Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,046,600 |
G→T |
100% |
pseudogene (210/1053 nt) |
yeeL ← |
pseudogene, glycosyltransferase homology |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,046,600 | 0 | G | T | 100.0%
| 827.0
/ NA
| 245 | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (132/113); total (132/113) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
ATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT > CP009273/2046457‑2046743
|
tCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTc > 2:3140199/1‑148 (MQ=255)
ccccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCt > 2:3223381/1‑148 (MQ=255)
cccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTa > 1:2147632/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaa > 1:2238025/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaa > 1:2335428/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaa > 1:2021875/1‑148 (MQ=255)
ccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTaa < 1:3800955/148‑1 (MQ=255)
tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaat < 1:187282/148‑1 (MQ=255)
cAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt > 1:3773715/1‑148 (MQ=255)
cAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt > 2:3047377/1‑148 (MQ=255)
aaTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatta < 2:3055477/148‑1 (MQ=255)
aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaa < 1:3257698/148‑1 (MQ=255)
aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaa > 1:2565892/1‑148 (MQ=255)
aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaa < 1:1354321/148‑1 (MQ=255)
aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGACTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaa < 2:18323/148‑1 (MQ=255)
tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 2:2802908/1‑148 (MQ=255)
tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 2:923758/1‑148 (MQ=255)
cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTg < 1:2359259/148‑1 (MQ=255)
cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTg < 1:351492/148‑1 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCg > 2:1569673/1‑148 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCg < 2:2718618/148‑1 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCg < 2:2609962/148‑1 (MQ=255)
aGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTAATTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGAATAGTCATGGAGACTAAAGTTAATTTAGTCTCTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAATTCTAaattaattttat > 1:2316401/1‑144 (MQ=255)
gATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGa > 2:2946300/1‑148 (MQ=255)
gATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGa < 1:2774770/148‑1 (MQ=255)
ccGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGt < 2:2503988/148‑1 (MQ=255)
cGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaa < 2:3773715/148‑1 (MQ=255)
gTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaa < 1:450779/148‑1 (MQ=255)
aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg > 2:2967260/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg > 2:1503448/1‑148 (MQ=255)
ttGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGa > 1:2665377/1‑148 (MQ=255)
tGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGAt < 1:2402393/148‑1 (MQ=255)
tGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGAt < 1:1912510/148‑1 (MQ=255)
tgtTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTa < 2:1691609/148‑1 (MQ=255)
tgtTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTa < 1:1788278/148‑1 (MQ=255)
tgtTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTa > 1:501262/1‑148 (MQ=255)
tATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtt > 1:3761321/1‑148 (MQ=255)
tGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtttt < 1:1008532/148‑1 (MQ=255)
ttCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAt > 1:873601/1‑148 (MQ=255)
tCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATg < 2:2716786/148‑1 (MQ=255)
tCTTAGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATg < 2:1340176/148‑1 (MQ=255)
tttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCa > 1:2560325/1‑148 (MQ=255)
tttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCa < 2:1202124/148‑1 (MQ=255)
ttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCaa < 1:3434978/148‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCaa > 2:3463925/1‑148 (MQ=255)
aaaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCaa > 2:700207/1‑148 (MQ=255)
aaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAg < 2:1223194/148‑1 (MQ=255)
aaTCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATACTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTTTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAg > 2:3671825/1‑148 (MQ=255)
tcttttctttCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAgcg < 1:1559876/148‑1 (MQ=255)
cTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCTACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAgcgc > 1:3180661/1‑148 (MQ=255)
ttttATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGcc > 1:7039/1‑148 (MQ=255)
ttATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCg > 1:3257411/1‑148 (MQ=255)
ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACa < 1:2701413/148‑1 (MQ=255)
ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACa > 2:2137976/1‑148 (MQ=255)
tttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAg > 2:762051/1‑148 (MQ=255)
ttATTGTTGCGTGATCCTGAATTGTAATTGTGATTAATGTTAATTTATTCTGTTCATGTTTAAGCGAATTAAATACTTATAAATTATTTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAgg < 1:2919156/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGaaa < 1:250692/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAg < 1:3040854/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAg > 1:3088859/1‑148 (MQ=255)
tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAg > 2:1630047/1‑148 (MQ=255)
gTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa > 2:3514150/1‑148 (MQ=255)
ttGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAt > 2:1550865/1‑148 (MQ=255)
gCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATgg > 2:147205/1‑148 (MQ=255)
gCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATgg > 2:2172680/1‑148 (MQ=255)
tGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCa < 2:3124855/148‑1 (MQ=255)
gATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt < 1:2163592/148‑1 (MQ=255)
gATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt < 2:3428864/148‑1 (MQ=255)
tCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAAt < 2:3239388/148‑1 (MQ=255)
ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTg > 1:149257/1‑148 (MQ=255)
tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa < 2:1743956/148‑1 (MQ=255)
tgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATc < 1:3147205/148‑1 (MQ=255)
cTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCggg > 2:2161644/1‑148 (MQ=255)
tGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAata < 1:2802999/148‑1 (MQ=255)
gTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat < 2:2447163/148‑1 (MQ=255)
ttAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATg > 2:2376379/1‑148 (MQ=255)
aaTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGa > 1:1963349/1‑148 (MQ=255)
aaTTTAGTATGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGa < 1:3581506/148‑1 (MQ=255)
aTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAt < 2:2806052/148‑1 (MQ=255)
tttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg < 1:2895698/148‑1 (MQ=255)
tttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATg < 2:2316401/148‑1 (MQ=255)
ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa > 2:89272/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa > 2:3027245/1‑148 (MQ=255)
gTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaa > 1:1899562/1‑148 (MQ=255)
tCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaac > 2:1774655/1‑148 (MQ=255)
tCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaac > 2:873869/1‑148 (MQ=255)
tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 2:2021875/148‑1 (MQ=255)
tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 1:665666/148‑1 (MQ=255)
tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTAGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 2:2238025/148‑1 (MQ=255)
ttCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAg > 1:1304814/1‑148 (MQ=255)
tCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt < 1:2234992/148‑1 (MQ=255)
tCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt < 2:1290105/148‑1 (MQ=255)
aGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTg < 1:811756/148‑1 (MQ=255)
gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGt < 2:19290/148‑1 (MQ=255)
ttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttt > 2:1329973/1‑148 (MQ=255)
ttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttt > 2:1751993/1‑148 (MQ=255)
cgcATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCa < 2:436958/148‑1 (MQ=255)
gcATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCaa < 1:3378437/148‑1 (MQ=255)
ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAatat > 1:177183/1‑148 (MQ=255)
ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAatat > 2:1540457/1‑148 (MQ=255)
tAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAtt > 1:2871011/1‑148 (MQ=255)
|
ATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT > CP009273/2046457‑2046743
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT > CP009273/2046453‑2046749
|
ACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAC < SRR19973069.1397343/150‑1 (MQ=60)
ACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAC < SRR19973069.1397338/150‑1 (MQ=60)
CATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTAAGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTC > SRR19973069.440159/1‑150 (MQ=60)
TCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTA > SRR19973069.2162354/1‑150 (MQ=60)
TCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTA > SRR19973069.312849/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973069.95787/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973069.2035925/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973069.2351317/1‑150 (MQ=60)
CCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA < SRR19973069.1353316/150‑1 (MQ=60)
CACCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAA > SRR19973069.2253122/1‑150 (MQ=60)
CCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAAT < SRR19973069.3825573/150‑1 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT > SRR19973069.157327/1‑150 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT > SRR19973069.2051029/1‑150 (MQ=60)
CTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATT > SRR19973069.3798229/1‑150 (MQ=60)
TCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTA < SRR19973069.188824/150‑1 (MQ=60)
CAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAA > SRR19973069.2582861/1‑150 (MQ=60)
AATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAAT < SRR19973069.2747672/150‑1 (MQ=60)
ATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATT < SRR19973069.1363713/150‑1 (MQ=60)
ATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATT < SRR19973069.3279035/150‑1 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973069.2375716/150‑1 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973069.2375285/150‑1 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973069.2375279/150‑1 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973069.354002/150‑1 (MQ=60)
CAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTC < SRR19973069.354051/150‑1 (MQ=60)
AAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTAATTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGAATAGTCATGGAGACTAAAGTTAATTTAGTCTCTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAATTCTAAATTAATTttat > SRR19973069.2332167/1‑146 (MQ=60)
AGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAC > SRR19973069.2426977/1‑150 (MQ=60)
AGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGAC < SRR19973069.531412/150‑1 (MQ=60)
GATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACG < SRR19973069.2793252/150‑1 (MQ=60)
GTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAG > SRR19973069.68562/1‑150 (MQ=60)
GTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAG < SRR19973069.454074/150‑1 (MQ=60)
TATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGA > SRR19973069.2683248/1‑150 (MQ=60)
TGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGC < SRR19973069.2418654/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGC < SRR19973069.1925276/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGC < SRR19973069.1925532/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGC < SRR19973069.1925697/150‑1 (MQ=60)
TGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTA > SRR19973069.504857/1‑150 (MQ=60)
GTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAA < SRR19973069.2209829/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAT < SRR19973069.1801025/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAT < SRR19973069.1800874/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAT > SRR19973069.3703191/1‑150 (MQ=60)
GTTATGTTCTTTTCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATT < SRR19973069.1707879/150‑1 (MQ=60)
GTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATT > SRR19973069.3785774/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTA > SRR19973069.714226/1‑150 (MQ=60)
TGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAT < SRR19973069.1015472/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAT > SRR19973069.879676/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAT < SRR19973069.3350209/150‑1 (MQ=60)
TCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCA > SRR19973069.2577937/1‑150 (MQ=60)
TCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCA > SRR19973069.2577226/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGGTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAT < SRR19973069.1868382/150‑1 (MQ=60)
TTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATT < SRR19973069.3457298/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTC < SRR19973069.2724959/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTC < SRR19973069.3418644/150‑1 (MQ=60)
CTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAA > SRR19973069.291639/1‑150 (MQ=60)
CTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAA > SRR19973069.622080/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTTTATGTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGC < SRR19973069.382416/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCTACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGC > SRR19973069.3201347/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTCTTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCC < SRR19973069.1570527/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCC > SRR19973069.7152/1‑150 (MQ=60)
CTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCC > SRR19973069.722687/1‑150 (MQ=60)
CTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCC > SRR19973069.417957/1‑150 (MQ=60)
TTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCG > SRR19973069.2362997/1‑150 (MQ=60)
TTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCG > SRR19973069.295083/1‑150 (MQ=60)
TTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCG > SRR19973069.3278746/1‑150 (MQ=60)
TTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGA > SRR19973069.2707175/1‑150 (MQ=60)
ATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATA > SRR19973069.2643291/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAG > SRR19973069.1659257/1‑150 (MQ=60)
TTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGG < SRR19973069.2719514/150‑1 (MQ=60)
TTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGAATAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGAAATTCAAGCGCCCGAATAACAGG < SRR19973069.1392344/150‑1 (MQ=60)
TTATTGTTGCGTGATCCTGAATTGTAATTGTGATTAATGTTAATTTATTCTGTTCATGTTTAAGCGAATTAAATACTTATAAATTATTTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAA < SRR19973069.2938478/150‑1 (MQ=60)
AATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAG > SRR19973069.465309/1‑150 (MQ=60)
AATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAG > SRR19973069.3109224/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGA < SRR19973069.252533/150‑1 (MQ=60)
ATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGA < SRR19973069.252527/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAT < SRR19973069.3061004/150‑1 (MQ=60)
GTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATG > SRR19973069.2838990/1‑150 (MQ=60)
tttcgttttccttcatttTCATTTTGACTAATGTTATTTTAGTCTGTTAAAGTTTAAGCGCATTAAATTCTTCTATATTATTTGTCTACGTTAAAATTAAAAGATGATTAATTTTCTGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGG < SRR19973069.1198212/132‑1 (MQ=60)
TTGCGTGATCCTTCATAGTCTTTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGAAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGG < SRR19973069.1626553/150‑1 (MQ=60)
