Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,766,847 |
T→C |
intergenic (+582/‑125) |
yibG → / → b4549 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,766,847 | 0 | T | C | 98.8%
| 583.0
/ ‑4.1
| 167 | intergenic (+582/‑125) | yibG/b4549 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (91/74); total (92/75) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > NC_000913/3766757‑3766936
|
tttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCa < 1:248659/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag < 2:2430891/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag < 2:2271545/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag > 2:4619063/1‑93 (MQ=255)
ggTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCagag > 2:5245085/1‑93 (MQ=255)
gTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGc < 1:4107750/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGcc > 2:5618638/1‑93 (MQ=255)
tCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGcc > 2:1667806/1‑93 (MQ=255)
cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg > 2:5283956/1‑93 (MQ=255)
cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg > 1:4721676/1‑93 (MQ=255)
gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa > 1:3708743/1‑93 (MQ=255)
gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa > 2:4815861/1‑93 (MQ=255)
tCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAt > 1:566552/1‑93 (MQ=255)
cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa > 1:4350864/1‑93 (MQ=255)
tttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAg > 1:3921648/1‑93 (MQ=255)
tttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAg > 2:3359769/1‑93 (MQ=255)
ttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGc > 2:4710522/1‑93 (MQ=255)
ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:873493/1‑93 (MQ=255)
ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:1131691/1‑93 (MQ=255)
tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc < 2:5113340/93‑1 (MQ=255)
tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc > 2:829948/1‑93 (MQ=255)
tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc > 2:3559910/1‑93 (MQ=255)
cGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTACCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACa < 2:5317916/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAg > 2:5520838/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt > 1:5351171/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt > 2:1050308/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 1:1530829/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 1:1349320/1‑93 (MQ=255)
tCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTa > 1:5127486/1‑93 (MQ=255)
cTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAc > 2:2816210/1‑93 (MQ=255)
tGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACg > 1:5494884/1‑93 (MQ=255)
tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc < 2:872056/93‑1 (MQ=255)
tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc > 2:4193819/1‑93 (MQ=255)
ccGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTCATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACt < 1:5199609/93‑1 (MQ=255)
ccGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACt > 1:5610899/1‑93 (MQ=255)
gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa > 1:2662306/1‑93 (MQ=255)
gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa < 2:6335600/93‑1 (MQ=255)
gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa > 1:2652276/1‑93 (MQ=255)
gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa > 1:3243509/1‑93 (MQ=255)
ggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaaa < 2:6058893/93‑1 (MQ=255)
ggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaaa < 2:3437058/93‑1 (MQ=255)
tttataACTGGTTTATCTAATCACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata < 2:4475734/91‑1 (MQ=255)
tGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata < 1:2790909/93‑1 (MQ=255)
tGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata > 1:4977555/1‑93 (MQ=255)
gTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAatat < 1:333395/93‑1 (MQ=255)
ataACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATgg > 1:4818458/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCa > 1:1727039/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa < 1:120961/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg < 2:3948090/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg < 1:736008/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:923425/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:1117116/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:1070687/93‑1 (MQ=255)
gTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtt < 1:2119981/93‑1 (MQ=255)
tttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtta > 1:3581380/1‑93 (MQ=255)
tttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtta < 1:4759794/93‑1 (MQ=255)
tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt < 2:6287286/93‑1 (MQ=255)
tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt < 2:5677082/93‑1 (MQ=255)
cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc > 1:1578549/1‑93 (MQ=255)
cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc > 2:1191584/1‑93 (MQ=255)
cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc < 2:3804518/93‑1 (MQ=255)
aaTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACaa > 1:32919/1‑93 (MQ=255)
aTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAt < 2:4991973/93‑1 (MQ=255)
aTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAt < 2:4077740/93‑1 (MQ=255)
tGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAtt > 1:883218/1‑93 (MQ=255)
gACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTg > 2:3394045/1‑93 (MQ=255)
aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt > 1:6383757/1‑93 (MQ=255)
aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt < 2:3148892/93‑1 (MQ=255)
cATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTa < 2:5395319/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAt > 2:1326337/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt < 2:2102262/93‑1 (MQ=255)
agCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt < 1:4558606/92‑1 (MQ=255)
gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt < 1:5256598/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttttt > 2:6011427/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:6140465/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:5777009/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:2127357/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc < 2:540928/93‑1 (MQ=255)
aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct < 1:4201175/93‑1 (MQ=255)
aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct < 1:1651921/93‑1 (MQ=255)
aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa < 1:4602885/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:5537637/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:1278173/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:5177037/93‑1 (MQ=255)
aTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAtt < 1:3227437/93‑1 (MQ=255)
aTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAtt < 1:5038598/93‑1 (MQ=255)
gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc > 1:3488159/1‑93 (MQ=255)
gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc < 1:2843610/93‑1 (MQ=255)
aGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCt > 2:5961514/1‑93 (MQ=255)
tAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCg < 2:4093613/93‑1 (MQ=255)
tAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCg > 2:3016134/1‑93 (MQ=255)
atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg < 2:3816358/93‑1 (MQ=255)
atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg > 1:4905819/1‑93 (MQ=255)
atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGGTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg > 1:3195349/1‑93 (MQ=255)
tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt < 1:5635041/93‑1 (MQ=255)
tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:5688053/1‑93 (MQ=255)
tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:4605848/1‑93 (MQ=255)
atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 1:6214056/1‑93 (MQ=255)
atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 1:2734746/1‑93 (MQ=255)
atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 2:4994864/1‑93 (MQ=255)
|
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > NC_000913/3766757‑3766936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG > NC_000913/3766754‑3766939
|
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTC > SRR4302534.6203883/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCT > SRR4302534.3594632/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCA < SRR4302534.5487454/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAG < SRR4302534.255148/94‑1 (MQ=60)
TGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAG > SRR4302534.5025686/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCC < SRR4302534.4218238/94‑1 (MQ=60)
CCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAG > SRR4302534.4849916/1‑94 (MQ=60)
CGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGA > SRR4302534.3808444/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAT > SRR4302534.580468/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATA > SRR4302534.4468309/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG > SRR4302534.4026729/1‑94 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302534.1161277/1‑94 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302534.895575/1‑94 (MQ=60)
GGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACAT > SRR4302534.1496874/1‑94 (MQ=60)
ACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTA > SRR4302534.5769646/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT < SRR4302534.5249270/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT > SRR4302534.5495442/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTT > SRR4302534.1570994/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTT > SRR4302534.1384877/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTT > SRR4302534.652212/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTA > SRR4302534.5265922/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACG < SRR4302534.134885/94‑1 (MQ=60)
CTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACG > SRR4302534.5643060/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACG > SRR4302534.3388798/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACG > SRR4302534.5520624/1‑94 (MQ=60)
GTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGA < SRR4302534.4403413/94‑1 (MQ=60)
TCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACT > SRR4302534.5762695/1‑94 (MQ=60)
CCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTCATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTA < SRR4302534.5339870/94‑1 (MQ=60)
CGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAA > SRR4302534.2732686/1‑94 (MQ=60)
CGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAA > SRR4302534.2722419/1‑94 (MQ=60)
CGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAA > SRR4302534.5880978/1‑94 (MQ=60)
GAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAA > SRR4302534.3571997/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAA > SRR4302534.3329838/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAA > SRR4302534.2658069/1‑94 (MQ=60)
TTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATA > SRR4302534.5112288/1‑94 (MQ=60)
TTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATA > SRR4302534.5112286/1‑94 (MQ=60)
TGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATAT < SRR4302534.2864306/94‑1 (MQ=60)
GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG < SRR4302534.341953/94‑1 (MQ=60)
TATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGG > SRR4302534.4949242/1‑94 (MQ=60)
ATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGC > SRR4302534.244737/1‑94 (MQ=60)
ATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGC > SRR4302534.5950231/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA > SRR4302534.1771882/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG < SRR4302534.124164/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGG < SRR4302534.754213/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT < SRR4302534.1098462/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT < SRR4302534.946943/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT < SRR4302534.1146288/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT > SRR4302534.2799430/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT < SRR4302534.3308949/94‑1 (MQ=60)
TTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA > SRR4302534.3677710/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA < SRR4302534.1236442/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA < SRR4302534.2175781/94‑1 (MQ=60)
TTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTAT < SRR4302534.4889044/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAA > SRR4302534.874152/1‑94 (MQ=60)
TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC > SRR4302534.1619848/1‑94 (MQ=60)
TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC < SRR4302534.5714649/94‑1 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA > SRR4302534.685878/1‑94 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA < SRR4302534.909993/94‑1 (MQ=60)
TAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAA > SRR4302534.33783/1‑94 (MQ=60)
AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT > SRR4302534.4735927/1‑94 (MQ=60)
AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT < SRR4302534.1637292/94‑1 (MQ=60)
AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT > SRR4302534.5816083/1‑94 (MQ=60)
ATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATT > SRR4302534.905562/1‑94 (MQ=60)
GACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGT > SRR4302534.6556204/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATT < SRR4302534.1754127/94‑1 (MQ=60)
TGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTT < SRR4302534.2835732/94‑1 (MQ=60)
AGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTT < SRR4302534.4682200/94‑1 (MQ=60)
GCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTT < SRR4302534.5398646/94‑1 (MQ=60)
AAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTT > SRR4302534.3582820/1‑94 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC > SRR4302534.2183388/1‑94 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC > SRR4302534.5933717/1‑94 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC > SRR4302534.6307478/1‑94 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC < SRR4302534.2903342/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC < SRR4302534.4314624/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC < SRR4302534.1694979/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302534.5334223/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATGAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302534.3816352/94‑1 (MQ=60)
AAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAT > SRR4302534.4700617/1‑94 (MQ=60)
AAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAT < SRR4302534.4727802/94‑1 (MQ=60)
AAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAT < SRR4302534.5296647/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT < SRR4302534.5687120/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT < SRR4302534.5316534/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT > SRR4302534.1840179/1‑94 (MQ=60)
AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT < SRR4302534.1311820/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT < SRR4302534.5174682/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT < SRR4302534.3313183/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC > SRR4302534.4530985/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC < SRR4302534.331748/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC > SRR4302534.3581906/1‑94 (MQ=60)
GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT < SRR4302534.4175715/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT < SRR4302534.2918320/94‑1 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG > SRR4302534.4883202/1‑94 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG > SRR4302534.5038802/1‑94 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG < SRR4302534.1156430/94‑1 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGGTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG > SRR4302534.3280055/1‑94 (MQ=60)
ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT > SRR4302534.4730834/1‑94 (MQ=60)
ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT > SRR4302534.5842085/1‑94 (MQ=60)
TATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > SRR4302534.6382905/1‑94 (MQ=60)
TATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG < SRR4302534.5787562/94‑1 (MQ=60)
TATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > SRR4302534.2806843/1‑94 (MQ=60)
TCTCAGAACCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG > SRR4302534.5500922/1‑94 (MQ=60)
|
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG > NC_000913/3766754‑3766939
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
