Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,519,657 |
G→T |
100% |
intergenic (‑149/‑171) |
nudE ← / → yrfF |
adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,519,657 | 0 | G | T | 99.7%
| 952.5
/ ‑4.9
| 278 | intergenic (‑149/‑171) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (158/119); minor base C (1/0); total (159/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > CP009273/3519513‑3519802
|
ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt > 2:385343/1‑149 (MQ=255)
ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt < 2:4552173/149‑1 (MQ=255)
gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt < 2:2999905/149‑1 (MQ=255)
gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt < 2:607996/149‑1 (MQ=255)
tCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg > 1:2117151/1‑149 (MQ=255)
tATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCt < 1:2839410/149‑1 (MQ=255)
tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGATATAACTCCATGAATTTGCTGa > 2:775946/1‑149 (MQ=255)
tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa < 1:846646/149‑1 (MQ=255)
tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa > 1:3304242/1‑149 (MQ=255)
gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGat < 1:1002002/149‑1 (MQ=255)
tgtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGatat < 2:4282932/149‑1 (MQ=255)
gtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATAtt < 1:2949258/149‑1 (MQ=255)
tgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTc < 1:3676119/149‑1 (MQ=255)
aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGcc > 1:4070254/1‑149 (MQ=255)
cAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCtt < 1:455483/149‑1 (MQ=255)
aGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTc < 1:1723038/149‑1 (MQ=255)
ggTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCaga < 1:988341/149‑1 (MQ=255)
ggTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCaga < 2:2839832/149‑1 (MQ=255)
tgtgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGttt < 2:4670171/149‑1 (MQ=255)
gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCt > 1:2924127/1‑149 (MQ=255)
atatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATg < 1:3418560/149‑1 (MQ=255)
tatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGa > 2:1497262/1‑149 (MQ=255)
cGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCa < 2:3533329/149‑1 (MQ=255)
ggACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAg > 1:1250385/1‑149 (MQ=255)
gACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGc > 1:3071237/1‑149 (MQ=255)
gACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGc > 2:1280205/1‑149 (MQ=255)
acacGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCg > 2:420350/1‑149 (MQ=255)
cacGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCgg < 2:4692470/149‑1 (MQ=255)
gCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTa < 1:753780/149‑1 (MQ=255)
gCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTa < 2:2468930/149‑1 (MQ=255)
ttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtg > 1:1910996/1‑149 (MQ=255)
ggCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGa > 1:561074/1‑149 (MQ=255)
ggCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGa > 2:1841335/1‑149 (MQ=255)
gCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt > 2:2007257/1‑149 (MQ=255)
tgtgAATTGCATGTTATTTACATTTATGGAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGc > 2:1670970/1‑149 (MQ=255)
gtgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt > 2:1735038/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa > 2:635181/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa < 2:1103072/149‑1 (MQ=255)
tGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatga < 2:225292/149‑1 (MQ=255)
aTGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGc < 1:3057910/149‑1 (MQ=255)
gTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTc > 1:3174966/1‑149 (MQ=255)
aTTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAg < 2:348682/149‑1 (MQ=255)
aTTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAg > 1:3067056/1‑149 (MQ=255)
ttACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAATTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGACTTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAGCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGtt > 1:4195876/1‑149 (MQ=255)
ttACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGtt > 2:4381297/1‑149 (MQ=255)
aCATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaa > 1:2082648/1‑149 (MQ=255)
aCATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaa < 2:2687019/149‑1 (MQ=255)
aTTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAAc > 2:4637640/1‑149 (MQ=255)
tGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAc > 2:1593512/1‑149 (MQ=255)
aaCTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCt < 1:750324/149‑1 (MQ=255)
aaCTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCt > 2:3901904/1‑149 (MQ=255)
aCTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCtt > 2:1131165/1‑149 (MQ=255)
aataaataATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCg > 2:891751/1‑149 (MQ=255)
ataaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGa > 1:1421244/1‑149 (MQ=255)
ataaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGa > 2:2147988/1‑149 (MQ=255)
taaataaTCGTCCTCGAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAt > 2:1223038/1‑149 (MQ=255)
aataatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAg > 1:1591361/1‑149 (MQ=255)
ataatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGc > 1:3906895/1‑149 (MQ=255)
taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGcc < 1:4495465/149‑1 (MQ=255)
atCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa > 1:3243870/1‑149 (MQ=255)
gTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTGTGCTATGATCAGCGGGTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCg > 2:3174004/1‑149 (MQ=255)
tCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGc < 2:2098563/149‑1 (MQ=255)
ccTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCa < 2:1116138/149‑1 (MQ=255)
ccTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCa < 2:2698158/149‑1 (MQ=255)
cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAg > 2:1623099/1‑149 (MQ=255)
cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAg > 2:3369769/1‑149 (MQ=255)
tcaaatcaaaTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGa > 2:4003927/1‑149 (MQ=255)
tcaaatcaaaTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGa > 2:4119662/1‑149 (MQ=255)
aatcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATc > 1:2389712/1‑149 (MQ=255)
aatcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATc > 1:4786500/1‑149 (MQ=255)
tcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt < 1:2568781/149‑1 (MQ=255)
tcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt > 2:1295291/1‑149 (MQ=255)
caaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATg < 1:3809894/149‑1 (MQ=255)
aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTa < 1:2286826/149‑1 (MQ=255)
aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTa < 1:703560/149‑1 (MQ=255)
aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCAATGAATTTGCTGATATTCCTCCTTCATAGGGTTTGCTATGATCAGCTGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACACCAAGCTTGCCGATAGACAACCGCAGACTCATGTa > 2:3310038/1‑149 (MQ=255)
tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtg < 1:1582629/149‑1 (MQ=255)
aaaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgt > 1:203421/1‑149 (MQ=255)
aaaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgt > 1:2428553/1‑149 (MQ=255)
aaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgtg < 1:3041226/149‑1 (MQ=255)
tCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCg < 1:3785630/149‑1 (MQ=255)
cactAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCgg < 2:3290577/146‑1 (MQ=255)
aaTAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGt < 2:4785179/149‑1 (MQ=255)
aTAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg < 1:3568094/149‑1 (MQ=255)
aTAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg > 1:3953568/1‑149 (MQ=255)
ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 2:2365948/1‑149 (MQ=255)
ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 1:419956/1‑149 (MQ=255)
ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 1:2327243/1‑149 (MQ=255)
ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 2:3129477/1‑149 (MQ=255)
gTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGACGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAc > 2:3272566/1‑149 (MQ=255)
ttGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACt > 1:361807/1‑149 (MQ=255)
aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:224161/1‑149 (MQ=255)
aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:4670719/1‑149 (MQ=255)
aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:1147961/1‑149 (MQ=255)
aCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGACTCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGc > 2:581268/1‑149 (MQ=255)
aCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGc > 2:2972994/1‑149 (MQ=255)
cTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTTATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGcc < 2:3916790/149‑1 (MQ=255)
cTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGcc < 2:3672214/149‑1 (MQ=255)
ccATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTg > 1:436005/1‑149 (MQ=255)
ccATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTg > 1:917451/1‑149 (MQ=255)
|
GGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > CP009273/3519513‑3519802
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACAG > CP009273/3519512‑3519806
|
GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAT > SRR19973071.2401952/1‑150 (MQ=60)
ATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTG > SRR19973071.2124973/1‑150 (MQ=60)
TATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTG < SRR19973071.2849502/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGA > SRR19973071.3315951/1‑150 (MQ=60)
TGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGAT < SRR19973071.849648/150‑1 (MQ=60)
GCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATA < SRR19973071.1005645/150‑1 (MQ=60)
GTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTC < SRR19973071.2959823/150‑1 (MQ=60)
GTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTC > SRR19973071.3627031/1‑150 (MQ=60)
GTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTC < SRR19973071.381028/150‑1 (MQ=60)
TGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCC < SRR19973071.3689109/150‑1 (MQ=60)
GAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCG < SRR19973071.2379730/150‑1 (MQ=60)
AATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCC > SRR19973071.4084668/1‑150 (MQ=60)
AATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCC > SRR19973071.4084555/1‑150 (MQ=60)
TCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTT < SRR19973071.2233563/150‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTT < SRR19973071.2232909/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTC < SRR19973071.457136/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTC < SRR19973071.4789548/150‑1 (MQ=60)
AGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCA > SRR19973071.1304573/1‑150 (MQ=60)
AGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCA < SRR19973071.1729452/150‑1 (MQ=60)
GGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAG < SRR19973071.2940361/150‑1 (MQ=60)
GGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAG < SRR19973071.991935/150‑1 (MQ=60)
GTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGG > SRR19973071.4469639/1‑150 (MQ=60)
TTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTT > SRR19973071.4401625/1‑150 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973071.64816/150‑1 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973071.2542532/150‑1 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT > SRR19973071.2934605/1‑150 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973071.3011540/150‑1 (MQ=60)
TGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCT < SRR19973071.2272348/150‑1 (MQ=60)
ATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGA < SRR19973071.3430661/150‑1 (MQ=60)
ATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGA < SRR19973071.3430204/150‑1 (MQ=60)
CGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAG > SRR19973071.1254862/1‑150 (MQ=60)
GGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGC > SRR19973071.3082118/1‑150 (MQ=60)
GGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGC > SRR19973071.3082110/1‑150 (MQ=60)
ACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGG < SRR19973071.606094/150‑1 (MQ=60)
ACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTT > SRR19973071.3092237/1‑150 (MQ=60)
ACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTT > SRR19973071.1489539/1‑150 (MQ=60)
GCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAC < SRR19973071.756360/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAC < SRR19973071.94997/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAC < SRR19973071.755966/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAC < SRR19973071.3390069/150‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACT < SRR19973071.3106945/150‑1 (MQ=60)
TTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTG > SRR19973071.1918002/1‑150 (MQ=60)
TCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTG > SRR19973071.1596318/1‑150 (MQ=60)
TCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTG < SRR19973071.1175874/150‑1 (MQ=60)
CGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGA > SRR19973071.563179/1‑150 (MQ=60)
CGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGA > SRR19973071.563182/1‑150 (MQ=60)
CGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGA > SRR19973071.3228924/1‑150 (MQ=60)
GGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAT > SRR19973071.977343/1‑150 (MQ=60)
GCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATG < SRR19973071.188726/150‑1 (MQ=60)
CAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGT < SRR19973071.72607/150‑1 (MQ=60)
CAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGT > SRR19973071.4360068/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATG > SRR19973071.3196477/1‑150 (MQ=60)
ATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCT < SRR19973071.3068862/150‑1 (MQ=60)
ATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCT < SRR19973071.3068759/150‑1 (MQ=60)
TGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTC > SRR19973071.3186034/1‑150 (MQ=60)
TCTTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTACTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGATGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGATCAAG > SRR19973071.3077921/1‑150 (MQ=60)
TATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAG > SRR19973071.3077929/1‑150 (MQ=60)
TTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAATTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGACTTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAGCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTT > SRR19973071.4210816/1‑150 (MQ=60)
TTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTT > SRR19973071.4210810/1‑150 (MQ=60)
TTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTT > SRR19973071.1805098/1‑150 (MQ=60)
TTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTT > SRR19973071.4210830/1‑150 (MQ=60)
TTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTT < SRR19973071.90841/150‑1 (MQ=60)
TACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAA > SRR19973071.2090426/1‑150 (MQ=60)
TACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAA > SRR19973071.329642/1‑150 (MQ=60)
TACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAA > SRR19973071.2090319/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACT > SRR19973071.3897546/1‑150 (MQ=60)
TATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCA < SRR19973071.4002929/150‑1 (MQ=60)
ATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAC < SRR19973071.2569666/150‑1 (MQ=60)
ATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAAATAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCAATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAC < SRR19973071.3711841/150‑1 (MQ=60)
TAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCT < SRR19973071.3620863/150‑1 (MQ=60)
CACTTAATAAATAATCGACCTCAAATCAAATTAAAAGTCAAAAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTT > SRR19973071.198044/1‑150 (MQ=60)
AACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTT < SRR19973071.752897/150‑1 (MQ=60)
CTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGC < SRR19973071.115230/150‑1 (MQ=60)
CTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGC < SRR19973071.115981/150‑1 (MQ=60)
TTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCC > SRR19973071.3958380/1‑150 (MQ=60)
TAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCG > SRR19973071.4207056/1‑150 (MQ=60)
AATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGA > SRR19973071.1426476/1‑150 (MQ=60)
AATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGA < SRR19973071.713577/150‑1 (MQ=60)
AATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGA < SRR19973071.2890900/150‑1 (MQ=60)
taaattaatctgcaaAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATA < SRR19973071.1900844/135‑1 (MQ=60)
AAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAG > SRR19973071.33034/1‑150 (MQ=60)
AAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAG > SRR19973071.1596980/1‑150 (MQ=60)
AATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGC > SRR19973071.3920736/1‑150 (MQ=60)
AATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGC > SRR19973071.3920680/1‑150 (MQ=60)
ATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCC > SRR19973071.2833572/1‑150 (MQ=60)
ATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCC > SRR19973071.2043439/1‑150 (MQ=60)
ATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCC > SRR19973071.430604/1‑150 (MQ=60)
TAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCA < SRR19973071.4511441/150‑1 (MQ=60)
AATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAA > SRR19973071.3255309/1‑150 (MQ=60)
AATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAA > SRR19973071.1627563/1‑150 (MQ=60)
AATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGATGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCAACGCTTGCCGATAGCCAA > SRR19973071.3682995/1‑150 (MQ=60)
CGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCG < SRR19973071.2018246/150‑1 (MQ=60)
GTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGC > SRR19973071.4564880/1‑150 (MQ=60)
GTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGC > SRR19973071.4517658/1‑150 (MQ=60)
CAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAAT > SRR19973071.1524415/1‑150 (MQ=60)
AAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATC > SRR19973071.2398308/1‑150 (MQ=60)
AAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATC > SRR19973071.4803367/1‑150 (MQ=60)
AAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATC < SRR19973071.3725136/150‑1 (MQ=60)
AAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATC > SRR19973071.3556602/1‑150 (MQ=60)
AATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCA > SRR19973071.1680205/1‑150 (MQ=60)
AATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCA > SRR19973071.2308228/1‑150 (MQ=60)
AATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCA > SRR19973071.2983077/1‑150 (MQ=60)
TCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATG < SRR19973071.2578105/150‑1 (MQ=60)
CAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGT < SRR19973071.3823416/150‑1 (MQ=60)
CAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGT > SRR19973071.4582179/1‑150 (MQ=60)
AATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAT < SRR19973071.2295213/150‑1 (MQ=60)
AATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAT < SRR19973071.514350/150‑1 (MQ=60)
AATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAT < SRR19973071.706034/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATT < SRR19973071.3067721/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATT < SRR19973071.3067698/150‑1 (MQ=60)
TTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTG < SRR19973071.778558/150‑1 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTTCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT > SRR19973071.2284575/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT > SRR19973071.4689729/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT > SRR19973071.2437344/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT > SRR19973071.204251/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT < SRR19973071.1588235/150‑1 (MQ=60)
TAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCACGAATTTGCTGATATTCCGCCTACAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCATGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGT > SRR19973071.842390/1‑150 (MQ=60)
AAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGT < SRR19973071.3052041/150‑1 (MQ=60)
GTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCG < SRR19973071.2079592/150‑1 (MQ=60)
GTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCG > SRR19973071.2899070/1‑150 (MQ=60)
TCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGG < SRR19973071.1400398/150‑1 (MQ=60)
TCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGG < SRR19973071.3799084/150‑1 (MQ=60)
AATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTG > SRR19973071.3967448/1‑150 (MQ=60)
ATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGC < SRR19973071.3580517/150‑1 (MQ=60)
AGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGA > SRR19973071.2335625/1‑150 (MQ=60)
AGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGA > SRR19973071.3837276/1‑150 (MQ=60)
AGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGA > SRR19973071.421365/1‑150 (MQ=60)
AGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGA > SRR19973071.2425866/1‑150 (MQ=60)
AGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGA > SRR19973071.2335710/1‑150 (MQ=60)
GTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACT > SRR19973071.363488/1‑150 (MQ=60)
GTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACT > SRR19973071.362970/1‑150 (MQ=60)
AATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCA > SRR19973071.1151961/1‑150 (MQ=60)
AATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCA > SRR19973071.4687349/1‑150 (MQ=60)
AATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCA > SRR19973071.225037/1‑150 (MQ=60)
TAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACG > SRR19973071.2665988/1‑150 (MQ=60)
CTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT < SRR19973071.897341/150‑1 (MQ=60)
TCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > SRR19973071.920771/1‑150 (MQ=60)
TCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > SRR19973071.437540/1‑150 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC < SRR19973071.3893919/150‑1 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC > SRR19973071.1433874/1‑150 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC < SRR19973071.3101480/150‑1 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC < SRR19973071.3101456/150‑1 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC < SRR19973071.3101406/150‑1 (MQ=60)
CATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGAC > SRR19973071.1434478/1‑150 (MQ=60)
ATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACA < SRR19973071.840676/150‑1 (MQ=60)
ATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACA < SRR19973071.1502681/150‑1 (MQ=60)
ATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACA > SRR19973071.3367872/1‑150 (MQ=60)
TGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACAG < SRR19973071.299746/150‑1 (MQ=60)
TGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACAG < SRR19973071.262747/150‑1 (MQ=60)
TGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACAG < SRR19973071.2664481/150‑1 (MQ=60)
|
GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTGACAG > CP009273/3519512‑3519806
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |