Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,456,705 |
C→A |
100% |
S72Y (TCC→TAC) |
yfdF → |
uncharacterized protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,456,705 | 0 | C | A | 97.2%
| 882.9
/ 13.8
| 282 | S72Y (TCC→TAC) | yfdF | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (135/139); total (139/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GATGAAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAA > CP009273/2456560‑2456849
|
gatgaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACt < 2:1433940/148‑1 (MQ=255)
gatgaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACt < 2:1077642/148‑1 (MQ=255)
gaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAg > 2:2743094/1‑148 (MQ=255)
gaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAg < 2:154961/148‑1 (MQ=255)
aaGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTTTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGt < 1:1604051/148‑1 (MQ=255)
gTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCTGTTa > 2:1833337/1‑148 (MQ=255)
tAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACt > 1:465610/1‑148 (MQ=255)
aaTGTATTATTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGTTAAGGAAGTAATAAGCACCTTTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACtt < 1:95079/148‑1 (MQ=255)
tGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTtat < 1:3308340/148‑1 (MQ=255)
gATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAACAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGAGCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatat > 2:1853167/1‑148 (MQ=255)
ttAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattg > 2:2717836/1‑148 (MQ=255)
ttAGAACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattg < 1:2554374/148‑1 (MQ=255)
tAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattga > 1:1259492/1‑148 (MQ=255)
tAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattga > 1:3036170/1‑148 (MQ=255)
aGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattgat < 2:73266/148‑1 (MQ=255)
tACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattgatat > 1:874885/1‑148 (MQ=255)
cAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattgatattg < 1:2858026/148‑1 (MQ=255)
gagTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACt > 2:3025932/1‑148 (MQ=255)
gagTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACt > 1:1056184/1‑148 (MQ=255)
agTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTc < 2:288081/148‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCa > 1:1674534/1‑148 (MQ=255)
ttCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCa < 2:2643353/148‑1 (MQ=255)
tCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCaa < 1:2345737/148‑1 (MQ=255)
aaaaCCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGa > 1:88622/1‑148 (MQ=255)
aaaCCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGAt > 1:2233269/1‑148 (MQ=255)
cTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTTTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAg < 1:2010203/148‑1 (MQ=255)
ttttAATTGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGAc < 2:2036282/148‑1 (MQ=255)
ttttAATGGTAAGGAATGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGAc < 2:144683/148‑1 (MQ=255)
ttttAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGAc < 2:2473372/148‑1 (MQ=255)
tttAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGAcc < 1:2980659/148‑1 (MQ=255)
aTGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCatat > 2:1315359/1‑148 (MQ=255)
ggTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTa > 1:3087159/1‑148 (MQ=255)
gTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTAc > 2:1382251/1‑148 (MQ=255)
aaggaatgAATAAGCACCTGTATTAAACATATACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTa < 1:1646243/148‑1 (MQ=255)
gaaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTg > 1:27179/1‑148 (MQ=255)
gaaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTg > 1:300253/1‑148 (MQ=255)
gaaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTg < 2:3455455/148‑1 (MQ=255)
aaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTgg < 1:1007594/148‑1 (MQ=255)
aggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGt < 1:130595/148‑1 (MQ=255)
gaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTAt < 1:1576427/148‑1 (MQ=255)
gaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTAt < 2:2392651/148‑1 (MQ=255)
gaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTAt > 1:2271274/1‑148 (MQ=255)
gaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACCTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTAt > 2:515363/1‑148 (MQ=255)
tAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGa > 1:850775/1‑148 (MQ=255)
ccTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCa > 1:2404753/1‑148 (MQ=255)
cTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCaa < 2:1021424/148‑1 (MQ=255)
cTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCaa < 1:2803290/148‑1 (MQ=255)
gTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGa > 2:2357495/1‑148 (MQ=255)
aTTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAAc > 1:2803117/1‑148 (MQ=255)
aTTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAAc < 2:3430328/148‑1 (MQ=255)
aaaCATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCAGACGAGTAAACCACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCaa < 2:2168726/148‑1 (MQ=255)
tCTAATTGAGATTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTAATTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGaa < 1:3362063/148‑1 (MQ=255)
cTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAAt < 2:3319475/148‑1 (MQ=255)
gCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCg < 2:3285721/148‑1 (MQ=255)
ttATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGaa < 1:1461527/148‑1 (MQ=255)
ataAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACt > 2:2985713/1‑148 (MQ=255)
ataAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACt > 2:382331/1‑148 (MQ=255)
ataAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTAGTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACt < 1:2171121/148‑1 (MQ=255)
taAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACta < 1:1137510/148‑1 (MQ=255)
aaaaCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATaa < 2:482706/148‑1 (MQ=255)
aaaaCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATaa < 1:1871232/148‑1 (MQ=255)
aCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGa > 2:1937272/1‑148 (MQ=255)
ccATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACaa > 2:1103668/1‑148 (MQ=255)
ccATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTAACTTATATTGATATTGACTCCAATTATACAGACCATATTACTATTGGTATCTACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCTAACTATAAAGACaa > 1:3232715/1‑148 (MQ=255)
aTACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAg > 1:731173/1‑148 (MQ=255)
tACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGa < 2:3466012/148‑1 (MQ=255)
tACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGa < 1:2912653/148‑1 (MQ=255)
aCGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGaa > 1:801108/1‑148 (MQ=255)
cGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAAc > 2:2843466/1‑148 (MQ=255)
cGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAAc > 2:3221078/1‑148 (MQ=255)
gAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACt > 1:1931601/1‑148 (MQ=255)
tAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGt < 1:1090413/148‑1 (MQ=255)
aaaCGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTc > 1:2472908/1‑148 (MQ=255)
cgacgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGt > 2:1204000/1‑148 (MQ=255)
cgacgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGt > 1:1724929/1‑148 (MQ=255)
acgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTAc > 2:2276876/1‑148 (MQ=255)
aTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACt > 1:2382252/1‑136 (MQ=255)
tCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATc > 2:1525188/1‑148 (MQ=255)
tCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATc > 1:1973563/1‑148 (MQ=255)
cTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCAt < 1:3470530/148‑1 (MQ=255)
cTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCAt < 2:1259492/148‑1 (MQ=255)
cTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCAt < 2:3036170/148‑1 (MQ=255)
ttATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCAtt < 1:1220827/148‑1 (MQ=255)
tataGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTa > 2:1762729/1‑148 (MQ=255)
ataGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTaa < 2:1056184/148‑1 (MQ=255)
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aGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATg > 2:926064/1‑148 (MQ=255)
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AATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAG < SRR19973066.2154463/150‑1 (MQ=60)
TTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGAC < SRR19973066.2389014/150‑1 (MQ=60)
TTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGAC < SRR19973066.2389027/150‑1 (MQ=60)
TACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGACT > SRR19973066.1884317/1‑150 (MQ=60)
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CAATGATGAAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGACT > CP009273/2456556‑2456853
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |