Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,677 |
+G |
intergenic (+175/‑264) |
kup → / → rbsD |
low affinity potassium transport system/RbsD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.6%
| 777.8
/ ‑3.9
| 222 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (119/102); total (120/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGTGTCGTTGATCCT‑c < 1:6355820/93‑1 (MQ=255)
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑c < 2:4095125/93‑1 (MQ=255)
tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑g < 2:2801613/93‑1 (MQ=255)
agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑gg < 2:2744127/93‑2 (MQ=255)
agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑gg > 2:3325782/1‑92 (MQ=255)
gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑ggc < 2:188643/93‑3 (MQ=255)
agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑ggcaa > 1:5066137/1‑89 (MQ=255)
agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACg < 2:2465750/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGc < 1:4199143/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGc > 2:2289808/1‑93 (MQ=255)
ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg < 2:713987/93‑1 (MQ=255)
ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:6281963/1‑93 (MQ=255)
ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:5810156/1‑93 (MQ=255)
ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:4231142/1‑93 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg < 2:4113026/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg > 1:778641/1‑93 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg < 2:3573769/93‑1 (MQ=255)
aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGt < 2:3652849/93‑1 (MQ=255)
aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGt < 1:1680980/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAt > 1:3603524/1‑93 (MQ=255)
gCTGCGTTCTGGAAGGATTAAGTTGCGGGATGAT‑GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 2:6151620/93‑1 (MQ=255)
gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAtt < 2:6194284/93‑1 (MQ=255)
gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAtt < 1:774327/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTTCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 2:1419044/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 1:3007980/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:1368508/1‑93 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:2161474/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:5942131/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCg < 1:1620120/93‑1 (MQ=255)
tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt > 1:5041443/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc < 1:5496812/93‑1 (MQ=255)
ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 2:1994547/1‑93 (MQ=255)
gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 1:5218099/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATTGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:317346/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGAGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:1018790/1‑93 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 2:1638649/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:4969204/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGCAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:3274393/93‑1 (MQ=255)
aaGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 1:4619764/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 1:378779/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGGATGATGGTAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 2:5550368/93‑1 (MQ=255)
ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 2:4195443/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 1:6386191/1‑93 (MQ=255)
gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 1:735032/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 2:2067491/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 2:1800648/93‑1 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:6336068/1‑93 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 2:593093/1‑93 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:4754386/93‑1 (MQ=255)
atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg < 2:6372448/93‑1 (MQ=255)
atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg > 1:210329/1‑93 (MQ=255)
tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 2:1586527/1‑93 (MQ=255)
tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 1:154310/93‑1 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct < 1:4039474/93‑1 (MQ=255)
atgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg < 2:4136251/93‑1 (MQ=255)
atgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg > 1:2332313/1‑93 (MQ=255)
tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 2:240228/1‑93 (MQ=255)
tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 1:6032677/1‑93 (MQ=255)
ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:2613400/1‑93 (MQ=255)
ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:5974079/1‑93 (MQ=255)
ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:2982946/1‑93 (MQ=255)
gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCaa < 1:1002979/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 1:2745856/1‑93 (MQ=255)
aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg > 1:117380/1‑93 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt > 1:6158911/1‑93 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:3109660/93‑1 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:1063714/93‑1 (MQ=255)
ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 1:4383675/1‑93 (MQ=255)
ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa < 2:5076480/93‑1 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 2:1457777/93‑1 (MQ=255)
cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 2:12863/1‑93 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:5693387/93‑1 (MQ=255)
tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc > 1:3941977/1‑93 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt > 2:2910046/1‑93 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 2:5305078/93‑1 (MQ=255)
tttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTg < 1:958378/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 1:138788/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 1:4546540/93‑1 (MQ=255)
gTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc > 2:4028478/1‑93 (MQ=255)
gTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTAGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc < 2:4269754/93‑1 (MQ=255)
cGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAc > 2:4595264/1‑93 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 1:3744105/93‑1 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 1:5766357/93‑1 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 1:4482688/1‑93 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa > 1:2868099/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 2:475349/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 2:2653488/93‑1 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:4284504/93‑1 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:5582976/93‑1 (MQ=255)
ggcGTTGCTCCT‑CGGCAAACGCCCGGGGTATTTGAGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGCGCACCAGATCa > 1:1841672/3‑93 (MQ=255)
cGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAt < 2:5128848/93‑1 (MQ=255)
gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 1:2055117/1‑93 (MQ=255)
gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:2329891/1‑93 (MQ=255)
gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:5155244/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 2:69897/1‑93 (MQ=255)
gATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 1:1967510/1‑93 (MQ=255)
gATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa < 2:3502085/93‑1 (MQ=255)
aTCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaa < 2:3843655/93‑1 (MQ=255)
tCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:4905511/1‑93 (MQ=255)
tCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:6123798/1‑93 (MQ=255)
|
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > NC_000913/3930584‑3930770
|
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGTGTCGTTGATCCT‑C‑G < SRR4302534.6527471/94‑1 (MQ=60)
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑G > SRR4302534.3122666/1‑94 (MQ=60)
TAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GG < SRR4302534.153841/94‑1 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAA > SRR4302534.5202918/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAA > SRR4302534.4974702/1‑94 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAA > SRR4302534.6062124/1‑94 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAA > SRR4302534.1660066/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAAC > SRR4302534.2988352/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCC < SRR4302534.4312555/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCC < SRR4302534.3797038/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTG > SRR4302534.5967846/1‑94 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTG > SRR4302534.4345180/1‑94 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTG > SRR4302534.6451962/1‑94 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGG > SRR4302534.5557866/1‑94 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGG > SRR4302534.798053/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA < SRR4302534.1407996/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA < SRR4302534.5154301/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA > SRR4302534.5202824/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA > SRR4302534.3256878/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA < SRR4302534.1724707/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA < SRR4302534.883301/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTGCGGGCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTA > SRR4302534.4381825/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAT > SRR4302534.3700422/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTT < SRR4302534.793621/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTG > SRR4302534.1404560/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTG < SRR4302534.3086679/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGC > SRR4302534.6293296/1‑94 (MQ=60)
GCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCG > SRR4302534.77437/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGT < SRR4302534.1662388/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGT > SRR4302534.3891018/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTC > SRR4302534.6526620/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTC > SRR4302534.2883785/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT > SRR4302534.5177593/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGC > SRR4302534.727745/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG < SRR4302534.5645035/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG > SRR4302534.2941943/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC > SRR4302534.5358944/1‑94 (MQ=60)
AAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CTGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTTTGCGCGG > SRR4302534.4181844/1‑94 (MQ=60)
AAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGG > SRR4302534.6353377/1‑94 (MQ=60)
GATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAA > SRR4302534.6128935/1‑94 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302534.5103745/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302534.1854776/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGCAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAA < SRR4302534.3361654/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGC < SRR4302534.205906/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGC > SRR4302534.652192/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTTGCCGGATGATGCAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGC < SRR4302534.1757023/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCT > SRR4302534.4745120/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG > SRR4302534.4503817/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG < SRR4302534.1064129/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGT > SRR4302534.388468/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAC > SRR4302534.6558704/1‑94 (MQ=60)
GCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTT < SRR4302534.753206/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTT < SRR4302534.3438241/94‑1 (MQ=60)
CCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTG > SRR4302534.6189902/1‑94 (MQ=60)
cggataaccaaacCCTCCTTCCTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAACCGCCCGTGGTATTTGGGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC < SRR4302534.6569143/81‑1 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC > SRR4302534.833477/1‑94 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC > SRR4302534.1698734/1‑94 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC > SRR4302534.6507230/1‑94 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT > SRR4302534.2331334/1‑94 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT > SRR4302534.6517034/1‑94 (MQ=60)
GATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTG > SRR4302534.215847/1‑94 (MQ=60)
GATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTG < SRR4302534.4883450/94‑1 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGGAAGCTTTACTTGCTGCT > SRR4302534.461265/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT < SRR4302534.158334/94‑1 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT > SRR4302534.724931/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT < SRR4302534.5022038/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG < SRR4302534.1640695/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG < SRR4302534.4147788/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG < SRR4302534.4191283/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG > SRR4302534.2394186/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGC > SRR4302534.6196622/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA > SRR4302534.2682560/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA > SRR4302534.6136334/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA > SRR4302534.3060983/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA > SRR4302534.5112124/1‑94 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302534.5891832/1‑94 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302534.111300/1‑94 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302534.3979404/1‑94 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC > SRR4302534.2818174/1‑94 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302534.1028704/94‑1 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC > SRR4302534.2499542/1‑94 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC > SRR4302534.4641077/1‑94 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302534.4744899/94‑1 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG > SRR4302534.120501/1‑94 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG > SRR4302534.6306534/1‑94 (MQ=60)
TACCTCCTTCTTTATGTCGCCTGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGA > SRR4302534.795003/1‑94 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT > SRR4302534.6326423/1‑94 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTA > SRR4302534.4337837/1‑94 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTA > SRR4302534.2803579/1‑94 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA > SRR4302534.4501853/1‑94 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA > SRR4302534.2588425/1‑94 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA < SRR4302534.1091285/94‑1 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA < SRR4302534.3191431/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG > SRR4302534.1518536/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG < SRR4302534.6503290/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGC > SRR4302534.6210557/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGC > SRR4302534.4047547/1‑94 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302534.4814097/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302534.2113334/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTG > SRR4302534.2038422/1‑94 (MQ=60)
TTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGC < SRR4302534.982795/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGC < SRR4302534.5045698/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTCCTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG < SRR4302534.3070925/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG > SRR4302534.3170019/1‑94 (MQ=60)
TTATGACGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCACACGCCCCAGGAATTTGCGTCTGCCCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAGTGCGCTTCG > SRR4302534.47857/1‑94 (MQ=50)
ATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTG < SRR4302534.142420/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTG < SRR4302534.4669799/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTGATGCGCTGCGTGC > SRR4302534.198578/1‑94 (MQ=60)
GTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCA > SRR4302534.3467598/1‑94 (MQ=60)
CGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACC > SRR4302534.4603967/1‑94 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA < SRR4302534.3844694/94‑1 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA > SRR4302534.2943414/1‑94 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA < SRR4302534.5922796/94‑1 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG > SRR4302534.1212407/1‑94 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG < SRR4302534.3852821/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGA < SRR4302534.5844533/94‑1 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAT < SRR4302534.5731510/94‑1 (MQ=60)
GAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC < SRR4302534.5733833/94‑1 (MQ=60)
GAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC < SRR4302534.4400537/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCA < SRR4302534.1263873/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCA < SRR4302534.5351241/94‑1 (MQ=60)
AGGCGTTGCTCCT‑CGGCAAACGCCCGGGGTATTTGAGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGCGCACCAGATCA > SRR4302534.1889535/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT > SRR4302534.2108805/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT > SRR4302534.5624854/1‑94 (MQ=60)
GTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302534.5952995/94‑1 (MQ=60)
TTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302534.4451425/94‑1 (MQ=60)
TGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGA > SRR4302534.2019012/1‑94 (MQ=60)
GATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA < SRR4302534.4060050/94‑1 (MQ=60)
GATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA > SRR4302534.4451676/1‑94 (MQ=60)
GATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA > SRR4302534.6154122/1‑94 (MQ=60)
ATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > SRR4302534.6290363/1‑94 (MQ=60)
ATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > SRR4302534.5038488/1‑94 (MQ=60)
TCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAAT > SRR4302534.5826383/1‑94 (MQ=60)
CCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATC > SRR4302534.6280981/1‑94 (MQ=60)
CT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302534.1085199/1‑94 (MQ=60)
CT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATCCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302534.4156854/1‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302534.2210615/4‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302534.4656102/4‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC < SRR4302534.3869113/91‑1 (MQ=60)
cgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302534.3056644/92‑1 (MQ=60)
cgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302534.1818647/92‑1 (MQ=60)
cgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302534.5777431/92‑1 (MQ=60)
G‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGC > SRR4302534.2656907/1‑94 (MQ=60)
G‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGC > SRR4302534.5744219/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGCTCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC < SRR4302534.5371282/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC < SRR4302534.3737426/94‑1 (MQ=60)
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GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > NC_000913/3930584‑3930770
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
