Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
475,805 |
C→A |
A120A (GCG→GCT) |
tomB ← |
Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 475,805 | 0 | C | A | 100.0%
| 711.7
/ NA
| 212 | A120A (GCG→GCT) | tomB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (115/97); total (115/97) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAG > CP009273/475658‑475951
|
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aTTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGa > 2:1859150/1‑150 (MQ=255)
aTTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGa > 1:801069/1‑150 (MQ=255)
atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct > 2:1311330/1‑150 (MQ=255)
atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTctct > 1:1816533/1‑150 (MQ=255)
tatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtc < 2:1492381/150‑1 (MQ=255)
tatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTtc < 2:3393493/150‑1 (MQ=255)
tctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCa > 1:3578827/1‑150 (MQ=255)
tctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCa > 1:1308719/1‑150 (MQ=255)
tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCAtt < 2:1684564/150‑1 (MQ=255)
gATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGa > 2:2277747/1‑150 (MQ=255)
gATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGa > 2:280414/1‑150 (MQ=255)
aTAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGAc > 1:3547477/1‑150 (MQ=255)
acGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAaac > 1:1130399/1‑150 (MQ=255)
acGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAaac < 2:2865701/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACg > 1:749074/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACg > 1:2290843/1‑150 (MQ=255)
aGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGAAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGaa > 2:733373/1‑150 (MQ=255)
cAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGa > 2:3740608/1‑150 (MQ=255)
aaTTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAt > 2:695331/1‑150 (MQ=255)
aaTTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGAt > 2:622312/1‑150 (MQ=255)
tGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTAc < 2:912625/150‑1 (MQ=255)
tGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTAc > 2:3161245/1‑150 (MQ=255)
tGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGa > 1:1295070/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGAc > 2:215777/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGAc > 1:3387822/1‑150 (MQ=255)
aaCGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTc > 1:798099/1‑150 (MQ=255)
acgacgTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTcc < 2:815511/150‑1 (MQ=255)
tAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCAtt > 1:899257/1‑150 (MQ=255)
tAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCAtt > 1:524009/1‑150 (MQ=255)
tAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCAtt < 2:52123/150‑1 (MQ=255)
aaaCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCAttt < 1:3726010/150‑1 (MQ=255)
aCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCt < 1:1716476/150‑1 (MQ=255)
aCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCt < 1:3421461/150‑1 (MQ=255)
aCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCt < 1:3310277/150‑1 (MQ=255)
aCGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCt < 1:2557844/150‑1 (MQ=255)
gCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGa > 1:3136923/1‑150 (MQ=255)
gCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGa > 2:2667361/1‑150 (MQ=255)
gCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGa > 2:2892326/1‑150 (MQ=255)
cATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGaa > 1:3221702/1‑150 (MQ=255)
aTTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAg < 1:1886364/150‑1 (MQ=255)
aatCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATTAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGc < 1:2059113/150‑1 (MQ=255)
atCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCa > 1:2979436/1‑150 (MQ=255)
atCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCa < 1:1174072/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCatat < 2:799779/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATAtt > 2:2944904/1‑150 (MQ=255)
ttttCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTa < 2:1874083/150‑1 (MQ=255)
ttCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAAt > 2:2972372/1‑150 (MQ=255)
cGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAc < 2:3497600/150‑1 (MQ=255)
gTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAcc < 1:3339620/150‑1 (MQ=255)
gTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAcc < 1:406702/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCAt < 2:2326246/150‑1 (MQ=255)
aaaGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATa > 2:918199/1‑150 (MQ=255)
aaaGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATa > 1:1785802/1‑150 (MQ=255)
aGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAac < 2:2007310/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAact < 2:3172467/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAact < 1:2210859/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAact < 1:2211162/150‑1 (MQ=255)
gTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAacta > 1:3526473/1‑150 (MQ=255)
ttttCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAactact > 2:2790225/1‑150 (MQ=255)
cGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaac > 1:2339708/1‑150 (MQ=255)
ggACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaaca > 1:124893/1‑150 (MQ=255)
ggACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaaca < 2:3504739/150‑1 (MQ=255)
ggACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaaca > 2:3773389/1‑150 (MQ=255)
gACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaa < 2:1295070/150‑1 (MQ=255)
gACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaa > 1:577503/1‑150 (MQ=255)
aCATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGaacaac > 2:3747710/1‑150 (MQ=255)
taTACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAacaaca > 2:2544856/2‑150 (MQ=255)
aTACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACAt < 1:100036/150‑1 (MQ=255)
cTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGgt < 2:144578/150‑1 (MQ=255)
cTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGgt > 2:1969592/1‑150 (MQ=255)
cTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGgt < 2:3583789/150‑1 (MQ=255)
ccTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTc < 2:1816533/150‑1 (MQ=255)
tATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAt < 2:2727008/150‑1 (MQ=255)
tATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAt < 1:3752719/150‑1 (MQ=255)
tATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAt < 1:1859155/150‑1 (MQ=255)
tGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATcc > 1:2756289/1‑150 (MQ=255)
ggTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCa < 1:76221/150‑1 (MQ=255)
gTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAg > 2:3563899/1‑150 (MQ=255)
gTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAg > 2:804538/1‑150 (MQ=255)
gTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAg > 2:1125144/1‑150 (MQ=255)
gTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAg > 2:1670122/1‑150 (MQ=255)
ttGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCAGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGa > 2:1647398/1‑150 (MQ=255)
tGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAg < 2:342403/148‑1 (MQ=255)
tGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGat < 2:524228/150‑1 (MQ=255)
taataaTTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGatat < 1:2667361/150‑1 (MQ=255)
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GGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACA > SRR19973061.125296/1‑150 (MQ=60)
GACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAA > SRR19973061.579009/1‑150 (MQ=60)
CATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACA < SRR19973061.3337285/150‑1 (MQ=60)
ATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACAT < SRR19973061.100364/150‑1 (MQ=60)
ACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAA < SRR19973061.3760493/150‑1 (MQ=60)
TTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAG > SRR19973061.1302413/1‑150 (MQ=60)
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TATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAT < SRR19973061.1863788/150‑1 (MQ=60)
TATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAT < SRR19973061.1863793/150‑1 (MQ=60)
TATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCAT < SRR19973061.3762324/150‑1 (MQ=60)
ATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATC > SRR19973061.3153633/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCC > SRR19973061.2763387/1‑150 (MQ=60)
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TGTAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGAG > SRR19973061.343313/1‑150 (MQ=60)
TAATAATTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATAT < SRR19973061.2674222/150‑1 (MQ=60)
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ATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAA > SRR19973061.3296740/1‑150 (MQ=60)
AAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATG > SRR19973061.3366039/1‑150 (MQ=60)
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ACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAG < SRR19973061.3450279/150‑1 (MQ=60)
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TAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCT > SRR19973061.1003591/1‑150 (MQ=60)
AGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTT < SRR19973061.3006957/150‑1 (MQ=60)
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TGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTT > CP009273/475657‑475954
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |