Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,783,091 |
G→T |
100% |
E134* (GAG→TAG) |
aroH → |
3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,783,091 | 0 | G | T | 97.9%
| 606.5
/ 3.3
| 195 | E134* (GAG→TAG) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base T (114/77); total (117/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTC > CP009273/1782949‑1783232
|
aTCGTAATGCTCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACCGTCTGGAGCGGGCGCGCAAATTACTTTTACAGTTACATTAGcagtgct > 2:3082554/1‑142 (MQ=255)
aTCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCg > 1:2869084/1‑148 (MQ=255)
cGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTc < 2:2781689/148‑1 (MQ=255)
gTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTcc < 2:1098096/148‑1 (MQ=255)
aaTGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCa < 1:1502184/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTcccca > 2:2391103/1‑146 (MQ=255)
tGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAAc > 1:374569/1‑148 (MQ=255)
tGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAAc > 2:1412499/1‑148 (MQ=255)
tGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAAc > 2:1894389/1‑148 (MQ=255)
tGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAAc > 2:1894321/1‑148 (MQ=255)
aCCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGa < 1:2089500/148‑1 (MQ=255)
ccTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGAc < 2:1883127/148‑1 (MQ=255)
cTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGAcc > 2:3096193/1‑148 (MQ=255)
aTTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGa > 1:215421/1‑148 (MQ=255)
aTTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGa > 2:1631033/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCt > 1:2469064/1‑148 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg > 2:682438/1‑148 (MQ=255)
aaaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCg > 1:3279602/1‑148 (MQ=255)
aaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGa < 1:1916159/148‑1 (MQ=255)
aaCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGa > 1:914061/1‑148 (MQ=255)
aCCACGACCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGat < 1:2622722/148‑1 (MQ=255)
aCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGat < 1:706403/148‑1 (MQ=255)
aCCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGat < 2:813610/148‑1 (MQ=255)
ccACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGata > 1:1631464/1‑148 (MQ=255)
cccGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGatat < 1:105663/146‑1 (MQ=255)
cACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGatat < 1:230857/148‑1 (MQ=255)
aaCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTg < 1:1681890/148‑1 (MQ=255)
aaCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTg > 1:1290391/1‑148 (MQ=255)
aaCTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTg < 1:3576594/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAc > 2:1216479/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAc > 2:3795170/1‑148 (MQ=255)
tgttgtCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGAcc > 2:2683079/1‑148 (MQ=255)
ttgtCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCgg > 2:2070772/1‑148 (MQ=255)
tCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCa < 2:3703242/148‑1 (MQ=255)
tGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTa < 1:3012149/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTAt < 1:1830381/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTAt < 2:1190183/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTAt < 1:3703162/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTAt < 2:1560807/148‑1 (MQ=255)
aaGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTCTTGc > 1:687150/1‑148 (MQ=255)
aaGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGc > 1:687137/1‑148 (MQ=255)
aGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCt > 2:2816107/1‑148 (MQ=255)
gACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGa > 2:1889239/1‑148 (MQ=255)
gACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGa > 2:2495850/1‑148 (MQ=255)
gACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGa < 2:3665882/148‑1 (MQ=255)
gACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGa < 2:1872100/148‑1 (MQ=255)
aCTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATCTGGTGACCGGTCAGTGTATTGCTGAt > 1:2757407/1‑148 (MQ=255)
aaTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTa > 1:424720/1‑148 (MQ=255)
aaTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTa > 2:1498695/1‑148 (MQ=255)
aaTCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTa > 2:1498361/1‑148 (MQ=255)
aaTCTCCGATCAATATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTa < 1:61517/148‑1 (MQ=255)
tctcCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAAt > 1:1872106/1‑148 (MQ=255)
ctcCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATc < 2:844050/148‑1 (MQ=255)
ctcCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATc > 1:1189297/1‑148 (MQ=255)
tcCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATAGGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGAGTTAATCa > 1:3175695/1‑148 (MQ=255)
aTCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTg > 1:2415900/1‑148 (MQ=255)
ttAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGa < 1:350200/148‑1 (MQ=255)
aCGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTgg > 1:2222085/1‑148 (MQ=255)
cGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGAGTGgc > 2:3037957/1‑148 (MQ=255)
gCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGCTATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGgcgc > 2:3376847/1‑148 (MQ=255)
gCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGgcgc > 2:3376869/1‑148 (MQ=255)
cAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCa > 2:3628469/1‑148 (MQ=255)
gCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCGTCGATATGGTGACCGGTCCGTTTATGGCTGATTTAATCAGTTGGGGGGCGATTGGCGCACg > 2:3168064/1‑148 (MQ=255)
cTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGt > 2:3716596/1‑148 (MQ=255)
cTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGt > 1:3099813/1‑148 (MQ=255)
cTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGt < 2:72696/148‑1 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac > 2:443977/1‑148 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac > 1:1115071/1‑148 (MQ=255)
aTCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtac > 2:2831864/1‑148 (MQ=255)
tCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtact > 1:1968445/1‑148 (MQ=255)
tCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGGTCCTCGATCTGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTACTCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtact > 1:1964688/1‑148 (MQ=255)
cGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtacta < 2:2163978/148‑1 (MQ=255)
cGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGtacta < 2:1487269/148‑1 (MQ=255)
tAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGa > 1:1546294/1‑148 (MQ=255)
aaaTCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGaa < 1:3217429/148‑1 (MQ=255)
aaaTCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGaa < 1:790978/148‑1 (MQ=255)
tCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGt < 1:868216/148‑1 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc < 2:1877551/148‑1 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc > 2:1076591/1‑148 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc > 1:523227/1‑148 (MQ=255)
cACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGAGATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTc > 2:2951878/1‑148 (MQ=255)
cGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAg > 2:17871/1‑148 (MQ=255)
ggAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCAc < 2:1444225/148‑1 (MQ=255)
caGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCAcc < 2:3523396/147‑1 (MQ=255)
cTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACcgcg < 2:2869084/148‑1 (MQ=255)
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AAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAG < SRR19973069.3238438/150‑1 (MQ=60)
AATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGT > SRR19973069.1895069/1‑150 (MQ=60)
ATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTC > SRR19973069.1842905/1‑150 (MQ=60)
ATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTC > SRR19973069.526937/1‑150 (MQ=60)
TCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCA < SRR19973069.874265/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAG < SRR19973069.2549102/150‑1 (MQ=60)
TGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACC > SRR19973069.1564429/1‑150 (MQ=60)
GCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATG < SRR19973069.2458017/150‑1 (MQ=60)
CGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGG < SRR19973069.2831308/150‑1 (MQ=60)
AAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCG > SRR19973069.3379694/1‑150 (MQ=60)
AAATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCG > SRR19973069.3379686/1‑150 (MQ=60)
AAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCG > SRR19973069.1300954/1‑150 (MQ=60)
AAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCG > SRR19973069.3433812/1‑150 (MQ=60)
AAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCG > SRR19973069.3433457/1‑150 (MQ=60)
AATTACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGGTATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGG > SRR19973069.1984163/1‑150 (MQ=60)
TACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAC < SRR19973069.324965/150‑1 (MQ=60)
TACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAC > SRR19973069.1541604/1‑150 (MQ=60)
TACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAC > SRR19973069.2845422/1‑150 (MQ=60)
ACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACT > SRR19973069.184199/1‑150 (MQ=60)
ACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACT > SRR19973069.2126734/1‑150 (MQ=60)
ACTTTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACT > SRR19973069.2126750/1‑150 (MQ=60)
TTTACAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTC < SRR19973069.3646444/150‑1 (MQ=60)
CAGGTAAATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGAGATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGT > SRR19973069.3823862/1‑150 (MQ=60)
ATTAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAG > SRR19973069.3823404/1‑150 (MQ=60)
TAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGT > SRR19973069.597486/1‑150 (MQ=60)
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CTGGAAATCGTAATGCGCACCTATTTTGAAAAACCACGAACTGTTGTCGGCTGGAAAGGACTAATCTCCGATCCAGATTTAAACGGCAGCTATCGGGTAAATCACGGTCTGGAGCTGGCGCGCAAATTACTTTTACAGGTAAATGAGCTGGGCGTCCCAACCGCGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGT > CP009273/1782947‑1783240
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |