Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,106,685 |
G→T |
85.5% |
S51Y (TCT→TAT) |
yghG ← |
secretin (GspDbeta) OM localization lipoprotein pilotin |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,106,685 | 0 | G | T | 85.5%
| 509.8
/ 89.6
| 228 | S51Y (TCT→TAT) | yghG | secretin (GspDbeta) OM localization lipoprotein pilotin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/14); new base T (83/111); total (103/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.46e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTAT > CP009273/3106540‑3106830
|
cACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCatat < 1:1030956/148‑1 (MQ=255)
cACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCatat < 1:4405/148‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTa < 1:150729/148‑1 (MQ=255)
tCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAAt > 2:1913988/1‑148 (MQ=255)
cGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATc > 2:1250942/1‑148 (MQ=255)
gTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGc > 1:732689/1‑148 (MQ=255)
gTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGc < 1:2193571/148‑1 (MQ=255)
cgcACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGtt < 1:1227307/148‑1 (MQ=255)
gcACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGttt < 1:1141457/148‑1 (MQ=255)
caTTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTgg > 2:609909/1‑148 (MQ=255)
caTTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTgg < 1:366749/148‑1 (MQ=255)
caTTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTgg > 1:245774/1‑148 (MQ=255)
aTTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGc > 1:2074125/1‑148 (MQ=255)
tttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCt < 1:944475/148‑1 (MQ=255)
tttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCt < 1:944605/148‑1 (MQ=255)
tttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCt < 1:446247/148‑1 (MQ=255)
ttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTg < 2:1854303/148‑1 (MQ=255)
ttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTg > 2:2645315/1‑148 (MQ=255)
ttGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTg > 2:2539825/1‑148 (MQ=255)
tGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGa < 2:2846194/148‑1 (MQ=255)
tCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGata < 1:1430323/148‑1 (MQ=255)
tCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGata < 1:168612/148‑1 (MQ=255)
cGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGatat > 1:1661746/1‑148 (MQ=255)
cGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTNTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGatct > 1:1680447/1‑146 (MQ=255)
ttGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATAttt < 1:609909/148‑1 (MQ=255)
gATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATTTCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTg < 1:696223/148‑1 (MQ=255)
gATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTg < 1:2357777/148‑1 (MQ=255)
tGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTg < 1:1005160/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGtt > 2:2826060/1‑148 (MQ=255)
aaaaGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGtttttt > 1:2829800/1‑148 (MQ=255)
aaaGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTgcgc < 2:783869/138‑1 (MQ=255)
aaaGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTgcgc > 1:783869/1‑138 (MQ=255)
aaaGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTc > 2:3106845/1‑148 (MQ=255)
ggcgtcaggcgtcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGcc < 2:1030355/148‑1 (MQ=255)
ggcgtcaggcgtcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGcc < 2:2682455/148‑1 (MQ=255)
gcgtcaggcgtcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCa < 1:472274/148‑1 (MQ=255)
aggcgtcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCTCCAGTaaa > 2:1871448/1‑148 (MQ=255)
ggcgtcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAAc < 2:1720111/148‑1 (MQ=255)
tcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGc < 1:2599680/148‑1 (MQ=255)
tcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGc > 2:2259279/1‑148 (MQ=255)
tcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGc > 2:1742954/1‑148 (MQ=255)
tcTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGc < 1:1310621/148‑1 (MQ=255)
cTGGGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCa > 2:341012/1‑148 (MQ=255)
cTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCa > 1:1944154/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑t < 2:2440380/148‑1 (MQ=255)
tttGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCAtt > 2:328194/1‑148 (MQ=255)
ttGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTa < 1:106856/148‑1 (MQ=255)
tgtgTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTAt < 2:131021/148‑1 (MQ=255)
tgtgTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTAt < 2:302910/148‑1 (MQ=255)
ccGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTAtggctggc > 2:963241/1‑148 (MQ=255)
cTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCAc < 1:2185729/148‑1 (MQ=255)
tGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACt < 1:1038449/148‑1 (MQ=255)
tGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACt > 2:510840/1‑148 (MQ=255)
aTAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTta > 2:2714023/1‑148 (MQ=255)
aTAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTta < 1:3124641/148‑1 (MQ=255)
aTGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTtaata < 1:2645315/148‑1 (MQ=255)
tGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTtaataa > 1:1968097/1‑148 (MQ=255)
gTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATc > 2:1612527/1‑148 (MQ=255)
tCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATcc > 1:1849060/1‑148 (MQ=255)
tCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATcc < 2:2493124/148‑1 (MQ=255)
aTTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTg < 1:1261477/148‑1 (MQ=255)
tttttACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGt > 1:2502755/1‑148 (MQ=255)
tttttACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGt > 1:770721/1‑148 (MQ=255)
tttttACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATAATTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGt > 1:845887/1‑148 (MQ=255)
tACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACg < 1:2411669/148‑1 (MQ=255)
aCCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGc > 1:2834693/1‑148 (MQ=255)
ccGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCATTTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGc > 1:2470979/1‑148 (MQ=255)
ccGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCt > 1:1873148/1‑148 (MQ=255)
ttGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTcaa > 2:84332/1‑148 (MQ=255)
ttGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTcaa > 2:2266124/1‑148 (MQ=255)
tgtgCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTcaac > 1:1166899/1‑148 (MQ=255)
tgCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTcaacaa < 2:1385348/148‑1 (MQ=255)
gCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAAt < 2:2130136/148‑1 (MQ=255)
cGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAg > 2:1043773/1‑148 (MQ=255)
cGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAg < 2:2914234/148‑1 (MQ=255)
cTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCg > 2:910705/1‑148 (MQ=255)
tACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGa < 2:671865/148‑1 (MQ=255)
tACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGa < 2:1661746/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGat < 1:657165/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGat < 1:1715437/148‑1 (MQ=255)
cTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGata > 2:952914/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGata < 2:1481828/148‑1 (MQ=255)
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cTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGata > 1:2868753/1‑148 (MQ=255)
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GGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATT > SRR19973070.2741567/1‑150 (MQ=60)
TTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATG < SRR19973070.107856/150‑1 (MQ=60)
CCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCA < SRR19973070.1088725/150‑1 (MQ=60)
CCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCA > SRR19973070.2687589/1‑150 (MQ=60)
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AATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAA > SRR19973070.1981392/1‑150 (MQ=60)
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ACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATAT < SRR19973070.661846/150‑1 (MQ=60)
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AGCACTAAGGTATATCCCGCATATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTC > SRR19973070.3182816/1‑150 (MQ=60)
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TATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGAC < SRR19973070.2905948/150‑1 (MQ=60)
TATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGAC < SRR19973070.2905965/150‑1 (MQ=60)
TATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGAC < SRR19973070.2906131/150‑1 (MQ=60)
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TTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAAGGCGTCAGGCGTCTGCGTGGTTTGTGTACCCGCTTCGCTGATAATGGTCATTTTTACCGTTGTGCCGCTACTTTGCGCCAGCACTAAGGTATATCCCGCAGATTTAATCGGCAGGTTTTGGCTGATATTTTGCGCCTGTTTTTTCGCCAGTAAACTGGCA‑TTTTCATTATGGCTGGCACAGCCACTTAATAATCCTGTAACGCTCAACAATAGCGATATTAATACCCTCCCTGGCATTTGTTTTATCGAC > CP009273/3106537‑3106834
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
