Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,972,637 |
2 bp→GC |
coding (430‑431/546 nt) |
wecD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,972,637 | 0 | C | G | 100.0%
| 675.3
/ NA
| 195 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (97/98); total (97/98) |
| * | NC_000913 | 3,972,638 | 0 | G | C | 100.0%
| 673.2
/ NA
| 194 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (96/98); total (96/98) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
CTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972550‑3972724
||
cTCACTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTcgc < 1:4612079/93‑1 (MQ=255)
tCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTcgcg > 1:1065475/1‑93 (MQ=255)
cAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCgg > 2:4453457/1‑93 (MQ=255)
cAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCgg > 1:3279992/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCTCGGt > 2:888687/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGt < 2:5981487/93‑1 (MQ=255)
aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTa < 2:4946253/93‑1 (MQ=255)
aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTa > 2:3651575/1‑93 (MQ=255)
aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTa < 2:456071/93‑1 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTaaaa < 1:2329901/93‑1 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTaaaa < 2:1772491/93‑1 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTaaaa < 1:2970220/93‑1 (MQ=255)
aCAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAaaca > 1:5918350/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAaacaa > 2:2955908/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAaacaa < 1:5611383/93‑1 (MQ=255)
aGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAaacaac > 2:3286422/1‑93 (MQ=255)
aGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAaacaac > 1:2246725/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACt > 2:5483285/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACttt < 1:915655/93‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCgg < 2:5363933/93‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCgg > 1:370944/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCgggg > 2:733872/1‑92 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCgggg > 1:5787809/1‑92 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:4724679/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGGATGCTCGCGGTCAAACAACTTTGCgggg > 1:3378955/1‑92 (MQ=255)
tGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGc > 2:3967555/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGc < 2:4164931/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGc < 2:4129842/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCCGGTGGCg > 1:4409646/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAAAAACTTTGCggggggggc > 2:4991932/1‑90 (MQ=255)
ctgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAcc > 2:2311762/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 1:2628513/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 1:1085424/1‑93 (MQ=255)
gctggctgGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCa > 1:1943568/1‑93 (MQ=255)
gctggctgGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCa > 1:327599/1‑93 (MQ=255)
ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGTGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAt < 1:3006797/93‑1 (MQ=255)
gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 2:2420455/93‑1 (MQ=255)
ctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATgg < 2:2332511/93‑1 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc > 1:409471/1‑93 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGCTGGCGACCCAAATGGGc < 1:2767650/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac < 2:3560777/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca < 1:1424794/93‑1 (MQ=255)
cgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAacac < 2:1724729/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc > 2:3321515/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc < 1:3573646/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc < 1:3980058/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg < 2:4776031/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg < 2:1305372/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc < 1:5833188/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 2:2420646/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCgcgc < 2:1619524/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCgcgc < 2:4064151/93‑1 (MQ=255)
tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt < 2:2035486/93‑1 (MQ=255)
gctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCtt < 1:5551633/93‑1 (MQ=255)
ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa < 1:4151688/93‑1 (MQ=255)
ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa > 1:1555883/1‑93 (MQ=255)
ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa < 2:5927406/93‑1 (MQ=255)
tgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaa < 1:2285948/93‑1 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa > 2:3851133/1‑93 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa > 2:6256537/1‑93 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc > 2:3458728/1‑93 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 1:3857638/93‑1 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 2:3199437/93‑1 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATCGGCACCACCGCCGGGCTTAAAc > 2:3349944/1‑93 (MQ=255)
gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg < 2:5805894/93‑1 (MQ=255)
ctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGa < 2:5407271/93‑1 (MQ=255)
tgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACATCTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGat < 1:1712794/93‑1 (MQ=255)
tgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGat > 2:3804020/1‑93 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 2:2184243/1‑93 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 1:5996774/1‑93 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 2:6439116/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac > 2:1401395/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:255484/93‑1 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca > 1:5985038/1‑93 (MQ=255)
cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:2463734/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:2898164/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca < 2:2485998/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 2:2731838/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaaa > 2:4312851/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaaa > 1:3241700/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAg < 1:2677355/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgt < 2:5623618/93‑1 (MQ=255)
cgcTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg < 2:489807/93‑1 (MQ=255)
gcTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg < 2:4600179/93‑1 (MQ=255)
cTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 1:5214625/93‑1 (MQ=255)
cTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt > 1:5743168/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 1:1840737/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 1:436299/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCg > 2:2928745/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa > 1:6295841/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa > 1:4837865/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa > 1:1023043/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt < 2:5058156/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt < 1:3458908/93‑1 (MQ=255)
gggCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg > 2:5326530/1‑93 (MQ=255)
gggCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg > 1:5446055/1‑93 (MQ=255)
gggCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg < 1:4717613/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 2:2523724/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 1:3072720/93‑1 (MQ=255)
cGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAg > 2:3700695/1‑93 (MQ=255)
||
CTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972550‑3972724
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAA > NC_000913/3972544‑3972726
|
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302534.2581627/94‑1 (MQ=60)
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302534.248437/94‑1 (MQ=60)
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302534.6196012/94‑1 (MQ=60)
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302534.3182517/94‑1 (MQ=60)
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302534.53980/94‑1 (MQ=60)
ACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGC > SRR4302534.5448378/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCG < SRR4302534.4737250/94‑1 (MQ=60)
CTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCG < SRR4302534.4575583/94‑1 (MQ=60)
CTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCG > SRR4302534.4471177/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCG > SRR4302534.1093099/1‑94 (MQ=60)
TCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGG > SRR4302534.3367414/1‑94 (MQ=60)
CAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGT > SRR4302534.6035971/1‑94 (MQ=60)
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTA < SRR4302534.1540315/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAAC < SRR4302534.3047991/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAAC > SRR4302534.2828737/1‑94 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAAC < SRR4302534.2391716/94‑1 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACA > SRR4302534.6079046/1‑94 (MQ=60)
ACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAA > SRR4302534.3322799/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAAC < SRR4302534.5763192/94‑1 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAAC > SRR4302534.2306271/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAAC > SRR4302534.879354/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTT < SRR4302534.5180222/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTG < SRR4302534.938950/94‑1 (MQ=60)
CGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCG < SRR4302534.2867519/94‑1 (MQ=60)
GCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGG > SRR4302534.380404/1‑94 (MQ=60)
CGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGG > SRR4302534.4007883/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGT < SRR4302534.3365531/94‑1 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGG > SRR4302534.5944812/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGGATGCTCGCGGTCAAACAACTTTGCGGGG > SRR4302534.3469529/1‑94 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302534.3337214/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302534.3428319/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTGAAACAACTTTGCGGGTGG > SRR4302534.4749494/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCCGGTGGCG > SRR4302534.4528660/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGA > SRR4302534.5982699/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302534.1113638/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302534.2698044/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302534.1673673/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302534.336025/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA < SRR4302534.6090546/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302534.1994396/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGTGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATG < SRR4302534.3085458/94‑1 (MQ=60)
GCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGG < SRR4302534.2535110/94‑1 (MQ=60)
GCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGCCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGG < SRR4302534.3010963/94‑1 (MQ=60)
TGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGC > SRR4302534.2493981/1‑94 (MQ=60)
TGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGC > SRR4302534.419941/1‑94 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCA > SRR4302534.4515430/1‑94 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGCTGGCGACCCAAATGGGCA < SRR4302534.2840497/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCCAACGGCGCTAAACTGGGAGTATGCTGGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAAC < SRR4302534.3806946/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302534.1462274/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302534.263236/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACC < SRR4302534.2744999/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302534.312653/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302534.4086566/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302534.3669769/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGC > SRR4302534.2371426/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGACGACCCAAATGGGCAACACCTCCGC < SRR4302534.4278230/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG < SRR4302534.5991538/94‑1 (MQ=60)
GCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTA < SRR4302534.5701503/94‑1 (MQ=60)
GCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTA > SRR4302534.1596626/1‑94 (MQ=60)
CTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAA < SRR4302534.4263761/94‑1 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA < SRR4302534.2346610/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302534.3961200/94‑1 (MQ=60)
AGCGGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302534.470647/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAT < SRR4302534.2131934/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACATCTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA < SRR4302534.1757286/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA < SRR4302534.5714873/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA > SRR4302534.5808500/1‑94 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA > SRR4302534.6159690/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302534.3841682/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302534.262139/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302534.6147620/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA > SRR4302534.4205921/1‑94 (MQ=60)
CAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATAC < SRR4302534.2974226/94‑1 (MQ=60)
CAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATAC < SRR4302534.2529190/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA > SRR4302534.3055665/1‑94 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGACAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA < SRR4302534.5917716/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAA > SRR4302534.3327960/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT < SRR4302534.2748139/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT > SRR4302534.3566184/1‑94 (MQ=60)
GCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTG > SRR4302534.5600078/1‑94 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT > SRR4302534.5898861/1‑94 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG > SRR4302534.1888581/1‑94 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG > SRR4302534.3477653/1‑94 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG < SRR4302534.5355363/94‑1 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG > SRR4302534.447417/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC < SRR4302534.6147793/94‑1 (MQ=60)
AAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCG > SRR4302534.1759163/1‑94 (MQ=60)
AAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCG > SRR4302534.2327788/1‑94 (MQ=60)
AAACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGCGCG > SRR4302534.2359147/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302534.4147618/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302534.1112196/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302534.6466134/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302534.4898502/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAA > SRR4302534.1049385/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAA > SRR4302534.4969104/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302534.1187343/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302534.1967865/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302534.3551886/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG > SRR4302534.5592782/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGT < SRR4302534.4845725/94‑1 (MQ=60)
GGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAGCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGAGCGAATGTA > SRR4302534.3809480/1‑94 (MQ=60)
GGCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTA > SRR4302534.834393/1‑94 (MQ=60)
GCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG < SRR4302534.3153434/94‑1 (MQ=60)
GCGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG < SRR4302534.6182975/94‑1 (MQ=60)
CGTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGA > SRR4302534.3356545/1‑94 (MQ=60)
GTATGCTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAA < SRR4302534.5004449/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAA > NC_000913/3972544‑3972726
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
