/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAG < SRR4302534.3307360/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGGTCGTTTATCGGCGGGgcctggg > SRR4302534.5192988/1‑87 (MQ=60)
TCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGgcaggggg > SRR4302534.6181036/1‑86 (MQ=60)
CCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCG > SRR4302534.2835114/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCT < SRR4302534.5517653/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCT < SRR4302534.4442308/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCT < SRR4302534.1191213/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCT < SRR4302534.2180346/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTG < SRR4302534.4752188/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGGGCTGCT > SRR4302534.5084126/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCGGGAGATGCT > SRR4302534.3292488/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCCACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCTGCGGGCCctgcgcttct > SRR4302534.2079297/1‑84 (MQ=60)
GGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCccgaggcgctt > SRR4302534.3618254/1‑83 (MQ=60)
CAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGCGCTACTTAT > SRR4302534.3347197/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGGTTATT > SRR4302534.6057733/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGGGCTGCTTATA > SRR4302534.4466708/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATA < SRR4302534.5704909/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAA > SRR4302534.1116047/1‑94 (MQ=60)
CCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAA < SRR4302534.5051127/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCATCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCACGAGCGGCTTATAAAA > SRR4302534.2730330/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGGCAGGAGCTGCTTATAAAT > SRR4302534.1631958/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCGTATAAAA > SRR4302534.6462777/1‑94 (MQ=60)
CTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGTGGGCCAGGAGCTGCTTttagataa > SRR4302534.1827909/1‑86 (MQ=60)
CTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCTTATAAATA‑C > SRR4302534.4063796/1‑94 (MQ=60)
CTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGGGCTGCTTTTAAATA‑A > SRR4302534.1521193/1‑94 (MQ=60)
CTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑A > SRR4302534.876696/1‑94 (MQ=60)
CTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAAGAGGGGCTTATAAATA‑C > SRR4302534.2098346/1‑94 (MQ=60)
CTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAAaaacg > SRR4302534.3860535/1‑89 (MQ=60)
TATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGG > SRR4302534.5166008/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCT > SRR4302534.5050475/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTG > SRR4302534.250011/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGG < SRR4302534.4282781/94‑1 (MQ=60)
GCGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGG < SRR4302534.2519495/94‑1 (MQ=60)
CGGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCGGAGCTGCTTTTAAATA‑CGGGCTGGGC > SRR4302534.586708/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCT > SRR4302534.1772118/1‑94 (MQ=60)
GTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGGGCTGCTTATtaattctggccgggccg > SRR4302534.4600566/1‑77 (MQ=60)
GTATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTG < SRR4302534.3634258/94‑1 (MQ=60)
TATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGG < SRR4302534.2184059/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTCTATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGtaactggtgcagcttatatataactgctgggcaggg > SRR4302534.3103160/1‑58 (MQ=60)
ATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTTTTAATA‑CCGGCTGGGCCGGG > SRR4302534.4727470/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGG < SRR4302534.2403300/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGG < SRR4302534.1806867/94‑1 (MQ=60)
TTGTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGT < SRR4302534.6445263/94‑1 (MQ=60)
TGTGCTGGCGAGGGCGCTCCCGGCGACCTATATCAGTGCCAGTGCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAAGA‑CGGGGTGGGCTGGGGA < SRR4302534.2290822/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTAT < SRR4302534.6404758/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATT < SRR4302534.3887947/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTG < SRR4302534.4865674/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTG < SRR4302534.2361878/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTTTAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGC > SRR4302534.2641009/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGC < SRR4302534.1151829/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCCGCTTATAAATA‑CGGGCTcgggtgggggtttgt > SRR4302534.448218/1‑79 (MQ=60)
TGGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAAGAGCTGCTTATAAATAagcgctgggcgggggttttcg > SRR4302534.5816924/1‑73 (MQ=60)
GGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTG < SRR4302534.6072528/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTG < SRR4302534.1538354/94‑1 (MQ=60)
GCGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGG < SRR4302534.2292511/94‑1 (MQ=60)
CGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATTAATACCGGGCGGGGTTGGG‑ATTGCTGGC > SRR4302534.4855153/1‑94 (MQ=60)
CGATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGC < SRR4302534.4087024/94‑1 (MQ=60)
GATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGGTGGGGATTGCTTGCG > SRR4302534.206352/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCG < SRR4302534.3203554/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCGATG < SRR4302534.5736575/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑AGGGCTGGGCGGGGGATTGCTGGCGggg > SRR4302534.4941542/1‑91 (MQ=60)
GCGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCgcggagcggactattaagacaggcggggctgggggttgctggcgagga > SRR4302534.1665250/1‑46 (MQ=60)
|
TCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATA‑CGGGCTGGGCTGGGTATTGCTGGCGATG > NC_000913/3405301‑3405486
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