CGTGATCCTGAATAGTCATTGTGACTTATGTTAATTTTGTCTGTTCATGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCA < SRR19973069.1189002/150‑1 (MQ=60)
GATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAG < SRR19973069.2178388/150‑1 (MQ=60)
GATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAG < SRR19973069.178800/150‑1 (MQ=60)
CCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCAT > SRR19973069.823868/1‑150 (MQ=60)
ATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAGGATGGCCATAGCATCGCCC > SRR19973069.2916448/1‑150 (MQ=60)
CATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTG > SRR19973069.150580/1‑150 (MQ=60)
CATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTG > SRR19973069.2334807/1‑150 (MQ=60)
CATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTG > SRR19973069.2162289/1‑150 (MQ=60)
TTGTGACTTATGTTAATTTAGTCTGTTCATGTTTAAGCGATTTAAATACTTCTAAATTATTTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGAT < SRR19973069.1403915/150‑1 (MQ=60)
TTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAGAGCATCGCCAATCTGAT < SRR19973069.3487227/150‑1 (MQ=60)
TGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATC < SRR19973069.3788065/150‑1 (MQ=60)
TGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGG < SRR19973069.3167788/150‑1 (MQ=60)
TAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAAT < SRR19973069.3244450/150‑1 (MQ=60)
ATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATAT < SRR19973069.2171737/150‑1 (MQ=60)
TGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATG < SRR19973069.2821510/150‑1 (MQ=60)
TGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATG < SRR19973069.2821602/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGA > SRR19973069.1976963/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGA > SRR19973069.1976968/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGA > SRR19973069.1977315/1‑150 (MQ=60)
TAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCTCCAATCTGATCGGGAATATGGAT < SRR19973069.2569851/150‑1 (MQ=60)
TAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGAAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAT < SRR19973069.327948/150‑1 (MQ=60)
TAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAAAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAT < SRR19973069.327966/150‑1 (MQ=60)
AATTTAGTATGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATG < SRR19973069.3604861/150‑1 (MQ=60)
TTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAC < SRR19973069.2914801/150‑1 (MQ=60)
TAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAA > SRR19973069.2672671/1‑150 (MQ=60)
TAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAA > SRR19973069.1912684/1‑150 (MQ=60)
TAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAA > SRR19973069.1912704/1‑150 (MQ=60)
TGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAG > SRR19973069.1313678/1‑150 (MQ=60)
TGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAG < SRR19973069.670194/150‑1 (MQ=60)
TCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCT < SRR19973069.2250073/150‑1 (MQ=60)
TCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCT < SRR19973069.2250983/150‑1 (MQ=60)
TCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCT < SRR19973069.2318983/150‑1 (MQ=60)
CAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTG > SRR19973069.3073325/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGT > SRR19973069.142166/1‑150 (MQ=60)
AGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTT < SRR19973069.3271959/150‑1 (MQ=60)
AGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTT < SRR19973069.817496/150‑1 (MQ=60)
AAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTC > SRR19973069.2223844/1‑150 (MQ=60)
AAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTC > SRR19973069.282743/1‑150 (MQ=60)
AAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTC > SRR19973069.3191861/1‑150 (MQ=60)
AGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCA > SRR19973069.3482185/1‑150 (MQ=60)
GCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATA < SRR19973069.3160760/150‑1 (MQ=60)
GCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATA < SRR19973069.3400512/150‑1 (MQ=60)
GCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCACCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATA > SRR19973069.3681700/1‑150 (MQ=60)
CATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAT > SRR19973069.178674/1‑150 (MQ=60)
ATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT > SRR19973069.2889866/1‑150 (MQ=60)
ATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATT > SRR19973069.2899828/1‑150 (MQ=60)
TTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTG < SRR19973069.2269567/150‑1 (MQ=60)
TAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGA > SRR19973069.1537784/1‑150 (MQ=60)
AAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAA > SRR19973069.2469041/1‑150 (MQ=60)
AAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAA > SRR19973069.2353533/1‑150 (MQ=60)
AATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAA > SRR19973069.1412039/1‑150 (MQ=60)
AATACTTCTAAATTAAGTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAA > SRR19973069.554940/1‑150 (MQ=60)
ATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAAT < SRR19973069.3226069/150‑1 (MQ=60)
ATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAAT < SRR19973069.3805373/150‑1 (MQ=60)
TACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT < SRR19973069.2965854/150‑1 (MQ=60)
|
ACGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGAAATT > CP009273/2046453‑2046749
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |