Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,783,091 |
G→T |
93.5% |
E134* (GAG→TAG) |
aroH → |
3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,783,091 | 0 | G | T | 93.5%
| 585.5
/ 30.0
| 210 | E134* (GAG→TAG) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/7); new base T (99/97); total (106/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGT > CP009273/1782946‑1783236
|
ggAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTg < 2:532643/148‑1 (MQ=255)
ggAAATCGTAAGGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGAGCCAGATTTACACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTg < 1:614055/148‑1 (MQ=255)
gAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTgg > 1:452686/1‑148 (MQ=255)
aaaTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTggg > 1:2645641/1‑148 (MQ=255)
aTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCg > 1:3315271/1‑148 (MQ=255)
aTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCg > 1:547289/1‑148 (MQ=255)
aTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCg > 2:1967118/1‑148 (MQ=255)
aTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCg > 1:2038753/1‑148 (MQ=255)
gTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTcc < 1:3564472/148‑1 (MQ=255)
tAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTccc > 2:414908/1‑148 (MQ=255)
tAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTccc > 1:2039805/1‑148 (MQ=255)
aaTGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCa > 2:2462575/1‑148 (MQ=255)
aCCTATTTTGAAAAACCACGAACGGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAACTCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGa < 2:1859222/148‑1 (MQ=255)
ccTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGAc > 2:1290703/1‑148 (MQ=255)
tATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCg > 1:3099928/1‑148 (MQ=255)
ttttGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAg > 1:1132742/1‑148 (MQ=255)
ttGAAAAACCACGAACTGTTGGCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGtt < 1:2464199/148‑1 (MQ=255)
tGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTc < 2:238053/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCCACGACCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCt < 2:2714925/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCt < 1:1478874/148‑1 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg < 2:3267824/148‑1 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg < 2:3267606/148‑1 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg > 1:761881/1‑148 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg > 1:2930868/1‑148 (MQ=255)
aCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGat < 1:288392/148‑1 (MQ=255)
ccACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGata < 2:637074/148‑1 (MQ=255)
cACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGatat > 2:555133/1‑148 (MQ=255)
caCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTg < 2:2907892/147‑1 (MQ=255)
aaCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTg < 1:586187/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAc < 2:763679/148‑1 (MQ=255)
gttgtCGGCTGGAAAGTACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCg < 2:1246144/148‑1 (MQ=255)
ttgtCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCgg > 1:1028188/1‑148 (MQ=255)
tCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCa > 2:934772/1‑148 (MQ=255)
gCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGtt < 2:3152016/148‑1 (MQ=255)
cTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGttt > 2:2855897/1‑148 (MQ=255)
tGGATAGGACTATTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGTTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTa < 1:1905375/148‑1 (MQ=255)
gAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTAtt > 1:2612462/1‑148 (MQ=255)
aaGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGc < 1:3448221/148‑1 (MQ=255)
aGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCt > 2:361307/1‑148 (MQ=255)
ggACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTg > 1:1253854/1‑148 (MQ=255)
ggACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTg > 2:1114697/1‑148 (MQ=255)
gACTATTCTCGGATCCAGATTTAAACGGCAGATATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGTTATATTAGCTGGGCGTCCCATCCGCGACCGAGTTCCTCGTTATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGa < 1:3148095/148‑1 (MQ=255)
aCTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAt < 1:1691087/148‑1 (MQ=255)
aCTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAt < 1:2347535/148‑1 (MQ=255)
aCTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAt > 2:1695347/1‑148 (MQ=255)
cTAATCTCCGATCCATATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTATGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAtt > 2:1200445/1‑148 (MQ=255)
cTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAtt < 1:1290703/148‑1 (MQ=255)
aaTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTa < 2:2634349/148‑1 (MQ=255)
tctcCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAAt > 1:2184670/1‑148 (MQ=255)
cGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGt < 2:449812/148‑1 (MQ=255)
aGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGgc > 2:1311998/1‑148 (MQ=255)
aTTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGgcgc < 1:1386992/148‑1 (MQ=255)
aTTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGgcgc > 1:1188228/1‑148 (MQ=255)
tttAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGcgcg > 2:1609164/1‑148 (MQ=255)
ttAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGa > 1:1363668/1‑148 (MQ=255)
tAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGAt < 2:2663882/148‑1 (MQ=255)
aCGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTgg < 2:841261/148‑1 (MQ=255)
cGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGgc > 2:1376935/1‑148 (MQ=255)
tATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGta < 2:6222/148‑1 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac < 1:2162864/148‑1 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac < 2:175911/148‑1 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac < 2:177287/148‑1 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac < 2:2218286/148‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACTGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtact > 1:2986668/1‑148 (MQ=255)
cGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtacta > 1:2956401/1‑148 (MQ=255)
gggTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtactac > 2:1453333/1‑148 (MQ=255)
gggTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtactac > 2:1453930/1‑148 (MQ=255)
aaTCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGaaa < 1:904104/148‑1 (MQ=255)
aaTCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGaaa < 1:2782886/148‑1 (MQ=255)
tCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGt < 1:92786/148‑1 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc < 1:414908/148‑1 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc > 1:2827011/1‑148 (MQ=255)
cGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAg > 2:3437633/1‑148 (MQ=255)
ggAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCAc < 2:1669718/148‑1 (MQ=255)
gAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCAcc > 1:2250509/1‑148 (MQ=255)
gAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCAcc > 2:3326534/1‑148 (MQ=255)
ggCGCGCAAATTACTTTGACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGaa < 2:2184659/148‑1 (MQ=255)
gcgcgcAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGaaa > 2:1932938/1‑148 (MQ=255)
gcgcgcAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGaaa > 1:832222/1‑148 (MQ=255)
cgcgcAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAAt < 1:678813/148‑1 (MQ=255)
cgcgcAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAAt < 2:2273861/148‑1 (MQ=255)
aaTTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTc > 1:668805/1‑148 (MQ=255)
ttACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCgg > 2:1029585/1‑148 (MQ=255)
ttACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCgg > 1:745138/1‑148 (MQ=255)
ttACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCgg > 2:2807749/1‑148 (MQ=255)
tACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGc > 1:1410427/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATCTGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCa > 2:2486616/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCa > 1:2494952/1‑148 (MQ=255)
cTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAc < 1:1993376/148‑1 (MQ=255)
tttACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCActc < 1:3233070/148‑1 (MQ=255)
tttACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCActc < 1:1462565/148‑1 (MQ=255)
tttACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCActc < 2:2137151/148‑1 (MQ=255)
tACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACtctc < 2:2039805/148‑1 (MQ=255)
tACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACtctc < 2:925115/148‑1 (MQ=255)
gaCAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACtctc < 2:1814035/147‑1 (MQ=255)
cAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCt > 2:2991507/1‑148 (MQ=255)
ggTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGt < 1:3049769/148‑1 (MQ=255)
aaTTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCgg < 1:361307/148‑1 (MQ=255)
aTGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGt < 2:761874/148‑1 (MQ=255)
aTGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGt < 2:2930868/148‑1 (MQ=255)
|
GCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGT > CP009273/1782946‑1783236
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGT > CP009273/1782944‑1783240
|
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAG > SRR19973066.993310/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAG > SRR19973066.7051/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAG > SRR19973066.6332/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAG < SRR19973066.1204698/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCTATCCAGATTTACACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGC < SRR19973066.732820/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGC < SRR19973066.2813459/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGC < SRR19973066.2265439/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGC < SRR19973066.2265414/150‑1 (MQ=60)
CTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTG > SRR19973066.2122181/1‑150 (MQ=60)
TGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGG > SRR19973066.456167/1‑150 (MQ=60)
GGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGG > SRR19973066.2663416/1‑150 (MQ=60)
GGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGG > SRR19973066.2652088/1‑150 (MQ=60)
GGAAATCGTAAGGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGAGCCAGATTTACACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGG < SRR19973066.618355/150‑1 (MQ=60)
AAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCG > SRR19973066.551230/1‑150 (MQ=60)
AAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCG > SRR19973066.3337279/1‑150 (MQ=60)
AAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCG > SRR19973066.2052960/1‑150 (MQ=60)
TCGTAATGCGCACCTATTTTTAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCC < SRR19973066.1374745/150‑1 (MQ=60)
CGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCC > SRR19973066.2054016/1‑150 (MQ=60)
CGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCC > SRR19973066.2053753/1‑150 (MQ=60)
GTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCA < SRR19973066.3588103/150‑1 (MQ=60)
AATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAAC > SRR19973066.453274/1‑150 (MQ=60)
CCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCG > SRR19973066.3120632/1‑150 (MQ=60)
TATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAG > SRR19973066.1140864/1‑150 (MQ=60)
TTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTT > SRR19973066.2395353/1‑150 (MQ=60)
TTGAAAAACCACGACCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCTATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCC < SRR19973066.2481441/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCC < SRR19973066.2481295/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAAACCACGAACTGTTGGCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCC < SRR19973066.2481000/150‑1 (MQ=60)
GAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTC < SRR19973066.878205/150‑1 (MQ=60)
AAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCG < SRR19973066.1489274/150‑1 (MQ=60)
AAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCG > SRR19973066.2950376/1‑150 (MQ=60)
AAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCG > SRR19973066.767524/1‑150 (MQ=60)
AAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCG > SRR19973066.767531/1‑150 (MQ=60)
AAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGA > SRR19973066.1595983/1‑150 (MQ=60)
AAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCATGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGAT > SRR19973066.1926745/1‑150 (MQ=60)
ACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATAT < SRR19973066.148808/150‑1 (MQ=60)
ACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATAT < SRR19973066.290463/150‑1 (MQ=60)
CACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGG > SRR19973066.3226136/1‑150 (MQ=60)
ACGAAGTGTTGTCGGCTGTAAAGGACTAATCTCCGATCCATATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCTATATGGT < SRR19973066.2732389/150‑1 (MQ=60)
CGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTG > SRR19973066.2999015/1‑150 (MQ=60)
AACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAC > SRR19973066.2931032/1‑150 (MQ=60)
AACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAC < SRR19973066.590279/150‑1 (MQ=60)
AACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAC < SRR19973066.1640905/150‑1 (MQ=60)
CCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCATATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACC < SRR19973066.1222222/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGG > SRR19973066.1035759/1‑150 (MQ=60)
TGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCA > SRR19973066.1768145/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGAAAGGCCTAATCACCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTT < SRR19973066.309658/150‑1 (MQ=60)
TGGATAGGACTATTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGTTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATT < SRR19973066.1918956/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATT < SRR19973066.593732/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATT > SRR19973066.2630118/1‑150 (MQ=60)
ANGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTG > SRR19973066.1262878/1‑150 (MQ=60)
AAGGACTAATCTCCGATCCATATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTG < SRR19973066.3471277/150‑1 (MQ=60)
AAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTG > SRR19973066.1262880/1‑150 (MQ=60)
GACTATTCTCGGATCCAGATTTAAACGGCAGATATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGTTATATTAGCTGGGCGTCCCATCCGCGACCGAGTTCCTCGTTATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATT < SRR19973066.3169089/150‑1 (MQ=60)
ACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTT < SRR19973066.1703388/150‑1 (MQ=60)
ACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTT < SRR19973066.2363499/150‑1 (MQ=60)
CTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTA < SRR19973066.1300045/150‑1 (MQ=60)
AATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAAT > SRR19973066.2199828/1‑150 (MQ=60)
AATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTGTATTGCTGATTTAAT > SRR19973066.2199817/1‑150 (MQ=60)
ATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATC < SRR19973066.2866187/150‑1 (MQ=60)
TCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCACAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGG > SRR19973066.1337958/1‑150 (MQ=60)
AGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGC > SRR19973066.3167730/1‑150 (MQ=60)
AGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGC > SRR19973066.1196561/1‑150 (MQ=60)
ATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGA < SRR19973066.1397011/150‑1 (MQ=60)
ATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGA > SRR19973066.1373527/1‑150 (MQ=60)
TAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTG > SRR19973066.3046864/1‑150 (MQ=60)
AAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGG > SRR19973066.3343692/1‑150 (MQ=60)
AAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGGTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGG > SRR19973066.3530320/1‑150 (MQ=60)
GGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCA > SRR19973066.3258234/1‑150 (MQ=60)
GCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTA < SRR19973066.3100368/150‑1 (MQ=60)
TATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACT > SRR19973066.578470/1‑150 (MQ=60)
TATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACTGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACT > SRR19973066.3006416/1‑150 (MQ=60)
ATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTA > SRR19973066.2975998/1‑150 (MQ=60)
ATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTA > SRR19973066.2975911/1‑150 (MQ=60)
ATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTA < SRR19973066.2177890/150‑1 (MQ=60)
GTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAA > SRR19973066.564653/1‑150 (MQ=60)
AATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGT < SRR19973066.2801622/150‑1 (MQ=60)
AATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGT > SRR19973066.2030418/1‑150 (MQ=60)
AATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGT < SRR19973066.910484/150‑1 (MQ=60)
ATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTC > SRR19973066.2846008/1‑150 (MQ=60)
ATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTC > SRR19973066.2845993/1‑150 (MQ=60)
TCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCA < SRR19973066.93786/150‑1 (MQ=60)
TCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCA > SRR19973066.2215670/1‑150 (MQ=60)
CACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAG < SRR19973066.418127/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAG < SRR19973066.418147/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAG < SRR19973066.92003/150‑1 (MQ=60)
GGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATC > SRR19973066.1036550/1‑150 (MQ=60)
TGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACC > SRR19973066.462062/1‑150 (MQ=60)
TGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACC > SRR19973066.2266025/1‑150 (MQ=60)
GGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCG > SRR19973066.2278914/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAA > SRR19973066.838289/1‑150 (MQ=60)
CGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGG < SRR19973066.683780/150‑1 (MQ=60)
CAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTC > SRR19973066.673689/1‑150 (MQ=60)
CAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTC > SRR19973066.674118/1‑150 (MQ=60)
AATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGG > SRR19973066.750670/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGC > SRR19973066.1420675/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGC > SRR19973066.1420556/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGC > SRR19973066.1420374/1‑150 (MQ=60)
TTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCA > SRR19973066.2511957/1‑150 (MQ=60)
CTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTC < SRR19973066.2007403/150‑1 (MQ=60)
TTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTC < SRR19973066.2541502/150‑1 (MQ=60)
TTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTC < SRR19973066.1472905/150‑1 (MQ=60)
TTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTC < SRR19973066.3254422/150‑1 (MQ=60)
TACAGGTATATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCT < SRR19973066.1193432/150‑1 (MQ=60)
TACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCT < SRR19973066.819822/150‑1 (MQ=60)
GGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCC < SRR19973066.3070167/150‑1 (MQ=60)
AATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTA < SRR19973066.363223/150‑1 (MQ=60)
AATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTA < SRR19973066.364133/150‑1 (MQ=60)
TAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGT > SRR19973066.3532123/1‑150 (MQ=60)
|
CGGCTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGT > CP009273/1782944‑1783240
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |