Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 99.4%
| 620.4
/ ‑3.7
| 177 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (72/104); total (72/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005509‑4005687
|
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑c < 2:5128016/93‑1 (MQ=255)
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑c > 2:6220218/1‑93 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cc < 1:4341735/93‑2 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cc < 2:4824550/93‑2 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cc < 2:4272330/93‑2 (MQ=255)
aaTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cct < 1:877146/93‑3 (MQ=255)
aaTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cct > 2:4059879/1‑91 (MQ=255)
aaTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cct < 2:3878129/93‑3 (MQ=255)
aTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGACTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCGTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cctg > 2:349541/1‑90 (MQ=255)
tGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGACCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑cctgt < 2:4706240/93‑5 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTAtc > 2:1105723/1‑93 (MQ=255)
tGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTAtctc < 1:2483505/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATctct < 1:2104830/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTctg < 1:362958/93‑1 (MQ=255)
ggCGGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTctg < 1:2663562/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATTTctgt > 1:6414844/1‑92 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTctgc < 2:3325162/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTctgct < 1:4941856/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTctgct > 1:1008699/1‑93 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGGATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTgg > 1:4090062/1‑93 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGAt < 1:262712/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATg < 1:6366092/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATgg > 1:3346873/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATggg < 2:3116908/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 2:6106018/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 1:1281989/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGACTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGG‑GTC‑CTGAATCTCTGCTGGATGGGt > 1:3103618/1‑93 (MQ=255)
cgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGtt < 1:3189973/93‑1 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:437818/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 1:539452/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa < 2:2170493/93‑1 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 1:4691199/1‑93 (MQ=255)
tctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa < 2:1899987/92‑1 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:1481203/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:1853606/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:5653177/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 1:3298422/1‑93 (MQ=255)
ctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAg > 1:5970634/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 2:6130028/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt > 1:5499455/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATg < 1:791689/93‑1 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:1604210/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:4409424/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc < 1:3889164/93‑1 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:3034600/1‑93 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 2:4977936/93‑1 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg < 1:3591051/93‑1 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg < 2:1229841/93‑1 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg < 1:2772400/93‑1 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggt < 1:5671463/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg < 2:3346281/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGAGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg > 2:2400930/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc > 1:1370405/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa > 1:2287190/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc < 1:4059879/93‑1 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc < 1:3778214/93‑1 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 2:3039411/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 1:1634409/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 2:1883554/93‑1 (MQ=255)
cGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaa < 2:2945271/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa > 2:641344/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa > 1:5087266/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag < 1:2936597/93‑1 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag > 1:1366123/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGGATCTCTGCTGGATGGGTTAGCAGGTGCTTCGTGGTGCACTGAAAagag > 1:2360515/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 1:3991339/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga > 2:5927007/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:544595/93‑1 (MQ=255)
gcTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgg < 2:527640/92‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt < 2:876830/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 1:1854127/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt < 1:1322486/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt < 2:3808997/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt > 2:2086484/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc < 1:3271235/93‑1 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 1:1204641/93‑1 (MQ=255)
tGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:2425628/1‑93 (MQ=255)
tGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:1618641/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc > 2:6423523/1‑93 (MQ=255)
tgcGCTGATTATGGTGGGCGGTCG‑C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc < 2:2657760/91‑1 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc < 1:691083/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt < 1:4821343/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt < 1:5821939/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt < 1:2219099/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTg < 1:3705176/93‑1 (MQ=255)
cTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcg > 2:4185986/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcg > 2:653234/1‑93 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgc > 1:981794/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 1:6205976/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 1:1534039/93‑1 (MQ=255)
tggtgcGCGGTCG‑C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg < 1:3235173/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 1:5172710/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGACGCGGTTTCTGCACCCGCGCCACAGGt < 1:5879318/93‑1 (MQ=255)
gtggGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 1:3370327/93‑1 (MQ=255)
tggGCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCg < 2:4514608/93‑1 (MQ=255)
gggCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa > 2:2927793/1‑93 (MQ=255)
gggCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa > 2:1501074/1‑93 (MQ=255)
gCGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc < 2:5787772/93‑1 (MQ=255)
cGGT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 1:2590528/93‑1 (MQ=255)
ggT‑G‑GCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg < 1:1114300/93‑1 (MQ=255)
|
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑G‑G‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005509‑4005687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑C > SRR4302534.3759459/1‑94 (MQ=60)
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑C > SRR4302534.3257048/1‑94 (MQ=60)
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑CC < SRR4302534.1142857/94‑1 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑Cct < SRR4302534.4459031/94‑3 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑Cctg < SRR4302534.899327/94‑4 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑Cctg < SRR4302534.731513/94‑4 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑Cctg > SRR4302534.255695/1‑91 (MQ=60)
ATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGT < SRR4302534.6568295/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTA < SRR4302534.3575420/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTAT > SRR4302534.23731/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTAT < SRR4302534.283201/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCT < SRR4302534.2549463/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTG < SRR4302534.2160107/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGC < SRR4302534.372214/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑Cctgtatttctgt > SRR4302534.6587918/1‑82 (MQ=60)
GGCGGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGC < SRR4302534.2733972/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCT > SRR4302534.1034611/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTG < SRR4302534.5075750/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGGATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGG > SRR4302534.4199935/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGA < SRR4302534.2209742/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302534.1669518/94‑1 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302534.269531/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGG < SRR4302534.6537997/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302534.3436467/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302534.1996061/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGACTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGG‑‑GGTCCTGAATCTCTGCTGGATGGGT > SRR4302534.3185252/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302534.4160349/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302534.1315733/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA < SRR4302534.3274423/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302534.552813/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA < SRR4302534.2691292/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302534.3719627/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC > SRR4302534.4818541/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA > SRR4302534.3386442/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA > SRR4302534.3344783/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302534.2454013/94‑1 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG > SRR4302534.6132797/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTAACGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302534.1312208/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT > SRR4302534.5647762/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC < SRR4302534.811517/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302534.3114179/1‑94 (MQ=60)
TGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACG < SRR4302534.3993568/94‑1 (MQ=60)
TGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACG < SRR4302534.6087828/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG < SRR4302534.3687635/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT < SRR4302534.2845350/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302534.5825017/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302534.3912457/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302534.1406518/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA > SRR4302534.2347885/1‑94 (MQ=60)
GATTAACGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA < SRR4302534.5035488/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302534.2767607/1‑94 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT < SRR4302534.4168776/94‑1 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT > SRR4302534.1677016/1‑94 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT < SRR4302534.3879645/94‑1 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA < SRR4302534.116105/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302534.4287659/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAA > SRR4302534.5224576/1‑94 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTTGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302534.4029701/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG > SRR4302534.1402104/1‑94 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGGATCTCTGCTGGATGGGTTAGCAGGTGCTTCGTGGTGCACTGAAAAGAG > SRR4302534.2423173/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302534.3013671/94‑1 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302534.5779537/94‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302534.4098170/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302534.1318259/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGT > SRR4302534.94028/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGT > SRR4302534.1902378/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT < SRR4302534.1453367/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302534.6504990/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302534.1357359/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGAGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAGAAAGAGGCGGTTT > SRR4302534.1587920/1‑94 (MQ=60)
GCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT < SRR4302534.3376301/94‑1 (MQ=60)
GCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT < SRR4302534.3358381/94‑1 (MQ=60)
GCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCT > SRR4302534.553773/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302534.5454468/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG < SRR4302534.5306824/94‑1 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302534.1660875/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302534.2490124/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG < SRR4302534.1236334/94‑1 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302534.3301669/1‑94 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302534.168104/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302534.3168846/94‑1 (MQ=60)
CATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC > SRR4302534.1405711/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC < SRR4302534.3058312/94‑1 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302534.1395138/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302534.3395430/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGTT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302534.60060/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302534.707997/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302534.2852849/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.4952193/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.2277876/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.5214160/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.869417/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.5979968/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302534.6651531/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302534.3804781/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302534.2287374/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGC > SRR4302534.1006854/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302534.448906/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA < SRR4302534.5840653/94‑1 (MQ=60)
TTATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA < SRR4302534.4192615/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCAGCGCCACAG > SRR4302534.6263214/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302534.6374716/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302534.1574275/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCGCGGTCGC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGT < SRR4302534.3321211/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302534.5312125/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGACGCGGTTTCTGCACCCGCGCCACAGGTC < SRR4302534.6038948/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302534.3460625/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302534.3672051/94‑1 (MQ=60)
GGCGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC < SRR4302534.4920034/94‑1 (MQ=60)
CGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302534.2659106/94‑1 (MQ=60)
CGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTA < SRR4302534.2712068/94‑1 (MQ=60)
CGGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAAGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGGTG > SRR4302534.251522/1‑94 (MQ=60)
GGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302534.1143391/94‑1 (MQ=60)
GGT‑GGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302534.3807655/94‑1 (MQ=60)
GC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302534.5281808/1‑94 (MQ=60)
GC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302534.1691861/1‑94 (MQ=60)
GC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302534.1397105/1‑94 (MQ=60)
GC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302534.3698715/1‑94 (MQ=60)
GC‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302534.103745/1‑94 (MQ=60)
ggcCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA < SRR4302534.148935/91‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302534.4526983/94‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302534.4286109/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCCGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302534.6490711/1‑94 (MQ=60)
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CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
