Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,288,835 |
T→C |
W261R (TGG→CGG) |
nrfD → |
formate‑dependent nitrate reductase complex |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,288,835 | 0 | T | C | 100.0%
| 753.4
/ NA
| 218 | W261R (TGG→CGG) | nrfD | formate‑dependent nitrate reductase complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (116/102); total (116/102) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCC > NC_000913/4288745‑4288924
|
ctgctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACgcgg > 1:3569642/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACgcggt > 2:1448733/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACgcggg > 1:3751939/1‑92 (MQ=255)
ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGtt > 2:278066/1‑93 (MQ=255)
ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGtt > 2:305108/1‑93 (MQ=255)
ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGtt < 1:21447/93‑1 (MQ=255)
ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGtt < 2:4065588/93‑1 (MQ=255)
gtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTc > 2:1942082/1‑93 (MQ=255)
gtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTc < 2:5916069/93‑1 (MQ=255)
gtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTc < 2:2919667/93‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTgg > 2:1645878/1‑93 (MQ=255)
ttttGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTgg > 1:1269838/1‑93 (MQ=255)
ttttGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTgg > 2:707518/1‑93 (MQ=255)
tttGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGgt > 2:5689645/1‑93 (MQ=255)
gTCGGTCTGGCGGTGGGCGATCACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTc < 1:1899322/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTCGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTc > 2:139270/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGcc > 2:1828676/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgg < 2:122184/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgg < 2:6365999/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCggg > 2:2128056/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTCGGTGTCGCCggg < 1:4904673/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggc > 2:5107359/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggct > 2:434800/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctg < 1:2711800/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctgg < 2:4645985/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctgg < 2:6050271/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctgg < 2:5298571/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctgg < 1:6100783/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctggggc > 1:5111002/1‑93 (MQ=255)
gggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCgggctggggct > 1:1736853/1‑93 (MQ=255)
gCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGa > 1:3946425/1‑93 (MQ=255)
gCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGa > 1:2008050/1‑93 (MQ=255)
gATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGAtt > 2:2743870/1‑93 (MQ=255)
gATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGAtt > 1:2748434/1‑93 (MQ=255)
aTGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATtg > 1:6208566/1‑93 (MQ=255)
aTGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATtg > 1:2035827/1‑93 (MQ=255)
aTGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATtg > 1:949431/1‑93 (MQ=255)
gACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATtgtg < 1:5475961/93‑1 (MQ=255)
ggTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCa > 1:5606747/1‑93 (MQ=255)
ggTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCa > 2:2011110/1‑93 (MQ=255)
ggTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCa < 1:2913457/93‑1 (MQ=255)
gTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCaa < 2:5578508/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAt < 1:4730287/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtg > 2:3827616/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtg < 2:4123596/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtg > 2:881833/1‑93 (MQ=255)
aaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgc < 2:3936428/93‑1 (MQ=255)
aaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgc < 2:5458851/93‑1 (MQ=255)
aaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgc > 1:1208161/1‑93 (MQ=255)
aGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGCTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGGCAAtgct > 1:2287299/1‑93 (MQ=255)
gTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgctg > 1:2954440/1‑93 (MQ=255)
gTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgctg > 2:1990384/1‑93 (MQ=255)
gTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAtgctg > 1:1480787/1‑93 (MQ=255)
gTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCa > 2:2112794/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCaa > 2:2641142/1‑93 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAc > 2:1558683/1‑93 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAc < 1:4081310/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAc < 1:4629045/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAc > 1:210830/1‑93 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAc < 1:6025236/93‑1 (MQ=255)
gcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAcc > 2:4692810/1‑93 (MQ=255)
gcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAcc > 2:1082122/1‑93 (MQ=255)
gcTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAcc > 1:4424059/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCg < 1:1791529/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGt < 2:3423957/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGGCATGAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGt > 1:5150624/1‑93 (MQ=255)
ggtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTg < 2:6117096/93‑1 (MQ=255)
ggtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTg > 2:4858656/1‑93 (MQ=255)
ggtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTg > 2:6181839/1‑93 (MQ=255)
gtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTgg > 2:2789811/1‑93 (MQ=255)
gtggCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTgg > 1:661042/1‑93 (MQ=255)
gcggcATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTc < 2:4494851/93‑1 (MQ=255)
aTTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCg > 2:5443448/1‑93 (MQ=255)
ttAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGc > 2:5281545/1‑93 (MQ=255)
ttAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGc > 2:4765655/1‑93 (MQ=255)
ttAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGc > 2:4652527/1‑93 (MQ=255)
tAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCa < 1:3067058/93‑1 (MQ=255)
tAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCa < 2:1284946/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAg < 2:2306792/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAg > 2:2492945/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGt > 1:4429986/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGtt < 2:6257725/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGtt > 1:2367504/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGtt < 2:1901214/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTcc > 2:5881569/1‑93 (MQ=255)
gcgcTTCCTGGACGCGGTGTTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCg < 1:4288459/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCg < 1:1990921/93‑1 (MQ=255)
gTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCa < 2:2234652/93‑1 (MQ=255)
tttCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAt > 1:1154158/1‑93 (MQ=255)
tttCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAt < 2:3570858/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAtt > 1:2613531/1‑93 (MQ=255)
tCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTc < 1:5431986/93‑1 (MQ=255)
tCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTc > 1:1398213/1‑93 (MQ=255)
tCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTc < 1:1301597/93‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTcc < 2:2366884/93‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTcc < 1:3221338/93‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTcc < 1:5840341/93‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTcc < 1:2417265/93‑1 (MQ=255)
tGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCt > 2:5409740/1‑93 (MQ=255)
aCGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGcc > 2:6413418/1‑93 (MQ=255)
|
CTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCC > NC_000913/4288745‑4288924
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGC > NC_000913/4288742‑4288928
|
TTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGC > SRR4302534.3523514/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGC < SRR4302534.3778703/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCG < SRR4302534.1640890/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGG < SRR4302534.2695934/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGG > SRR4302534.3665648/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCGGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGT < SRR4302534.1231832/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTG < SRR4302534.44934/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGT < SRR4302534.6031276/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGT > SRR4302534.1631803/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGT < SRR4302534.2497327/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCAGGCGCTGGGCCATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGT < SRR4302534.519932/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGCGTTTTTTGACGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGCCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGT < SRR4302534.3159634/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTT < SRR4302534.2208195/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTT < SRR4302534.3718621/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTC < SRR4302534.22019/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTG < SRR4302534.6346864/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTG > SRR4302534.2008984/1‑94 (MQ=60)
CGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGCACGCGGTGGATCTGGCT > SRR4302534.997387/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTT > SRR4302534.4273931/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTT < SRR4302534.2185456/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGG > SRR4302534.1303287/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGG < SRR4302534.5259226/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGGTTCTGGGCGGGGTGGTTGTGGGTTGG > SRR4302534.2798776/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTC > SRR4302534.5922/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTC < SRR4302534.2108717/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTCTGGCGGTGGGCGATCACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCG < SRR4302534.1948862/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCC > SRR4302534.4608137/1‑94 (MQ=60)
gttcgtgcgctgtgctatgatGGTAAATTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCG < SRR4302534.3524176/73‑1 (MQ=60)
GTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGG > SRR4302534.12784/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTCGGTGTCGCCGGGC < SRR4302534.5037633/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCT < SRR4302534.1363001/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGG < SRR4302534.4338826/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGG < SRR4302534.3027042/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGG < SRR4302534.2783394/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGG < SRR4302534.5595228/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGG < SRR4302534.6266679/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGG > SRR4302534.995034/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGG < SRR4302534.1327296/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGC > SRR4302534.5248927/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGATTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTtgagtcggcggggcgcggc > SRR4302534.3984446/1‑75 (MQ=60)
TGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCT < SRR4302534.5664011/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCT < SRR4302534.385494/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCT > SRR4302534.1781957/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCT > SRR4302534.5403902/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTG < SRR4302534.5601608/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGA > SRR4302534.4052093/1‑94 (MQ=60)
GGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGA > SRR4302534.2060599/1‑94 (MQ=60)
GGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGA < SRR4302534.2122787/94‑1 (MQ=60)
CGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATT < SRR4302534.206313/94‑1 (MQ=60)
CGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATT > SRR4302534.2820843/1‑94 (MQ=60)
GATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTG > SRR4302534.973601/1‑94 (MQ=60)
GATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTG > SRR4302534.3607982/1‑94 (MQ=60)
GATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTG > SRR4302534.2089060/1‑94 (MQ=60)
GATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTG > SRR4302534.2934413/1‑94 (MQ=60)
GATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTG > SRR4302534.6377338/1‑94 (MQ=60)
ATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGT < SRR4302534.628678/94‑1 (MQ=60)
GACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGC < SRR4302534.5623617/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCA > SRR4302534.5023072/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCA > SRR4302534.5758402/1‑94 (MQ=60)
GGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAA < SRR4302534.2989923/94‑1 (MQ=60)
GTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAT > SRR4302534.515624/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATG < SRR4302534.4858746/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGC > SRR4302534.1239952/1‑94 (MQ=60)
AAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCT > SRR4302534.2056027/1‑94 (MQ=60)
AAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGCTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGGCAATGCT > SRR4302534.2347997/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTG > SRR4302534.1519725/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTG > SRR4302534.3031891/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAAC > SRR4302534.216359/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGTGCTGATTTTGCCAATGCTGCTCAAACC < SRR4302534.5087085/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACC < SRR4302534.6188976/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACC < SRR4302534.4754660/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACC > SRR4302534.4543512/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACC < SRR4302534.4190863/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCG > SRR4302534.3215615/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCG < SRR4302534.460834/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCG > SRR4302534.2706958/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGT < SRR4302534.1838064/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGCGGCATGAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGT > SRR4302534.5289573/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTG > SRR4302534.4164794/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTAGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCCCAAACCGTGG < SRR4302534.522368/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGG > SRR4302534.4549463/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGG > SRR4302534.681725/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGG > SRR4302534.677116/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGG > SRR4302534.2401777/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGG > SRR4302534.3074260/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTC > SRR4302534.6142850/1‑94 (MQ=60)
GGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAAT > SRR4302534.4769093/1‑94 (MQ=60)
GCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATC > SRR4302534.6592834/1‑94 (MQ=60)
CATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCG < SRR4302534.5855335/94‑1 (MQ=60)
CATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCG > SRR4302534.1901659/1‑94 (MQ=60)
TTAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCA < SRR4302534.2261464/94‑1 (MQ=60)
TAGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAG < SRR4302534.3147595/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGT > SRR4302534.4549600/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGT < SRR4302534.2433293/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTT > SRR4302534.1452370/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTT < SRR4302534.6225038/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTT > SRR4302534.2430361/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCCATGCTGCTCAAACCGTGGGGCAATCGCAGGTC > SRR4302534.2484036/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCG < SRR4302534.2948149/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGG < SRR4302534.2043054/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTCCTGGACGCGGTGTTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGG < SRR4302534.4404643/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCA > SRR4302534.3677932/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAT > SRR4302534.1184420/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATT > SRR4302534.2682694/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTC > SRR4302534.1434998/1‑94 (MQ=60)
TCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCC < SRR4302534.5578219/94‑1 (MQ=60)
TCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCC < SRR4302534.1804601/94‑1 (MQ=60)
TCTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCC < SRR4302534.1335922/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCT < SRR4302534.3306870/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCT < SRR4302534.2481552/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCA < SRR4302534.5998885/94‑1 (MQ=60)
TGGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTG < SRR4302534.1331251/94‑1 (MQ=60)
GGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGTTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGC > SRR4302534.2038081/1‑94 (MQ=60)
GGACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGC < SRR4302534.1739676/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCG > SRR4302534.2301317/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTG > SRR4302534.1041801/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGC > SRR4302534.491373/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGC > SRR4302534.2360836/1‑94 (MQ=60)
|
TTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGC > NC_000913/4288742‑4288928
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
