Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,775,744 |
C→A |
56.7% |
V31V (GTC→GTA) |
ydiS → |
putative oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,775,744 | 0 | C | A | 56.7%
| ‑1.1
/ inf
| 282 | V31V (GTC→GTA) | ydiS | putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (64/58); new base A (78/82); total (142/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
TTCCCCTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTCTTAAC > CP009273/1775597‑1775893
|
ttCCCCTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCt < 1:1095669/150‑1 (MQ=255)
ccccTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTgg > 1:1495256/1‑150 (MQ=255)
cccTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGt < 1:1312648/150‑1 (MQ=255)
cTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGa > 2:659884/1‑150 (MQ=255)
tttCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGAt < 1:889188/150‑1 (MQ=255)
cAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGa < 1:764383/150‑1 (MQ=255)
aaCCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGaa > 2:2521942/1‑150 (MQ=255)
ccACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcg > 2:1712134/1‑150 (MQ=255)
cacaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgc < 1:2654395/150‑1 (MQ=255)
cacaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAAcgc < 2:1529384/150‑1 (MQ=255)
acaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAAcgcg < 2:4599890/150‑1 (MQ=255)
acaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAAcgcg > 1:645261/1‑150 (MQ=255)
acaTCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAAGTTGATGCCATTGGGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAAcgcg > 1:1921876/1‑150 (MQ=255)
tcCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGAc < 2:1483983/150‑1 (MQ=255)
cGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGt > 1:2885812/1‑150 (MQ=255)
gCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGAATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTg > 2:2925465/1‑150 (MQ=255)
tGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGcc < 1:4097848/150‑1 (MQ=255)
gTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCg > 1:4364419/1‑150 (MQ=255)
tAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCgg < 1:3222150/150‑1 (MQ=255)
aaCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAt < 2:3407727/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATg < 1:3739123/150‑1 (MQ=255)
gCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTa < 2:3081927/150‑1 (MQ=255)
gCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTa > 1:3591220/1‑150 (MQ=255)
gCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTa > 1:2792178/1‑150 (MQ=255)
cAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTaa > 2:3074351/1‑150 (MQ=255)
aGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTaaa > 1:2563974/1‑150 (MQ=255)
gggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAc < 2:74394/150‑1 (MQ=255)
gggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAc > 2:2825736/1‑150 (MQ=255)
gggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAAc > 2:3362736/1‑150 (MQ=255)
ggAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACa > 2:3231024/1‑150 (MQ=255)
aaGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATg > 2:1210128/1‑150 (MQ=255)
aaGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATg > 2:1210014/1‑150 (MQ=255)
gggAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGAc > 1:4561125/1‑150 (MQ=255)
gAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAATCATGACcg > 1:4108070/1‑150 (MQ=255)
tAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCggcggg > 2:516610/1‑150 (MQ=255)
cGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGt < 2:464517/150‑1 (MQ=255)
gCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTc < 2:4234667/150‑1 (MQ=255)
tGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCttt < 2:1924084/150‑1 (MQ=255)
tGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCttt < 2:556414/150‑1 (MQ=255)
tGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCttt < 2:662753/150‑1 (MQ=255)
gTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTa < 2:2653128/150‑1 (MQ=255)
tCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTAt > 1:151621/1‑150 (MQ=255)
ggATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGc < 1:463039/150‑1 (MQ=255)
gACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCcac < 2:858808/150‑1 (MQ=255)
gACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCcac < 1:1012775/150‑1 (MQ=255)
aCAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCcaca > 1:4509605/1‑150 (MQ=255)
cAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCcacac > 1:1776092/1‑150 (MQ=255)
aTTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCAGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGAAGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTAATGCCCACACACt > 1:1368395/1‑150 (MQ=255)
ttGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTg > 2:2488861/1‑150 (MQ=255)
tGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGa < 2:1804317/150‑1 (MQ=255)
gATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGaa > 2:339448/1‑150 (MQ=255)
aTGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAg > 2:3890902/1‑150 (MQ=255)
aTGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAg > 1:2601938/1‑150 (MQ=255)
ccATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCaa > 1:1674966/1‑150 (MQ=255)
aTTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATc < 1:2445557/150‑1 (MQ=255)
ttGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCa > 1:4442995/1‑150 (MQ=255)
tgGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTc > 1:1225065/1‑150 (MQ=255)
tgGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTc > 2:3247664/1‑150 (MQ=255)
ggTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTcc < 1:401723/150‑1 (MQ=255)
ggTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTcc < 1:2281369/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 1:2506165/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 1:2399262/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 1:2127738/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 1:1430476/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 2:1055350/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCa < 1:3911067/150‑1 (MQ=255)
gCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCttt < 2:3155321/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCa > 1:2032609/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCa < 2:1090836/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAg < 1:964323/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTa > 2:4595628/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCa > 1:293691/1‑150 (MQ=255)
cTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAg < 2:4442564/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAgcg > 1:2251251/1‑150 (MQ=255)
aGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCg > 1:2913968/1‑150 (MQ=255)
cGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGt < 1:1010413/150‑1 (MQ=255)
ccGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAAc < 2:593396/150‑1 (MQ=255)
gCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGc < 1:4485363/150‑1 (MQ=255)
cTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAg > 1:3572834/1‑150 (MQ=255)
gTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTc < 2:2013974/150‑1 (MQ=255)
tCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTca > 2:2217768/1‑150 (MQ=255)
cATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTcac > 1:1604484/1‑150 (MQ=255)
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GGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCT > SRR19973072.2263194/1‑150 (MQ=60)
GGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTT < SRR19973072.308899/150‑1 (MQ=60)
GGATGTACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTT < SRR19973072.308906/150‑1 (MQ=60)
GATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTC > SRR19973072.541301/1‑150 (MQ=60)
GATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTC > SRR19973072.3714475/1‑150 (MQ=60)
GATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTC > SRR19973072.3714471/1‑150 (MQ=60)
TGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTCTT < SRR19973072.2366709/150‑1 (MQ=60)
ACTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTCTTAAC < SRR19973072.565633/150‑1 (MQ=60)
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TTCCCCTTTCAACCACATCTCCCGCTGTAAACGCAGCGGGAAGGGAGCATAACGCATGTCGGATGACAAATTTGATGCCATTGTGGTCGGTGCGGGCGTTGCTGGTAGCGTTGCCGCACTGGTCATGGCACGAGCCGGGCTGGATGTCCTGGTGATAGAACGCGGCGACAGTGCCGGATGTAAAAACATGACCGGCGGGCGTCTTTATGCCCACACACTTGAAGCAATCATTCCAGGCTTTGCAGTATCAGCGCCGGTAGAACGCAAGGTCACACGCGAGAAAATCTCCTTCTTAAC > CP009273/1775597‑1775893
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
