Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,777,451 |
C→A |
100% |
A55E (GCG→GAG) |
fadK → |
short chain acyl‑CoA synthetase, anaerobic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,777,451 | 0 | C | A | 95.0%
| 597.3
/ 21.1
| 200 | A55E (GCG→GAG) | fadK | short chain acyl‑CoA synthetase, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/6); new base A (87/103); total (91/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
TTTAACGAACAACGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTTCCG > CP009273/1777306‑1777594
|
tttAACGAACAACGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAgcgagc < 2:2954166/148‑1 (MQ=255)
ttAACGAACAACGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCt > 1:2474668/1‑148 (MQ=255)
gAACAACGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATc < 2:2009036/148‑1 (MQ=255)
aacaacGTCGTGCGGCGTATCGTCATCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCa > 1:684804/1‑148 (MQ=255)
aacaacGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCa > 2:461520/1‑148 (MQ=255)
aacaacGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCa > 2:1322286/1‑148 (MQ=255)
caacGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCAcg < 1:712766/148‑1 (MQ=255)
acGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCAcgcc > 2:788031/1‑148 (MQ=255)
tcgtGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCcgcg < 1:1150318/148‑1 (MQ=255)
tGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGc > 1:2486830/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGc > 1:2484528/1‑148 (MQ=255)
gcgTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTc < 1:1928942/148‑1 (MQ=255)
gcgTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTc < 1:2962614/148‑1 (MQ=255)
gcgTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTc < 1:1437701/148‑1 (MQ=255)
gcgTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTc < 1:3205847/148‑1 (MQ=255)
gcgTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTc < 1:1190250/148‑1 (MQ=255)
tCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCa > 2:2443364/1‑148 (MQ=255)
gTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCaaa < 2:141236/148‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACt > 2:694594/1‑148 (MQ=255)
aGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTg < 1:2085555/148‑1 (MQ=255)
aaGGGTTATGGGGAGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAAATGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGACTGGCAAACTGGAt > 2:504962/1‑148 (MQ=255)
aGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCTATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATg > 1:2417961/1‑148 (MQ=255)
aGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATg < 1:2244051/148‑1 (MQ=255)
aGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATg < 2:228774/148‑1 (MQ=255)
aGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATg > 1:1889981/1‑148 (MQ=255)
gggTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGt < 2:1119055/148‑1 (MQ=255)
gggTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGt < 2:1119101/148‑1 (MQ=255)
gggTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGt > 1:1482962/1‑148 (MQ=255)
ggTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGtt > 1:3009406/1‑148 (MQ=255)
gTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTa < 2:2063806/148‑1 (MQ=255)
gTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTa < 1:2498488/148‑1 (MQ=255)
gTTATGGGGCGATGCGTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTa < 2:3115480/148‑1 (MQ=255)
gTTAGGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTa < 2:2610009/148‑1 (MQ=255)
ttATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAg < 1:514211/148‑1 (MQ=255)
tGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGa > 1:3403376/1‑148 (MQ=255)
ggggCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGaa > 1:2892428/1‑148 (MQ=255)
gggCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAg > 1:1684265/1‑148 (MQ=255)
gggCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAg > 1:479754/1‑148 (MQ=255)
ggCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAgg < 2:1395112/148‑1 (MQ=255)
cGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAAGTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGt < 1:1972226/148‑1 (MQ=255)
gATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTa > 2:1657178/1‑148 (MQ=255)
aTGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTAt > 2:2030553/1‑148 (MQ=255)
aTGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTAt < 1:803332/148‑1 (MQ=255)
aTGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTAt > 2:922522/1‑148 (MQ=255)
ttCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGaa > 1:454232/1‑148 (MQ=255)
tCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAAt > 1:2830369/1‑148 (MQ=255)
tGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAgg < 1:1584438/148‑1 (MQ=255)
ccGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGa > 2:2781303/1‑148 (MQ=255)
gATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatc > 2:162395/1‑148 (MQ=255)
gATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatc > 2:161763/1‑148 (MQ=255)
aTTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatcg > 1:928007/1‑148 (MQ=255)
tACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatcgca < 1:416851/148‑1 (MQ=255)
tACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatcgca > 2:871924/1‑148 (MQ=255)
tGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatcgcatcg < 2:535348/148‑1 (MQ=255)
tGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGatcgcatcg < 2:535268/148‑1 (MQ=255)
gcagcaGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGAtcgcatcgca > 2:1889266/1‑148 (MQ=255)
gcagcaGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGAtcgcatcgca < 1:3158025/148‑1 (MQ=255)
gcagACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCAttt < 1:1061048/148‑1 (MQ=255)
cagACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTc > 2:127578/1‑148 (MQ=255)
aCCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCa > 1:3429764/1‑126 (MQ=255)
aCCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCa < 2:3429764/126‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGc < 2:45925/148‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGc < 2:3467659/148‑1 (MQ=255)
tCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCct > 1:764898/1‑148 (MQ=255)
cGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCctg < 2:1584842/148‑1 (MQ=255)
cGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCctg > 2:396430/1‑148 (MQ=255)
tGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGgtg < 2:2684934/148‑1 (MQ=255)
gACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAAt < 2:3297576/148‑1 (MQ=255)
cAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAAttt > 1:1662784/1‑148 (MQ=255)
cAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAAttt < 1:2470009/148‑1 (MQ=255)
aTTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCg > 1:64568/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCg > 1:1713599/1‑148 (MQ=255)
ttGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGt > 2:2380838/1‑148 (MQ=255)
ccGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtat < 2:2163760/148‑1 (MQ=255)
ccGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtat < 1:2331675/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatcta < 1:2443364/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatcta < 1:854870/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatcta < 1:387575/148‑1 (MQ=255)
ggTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatctat < 1:788558/148‑1 (MQ=255)
ggTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatctat < 2:1510405/148‑1 (MQ=255)
gTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTtatctatc < 1:1323512/148‑1 (MQ=255)
gATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTtg < 2:549649/148‑1 (MQ=255)
aTAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTtgc > 2:1412617/1‑148 (MQ=255)
aTAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTtgc > 2:3180265/1‑148 (MQ=255)
aTAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCGGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTtgc > 1:1987685/1‑148 (MQ=255)
tAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTtgcc < 2:2486830/148‑1 (MQ=255)
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AGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGAGATCGgaagagcacacgtc > SRR19973067.3451663/1‑136 (MQ=60)
GCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCT > SRR19973067.2563815/1‑150 (MQ=60)
GCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCT > SRR19973067.770210/1‑150 (MQ=60)
CTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTG > SRR19973067.2901827/1‑150 (MQ=60)
TCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGG < SRR19973067.464714/150‑1 (MQ=60)
AGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATAGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATT > SRR19973067.2408720/1‑150 (MQ=60)
GACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTT > SRR19973067.1674251/1‑150 (MQ=60)
CAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTAC < SRR19973067.2486246/150‑1 (MQ=60)
CAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTAC < SRR19973067.2485734/150‑1 (MQ=60)
CAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTAC < SRR19973067.3559380/150‑1 (MQ=60)
AAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCG > SRR19973067.65340/1‑150 (MQ=60)
AAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCG > SRR19973067.1725352/1‑150 (MQ=60)
CCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCT < SRR19973067.943763/150‑1 (MQ=60)
CCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCT < SRR19973067.2346969/150‑1 (MQ=60)
CCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCT < SRR19973067.793476/150‑1 (MQ=60)
CGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTA < SRR19973067.699388/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATC < SRR19973067.390278/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATC < SRR19973067.390283/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATC < SRR19973067.2459411/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATC > SRR19973067.1169818/1‑150 (MQ=60)
TGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATC < SRR19973067.860631/150‑1 (MQ=60)
GGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCT < SRR19973067.794008/150‑1 (MQ=60)
GGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCT < SRR19973067.794028/150‑1 (MQ=60)
GGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCT < SRR19973067.50750/150‑1 (MQ=60)
GTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTT < SRR19973067.1332541/150‑1 (MQ=60)
TCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTG < SRR19973067.1452312/150‑1 (MQ=60)
CGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCGGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGC > SRR19973067.2001124/1‑150 (MQ=60)
ATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCT < SRR19973067.3241469/150‑1 (MQ=60)
TCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCT < SRR19973067.1438177/150‑1 (MQ=60)
ATCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGG > SRR19973067.3523555/1‑150 (MQ=60)
TCGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTTGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGT < SRR19973067.2038840/150‑1 (MQ=60)
CGTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTG < SRR19973067.1259094/150‑1 (MQ=60)
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GTACACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGC < SRR19973067.1270655/150‑1 (MQ=60)
CACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGT > SRR19973067.2442754/1‑150 (MQ=60)
CACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGT > SRR19973067.2442755/1‑150 (MQ=60)
ACCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGAT > SRR19973067.1312157/1‑150 (MQ=60)
CCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTT < SRR19973067.2827922/150‑1 (MQ=60)
CCTATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTT < SRR19973067.2117157/150‑1 (MQ=60)
ATAGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTTCCG > SRR19973067.2772177/1‑150 (MQ=60)
AGCGAGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTTCCGTG > SRR19973067.303300/1‑150 (MQ=60)
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ACGTTTAACGAACAACGTCGTGCGGCGTATCGTCAGCAAGGGTTATGGGGCGATGCTTCGCTGGCCGATTACTGGCAGCAGACCGCTCGTGCGATGCCAGACAAAATTGCCGTGGTCGATAATCATGGTGCATCGTACACCTATAGCGCGCTCGATCACGCCGCGAGCTGTCTGGCAAACTGGATGTTAGCGAAGGGTATTGAATCAGGCGATCGCATCGCATTTCAACTGCCTGGCTGGTGTGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCTGAAAATCGGTGCAGTTTCCGTG > CP009273/1777303‑1777596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
