Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,407,678 |
T→A |
7.4% |
S244T (TCT→ACT) |
ackA → |
acetate kinase A and propionate kinase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,407,678 | 0 | T | A | 7.4%
| 1102.0
/ 60.7
| 325 | S244T (TCT→ACT) | ackA | acetate kinase A and propionate kinase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (157/143); new base A (10/14); total (168/157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
AAAAATGCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTA > CP009273/2407530‑2407826
|
aaaaaTGCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTc > 1:667399/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACCTCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCAGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTg < 2:4312011/150‑1 (MQ=255)
tGCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTg > 2:2994069/1‑150 (MQ=255)
gCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGa < 2:2828071/150‑1 (MQ=255)
cTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGat < 1:687585/150‑1 (MQ=255)
gAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGatat < 1:1906750/150‑1 (MQ=255)
aaCATACCGTTATAAGAACTGAACATCATATCCTGCCAGCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCATCAAAGGTAAATGCGTTGAAAACTATATTGGCCTGACGCCTCTTGAATGTATTTTCATGTGTACCAGTTCTGGTGATATc < 2:3938257/150‑1 (MQ=255)
aaCAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATc < 1:1396543/150‑1 (MQ=255)
aaCAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATc < 2:265054/150‑1 (MQ=255)
aaCAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATc > 2:2455368/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTCTGGGCCTGACCCCGCTGGACGGTCTGGTCATGGGTACCCGGTCTGGTGATATCGa > 2:3383822/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGCTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACAACTATGTTCCTGACCCCGATGGAAGGTCTGGTCATTGGTACCCGTTCTGGTGATATAGa > 2:1359778/1‑150 (MQ=255)
aaaCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGAt < 2:56163/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATc < 2:846526/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATc < 2:3110673/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATc < 1:355141/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATc < 1:1343355/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATcc < 1:591718/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATcc < 2:3770512/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATcc < 2:1430165/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATcc < 1:3405290/150‑1 (MQ=255)
ccGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCg < 1:3311711/150‑1 (MQ=255)
gTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCg > 2:2227215/1‑150 (MQ=255)
gaagaaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGatc > 2:579519/1‑150 (MQ=255)
gaagaaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGatc > 2:4105082/1‑150 (MQ=255)
gaagaaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGatc < 1:953498/150‑1 (MQ=255)
gaaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGatcatc < 2:1928187/150‑1 (MQ=255)
gaaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGatcatc > 2:3291042/1‑150 (MQ=255)
aaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCt < 2:194392/150‑1 (MQ=255)
aaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCt > 2:1187319/1‑150 (MQ=255)
aaCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCGCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCt > 1:1244256/1‑150 (MQ=255)
aCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCtt > 1:2812119/1‑150 (MQ=255)
aCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCtt < 1:4385788/150‑1 (MQ=255)
aCTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCtt < 1:2111240/150‑1 (MQ=255)
cTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTc < 1:4258244/150‑1 (MQ=255)
cTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTc > 2:342954/1‑150 (MQ=255)
tGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCACCGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCAGACCCCCCGGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCCTCTTcc > 1:2416473/1‑150 (MQ=255)
aaCATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCAc > 2:2420468/1‑150 (MQ=255)
aCATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCAcc < 2:3698877/150‑1 (MQ=255)
tcaCCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACg < 2:1182342/150‑1 (MQ=255)
tcaCCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACg < 1:2552556/150‑1 (MQ=255)
tcaCCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACg > 2:4472844/1‑150 (MQ=255)
tGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACAcc > 1:1676142/1‑150 (MQ=255)
ccACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCt < 1:217119/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGc < 2:1989713/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGc > 2:3982889/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATg > 2:1216420/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATg > 1:1718385/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGc < 2:1455787/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGc > 2:643409/1‑150 (MQ=255)
gtggtTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTg < 2:69380/150‑1 (MQ=255)
tCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCa > 1:1498312/1‑150 (MQ=255)
tGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATcaacaa > 2:1571643/1‑150 (MQ=255)
cTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAAc < 2:3164659/150‑1 (MQ=255)
tATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAAct > 2:746099/1‑150 (MQ=255)
aTCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTCCCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAActg > 1:2052174/1‑150 (MQ=255)
cGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAActgctg < 2:2167993/150‑1 (MQ=255)
cGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAActgctg < 2:1868646/150‑1 (MQ=255)
cGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAActgctg > 1:3661489/1‑150 (MQ=255)
gCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGa < 1:1796850/150‑1 (MQ=255)
gCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGa < 1:4072501/150‑1 (MQ=255)
cAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGAc > 1:3904231/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGAcc > 1:1000839/1‑150 (MQ=255)
aCGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCa < 2:1687385/150‑1 (MQ=255)
gTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAag > 1:2944181/1‑150 (MQ=255)
gTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAag < 1:4413397/150‑1 (MQ=255)
aaTGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGt < 1:4485479/150‑1 (MQ=255)
ttGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGcc < 2:3641947/150‑1 (MQ=255)
tGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCct > 1:3802025/1‑150 (MQ=255)
tGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCct > 2:2943518/1‑150 (MQ=255)
cacCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCctgct > 2:1026403/1‑150 (MQ=255)
acCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCctgctg > 2:463077/1‑150 (MQ=255)
acCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCctgctg > 2:1486859/1‑150 (MQ=255)
ccTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTgg < 1:740840/150‑1 (MQ=255)
ctctATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTggg < 1:1708039/150‑1 (MQ=255)
ctATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTc < 1:3621583/150‑1 (MQ=255)
tGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGa > 2:1901804/1‑150 (MQ=255)
ggCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGAcc < 1:3275460/150‑1 (MQ=255)
ggCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGAcc < 1:3971022/150‑1 (MQ=255)
gCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTACTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCg < 2:4240657/150‑1 (MQ=255)
tGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAg > 1:2881995/1‑150 (MQ=255)
tGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAg > 2:4446588/1‑150 (MQ=255)
tGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAg < 2:1389619/150‑1 (MQ=255)
gACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGt > 2:2386733/1‑150 (MQ=255)
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cGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCa > 2:2709105/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCa > 1:1084548/1‑150 (MQ=255)
aaGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACt > 2:2457338/1‑150 (MQ=255)
cTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGc > 1:861231/1‑150 (MQ=255)
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tCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATg > 2:3573537/1‑150 (MQ=255)
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cccGTTCTGGTGATATTGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCGGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACa < 1:2731629/150‑1 (MQ=255)
cccGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACa > 2:3846708/1‑150 (MQ=255)
ttCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTa < 1:2994194/150‑1 (MQ=255)
|
AAAAATGCTGAACAAACCGGTAGAAGAACTGAACATCATCACCTGCCACCTGGGCAACGGTGGTTCCGTTTCTGCTATCCGCAACGGTAAATGCGTTGACACCTCTATGGGCCTGACCCCGCTGGAAGGTCTGGTCATGGGTACCCGTTCTGGTGATATCGATCCGGCGATCATCTTCCACCTGCACGACACCCTGGGCATGAGCGTTGACGCAATCAACAAACTGCTGACCAAAGAGTCTGGCCTGCTGGGTCTGACCGAAGTGACCAGCGACTGCCGCTATGTTGAAGACAACTA > CP009273/2407530‑2407826
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
