Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,409,935 |
G→T |
36.1% |
A570A (GCG→GCT) |
pta → |
phosphate acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,409,935 | 0 | G | T | 36.1%
| 247.5
/ 145.7
| 163 | A570A (GCG→GCT) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/49); new base T (29/30); total (84/79) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.45e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
CCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACC > CP009273/2409788‑2410080
|
ccgtccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGACCAGCTGGCAGAAATcgcg > 1:3309004/1‑148 (MQ=255)
ccgtccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATcgcg > 1:1170926/1‑148 (MQ=255)
tccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGAtt > 2:3159030/1‑148 (MQ=255)
cgccgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCa < 2:1121232/148‑1 (MQ=255)
cgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTc < 1:1872170/148‑1 (MQ=255)
cTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCg > 2:356765/1‑148 (MQ=255)
tGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGc < 1:211361/148‑1 (MQ=255)
gCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCt > 2:739550/1‑148 (MQ=255)
aGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGa < 2:1415780/148‑1 (MQ=255)
aGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGa < 2:1118670/148‑1 (MQ=255)
cTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGAtt > 1:1920799/1‑148 (MQ=255)
aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg > 1:2873764/1‑148 (MQ=255)
aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg < 2:1170926/148‑1 (MQ=255)
aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg > 2:911616/1‑148 (MQ=255)
tCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGc > 1:1294694/1‑148 (MQ=255)
aaaaCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTg < 2:2804564/148‑1 (MQ=255)
cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc < 1:1003991/148‑1 (MQ=255)
cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc > 1:3171773/1‑148 (MQ=255)
cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc > 1:3077499/1‑148 (MQ=255)
cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGAGTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc < 1:2545103/148‑1 (MQ=255)
tGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGcc < 2:1380012/148‑1 (MQ=255)
ccGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCg < 2:241362/148‑1 (MQ=255)
gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGt < 1:1205373/148‑1 (MQ=255)
ggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTa < 1:86978/148‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt < 1:3190233/148‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt > 1:2148507/1‑148 (MQ=255)
cAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATc > 1:1597476/1‑148 (MQ=255)
gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 2:1207420/148‑1 (MQ=255)
gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa > 2:2366098/1‑148 (MQ=255)
gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 2:675759/148‑1 (MQ=255)
cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGaa < 2:2479708/148‑1 (MQ=255)
cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGaa < 2:821749/148‑1 (MQ=255)
cccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAAcc > 1:1197215/1‑148 (MQ=255)
ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcg < 2:83536/148‑1 (MQ=255)
cTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgc > 2:2131667/1‑148 (MQ=255)
gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:3215361/148‑1 (MQ=255)
gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:3215517/148‑1 (MQ=255)
gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:1926010/148‑1 (MQ=255)
tATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGt < 1:671745/148‑1 (MQ=255)
tATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGt > 2:2194478/1‑148 (MQ=255)
tCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg < 1:1545099/148‑1 (MQ=255)
cTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTCTCGAACCGCGCGTTGc > 1:351141/1‑148 (MQ=255)
ttCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCt < 2:1916210/148‑1 (MQ=255)
ccGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTAt < 2:1008811/148‑1 (MQ=255)
cGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGACCAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATg > 1:133507/1‑148 (MQ=255)
gtTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctc > 2:1601215/1‑148 (MQ=255)
tcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCtctc > 2:200563/1‑148 (MQ=255)
tcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCtctc > 2:1903589/1‑148 (MQ=255)
cATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc < 2:523446/148‑1 (MQ=255)
cATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc < 2:523297/148‑1 (MQ=255)
ctgctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCa > 1:2768925/1‑148 (MQ=255)
gctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCAcc > 2:1044021/1‑148 (MQ=255)
gcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCAGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGt > 2:2253002/1‑148 (MQ=255)
ccGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTa < 1:2438504/148‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:2389547/148‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:446219/148‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc > 1:1690739/1‑148 (MQ=255)
aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:1570437/148‑1 (MQ=255)
aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:2128818/1‑148 (MQ=255)
aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:1612336/1‑148 (MQ=255)
aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt < 1:626336/148‑1 (MQ=255)
aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:424355/1‑148 (MQ=255)
cAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTg < 2:1294694/148‑1 (MQ=255)
aGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTgg < 1:2140445/148‑1 (MQ=255)
tttccgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAATTCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGGTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTCCTTCTGGTGc > 2:963287/1‑148 (MQ=255)
ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa > 2:898736/1‑148 (MQ=255)
ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa > 2:900776/1‑148 (MQ=255)
ttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGc > 1:980135/1‑148 (MQ=255)
acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGa < 2:1351838/148‑1 (MQ=255)
gACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAg > 1:754171/1‑148 (MQ=255)
tgtgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGaaa > 1:940967/1‑148 (MQ=255)
tgtgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGaaa > 2:2401936/1‑148 (MQ=255)
gCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAg > 2:3030688/1‑148 (MQ=255)
gCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAg < 1:3141183/148‑1 (MQ=255)
tCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTcg < 2:2873764/148‑1 (MQ=255)
aCCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGa < 1:603414/148‑1 (MQ=255)
ccGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAg < 1:3077052/148‑1 (MQ=255)
ggATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCa > 1:1713688/1‑148 (MQ=255)
gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 2:2140715/148‑1 (MQ=255)
gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa > 1:1111303/1‑148 (MQ=255)
tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt > 1:1153185/1‑148 (MQ=255)
tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt > 1:2946904/1‑148 (MQ=255)
ccGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTc > 2:2667437/1‑148 (MQ=255)
ccGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTc < 1:1722171/148‑1 (MQ=255)
cGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCg < 1:367605/148‑1 (MQ=255)
cGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCg < 1:3227038/148‑1 (MQ=255)
gACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGt < 1:2101932/148‑1 (MQ=255)
gCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGaa > 1:2157269/1‑148 (MQ=255)
ggCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGaaaaa < 2:3228775/148‑1 (MQ=255)
gCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCACCTCGTCTGGCGCAGGAAAAAc > 1:2035602/1‑148 (MQ=255)
gCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAAc > 1:241297/1‑148 (MQ=255)
aGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCTGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGAAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGt < 1:794353/148‑1 (MQ=255)
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aaaTCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcc > 1:508849/1‑148 (MQ=255)
aTCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctg > 1:1299446/1‑148 (MQ=255)
tCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctga > 1:2645382/1‑148 (MQ=255)
tCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctga > 1:2756236/1‑148 (MQ=255)
cgctATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctgac > 2:1826021/1‑148 (MQ=255)
gcgATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctgacc < 1:3184756/148‑1 (MQ=255)
|
CCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACC > CP009273/2409788‑2410080
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
