Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
380,236 |
C→A |
49.2% |
intergenic (‑164/‑452) |
yaiS ← / → tauA |
putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 380,236 | 0 | C | A | 49.2%
| 140.6
/ inf
| 302 | intergenic (‑164/‑452) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (78/75); new base A (47/100); total (125/177) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.02e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAA > CP009273/380088‑380385
|
tttatttaTTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCa > 2:3393135/1‑150 (MQ=255)
ttatttatTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCaa > 1:1408763/1‑150 (MQ=255)
atttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAAtt < 1:1805348/150‑1 (MQ=255)
tttattAGACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTc < 1:3032981/150‑1 (MQ=255)
ataCTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGt < 1:2467444/150‑1 (MQ=255)
ctacAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTaa > 1:209910/1‑150 (MQ=255)
acAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAgt < 2:4482231/150‑1 (MQ=255)
acAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAgt < 2:2244784/150‑1 (MQ=255)
aGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCACTTCATATGTTAAGTGtt > 2:1426528/1‑150 (MQ=255)
aGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGtt > 2:1410490/1‑150 (MQ=255)
aGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTGCGACTGGGTCATGTTTCTATGAACTTCATAGGTTATGTGtt > 2:2042364/1‑150 (MQ=255)
gCACACCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGttt < 2:2423314/150‑1 (MQ=255)
gCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGCACAGCAAGGGCGTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGttt < 2:2598023/150‑1 (MQ=255)
gCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGttt > 2:455154/1‑150 (MQ=255)
cacaACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTg < 1:76562/150‑1 (MQ=255)
caACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTa < 1:2409467/150‑1 (MQ=255)
aaCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTAt > 2:575655/1‑150 (MQ=255)
gATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGtt > 1:4176971/1‑150 (MQ=255)
gCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTgg < 2:804401/150‑1 (MQ=255)
cACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgt < 1:3852520/150‑1 (MQ=255)
cTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtat < 2:2085160/150‑1 (MQ=255)
tCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatg > 1:1918119/1‑150 (MQ=255)
gagaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgtat < 2:4187038/150‑1 (MQ=255)
gagaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTATCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgtat < 1:4472927/150‑1 (MQ=255)
aCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGt > 1:1686570/1‑150 (MQ=255)
aCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGt > 1:312235/1‑150 (MQ=255)
aCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTACTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGt < 2:4051379/150‑1 (MQ=255)
gTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTa < 1:3626918/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTAttt < 1:1449066/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTAttt < 1:2953879/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTAttt < 1:652567/150‑1 (MQ=255)
aTCTCGGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTAttt < 1:3394068/150‑1 (MQ=255)
ctctGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTg > 1:2723512/1‑150 (MQ=255)
ctctGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTg > 1:2722951/1‑150 (MQ=255)
ctctGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTg < 1:191035/150‑1 (MQ=255)
ctctGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTg < 1:2224033/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAATGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGttt < 1:2997842/150‑1 (MQ=255)
ggCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGtttt < 1:88902/150‑1 (MQ=255)
ggCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGtttt < 1:88865/150‑1 (MQ=255)
gcAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTtata < 2:4128204/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATAc < 2:4311022/150‑1 (MQ=255)
aGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACa > 2:598832/1‑150 (MQ=255)
aGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACa > 2:232815/1‑150 (MQ=255)
aGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTCCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACa > 2:3514241/1‑150 (MQ=255)
ccAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACAtt > 2:3127397/1‑150 (MQ=255)
gATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTa < 1:429710/150‑1 (MQ=255)
aatgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAATGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGAttt < 2:1865728/150‑1 (MQ=255)
aatgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGAttt < 2:1254388/150‑1 (MQ=255)
aatgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGAttt > 2:1793899/1‑150 (MQ=255)
tgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAg < 1:1415534/150‑1 (MQ=255)
tgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAg < 1:3682603/150‑1 (MQ=255)
tgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTGTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAg < 1:3682482/150‑1 (MQ=255)
gttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGt < 2:3288319/150‑1 (MQ=255)
aaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTg > 1:2961672/1‑150 (MQ=255)
aaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTg < 1:4212215/150‑1 (MQ=255)
tGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatt < 2:1325077/150‑1 (MQ=255)
gCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatta < 1:2202981/150‑1 (MQ=255)
taataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaattaat > 1:3200184/1‑150 (MQ=255)
aataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaattaatt > 2:1309476/1‑150 (MQ=255)
taaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGc < 1:2159861/150‑1 (MQ=255)
aaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCa < 1:956347/150‑1 (MQ=255)
aCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCAt < 2:3922181/150‑1 (MQ=255)
cTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCAtt < 1:4310761/150‑1 (MQ=255)
gAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTa < 1:2083511/150‑1 (MQ=255)
gAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTa < 2:292695/150‑1 (MQ=255)
aaaGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaa > 1:1348855/1‑150 (MQ=255)
aaaGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaa < 2:18137/150‑1 (MQ=255)
aaGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAATGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaa < 1:1575462/150‑1 (MQ=255)
aGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaa > 2:4046732/1‑150 (MQ=255)
aGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaa < 1:1045938/150‑1 (MQ=255)
gCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaaa < 1:1561672/150‑1 (MQ=255)
gCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaaa > 1:2871646/1‑150 (MQ=255)
aaGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAata > 1:3941996/1‑150 (MQ=255)
gggCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATg < 1:3465687/150‑1 (MQ=255)
tttCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCt < 1:4022050/150‑1 (MQ=255)
tttCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAATGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCt > 1:848586/1‑150 (MQ=255)
gACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGaa > 2:1071564/1‑150 (MQ=255)
aCCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAAc < 1:4391437/150‑1 (MQ=255)
ggTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCAtt < 2:1408735/150‑1 (MQ=255)
ggtCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTg < 2:3679641/148‑1 (MQ=255)
tCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGtt < 1:597428/150‑1 (MQ=255)
cGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGttt < 2:3028536/150‑1 (MQ=255)
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TGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCA < SRR19973076.2916623/150‑1 (MQ=60)
TGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCA < SRR19973076.636082/150‑1 (MQ=60)
TGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCA < SRR19973076.632323/150‑1 (MQ=60)
TCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTT < SRR19973076.598349/150‑1 (MQ=60)
TCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTT < SRR19973076.439077/150‑1 (MQ=60)
CGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTT > SRR19973076.3762258/1‑150 (MQ=60)
CGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTT < SRR19973076.236697/150‑1 (MQ=60)
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CGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTT < SRR19973076.236690/150‑1 (MQ=60)
CGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTT < SRR19973076.236651/150‑1 (MQ=60)
CGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTT < SRR19973076.3060328/150‑1 (MQ=60)
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ACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAATGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTAT < SRR19973076.4384925/150‑1 (MQ=60)
ACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTAT > SRR19973076.3041273/1‑150 (MQ=60)
TGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATAT < SRR19973076.3427935/150‑1 (MQ=60)
GGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATA < SRR19973076.2760385/150‑1 (MQ=60)
GGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATA < SRR19973076.2760495/150‑1 (MQ=60)
GGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGTACAAGCATTGTTTATATA > SRR19973076.3566570/1‑150 (MQ=60)
GGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATA > SRR19973076.3565998/1‑150 (MQ=60)
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GTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAATGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACA > SRR19973076.4036444/1‑150 (MQ=60)
AATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATT < SRR19973076.599623/150‑1 (MQ=60)
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AATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATT < SRR19973076.599760/150‑1 (MQ=60)
TGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTAT < SRR19973076.288449/150‑1 (MQ=60)
GTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTTTTAGTATGTATGGTATGTATAGTTATATTGTTTTATACAATGTATTTAGATCTGATTTAGTTTGTCAATTAAAAGCATATAAAAAAAATGTTCTGTGAACAATCATTGTTTAAATACATAATG > SRR19973076.760125/1‑150 (MQ=60)
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AAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAA > SRR19973076.4277176/1‑150 (MQ=60)
AAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAA > SRR19973076.4277192/1‑150 (MQ=60)
AAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAA > SRR19973076.4277222/1‑150 (MQ=60)
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TTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAA > CP009273/380088‑380385
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
