Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,519,657 |
G→T |
100% |
intergenic (‑149/‑171) |
nudE ← / → yrfF |
adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,519,657 | 0 | G | T | 100.0%
| 626.3
/ ‑6.7
| 194 | intergenic (‑149/‑171) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (115/78); total (116/78) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT > CP009273/3519514‑3519801
|
gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt < 2:1000739/148‑1 (MQ=255)
gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt < 2:2459683/148‑1 (MQ=255)
gATATATGATGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGTCAATGTGAATTTCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt < 1:1177779/148‑1 (MQ=255)
aTCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt < 2:1988310/148‑1 (MQ=255)
aTCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt > 1:1746214/1‑148 (MQ=255)
cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg > 2:1100458/1‑148 (MQ=255)
cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg > 2:1099487/1‑148 (MQ=255)
tATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGc < 2:137189/148‑1 (MQ=255)
aTGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCt < 2:1979405/148‑1 (MQ=255)
tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTg > 2:2911898/1‑148 (MQ=255)
gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa < 2:2925935/148‑1 (MQ=255)
gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa < 2:1654672/148‑1 (MQ=255)
tgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATAtt < 1:1490705/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc > 2:2784/1‑148 (MQ=255)
tCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGcc < 1:1581463/148‑1 (MQ=255)
ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag < 2:766688/148‑1 (MQ=255)
tATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAgg > 1:314203/1‑148 (MQ=255)
aTTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAggg < 2:1308073/148‑1 (MQ=255)
aTTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAggg < 2:2231650/148‑1 (MQ=255)
tgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTg < 2:577897/148‑1 (MQ=255)
tgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTg < 1:2927665/148‑1 (MQ=255)
gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGGATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc < 2:558870/148‑1 (MQ=255)
gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc < 2:2963225/148‑1 (MQ=255)
gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc < 2:898924/148‑1 (MQ=255)
atCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGa < 2:952547/148‑1 (MQ=255)
tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 1:1569116/148‑1 (MQ=255)
tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 2:1750705/148‑1 (MQ=255)
cGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCt > 2:2478419/1‑116 (MQ=255)
acGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCgg < 2:2622651/148‑1 (MQ=255)
cGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGt < 1:2447231/148‑1 (MQ=255)
gCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGtt < 1:2109070/148‑1 (MQ=255)
ttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACt > 2:1363929/1‑148 (MQ=255)
tCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTCATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtg < 1:2319945/148‑1 (MQ=255)
gCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGa < 1:726095/148‑1 (MQ=255)
gCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGa < 2:378499/148‑1 (MQ=255)
cAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt > 1:385671/1‑148 (MQ=255)
cAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt > 1:3134631/1‑148 (MQ=255)
aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:189541/1‑148 (MQ=255)
aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 1:2675940/1‑148 (MQ=255)
aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:942495/1‑148 (MQ=255)
tgtgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgtg > 2:1178591/1‑148 (MQ=255)
tgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt > 2:3092714/1‑148 (MQ=255)
aTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa < 1:1666359/148‑1 (MQ=255)
ttGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAat > 2:1067553/1‑148 (MQ=255)
ttGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAat > 2:1533323/1‑148 (MQ=255)
tGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatg > 1:581275/1‑148 (MQ=255)
tGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGATGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAatg > 2:3118073/1‑148 (MQ=255)
gCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatga < 2:2897561/148‑1 (MQ=255)
tGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGc > 1:2465850/1‑148 (MQ=255)
tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa > 2:2535109/1‑148 (MQ=255)
tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa < 2:2598046/148‑1 (MQ=255)
tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa < 2:1433743/148‑1 (MQ=255)
aTTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCaa > 1:2063427/1‑148 (MQ=255)
cATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaa < 2:3051184/148‑1 (MQ=255)
cATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaa > 2:751781/1‑148 (MQ=255)
ttATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACt > 1:1872219/1‑148 (MQ=255)
gTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAc > 2:2952047/1‑148 (MQ=255)
gTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAc > 2:2952031/1‑148 (MQ=255)
tAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACg > 2:1320643/1‑148 (MQ=255)
aaCTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGc > 1:420630/1‑148 (MQ=255)
aCTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCt > 2:21925/1‑148 (MQ=255)
taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 1:463120/1‑148 (MQ=255)
ataaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGTTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCg > 1:719788/1‑148 (MQ=255)
ataaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCg > 1:497722/1‑148 (MQ=255)
aaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAt < 2:3135738/148‑1 (MQ=255)
ataatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAg > 1:3171418/1‑148 (MQ=255)
taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGc > 1:339104/1‑148 (MQ=255)
taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGc > 2:427357/1‑148 (MQ=255)
taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGc > 2:2095774/1‑148 (MQ=255)
atCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCa > 1:710725/1‑148 (MQ=255)
tCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa > 2:781802/1‑148 (MQ=255)
tCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa < 2:2122046/148‑1 (MQ=255)
gTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAAcc > 1:356893/1‑148 (MQ=255)
gTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGATGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGATTAATGATGCTCAAGTTAAACTCAACGCTTGCCGATAGACAAcc > 1:356891/1‑148 (MQ=255)
tCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCg > 1:807337/1‑148 (MQ=255)
tCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCg < 2:1143553/148‑1 (MQ=255)
ccTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGc > 1:2821759/1‑148 (MQ=255)
ccTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGc > 2:1726884/1‑148 (MQ=255)
cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCa > 2:2736141/1‑148 (MQ=255)
cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCa > 2:1554760/1‑148 (MQ=255)
cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCa > 2:1555150/1‑148 (MQ=255)
caaatcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAAATCCATGAATTTGCTGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGa > 1:3235307/1‑148 (MQ=255)
aatcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAAt > 1:1026264/1‑148 (MQ=255)
caaatTAAAAGTCAATATGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt < 1:2875978/148‑1 (MQ=255)
ttAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTAAATGAATTTGCTGATAGTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCNGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAt < 1:1680491/148‑1 (MQ=255)
tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt > 2:1636635/1‑148 (MQ=255)
aGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt > 1:1138736/1‑148 (MQ=255)
gTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTc > 2:1908774/1‑148 (MQ=255)
tCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTcc > 2:1494950/1‑148 (MQ=255)
tCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTcc > 1:1042357/1‑148 (MQ=255)
cAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCg > 1:3266630/1‑148 (MQ=255)
ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg > 1:2344375/1‑148 (MQ=255)
ttGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAc > 1:1762251/1‑148 (MQ=255)
ttGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAc > 1:2882564/1‑148 (MQ=255)
tGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACt > 1:3276388/1‑148 (MQ=255)
tGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACt > 1:740663/1‑148 (MQ=255)
aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGAcc > 2:1198545/1‑148 (MQ=255)
aaCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGCGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGACTCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCAc > 1:2236643/1‑148 (MQ=255)
ccATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCt < 1:1386303/148‑1 (MQ=255)
ccATGAATGTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCt < 1:3051100/148‑1 (MQ=255)
|
GATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT > CP009273/3519514‑3519801
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC > CP009273/3519513‑3519804
|
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATT > SRR19973070.1758323/1‑150 (MQ=60)
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATT > SRR19973070.1758266/1‑150 (MQ=60)
GATATATGATGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGTCAATGTGAATTTCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTT < SRR19973070.1186041/150‑1 (MQ=60)
CTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCT < SRR19973070.37234/150‑1 (MQ=60)
ctggagttcagacgtgtgctcttccgatcTATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGA < SRR19973070.2494558/121‑1 (MQ=60)
TGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCC > SRR19973070.1060188/1‑150 (MQ=60)
TGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCC > SRR19973070.723506/1‑150 (MQ=60)
TGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCC < SRR19973070.1501137/150‑1 (MQ=60)
AATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCC < SRR19973070.1433866/150‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTT < SRR19973070.1592548/150‑1 (MQ=60)
GGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAG > SRR19973070.3070626/1‑150 (MQ=60)
GTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGG > SRR19973070.317043/1‑150 (MQ=60)
GTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGG > SRR19973070.316469/1‑150 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973070.2946560/150‑1 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973070.2946186/150‑1 (MQ=60)
ATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATC > SRR19973070.1354487/1‑150 (MQ=60)
ATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATC > SRR19973070.2475856/1‑150 (MQ=60)
TCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCA < SRR19973070.1580150/150‑1 (MQ=60)
TCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCA < SRR19973070.1580146/150‑1 (MQ=60)
TCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCA > SRR19973070.1680917/1‑150 (MQ=60)
CGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTA < SRR19973070.2463246/150‑1 (MQ=60)
CGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTA < SRR19973070.2462957/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAC < SRR19973070.2123218/150‑1 (MQ=60)
TCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTCATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTG < SRR19973070.2335362/150‑1 (MQ=60)
TCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTG < SRR19973070.329747/150‑1 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT < SRR19973070.1767679/150‑1 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT > SRR19973070.3154879/1‑150 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT < SRR19973070.3284167/150‑1 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT > SRR19973070.388501/1‑150 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT > SRR19973070.389955/1‑150 (MQ=60)
GCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATG < SRR19973070.733006/150‑1 (MQ=60)
GCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATG < SRR19973070.731247/150‑1 (MQ=60)
CAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGT > SRR19973070.2693314/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATG > SRR19973070.585279/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATG < SRR19973070.1677806/150‑1 (MQ=60)
CATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGC > SRR19973070.2481941/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCA > SRR19973070.1160756/1‑150 (MQ=60)
TTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAA > SRR19973070.2077351/1‑150 (MQ=60)
TATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAG > SRR19973070.2132088/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACT > SRR19973070.1884986/1‑150 (MQ=60)
GTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGC > SRR19973070.423696/1‑150 (MQ=60)
CTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGC > SRR19973070.466821/1‑150 (MQ=60)
CTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGC > SRR19973070.466422/1‑150 (MQ=60)
TAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGTTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCG > SRR19973070.724915/1‑150 (MQ=60)
TAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGTTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCG > SRR19973070.724934/1‑150 (MQ=60)
TAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCG > SRR19973070.501191/1‑150 (MQ=60)
TAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCG > SRR19973070.3005718/1‑150 (MQ=60)
ATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAT > SRR19973070.338204/1‑150 (MQ=60)
ATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAT > SRR19973070.2016304/1‑150 (MQ=60)
AAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAG > SRR19973070.3191948/1‑150 (MQ=60)
AATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGC > SRR19973070.341575/1‑150 (MQ=60)
ATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCC > SRR19973070.2110972/1‑150 (MQ=60)
TAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCA > SRR19973070.715791/1‑150 (MQ=60)
TAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCA > SRR19973070.715674/1‑150 (MQ=60)
TAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCA > SRR19973070.281628/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAAC > SRR19973070.1638497/1‑150 (MQ=60)
TCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACC > SRR19973070.359494/1‑150 (MQ=60)
TCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGATGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGATTAATGATGCTCAAGTTAAACTCAACGCTTGCCGATAGACAACC > SRR19973070.359492/1‑150 (MQ=60)
CGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCG > SRR19973070.812877/1‑150 (MQ=60)
GTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGC > SRR19973070.2840347/1‑150 (MQ=60)
GTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGC > SRR19973070.2840003/1‑150 (MQ=60)
GTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGC > SRR19973070.518836/1‑150 (MQ=60)
CTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAAATCCATGAATTTGCTGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGA > SRR19973070.3256189/1‑150 (MQ=60)
CAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAAT > SRR19973070.1033540/1‑150 (MQ=60)
AAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATC > SRR19973070.346966/1‑150 (MQ=60)
AATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCA > SRR19973070.2307830/1‑150 (MQ=60)
ATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAT < SRR19973070.3256104/150‑1 (MQ=60)
CAAATTAAAAGTCAATATGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGT < SRR19973070.2894605/150‑1 (MQ=60)
TTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTG > SRR19973070.764129/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTAAATGAATTTGCTGATAGTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCNGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTG < SRR19973070.1692002/150‑1 (MQ=60)
AAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGT > SRR19973070.1146631/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCC > SRR19973070.1049712/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCC > SRR19973070.439104/1‑150 (MQ=60)
GTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCG > SRR19973070.3287651/1‑150 (MQ=60)
AATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTG > SRR19973070.3157405/1‑150 (MQ=60)
TAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCG > SRR19973070.2359924/1‑150 (MQ=60)
GGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAC > SRR19973070.87620/1‑150 (MQ=60)
GGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAC > SRR19973070.2901224/1‑150 (MQ=60)
GGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAC > SRR19973070.2901139/1‑150 (MQ=60)
GGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAC > SRR19973070.1774446/1‑150 (MQ=60)
GTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACT > SRR19973070.3297441/1‑150 (MQ=60)
GTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACT > SRR19973070.745899/1‑150 (MQ=60)
GTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCAACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTTTGTCCGGTGCGACT > SRR19973070.1858953/1‑150 (MQ=60)
ATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGCGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGACTCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCAC > SRR19973070.2251394/1‑150 (MQ=60)
CTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT < SRR19973070.1531495/150‑1 (MQ=60)
CCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGA < SRR19973070.1395679/150‑1 (MQ=60)
CCATGAATGTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGA < SRR19973070.3070539/150‑1 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC < SRR19973070.1329777/150‑1 (MQ=60)
|
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC > CP009273/3519513‑3519804
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
