Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F2 I207 R1
|
218 |
45.0 |
2482936 |
97.1% |
2410930 |
86.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
674,442 |
T→G |
T141P (ACT→CCT) |
ybeT ← |
tetratricopeptide repeat protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 674,442 | 0 | T | G | 100.0%
| 174.9
/ NA
| 50 | T141P (ACT→CCT) | ybeT | tetratricopeptide repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (22/28); total (22/28) |
GTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGTATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAG > NZ_CP009273/674355‑674523
|
gttgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGgat > 1:1193561/1‑90 (MQ=255)
gttgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGgat > 1:842275/1‑90 (MQ=255)
tgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGatat < 2:369964/90‑1 (MQ=255)
tgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGatat < 2:1043415/90‑1 (MQ=255)
tgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGatat > 1:926508/1‑90 (MQ=255)
tgttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGatat < 1:655316/90‑1 (MQ=255)
gttTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATAtt < 1:369677/90‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtga > 2:1227738/1‑90 (MQ=255)
gCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagca < 2:558710/90‑1 (MQ=255)
gCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagca < 2:511106/90‑1 (MQ=255)
gCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagca < 2:275106/90‑1 (MQ=255)
cGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcat < 2:1202851/90‑1 (MQ=255)
cGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcat < 2:1159743/90‑1 (MQ=255)
cGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcat < 2:722419/90‑1 (MQ=255)
ggTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcatg < 2:181709/90‑1 (MQ=255)
ggTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcatg < 2:296029/90‑1 (MQ=255)
ggTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcatg > 1:1199073/1‑90 (MQ=255)
cAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagc > 2:1222426/1‑84 (MQ=255)
cAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagc < 1:1222426/84‑1 (MQ=255)
aaCCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCt < 1:1011825/90‑1 (MQ=255)
tttttGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGGTCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTc > 2:1132814/1‑90 (MQ=255)
tttttGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTc > 2:338255/1‑90 (MQ=255)
agaTTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAgctgc < 2:34150/90‑1 (MQ=255)
aagatCAAAAAGGTTAAAAATTAATCCCTGGGCCTTTTTTTAAGAT‑AAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAgctgc < 1:241432/86‑1 (MQ=255)
gaTTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAgctgct < 1:911830/90‑1 (MQ=255)
gTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCa > 1:249982/1‑90 (MQ=255)
tAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCaga > 1:30267/1‑90 (MQ=255)
tAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCaga > 2:839478/1‑90 (MQ=255)
c‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGaa < 2:586397/90‑1 (MQ=255)
c‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGaa > 1:315314/1‑90 (MQ=255)
aTTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAAt < 1:728991/90‑1 (MQ=255)
aTTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAAt < 1:338255/90‑1 (MQ=255)
ttAATACCTGAGCCATTTTTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAAtt < 2:738831/90‑1 (MQ=255)
aaTACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGc > 1:239458/1‑90 (MQ=255)
aaTACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGc > 1:1034018/1‑90 (MQ=255)
aaTACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATCGc < 2:147585/90‑1 (MQ=255)
cTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTAc < 2:842275/90‑1 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcat < 1:1027343/41‑1 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATtgagcat > 2:1027343/1‑41 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACg > 2:10576/1‑90 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACg > 1:272572/1‑90 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACg > 2:1001276/1‑90 (MQ=255)
tGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACg > 1:491259/1‑90 (MQ=255)
gAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACgg > 1:331192/1‑90 (MQ=255)
aGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACggg > 1:1036011/1‑90 (MQ=255)
aTTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTgagcatgagcat > 2:944624/1‑41 (MQ=255)
aTTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTgagcatgagcat < 1:944624/41‑1 (MQ=255)
aGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGa < 1:839478/90‑1 (MQ=255)
aGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGa < 1:1001276/90‑1 (MQ=255)
aaCCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCa > 1:794966/1‑90 (MQ=255)
aaCCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCa > 1:499363/1‑90 (MQ=255)
aCCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAg < 2:331192/90‑1 (MQ=255)
|
GTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAAC‑ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGTATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAG > NZ_CP009273/674355‑674523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTTTGTAATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGTATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATCC > NZ_CP009273/674345‑674540
|
TTTTTGTAATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGAT > SRR3722089.854219/1‑100 (MQ=60)
TTTTTGTAATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGAT > SRR3722089.1211706/1‑100 (MQ=60)
TTTGTAATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATAT > SRR3722089.940029/1‑100 (MQ=60)
AATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGC < SRR3722089.53960/100‑1 (MQ=60)
GTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATG > SRR3722089.1217303/1‑100 (MQ=60)
TGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAG < SRR3722089.663748/100‑1 (MQ=60)
GTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGC < SRR3722089.374220/100‑1 (MQ=60)
GGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATAC < SRR3722089.1240999/100‑1 (MQ=60)
agatggtcgtcggcagcgtcagatgtgtataagagacagCATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCC < SRR3722089.1042673/61‑1 (MQ=60)
agatggtcgtcggcagcgtcagatgtgtataagagacagTACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTC < SRR3722089.958472/61‑1 (MQ=60)
AACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTG < SRR3722089.1026896/100‑1 (MQ=60)
aagatcaaaaaggttaaaaattaatccctgggcctttttttaagatAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATAC < SRR3722089.244504/54‑1 (MQ=60)
GATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACC < SRR3722089.925102/100‑1 (MQ=60)
ATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCA > SRR3722089.253171/1‑100 (MQ=60)
TCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGA > SRR3722089.30636/1‑100 (MQ=60)
TAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAA > SRR3722089.319311/1‑100 (MQ=60)
GGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGC > SRR3722089.1049474/1‑100 (MQ=60)
GGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGC > SRR3722089.242498/1‑100 (MQ=60)
CATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACG > SRR3722089.276055/1‑100 (MQ=60)
CATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACG > SRR3722089.497078/1‑100 (MQ=60)
ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGG < SRR3722089.738475/100‑1 (MQ=60)
ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGG < SRR3722089.342474/100‑1 (MQ=60)
ATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGG > SRR3722089.335335/1‑100 (MQ=60)
TTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGG > SRR3722089.1051504/1‑100 (MQ=60)
TCTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCctgtctcttatacacatctgacgctgccgacgaccatcttagtgtagatctc > SRR3722089.479565/1‑48 (MQ=60)
CTGTGGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCA > SRR3722089.805920/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCA > SRR3722089.505271/1‑100 (MQ=60)
AGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACC < SRR3722089.1016162/100‑1 (MQ=60)
AGATCAAACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACC < SRR3722089.851369/100‑1 (MQ=60)
AACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAG > SRR3722089.9740/1‑100 (MQ=60)
ACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGG > SRR3722089.1096400/1‑100 (MQ=60)
ACCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGG > SRR3722089.218727/1‑100 (MQ=60)
CCTAAAGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGT > SRR3722089.552592/1‑100 (MQ=60)
AGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGctgtct > SRR3722089.740452/1‑94 (MQ=60)
AGGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATC > SRR3722089.533811/1‑100 (MQ=60)
GGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATCC > SRR3722089.675270/1‑100 (MQ=60)
GGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATCC < SRR3722089.1141098/100‑1 (MQ=60)
GGATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATCC > SRR3722089.502267/1‑100 (MQ=60)
|
TTTTTGTAATGTTGTTTGGCGGTCAGTTTTAACCATTTTTGAGATTCATAATGGTTAACATTAATACCTGAGCCATTTCTGTAGATCAAACCTAAAGTATATTGAGCATGAGCATACCCTTGTTCAGCTGCTTCCTTATACCAGAGAATTGCTTTACGGGTGTCGGGTTTGACCCCCAGACCTTTGAGGTAGATCC > NZ_CP009273/674345‑674540
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
