Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,402,992 |
A→G |
N243S (AAC→AGC) |
purA → |
adenylosuccinate synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,402,992 | 0 | A | G | 100.0%
| 937.4
/ NA
| 263 | N243S (AAC→AGC) | purA | adenylosuccinate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (130/133); total (130/133) |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
TCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTC > NC_000913/4402903‑4403081
|
tCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAgcac < 2:4916858/93‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGcacc > 1:5715445/1‑93 (MQ=255)
cAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGcacc < 1:2098969/93‑1 (MQ=255)
aGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGcacca > 2:6362885/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCActg > 2:591385/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCActgc < 2:1297354/93‑1 (MQ=255)
ggCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGAACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCActgct > 2:1745101/1‑93 (MQ=255)
gCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCActgctg < 1:6255227/93‑1 (MQ=255)
gCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCActgctg > 2:2043411/1‑93 (MQ=255)
gATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCtggt < 2:2478549/93‑1 (MQ=255)
tttCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCtggtgg < 2:4894046/93‑1 (MQ=255)
tttCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCtggtgg < 1:703511/93‑1 (MQ=255)
tttCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCtggcgg > 2:3786122/1‑93 (MQ=255)
tCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcg < 2:1872594/93‑1 (MQ=255)
gTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcgtg > 2:1580489/1‑93 (MQ=255)
tCATGTTTGCAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcgtgg < 1:5159719/93‑1 (MQ=255)
tCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcgtgg < 2:2657124/93‑1 (MQ=255)
cATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcgtggc < 2:383685/93‑1 (MQ=255)
cATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGgtggcgtggc < 2:4800264/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGtggcgtggcg > 1:2046154/1‑93 (MQ=255)
gTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACGACTGCTGGTGGCGTGGCGAc < 1:1084513/93‑1 (MQ=255)
gTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGAc < 2:5689391/93‑1 (MQ=255)
gTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGAc < 1:4520580/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGt < 1:1020853/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGGACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGtt > 1:6150313/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTCCTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTc < 1:131732/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTc < 1:5276458/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTc > 2:105112/1‑93 (MQ=255)
ggTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTcc > 1:6136068/1‑93 (MQ=255)
ggTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTcc > 2:6074354/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGc > 1:4235314/1‑93 (MQ=255)
gcgcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGc > 2:4526785/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGcc > 2:602124/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGcc < 2:4620888/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCt < 1:565736/93‑1 (MQ=255)
gcAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCt > 2:5376933/1‑93 (MQ=255)
aGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTgg < 1:2347548/93‑1 (MQ=255)
aGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTgg > 1:6404406/1‑93 (MQ=255)
aGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTgg > 1:6452749/1‑93 (MQ=255)
gggTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTggg > 2:417998/1‑93 (MQ=255)
ggTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGc < 2:1467559/93‑1 (MQ=255)
ggTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGc > 1:3127846/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCcgc > 2:4334744/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGt < 2:3332460/93‑1 (MQ=255)
ctgctgAATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGt < 1:1487554/93‑1 (MQ=255)
gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTa > 2:1108401/1‑93 (MQ=255)
gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTa > 2:1394593/1‑93 (MQ=255)
gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTa < 1:4183628/93‑1 (MQ=255)
gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTa > 2:551860/1‑93 (MQ=255)
gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTa > 1:5060408/1‑93 (MQ=255)
ggATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCTGGCCTGGGCCCGCGTTATGt < 1:3651598/93‑1 (MQ=255)
ggATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGt < 2:3675904/93‑1 (MQ=255)
gATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATgct < 1:3348036/93‑3 (MQ=255)
atatCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGttc > 2:6201146/1‑92 (MQ=255)
tatCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTgc > 2:1821963/1‑92 (MQ=255)
tCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGAtt > 2:6315100/1‑93 (MQ=255)
cGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTa < 2:4391733/93‑1 (MQ=255)
gACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTAc < 2:3384419/93‑1 (MQ=255)
gACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTAc > 1:1418724/1‑93 (MQ=255)
gACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGCTATGTTGATTAc > 1:4800964/1‑93 (MQ=255)
ccACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGt < 1:2709821/93‑1 (MQ=255)
ccACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGt < 1:3709590/93‑1 (MQ=255)
ccACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGt < 1:5985408/93‑1 (MQ=255)
cACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGtt > 2:4678834/1‑93 (MQ=255)
cACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGtt > 2:3935908/1‑93 (MQ=255)
cACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGtt < 2:6427646/93‑1 (MQ=255)
aCGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTc > 1:6281914/1‑93 (MQ=255)
cGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCt < 1:2208395/93‑1 (MQ=255)
cGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCt > 2:2113074/1‑93 (MQ=255)
cGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCt > 2:370334/1‑93 (MQ=255)
gTACTTNTCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTgg < 2:705616/93‑1 (MQ=255)
gTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTgg < 1:1778393/93‑1 (MQ=255)
gTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGCCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTgg < 1:34255/93‑1 (MQ=255)
tACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTggg > 1:2991977/1‑93 (MQ=255)
aCTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGt > 1:1658477/1‑93 (MQ=255)
aCTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGt > 2:5057908/1‑93 (MQ=255)
tATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATc < 1:4478609/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATcc < 2:5648740/93‑1 (MQ=255)
tCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCt > 1:5321312/1‑93 (MQ=255)
tCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCt < 2:2260487/93‑1 (MQ=255)
tCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCt > 2:2499742/1‑93 (MQ=255)
ccGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTc < 1:3840234/93‑1 (MQ=255)
ccGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTc < 1:4051534/93‑1 (MQ=255)
gtacgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCaa < 2:1538784/93‑1 (MQ=255)
gtacgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCaa > 2:1235401/1‑93 (MQ=255)
gtacgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCaa < 2:2738095/93‑1 (MQ=255)
tacgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCaaa < 2:3996416/93‑1 (MQ=255)
tacgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCaaa > 1:4325271/1‑93 (MQ=255)
acgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAg > 2:5196224/1‑93 (MQ=255)
cgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGGCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAgt > 1:4922571/1‑92 (MQ=255)
cgtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGc < 1:2153748/93‑1 (MQ=255)
gtaACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCt < 1:290234/93‑1 (MQ=255)
aaCTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTa > 1:5871092/1‑93 (MQ=255)
aaCTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTa > 2:2139556/1‑93 (MQ=255)
aCTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGCATCCTCAAAGCTTAc > 1:4754706/1‑93 (MQ=255)
cttcttCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACt < 1:1579761/93‑1 (MQ=255)
cttcttCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACt < 1:4653234/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCAGTACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGCTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTc > 1:2497714/1‑93 (MQ=255)
ttcCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCAc > 2:2899234/1‑93 (MQ=255)
ccAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTc < 2:2939211/93‑1 (MQ=255)
|
TCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTC > NC_000913/4402903‑4403081
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGT > NC_000913/4402899‑4403085
|
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG < SRR4302534.924364/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG > SRR4302534.5023011/1‑94 (MQ=60)
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG < SRR4302534.365213/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG < SRR4302534.2575888/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG < SRR4302534.1745075/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAG > SRR4302534.1535603/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCA < SRR4302534.5929896/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCAC > SRR4302534.137905/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACC > SRR4302534.5870294/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCA < SRR4302534.2154049/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTATGTAACTTCTTCCAGCACCAC < SRR4302534.6489328/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCAC < SRR4302534.4191562/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCAC > SRR4302534.2744722/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACT > SRR4302534.5155185/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACT < SRR4302534.2291398/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACT < SRR4302534.4063949/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTG > SRR4302534.868335/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCAGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTG > SRR4302534.5457149/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCT > SRR4302534.4812529/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTG > SRR4302534.1791232/1‑94 (MQ=60)
GCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGG < SRR4302534.6424765/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACTACTGCTGGT < SRR4302534.6443281/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGT < SRR4302534.4385755/94‑1 (MQ=60)
GATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTG < SRR4302534.4725465/94‑1 (MQ=60)
GATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTG < SRR4302534.335195/94‑1 (MQ=60)
GATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTG > SRR4302534.5043348/1‑94 (MQ=60)
GATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTG < SRR4302534.1194863/94‑1 (MQ=60)
TTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGC < SRR4302534.720764/94‑1 (MQ=60)
TCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGT > SRR4302534.3574341/1‑94 (MQ=60)
CGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTG > SRR4302534.718529/1‑94 (MQ=60)
GTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGG < SRR4302534.170105/94‑1 (MQ=60)
TCATGTTTGCAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGC < SRR4302534.5298845/94‑1 (MQ=60)
CATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCG > SRR4302534.2099638/1‑94 (MQ=60)
GTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACGACTGCTGGTGGCGTGGCGACC < SRR4302534.1112713/94‑1 (MQ=60)
GTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACC < SRR4302534.2827911/94‑1 (MQ=60)
GTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACC < SRR4302534.1564373/94‑1 (MQ=60)
GTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACC < SRR4302534.4643038/94‑1 (MQ=60)
TTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGG < SRR4302534.5304646/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGGACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTT > SRR4302534.6317628/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTT < SRR4302534.1047133/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTCCTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCC < SRR4302534.135212/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCG > SRR4302534.2115915/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCC > SRR4302534.6302972/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCC < SRR4302534.5418935/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCC < SRR4302534.2233648/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCG < SRR4302534.2182502/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCG < SRR4302534.6252404/94‑1 (MQ=60)
TGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGC > SRR4302534.4349481/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCT < SRR4302534.1484367/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCT < SRR4302534.4577580/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTG < SRR4302534.579641/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTG < SRR4302534.6417653/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGG > SRR4302534.6626624/1‑94 (MQ=60)
CAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGG > SRR4302534.6577298/1‑94 (MQ=60)
AGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGG < SRR4302534.6618249/94‑1 (MQ=60)
AGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGG < SRR4302534.2409840/94‑1 (MQ=60)
AGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGG > SRR4302534.5629607/1‑94 (MQ=60)
TGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGC > SRR4302534.3210082/1‑94 (MQ=60)
GGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGC > SRR4302534.2052436/1‑94 (MQ=60)
GGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGC > SRR4302534.4535579/1‑94 (MQ=60)
GTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCCCCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCC < SRR4302534.5158448/94‑1 (MQ=60)
GTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCC < SRR4302534.2109547/94‑1 (MQ=60)
GTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCC < SRR4302534.2248612/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTTCGGCCTGGGCCCGC > SRR4302534.3332579/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGC > SRR4302534.2667516/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTT > SRR4302534.350368/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCCGCCTGGGCCCGCGTT > SRR4302534.5091944/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGAATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTT < SRR4302534.1526684/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTA > SRR4302534.6196666/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTA > SRR4302534.5197070/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTAT < SRR4302534.4296695/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTAT < SRR4302534.5462974/94‑1 (MQ=60)
TGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGT > SRR4302534.3163140/1‑94 (MQ=60)
TGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGT < SRR4302534.414785/94‑1 (MQ=60)
TGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGT > SRR4302534.256126/1‑94 (MQ=60)
TGGATATCGACCACGGGACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGCGCCCGCGTTATGT > SRR4302534.4831858/1‑94 (MQ=60)
GGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCTGGCCTGGGCCCGCGTTATGTT < SRR4302534.3749733/94‑1 (MQ=60)
GGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTT > SRR4302534.4990300/1‑94 (MQ=60)
GATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGCTG < SRR4302534.3437685/94‑1 (MQ=60)
TATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGAT > SRR4302534.3098424/1‑94 (MQ=60)
ATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATT > SRR4302534.6308893/1‑94 (MQ=60)
CGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTAC > SRR4302534.1296199/1‑94 (MQ=60)
CGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTAC > SRR4302534.1456054/1‑94 (MQ=60)
CGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGCTATGTTGATTAC > SRR4302534.4931329/1‑94 (MQ=60)
GACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACG < SRR4302534.3566051/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTT < SRR4302534.3809321/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTT < SRR4302534.6090065/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTT < SRR4302534.6148000/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTT < SRR4302534.2781369/94‑1 (MQ=60)
CACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTC > SRR4302534.6451913/1‑94 (MQ=60)
CGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTG < SRR4302534.3041138/94‑1 (MQ=60)
CGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTG < SRR4302534.2266861/94‑1 (MQ=60)
GGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGG > SRR4302534.778165/1‑94 (MQ=60)
GTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGG < SRR4302534.1824579/94‑1 (MQ=60)
GTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGG < SRR4302534.5257520/94‑1 (MQ=60)
GTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGG > SRR4302534.3070179/1‑94 (MQ=60)
GTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGCCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGG < SRR4302534.35160/94‑1 (MQ=60)
TACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGT < SRR4302534.6312217/94‑1 (MQ=60)
TACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGT > SRR4302534.1701685/1‑94 (MQ=60)
TACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGT < SRR4302534.5322442/94‑1 (MQ=60)
CTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTAT < SRR4302534.3763251/94‑1 (MQ=60)
TTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATC < SRR4302534.5824710/94‑1 (MQ=60)
TTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATC > SRR4302534.6630598/1‑94 (MQ=60)
TTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATC > SRR4302534.4160246/1‑94 (MQ=60)
TTATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATC < SRR4302534.1422003/94‑1 (MQ=60)
TATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCC < SRR4302534.4599774/94‑1 (MQ=60)
ATCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCT > SRR4302534.5464833/1‑94 (MQ=60)
TCCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTC < SRR4302534.6448333/94‑1 (MQ=60)
CCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGTGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCA > SRR4302534.2374712/1‑94 (MQ=60)
CCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCA < SRR4302534.4160199/94‑1 (MQ=60)
CCGTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCA < SRR4302534.3943384/94‑1 (MQ=60)
GTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAA > SRR4302534.4442291/1‑94 (MQ=60)
GTACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAA > SRR4302534.4646396/1‑94 (MQ=60)
TACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAG < SRR4302534.4322545/94‑1 (MQ=60)
TACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAG > SRR4302534.1687284/1‑94 (MQ=60)
ACGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGGCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGT > SRR4302534.5055981/1‑94 (MQ=60)
CGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCGCGGCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGCTCTGCGTATCCTCAcaact > SRR4302534.1529960/1‑89 (MQ=60)
CGTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCT < SRR4302534.2210601/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTT < SRR4302534.297739/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTT < SRR4302534.153286/94‑1 (MQ=60)
TAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTA > SRR4302534.6030503/1‑94 (MQ=60)
TAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTA < SRR4302534.6474149/94‑1 (MQ=60)
TAACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTA > SRR4302534.3753364/1‑94 (MQ=60)
AACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTAC > SRR4302534.3840803/1‑94 (MQ=60)
AACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTAC > SRR4302534.4884505/1‑94 (MQ=60)
AACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGCATCCTCAAAGCTTAC > SRR4302534.4883776/1‑94 (MQ=60)
ACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACT < SRR4302534.4618167/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACT < SRR4302534.2028441/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACT < SRR4302534.5884137/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTCCAGTACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGCTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTC > SRR4302534.2564045/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTC < SRR4302534.4779556/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTC > SRR4302534.584879/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTC < SRR4302534.1621087/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGATCCGGCCTGGGACCGCGTTATGTTGATTAAGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCC > SRR4302534.2793596/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCA < SRR4302534.5954384/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCACCACTACTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCAC > SRR4302534.4441328/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACT > SRR4302534.108413/1‑94 (MQ=60)
CAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTAGTCCACTCGT > SRR4302534.494015/1‑94 (MQ=60)
CAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGT < SRR4302534.1544291/94‑1 (MQ=60)
CAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGT > SRR4302534.6299603/1‑94 (MQ=60)
CAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGT > SRR4302534.5370352/1‑94 (MQ=60)
CAGCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGT < SRR4302534.4850580/94‑1 (MQ=60)
GCACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGT < SRR4302534.2275019/94‑1 (MQ=60)
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CGCGTCAGCGTGGCGATTTCGTCATGTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGT > NC_000913/4402899‑4403085
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
