Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,543,355 |
T→A |
19.4% |
N184Y (AAC→TAC) |
yfeX ← |
porphyrinogen oxidase, cytoplasmic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,543,355 | 0 | T | A | 19.4%
| 541.2
/ 114.5
| 225 | N184Y (AAC→TAC) | yfeX | porphyrinogen oxidase, cytoplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (106/75); new base A (30/14); total (136/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.03e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GCGAACAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGCT > CP009273/2543209‑2543501
|
cAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAgctg > 2:1267899/1‑148 (MQ=255)
cAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAgctg > 1:1273206/1‑148 (MQ=255)
aaTCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAgctgc < 1:1658406/148‑1 (MQ=255)
aTCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAgctgct < 2:665308/148‑1 (MQ=255)
tCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAg > 2:926776/1‑148 (MQ=255)
cAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAgg < 2:2196707/148‑1 (MQ=255)
aGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGt > 2:3129500/1‑148 (MQ=255)
gCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCTTGGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGtt > 2:1629743/1‑148 (MQ=255)
gCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATAGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGtt > 2:1623533/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTtgtg > 2:1963913/1‑148 (MQ=255)
gCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTcc < 1:484343/148‑1 (MQ=255)
cATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCa < 2:2336941/148‑1 (MQ=255)
cttcttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACg > 2:1335861/1‑148 (MQ=255)
cttcttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACg < 1:1853705/148‑1 (MQ=255)
cttcttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTATTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACg > 1:225155/1‑148 (MQ=255)
ttcttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGc < 2:134943/148‑1 (MQ=255)
cttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTg > 1:774760/1‑148 (MQ=255)
ttCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGa > 1:2631831/1‑148 (MQ=255)
aGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACaa < 1:2563626/148‑1 (MQ=255)
gATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACaaa > 1:849062/1‑148 (MQ=255)
cAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAacac > 1:2220727/1‑148 (MQ=255)
cAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAacac > 1:2220414/1‑148 (MQ=255)
cAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAacac > 1:206609/1‑148 (MQ=255)
cAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAacac < 1:189948/148‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAAcaca < 1:2119575/148‑1 (MQ=255)
gcgGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAg < 1:754783/148‑1 (MQ=255)
cgGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGc < 2:1638823/148‑1 (MQ=255)
gaggtgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTgccg > 2:2059298/1‑148 (MQ=255)
aggtgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTgccgc < 1:299108/148‑1 (MQ=255)
tgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGccgcccg > 2:1815225/1‑148 (MQ=255)
tgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGccgcccg > 2:8080/1‑148 (MQ=255)
tgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATATCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACAAAGCTGccgcccg > 1:1226775/1‑148 (MQ=255)
agGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATc > 2:2936567/1‑148 (MQ=255)
agGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATc > 1:564199/1‑148 (MQ=255)
ggTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGGCGCTTTGGTGCGCCCCATCACCAACTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACCCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATcc > 1:602032/1‑148 (MQ=255)
gTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCa > 2:666080/1‑148 (MQ=255)
ttCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACg > 1:3051705/1‑148 (MQ=255)
ttCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACg > 2:2154567/1‑148 (MQ=255)
ttCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACg > 2:359065/1‑148 (MQ=255)
cGGACGGTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTACTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAATCACATAGATGCCGCCCGCATCCACGCCg < 1:1410127/148‑1 (MQ=255)
aCGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCt < 1:3512272/148‑1 (MQ=255)
aCGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCt < 1:1963913/148‑1 (MQ=255)
cGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCtt < 2:858405/148‑1 (MQ=255)
ttCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTg < 2:1113655/148‑1 (MQ=255)
gtcgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATa < 1:2488447/148‑1 (MQ=255)
cgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAAc > 2:507854/1‑148 (MQ=255)
cgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAAc < 2:688771/148‑1 (MQ=255)
cgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAAc > 1:2687154/1‑148 (MQ=255)
cgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAAc > 2:1317288/1‑148 (MQ=255)
gATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACt > 1:1729722/1‑148 (MQ=255)
aTCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACtt < 2:1444006/148‑1 (MQ=255)
ctctTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTcg > 1:1542736/1‑148 (MQ=255)
ctctTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTcg > 1:2024607/1‑148 (MQ=255)
ttGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGAcgcg > 2:3428293/1‑148 (MQ=255)
ttGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGAcgcg < 2:576104/148‑1 (MQ=255)
tGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGt < 2:1276497/148‑1 (MQ=255)
ggCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtc > 2:3092581/1‑148 (MQ=255)
ggCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtc < 1:889496/148‑1 (MQ=255)
gCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtct < 1:104915/148‑1 (MQ=255)
gCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtct > 2:1697591/1‑148 (MQ=255)
ccTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtctc > 2:1598749/1‑148 (MQ=255)
tctTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCtt > 1:2068325/1‑148 (MQ=255)
ctTTGGTGCGCCCGATCATCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGCTCCCAACGCTGCACAAACACATAGCTGCCGCCGGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTc < 1:2687758/148‑1 (MQ=255)
ctTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTc > 2:2672054/1‑148 (MQ=255)
tttGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCa > 1:1668035/1‑148 (MQ=255)
ttGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCAc < 1:3555131/148‑1 (MQ=255)
cccGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCggg > 1:633514/1‑148 (MQ=255)
cGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGtt > 1:3255422/1‑148 (MQ=255)
cGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGtt > 1:1485634/1‑148 (MQ=255)
gATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGttt < 1:1267899/148‑1 (MQ=255)
aTCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACGAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGtttt > 2:1085420/1‑148 (MQ=255)
tCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTc < 2:2430169/148‑1 (MQ=255)
cACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTcc > 1:316551/1‑148 (MQ=255)
cACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTcc < 1:2154567/148‑1 (MQ=255)
cATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTa > 2:1926958/1‑148 (MQ=255)
tctcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTAcc > 2:287844/1‑148 (MQ=255)
tctcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTAcc > 1:3132808/1‑148 (MQ=255)
tcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGt < 1:230775/148‑1 (MQ=255)
tcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGt < 1:331629/148‑1 (MQ=255)
tcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGt > 2:558120/1‑148 (MQ=255)
ccTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTc > 2:425637/1‑148 (MQ=255)
gATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGAGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGACCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCTTcaac > 2:1213784/1‑148 (MQ=255)
aTCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaaca > 2:1522050/1‑148 (MQ=255)
tCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaacaa < 2:225155/148‑1 (MQ=255)
tCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaacaa < 2:3522967/148‑1 (MQ=255)
tCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaacaa < 2:1936165/148‑1 (MQ=255)
cGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACaaa < 1:344667/148‑1 (MQ=255)
gTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAg < 1:1295391/148‑1 (MQ=255)
gTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAg < 1:973601/148‑1 (MQ=255)
gTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAg < 2:3244722/148‑1 (MQ=255)
tGATCGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGc < 1:926776/148‑1 (MQ=255)
gAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGcc > 1:3379414/1‑148 (MQ=255)
aaCGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCg < 2:675785/148‑1 (MQ=255)
gCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACNCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACNCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTc > 1:790308/1‑148 (MQ=255)
cTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCa < 1:1623533/148‑1 (MQ=255)
cTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCa < 1:3390939/148‑1 (MQ=255)
ctCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAACCACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCGGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGt < 2:2777341/147‑1 (MQ=255)
cGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCAc > 1:2381899/1‑148 (MQ=255)
ttGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGct > 2:2447578/1‑148 (MQ=255)
ttGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGct > 2:3198905/1‑148 (MQ=255)
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GCGAACAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGCT > CP009273/2543209‑2543501
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
