Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,501,571 |
C→A |
82.7% |
G127C (GGC→TGC) |
php ← |
phosphotriesterase homology protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,501,571 | 0 | C | A | 82.7%
| 567.4
/ 134.1
| 243 | G127C (GGC→TGC) | php | phosphotriesterase homology protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/17); new base A (98/103); total (123/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CCCGTGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCCA > CP009273/3501422‑3501717
|
cccGTGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCTGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGcc < 1:768682/150‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGAt < 1:2229421/150‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGAt < 2:2010436/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGAtc > 2:2391112/1‑150 (MQ=255)
gCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTcc < 2:3412345/150‑1 (MQ=255)
cTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCcg > 1:2600825/1‑150 (MQ=255)
tGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCcgcg < 2:2084045/150‑1 (MQ=255)
tAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCgat > 2:1836213/1‑150 (MQ=255)
aGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCgatg > 2:4057085/1‑150 (MQ=255)
aGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCgatg > 2:2256709/1‑150 (MQ=255)
aGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCgatg < 1:375406/150‑1 (MQ=255)
aaCGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATc < 1:1384764/150‑1 (MQ=255)
aaCGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATc > 2:4256409/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATccc < 2:3535455/150‑1 (MQ=255)
cAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGc < 1:3493897/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCtt > 1:1278239/1‑150 (MQ=255)
gTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCtt > 1:3562789/1‑150 (MQ=255)
tGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTc > 2:2748095/1‑150 (MQ=255)
gCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCa < 2:719839/150‑1 (MQ=255)
cccATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTg > 1:2509161/1‑150 (MQ=255)
cccATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTg > 2:400925/1‑150 (MQ=255)
ccATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGc > 1:1201209/1‑150 (MQ=255)
ccATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGc > 1:4032424/1‑150 (MQ=255)
ccATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTGTCAGCTCCGTGc > 1:1614780/1‑150 (MQ=255)
cATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGcc > 1:3439202/1‑150 (MQ=255)
aTCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCa < 2:3063685/150‑1 (MQ=255)
cGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATc > 1:2678264/1‑150 (MQ=255)
cGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATc > 1:2015556/1‑150 (MQ=255)
cTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATa > 2:364745/1‑150 (MQ=255)
cTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATa > 2:397478/1‑150 (MQ=255)
tGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATAc > 1:757798/1‑150 (MQ=255)
aaCGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATAccc > 1:3811248/1‑150 (MQ=255)
acgacgTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCt > 2:2762993/1‑150 (MQ=255)
acgTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCGGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGtt > 2:3308950/1‑150 (MQ=255)
cgTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTc < 1:4384117/150‑1 (MQ=255)
cgTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTc < 1:2294586/150‑1 (MQ=255)
gTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCa < 1:3823648/150‑1 (MQ=255)
tGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAAtt < 2:4412553/150‑1 (MQ=255)
tGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAAtt < 1:597308/150‑1 (MQ=255)
tGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAt < 1:2823030/150‑1 (MQ=255)
tGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAt < 1:2822565/150‑1 (MQ=255)
tGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAt < 2:703096/150‑1 (MQ=255)
gagaTCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCg < 2:3926948/150‑1 (MQ=255)
aTCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGAcc > 1:3558967/1‑150 (MQ=255)
aTCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGAcc > 1:1277653/1‑150 (MQ=255)
tCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCa > 2:37524/1‑150 (MQ=255)
cGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCAt < 2:3007687/150‑1 (MQ=255)
cGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAACTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTcc < 2:1139272/150‑1 (MQ=255)
ggTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTgcgc > 1:1181426/1‑150 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGcc < 1:1347886/150‑1 (MQ=255)
tCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCa < 1:3288419/150‑1 (MQ=255)
ttATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTcc > 2:4373302/1‑150 (MQ=255)
tATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCt < 1:2734404/150‑1 (MQ=255)
tATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCt > 1:3205027/1‑150 (MQ=255)
tATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCt < 2:1531653/150‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGc < 2:1639981/150‑1 (MQ=255)
cagcgcagcgGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCt < 2:1744024/150‑1 (MQ=255)
agcgcagcgGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTg < 1:1230601/150‑1 (MQ=255)
agcgcagcgGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTg > 2:2301014/1‑150 (MQ=255)
agcgcagcgGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTg > 1:3849168/1‑150 (MQ=255)
cgcagcgGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTACGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCg < 1:1095039/150‑1 (MQ=255)
cgcagcgGCAATAAATACCTTCTCGTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCg < 2:3260056/150‑1 (MQ=255)
aataaataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCcac > 1:3505398/1‑150 (MQ=255)
aaataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATg > 1:1838193/1‑150 (MQ=255)
aaataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATg < 2:3857757/150‑1 (MQ=255)
aataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGt < 1:1440448/150‑1 (MQ=255)
ataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGtt > 2:13406/1‑150 (MQ=255)
ataCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGtt > 1:3809721/1‑150 (MQ=255)
taCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTc < 2:4331187/150‑1 (MQ=255)
taCCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTAATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTc > 1:812631/1‑150 (MQ=255)
cTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCgg > 2:4284545/1‑150 (MQ=255)
ttCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCggg < 2:4023461/150‑1 (MQ=255)
ttCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCggg < 1:110867/150‑1 (MQ=255)
ttCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCCCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCggg > 1:3366186/1‑150 (MQ=255)
tctcTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGa < 1:2136067/150‑1 (MQ=255)
tctcTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAGCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGa < 1:3303203/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAAc < 2:1716031/150‑1 (MQ=255)
cggcgTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTc < 1:4256409/150‑1 (MQ=255)
cggcgTAATCTTTCCGTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTc < 1:877977/150‑1 (MQ=255)
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TGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAT < SRR19973080.2838557/150‑1 (MQ=60)
TGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAT < SRR19973080.2838532/150‑1 (MQ=60)
TGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAT < SRR19973080.562403/150‑1 (MQ=60)
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TATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCT > SRR19973080.3222721/1‑150 (MQ=60)
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GCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACG > SRR19973080.3333125/1‑150 (MQ=60)
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CGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTACGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCG < SRR19973080.1101352/150‑1 (MQ=60)
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GCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTC < SRR19973080.4161386/150‑1 (MQ=60)
CAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCA < SRR19973080.381473/150‑1 (MQ=60)
AATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCAC > SRR19973080.3524736/1‑150 (MQ=60)
AATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCAC > SRR19973080.3524729/1‑150 (MQ=60)
TAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACAT < SRR19973080.3079182/150‑1 (MQ=60)
AAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATG > SRR19973080.1848548/1‑150 (MQ=60)
AATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGT < SRR19973080.1448846/150‑1 (MQ=60)
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TACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTC > SRR19973080.791551/1‑150 (MQ=60)
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TCTTTCCTTCGCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAAT > SRR19973080.492205/1‑150 (MQ=60)
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GCTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACA < SRR19973080.879071/150‑1 (MQ=60)
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CTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAG > SRR19973080.3784002/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGGTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAG > SRR19973080.1490470/1‑150 (MQ=60)
TGGTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGG < SRR19973080.332276/150‑1 (MQ=60)
GTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCC > SRR19973080.1877303/1‑150 (MQ=60)
GTGCAGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCC < SRR19973080.37261/150‑1 (MQ=60)
AGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCCACCA > SRR19973080.708578/1‑150 (MQ=60)
AGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCCACCA > SRR19973080.3041803/1‑150 (MQ=60)
AGATCTCCGCGATCATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCAACGACCATCACCTGCGACAGTTCCAGCACGCTGCGGGTCGCCACAAGATCCGGGAAAAACGCGACCTGGTAAAAACCCGTACAGGCCACCA > SRR19973080.3041663/1‑150 (MQ=60)
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CCCGTGGGCTTGTAGCAACGCCAGTTGCTCCAGCCCCATCGTGCTGAACGACGTATGCGTGGAGATCGGGCGTCCGGTCTGGTTATGCGCCAGCGCAGCGGCAATAAATACCTTCTCTTCCAGCGGCGTAATCTTTCCTTCGCTGGTGCCGATCTCCGCGATGATCCCGGCTTTCAGCTCCGTGCCATCGATACCCTGTTCAATTTCATCGACCATCTCCTGCGCCAGTTCCTGCACGCTGCGGGTCGCCACATGTTCCGGGAAAAACGCGTCCTGGTAATAACCGGTACAGGCCACCA > CP009273/3501422‑3501720
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |