Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,456,705 |
C→A |
100% |
S72Y (TCC→TAC) |
yfdF → |
uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,456,705 | 0 | C | A | 97.2%
| 660.5
/ 8.6
| 211 | S72Y (TCC→TAC) | yfdF | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/4); new base A (116/88); total (118/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GATGAAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGAC > CP009273/2456560‑2456852
|
gatgaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTc < 1:3425855/149‑1 (MQ=255)
gaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACTAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGt < 2:2517157/149‑1 (MQ=255)
gaAGTTAATGGATTAGTACAAGAGATCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGt < 2:3310861/149‑1 (MQ=255)
aGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTa > 2:1056731/1‑149 (MQ=255)
gTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTAc < 2:2031863/149‑1 (MQ=255)
ttAATGTATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGTTAAGGAAGTAATAAGCACCTTTATTAAAAATCTACTTGAGCTTAAAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACt < 1:2857453/149‑1 (MQ=255)
ttAATGGATTATTACATGAGTTAAAAAAACTTTTTAATGGTATGTAAGTAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTTAGTTTATAAAAAACGCAATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACt < 1:799686/149‑1 (MQ=255)
tAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACtt > 1:3830185/1‑149 (MQ=255)
tAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACtt < 2:1098735/149‑1 (MQ=255)
aaTGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTta > 2:3613066/1‑149 (MQ=255)
aaTGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTta < 1:2021927/149‑1 (MQ=255)
aTGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTtat > 1:3694186/1‑149 (MQ=255)
tGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTtata > 2:1463370/1‑149 (MQ=255)
taTTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTTTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatatt < 1:566847/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattg < 2:291676/149‑1 (MQ=255)
ttAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattga < 2:2774419/149‑1 (MQ=255)
ttAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattga < 2:2797824/149‑1 (MQ=255)
gTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattgatat > 1:1208986/1‑149 (MQ=255)
aCAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTatattgatattg > 2:3904692/1‑149 (MQ=255)
aaGAGTTAAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGAc < 1:3212289/149‑1 (MQ=255)
agagTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACt > 2:2709735/1‑149 (MQ=255)
agagTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACt > 1:291706/1‑149 (MQ=255)
gagTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTc > 2:2490891/1‑149 (MQ=255)
ttCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCaa > 2:766853/1‑149 (MQ=255)
aacAAAAACATTTTTATTGGAAACGAAGTAAAAACCACCTTTATAAAAAATCTACTTGAGATTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCaa < 1:697254/147‑1 (MQ=255)
tCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAAt > 2:526456/1‑149 (MQ=255)
cTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGa < 2:1882777/149‑1 (MQ=255)
tttttAATGGTAAGGAAGTAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACTAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGAc < 2:1391373/149‑1 (MQ=255)
tttAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCa < 2:2959754/149‑1 (MQ=255)
ttAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCat > 1:1479913/1‑149 (MQ=255)
ttAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCat < 2:4067605/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCat > 2:891225/1‑147 (MQ=255)
aaTGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCat < 1:891225/147‑1 (MQ=255)
tAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTa > 1:3337118/1‑149 (MQ=255)
aggaaggaATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTAtt < 1:2640853/149‑1 (MQ=255)
aaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGATCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGt < 1:1897205/149‑1 (MQ=255)
aaggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGt > 1:3533150/1‑149 (MQ=255)
ggaaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTAt > 2:1557330/1‑149 (MQ=255)
aaTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCg > 2:3019666/1‑149 (MQ=255)
aTAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGa > 1:3771085/1‑149 (MQ=255)
cgCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACaa < 1:2994372/148‑1 (MQ=255)
aGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACaa < 1:2946288/149‑1 (MQ=255)
aGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACaa < 2:1817166/149‑1 (MQ=255)
cACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAAcc > 1:1123215/1‑149 (MQ=255)
cTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAg > 1:3791208/1‑149 (MQ=255)
tGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGa < 1:292517/149‑1 (MQ=255)
gTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGaa > 2:2278398/1‑149 (MQ=255)
gTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATAGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGaa > 1:313142/1‑149 (MQ=255)
aTTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAAcc < 1:1861740/149‑1 (MQ=255)
aaaCATCTACTTTAGATTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAAt < 1:135763/149‑1 (MQ=255)
aaCATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATa > 2:3543138/1‑149 (MQ=255)
aTCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGaa > 2:2547418/1‑149 (MQ=255)
tACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTa > 1:3733098/1‑149 (MQ=255)
cTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTAcc > 1:368819/1‑149 (MQ=255)
ttGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCt < 1:1621939/149‑1 (MQ=255)
ttGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCt < 2:1970221/149‑1 (MQ=255)
aGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCg < 2:3105253/149‑1 (MQ=255)
ttATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAAc > 1:4093923/1‑149 (MQ=255)
ataAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACta < 2:2927407/149‑1 (MQ=255)
aaaaCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATaaa < 2:3550499/149‑1 (MQ=255)
aaaaCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATaaa < 2:3550979/149‑1 (MQ=255)
aaaCGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAg > 1:3938612/1‑149 (MQ=255)
cgacATACGAGTAAACGACTATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACa < 2:2571243/146‑1 (MQ=255)
cgacATACGAGTAAAAGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACa < 2:2569484/146‑1 (MQ=255)
gCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACaa > 1:2697420/1‑149 (MQ=255)
gCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACaa > 1:634415/1‑149 (MQ=255)
cATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAg > 1:408051/1‑149 (MQ=255)
cATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAg > 1:2479308/1‑149 (MQ=255)
tACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGaa > 2:3110912/1‑149 (MQ=255)
tACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGaa < 2:1598350/149‑1 (MQ=255)
tACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGaa > 2:3030001/1‑149 (MQ=255)
gTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGt < 2:829402/149‑1 (MQ=255)
aaaCGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTcc > 2:2156832/1‑149 (MQ=255)
aaaCGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTcc > 2:131202/1‑149 (MQ=255)
aaaCGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTcc < 2:768743/149‑1 (MQ=255)
aaaCGACGATCATTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTcc < 2:3712228/149‑1 (MQ=255)
acgacgATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGt < 2:141685/149‑1 (MQ=255)
cgacgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTa > 2:550384/1‑149 (MQ=255)
gacgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTAc > 1:3872464/1‑149 (MQ=255)
gacgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTAc < 2:1241160/149‑1 (MQ=255)
cgaTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTa < 1:2229005/149‑1 (MQ=255)
aTCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATc > 1:25786/1‑149 (MQ=255)
cTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGACATCGTCCGTACTATCAtt > 2:3549446/1‑149 (MQ=255)
ttATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTa < 1:3763360/149‑1 (MQ=255)
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tataGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTaa > 2:3133556/1‑149 (MQ=255)
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AAACGACCATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCG < SRR19973068.2575571/150‑1 (MQ=60)
CGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTAC > SRR19973068.3895845/1‑150 (MQ=60)
CGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTAC > SRR19973068.3895950/1‑150 (MQ=60)
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TTATAGATTTAATATTAATAATTACTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAA > SRR19973068.2804632/1‑150 (MQ=60)
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TCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGACT < SRR19973068.3990971/150‑1 (MQ=60)
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TCCTCAGTTAATAATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGACT < SRR19973068.3990247/150‑1 (MQ=60)
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CAATGATGAAGTTAATGGATTAGTACAAGAGTTCAAAAACCTTTTTAATGGTAAGGAAGGAATAAGCACCTGTATTAAACATCTACTTGAGCTTATAAAAAACGCCATACGAGTAAACGACGATCCTTATAGATTTAATATTAATAATTCCTCAGTTACTTATATTGATATTGACTCCAATGATACAGACCATATTACTATTGGTATCGACAACCAAGAACCAATAGAATTACCTGCGAACTATAAAGACAAAGAACTCGTCCGTACTATCATTAATGACAACATAGTTGAGAAGACT > CP009273/2456556‑2456853
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
