Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,046,600 |
G→T |
89.9% |
pseudogene (210/1053 nt) |
yeeL ← |
pseudogene, glycosyltransferase homology |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,046,600 | 0 | G | T | 89.9%
| 580.0
/ 57.0
| 225 | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/13); new base T (111/91); total (121/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAT > CP009273/2046456‑2046742
|
aTCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACtt > 1:45076/1‑148 (MQ=255)
cccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTa > 1:1638832/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaa > 1:732330/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGGGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTATATACTTCTaa > 1:2772948/1‑148 (MQ=255)
cTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaaa < 1:2494961/148‑1 (MQ=255)
cTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaaa < 2:2359150/148‑1 (MQ=255)
tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaat < 1:1748116/148‑1 (MQ=255)
cAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt > 1:1980249/1‑148 (MQ=255)
tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 1:2013408/1‑148 (MQ=255)
gCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaatt > 2:520206/1‑148 (MQ=255)
cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTg < 1:2589248/148‑1 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTAATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCg > 1:223137/1‑148 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTAATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCg > 1:3140725/1‑148 (MQ=255)
aTCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAc > 1:2061323/1‑148 (MQ=255)
aTCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAc > 1:894456/1‑148 (MQ=255)
tCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACg < 1:917223/148‑1 (MQ=255)
ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGt < 1:743733/148‑1 (MQ=255)
ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGt < 2:2650243/148‑1 (MQ=255)
ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGt < 2:757387/148‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGtt < 1:1120019/148‑1 (MQ=255)
ggCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTa < 1:2818291/148‑1 (MQ=255)
gTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACaa < 2:1060358/148‑1 (MQ=255)
aCCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAAtt < 2:1220495/148‑1 (MQ=255)
ccGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTa < 2:13611/148‑1 (MQ=255)
ccGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTa < 2:1690506/148‑1 (MQ=255)
tATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaaa > 1:971511/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg < 1:1472023/148‑1 (MQ=255)
aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg > 2:455061/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg < 2:2872424/148‑1 (MQ=255)
tgtgTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt < 2:1398349/148‑1 (MQ=255)
tgtgTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt < 2:1553276/148‑1 (MQ=255)
tgtgTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt < 2:701525/148‑1 (MQ=255)
aTGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAttt > 1:2837923/1‑148 (MQ=255)
tGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtttt < 1:1930984/148‑1 (MQ=255)
gTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTa > 1:2635585/1‑148 (MQ=255)
gTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTa < 2:243103/148‑1 (MQ=255)
ttCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAt > 1:2608063/1‑148 (MQ=255)
tCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATg > 2:2752608/1‑148 (MQ=255)
tttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCa < 1:3062629/148‑1 (MQ=255)
tttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCa < 2:1864332/148‑1 (MQ=255)
ttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCaa > 2:1787709/1‑148 (MQ=255)
gCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAtt < 2:2837827/148‑1 (MQ=255)
aaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAg > 1:1064587/1‑148 (MQ=255)
tCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAgcg < 2:2526419/148‑1 (MQ=255)
tCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAgcg > 2:2905443/1‑148 (MQ=255)
tCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAgcg > 2:2226723/1‑148 (MQ=255)
ttttATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGcc > 1:2129171/1‑148 (MQ=255)
ttATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCg > 2:2242958/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCGAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGaa > 1:1561754/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGaa > 2:815617/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGaa > 2:2586850/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGaa > 2:882462/1‑148 (MQ=255)
ttCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATa > 2:1501822/1‑148 (MQ=255)
ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACa > 1:3214840/1‑148 (MQ=255)
ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACa < 2:2187118/148‑1 (MQ=255)
ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACa > 1:3259410/1‑148 (MQ=255)
tttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAg < 1:688276/148‑1 (MQ=255)
gTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa < 2:1422189/148‑1 (MQ=255)
tGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATg > 1:1940223/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATg > 1:1544218/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATg > 2:1069790/1‑148 (MQ=255)
gTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTTATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCTCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGcc < 2:1716341/148‑1 (MQ=255)
gATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt > 1:2381046/1‑148 (MQ=255)
gATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt > 2:2670356/1‑148 (MQ=255)
tCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg > 2:2578659/1‑148 (MQ=255)
tCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg > 1:227447/1‑148 (MQ=255)
tCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg > 1:1836585/1‑148 (MQ=255)
ccTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGc > 1:1356577/1‑148 (MQ=255)
cATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCg > 2:2554201/1‑148 (MQ=255)
cATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCg > 2:2103263/1‑148 (MQ=255)
tCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAAt > 1:3067846/1‑148 (MQ=255)
cATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATc > 1:810457/1‑148 (MQ=255)
aTTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCt > 1:203966/1‑148 (MQ=255)
tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa < 2:2635585/148‑1 (MQ=255)
aCTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTCATCgg > 2:3030498/1‑148 (MQ=255)
aCTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCgg < 2:3127124/148‑1 (MQ=255)
tAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGa > 2:3169349/1‑148 (MQ=255)
attttAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAat < 1:3094291/145‑1 (MQ=255)
aTGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAat < 2:1638832/148‑1 (MQ=255)
gTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat > 2:2440048/1‑148 (MQ=255)
tAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATgg > 1:557186/1‑148 (MQ=255)
tttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg > 2:2425136/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa > 1:603008/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa > 1:2179501/1‑148 (MQ=255)
tAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGac < 1:520206/148‑1 (MQ=255)
tAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGac < 2:1431281/148‑1 (MQ=255)
tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 2:1497204/148‑1 (MQ=255)
ttCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAg > 1:2165591/1‑148 (MQ=255)
tCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt > 2:1031912/1‑148 (MQ=255)
cAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTc < 1:2316680/148‑1 (MQ=255)
aGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTg < 1:3067549/148‑1 (MQ=255)
aGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTg < 1:2908958/148‑1 (MQ=255)
gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGt < 2:1619955/148‑1 (MQ=255)
gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAAGTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGt > 1:2161206/1‑148 (MQ=255)
tttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCACGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtt < 1:1226201/148‑1 (MQ=255)
ttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttt > 2:2305555/1‑148 (MQ=255)
agctaaTTAAATACTTCTAAATTAATTTTCGAAGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtttttt < 1:975796/143‑1 (MQ=255)
cgcATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCa < 2:2011522/148‑1 (MQ=255)
cATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAGAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAat < 1:869133/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAatat > 2:1871654/1‑148 (MQ=255)
|
CATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAT > CP009273/2046456‑2046742
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT > CP009273/2046452‑2046749
|
TACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATA < SRR19973070.1131986/150‑1 (MQ=60)
ACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAC < SRR19973070.1758250/150‑1 (MQ=60)
CGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACT > SRR19973070.1158743/1‑150 (MQ=60)
GCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTT > SRR19973070.45648/1‑150 (MQ=60)
ATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCT > SRR19973070.1790368/1‑150 (MQ=60)
ATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCT > SRR19973070.488722/1‑150 (MQ=60)
TCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTA > SRR19973070.1650179/1‑150 (MQ=60)
TCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTA > SRR19973070.1650174/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973070.737584/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973070.737439/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973070.737516/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGGGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTATATACTTCTAA > SRR19973070.2790717/1‑150 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT > SRR19973070.1993644/1‑150 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT > SRR19973070.1993734/1‑150 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT < SRR19973070.2511141/150‑1 (MQ=60)
TCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTA < SRR19973070.1760234/150‑1 (MQ=60)
AATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAAT > SRR19973070.2027028/1‑150 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973070.2606167/150‑1 (MQ=60)
AAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTAATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCG > SRR19973070.3161016/1‑150 (MQ=60)
AAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTAATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCG > SRR19973070.224744/1‑150 (MQ=60)
AAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGA > SRR19973070.998944/1‑150 (MQ=60)
AAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGA > SRR19973070.3208136/1‑150 (MQ=60)
AGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAC > SRR19973070.2075239/1‑150 (MQ=60)
AGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAC > SRR19973070.900785/1‑150 (MQ=60)
AGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAC > SRR19973070.900772/1‑150 (MQ=60)
TCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTT < SRR19973070.923751/150‑1 (MQ=60)
TCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTT > SRR19973070.2201265/1‑150 (MQ=60)
CCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTA < SRR19973070.748989/150‑1 (MQ=60)
CCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTA < SRR19973070.2424888/150‑1 (MQ=60)
CGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAC < SRR19973070.1127675/150‑1 (MQ=60)
GGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACA > SRR19973070.796475/1‑150 (MQ=60)
GGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACA < SRR19973070.2836510/150‑1 (MQ=60)
CCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAA < SRR19973070.3273024/150‑1 (MQ=60)
CCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAA > SRR19973070.2600789/1‑150 (MQ=60)
CGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAA > SRR19973070.978447/1‑150 (MQ=60)
GTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAG > SRR19973070.519188/1‑150 (MQ=60)
GTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAG > SRR19973070.365093/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGAT < SRR19973070.2835153/150‑1 (MQ=60)
ATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGAT > SRR19973070.1105644/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGAT < SRR19973070.1482313/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGC > SRR19973070.2432340/1‑150 (MQ=60)
CTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTT > SRR19973070.99869/1‑150 (MQ=60)
TTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTT > SRR19973070.2856195/1‑150 (MQ=60)
TTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTT > SRR19973070.2856291/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTA > SRR19973070.2652770/1‑150 (MQ=60)
TGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAT > SRR19973070.2625088/1‑150 (MQ=60)
TGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAT < SRR19973070.1943987/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGATTAATTTTAT > SRR19973070.2625061/1‑150 (MQ=60)
CTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCTACTTTACAATTAAAAGATGATTAATTTTATGCAA > SRR19973070.648629/1‑150 (MQ=60)
CTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAA > SRR19973070.2071697/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAT < SRR19973070.3082240/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAT < SRR19973070.2643067/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAT < SRR19973070.980233/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTC > SRR19973070.308558/1‑150 (MQ=60)
TGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTC > SRR19973070.1987991/1‑150 (MQ=60)
TAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAG > SRR19973070.1072046/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGC > SRR19973070.889668/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCC > SRR19973070.2143408/1‑150 (MQ=60)
TTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCGAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAA > SRR19973070.1572745/1‑150 (MQ=60)
TTCTTTTAATGTTGCGTGATCATGAATAGTCTTTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAATTTTAAGCGAATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAAC < SRR19973070.1449726/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACA > SRR19973070.3235629/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACA > SRR19973070.3280398/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAG > SRR19973070.2112607/1‑150 (MQ=60)
TTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGAATAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGA < SRR19973070.693184/150‑1 (MQ=60)
AATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAG > SRR19973070.2979452/1‑150 (MQ=60)
TGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAT > SRR19973070.2684796/1‑150 (MQ=60)
TGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAT > SRR19973070.2684928/1‑150 (MQ=60)
GTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATG > SRR19973070.1953091/1‑150 (MQ=60)
GTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATG > SRR19973070.1953263/1‑150 (MQ=60)
GTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATG > SRR19973070.1555067/1‑150 (MQ=60)
GTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATG > SRR19973070.1555068/1‑150 (MQ=60)
ctttATCCTGCATTGTCTTTGTGAATATTGTTAATTTAGTCTGTTCATGTTTAAGCGAATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAGGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCA < SRR19973070.851489/146‑1 (MQ=60)
GTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAT > SRR19973070.2396780/1‑150 (MQ=60)
GTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAT > SRR19973070.2396674/1‑150 (MQ=60)
gatcatgaatattaATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAAAATTAAAAGATGATTAATTTTATGAAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAG < SRR19973070.3123433/136‑1 (MQ=60)
GATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAG > SRR19973070.1849201/1‑150 (MQ=60)
GATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAG > SRR19973070.229066/1‑150 (MQ=60)
ATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGC > SRR19973070.1365845/1‑150 (MQ=60)
CATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCC > SRR19973070.2039863/1‑150 (MQ=60)
ATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAATCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCA > SRR19973070.1985458/1‑150 (MQ=60)
ATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCA > SRR19973070.3092656/1‑150 (MQ=60)
ATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCA > SRR19973070.854657/1‑150 (MQ=60)
AGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAAT < SRR19973070.1391607/150‑1 (MQ=60)
AGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAAT > SRR19973070.3087518/1‑150 (MQ=60)
GTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATC > SRR19973070.31724/1‑150 (MQ=60)
GTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATC > SRR19973070.816009/1‑150 (MQ=60)
TCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCT > SRR19973070.205500/1‑150 (MQ=60)
TAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAAT < SRR19973070.905049/150‑1 (MQ=60)
ATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATAT < SRR19973070.3114226/150‑1 (MQ=60)
GTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGG > SRR19973070.560618/1‑150 (MQ=60)
GTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGG > SRR19973070.560855/1‑150 (MQ=60)
TAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAT < SRR19973070.2257774/150‑1 (MQ=60)
AATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATG < SRR19973070.701580/150‑1 (MQ=60)
ATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGA > SRR19973070.2193927/1‑150 (MQ=60)
ATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGA > SRR19973070.607198/1‑150 (MQ=60)
ATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGA > SRR19973070.607215/1‑150 (MQ=60)
TTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAC < SRR19973070.149775/150‑1 (MQ=60)
TAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAA < SRR19973070.523748/150‑1 (MQ=60)
GTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACA < SRR19973070.219343/150‑1 (MQ=60)
TGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAG > SRR19973070.2179960/1‑150 (MQ=60)
TTCAAGTTTAAGTGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTC < SRR19973070.2143856/150‑1 (MQ=60)
CAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTG > SRR19973070.1943222/1‑150 (MQ=60)
CAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTG < SRR19973070.2332071/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCTACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGT > SRR19973070.1348999/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGT > SRR19973070.2178370/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAAGTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGT > SRR19973070.2175570/1‑150 (MQ=60)
AGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTT < SRR19973070.2927770/150‑1 (MQ=60)
AGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTT < SRR19973070.3087217/150‑1 (MQ=60)
AGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTT < SRR19973070.3087494/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAGCGCATTAAATACTTCTTAATTAATTGTCGACGTTACATTTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCTTAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTT < SRR19973070.96262/150‑1 (MQ=60)
TTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCACGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTT < SRR19973070.1234780/150‑1 (MQ=60)
TTAAGCGAATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTT < SRR19973070.2314/150‑1 (MQ=60)
agctaATTAAATACTTCTAAATTAATTTTCGAAGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCA < SRR19973070.982756/145‑1 (MQ=60)
AGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTNA < SRR19973070.2924234/150‑1 (MQ=60)
GCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAA < SRR19973070.2121960/150‑1 (MQ=60)
CATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAGAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAT < SRR19973070.875208/150‑1 (MQ=60)
ATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATAGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT < SRR19973070.1657499/150‑1 (MQ=60)
ATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTGACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT < SRR19973070.2934834/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT < SRR19973070.2241363/150‑1 (MQ=60)
AAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAA > SRR19973070.692029/1‑150 (MQ=60)
TACTTCTAAATTATTTGTCGACTTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT < SRR19973070.2687702/150‑1 (MQ=60)
|
TACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT > CP009273/2046452‑2046749
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |