Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
475,805 |
C→A |
100% |
A120A (GCG→GCT) |
tomB ← |
Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 475,805 | 0 | C | A | 100.0%
| 726.0
/ NA
| 218 | A120A (GCG→GCT) | tomB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (122/96); total (122/96) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATG > CP009273/475660‑475949
|
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tCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGa > 1:2693608/1‑148 (MQ=255)
tCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGa > 2:3119411/1‑148 (MQ=255)
tCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGa < 1:1466361/148‑1 (MQ=255)
cGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGAt > 1:339773/1‑148 (MQ=255)
atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATtct > 2:355816/1‑148 (MQ=255)
tttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATtctc > 1:1400885/1‑148 (MQ=255)
tttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATtctc < 2:2792765/148‑1 (MQ=255)
ttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct < 1:1314177/148‑1 (MQ=255)
ttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct < 1:3280881/148‑1 (MQ=255)
ttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct > 2:1251482/1‑148 (MQ=255)
ttatttTTCTAGATAACACGCTCCATCGTGTCAATTGTCTGGCAACGAAGTAAACGAATTAAATAATCGGTTTTCTTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTAACTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct < 1:2585200/148‑1 (MQ=255)
tatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCtt < 2:2319220/148‑1 (MQ=255)
atttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCttt > 1:983160/1‑148 (MQ=255)
tttttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtc > 2:2177155/1‑148 (MQ=255)
ttttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtcg < 1:1167403/148‑1 (MQ=255)
tttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtcg < 1:1167348/148‑1 (MQ=255)
tctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtcgtcg > 2:701631/1‑148 (MQ=255)
tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAATCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCa > 2:1358972/1‑148 (MQ=255)
tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGTTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCa < 2:3187519/148‑1 (MQ=255)
tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCa < 2:2168196/148‑1 (MQ=255)
aTAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTg < 2:550023/148‑1 (MQ=255)
aTAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTg > 1:952668/1‑148 (MQ=255)
aaCACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGAc > 1:3003935/1‑148 (MQ=255)
acacGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACa > 1:2091548/1‑148 (MQ=255)
cacGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACaa > 2:2949943/1‑148 (MQ=255)
cTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAaaca < 2:2639618/148‑1 (MQ=255)
aGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACgg > 2:473689/1‑148 (MQ=255)
cGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGaa > 2:1316290/1‑148 (MQ=255)
gtCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAg > 1:3162135/1‑148 (MQ=255)
tCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGt < 1:2941973/148‑1 (MQ=255)
tCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGt < 2:2812184/148‑1 (MQ=255)
tCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGt < 2:1186739/148‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAt > 1:2828571/1‑148 (MQ=255)
ttGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAt > 1:2975523/1‑148 (MQ=255)
tGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATTGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAtt < 1:1239434/148‑1 (MQ=255)
tGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAtt > 2:2607317/1‑148 (MQ=255)
tGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAtt < 1:1641797/148‑1 (MQ=255)
tCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTAc < 1:1029470/148‑1 (MQ=255)
tCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTAc > 2:2460391/1‑148 (MQ=255)
gCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGa < 1:1398280/148‑1 (MQ=255)
acgacgTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACtt < 1:480542/148‑1 (MQ=255)
tAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCa > 2:477499/1‑148 (MQ=255)
aCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCAttt < 2:1400903/148‑1 (MQ=255)
ttAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGaa > 2:2802961/1‑148 (MQ=255)
tAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAg > 1:2969149/1‑148 (MQ=255)
aataatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGAt > 1:1791572/1‑148 (MQ=255)
ataatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATc < 2:1549770/148‑1 (MQ=255)
taatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATcc > 2:1003897/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATcc > 2:381388/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATcc > 2:481674/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATcc > 1:1232579/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACATGACTTCCGCCATTTCTGAAGATcc > 2:2352579/1‑148 (MQ=255)
atCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTg > 2:2119336/1‑148 (MQ=255)
tCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGc < 1:134709/148‑1 (MQ=255)
tCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGc > 2:1457425/1‑148 (MQ=255)
tCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGc < 2:405005/148‑1 (MQ=255)
tCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGc < 1:1438274/148‑1 (MQ=255)
cGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCa < 2:2916631/148‑1 (MQ=255)
ggTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCat < 2:621542/148‑1 (MQ=255)
gTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCata < 2:2967515/148‑1 (MQ=255)
ttttCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCatat > 2:1387493/1‑148 (MQ=255)
tCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTaa < 2:782345/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATa < 1:2130274/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATa < 2:1603937/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATa < 2:2686319/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATa < 2:1031738/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAc > 2:2225085/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAc > 2:2225130/1‑148 (MQ=255)
gg‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATaa > 1:1626569/1‑148 (MQ=255)
tttttCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAact > 1:2404417/1‑148 (MQ=255)
ttttCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAacta < 1:2343832/148‑1 (MQ=255)
ttCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAactact < 1:2296471/148‑1 (MQ=255)
ggACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaa < 2:2487069/148‑1 (MQ=255)
gACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaac > 1:2688623/1‑148 (MQ=255)
cATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaa < 2:1347464/148‑1 (MQ=255)
aTACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaac < 2:2636190/148‑1 (MQ=255)
aTACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCAATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaac < 1:1111115/148‑1 (MQ=255)
tACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAacaaca > 1:1926248/1‑148 (MQ=255)
tACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAacaaca < 1:3119411/148‑1 (MQ=255)
cTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATa > 2:1335762/1‑148 (MQ=255)
ccTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCATGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATTCCATAACTACTGAACAACATAAAGgtg < 1:172330/148‑1 (MQ=255)
ccTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGgtg < 2:743797/148‑1 (MQ=255)
catATGTTTTTAATAATTATAACAATATAAAATAGCATGATTCTCTTTAGTAGCATTGAAAAAACATCTGAATAGTAGATTACCTGACTTCCGCAATTTATGAAGATCCTGCATATTAATACCATAAATACTGAACAACATAAAGgtg < 1:3145176/146‑1 (MQ=255)
gTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGa < 1:131692/148‑1 (MQ=255)
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G‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTA > SRR19973070.2632328/1‑150 (MQ=60)
TTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACT < SRR19973070.2359378/150‑1 (MQ=60)
TTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGA < SRR19973070.2036184/150‑1 (MQ=60)
TTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGA < SRR19973070.2311749/150‑1 (MQ=60)
CGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAAC > SRR19973070.2706045/1‑150 (MQ=60)
GACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAA > SRR19973070.2159024/1‑150 (MQ=60)
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CATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACA < SRR19973070.2705754/150‑1 (MQ=60)
CATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACA > SRR19973070.1939229/1‑150 (MQ=60)
CATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACA < SRR19973070.2169077/150‑1 (MQ=60)
ATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACAT > SRR19973070.2582490/1‑150 (MQ=60)
ATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCAATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACAT < SRR19973070.1118716/150‑1 (MQ=60)
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AATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATT < SRR19973070.789083/150‑1 (MQ=60)
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AAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCCCCATTTCTGAAGATCCTTCATATTAATACCATAACTAATGAACAACATAAATGTGTCAACCAGATATTCGTCGATCTGCT > SRR19973070.412046/1‑150 (MQ=60)
AAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATG < SRR19973070.1242182/150‑1 (MQ=60)
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ACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAG < SRR19973070.297996/150‑1 (MQ=60)
TAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCT < SRR19973070.2476457/150‑1 (MQ=60)
AGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCCTATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCGT > SRR19973070.392475/1‑150 (MQ=60)
AGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATACAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTT < SRR19973070.2191573/150‑1 (MQ=60)
AGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTT > SRR19973070.392478/1‑150 (MQ=60)
|
CTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTT > CP009273/475656‑475954
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
