Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,543,355 |
T→A |
42.4% |
N184Y (AAC→TAC) |
yfeX ← |
porphyrinogen oxidase, cytoplasmic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,543,355 | 0 | T | A | 42.4%
| 155.5
/ inf
| 259 | N184Y (AAC→TAC) | yfeX | porphyrinogen oxidase, cytoplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (85/64); new base A (63/47); total (148/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GAACAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGCT > CP009273/2543211‑2543501
|
aaCAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAgct < 1:1714072/149‑1 (MQ=255)
aaTCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAgctgct < 2:2131841/149‑1 (MQ=255)
tCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTc > 1:2348500/1‑149 (MQ=255)
tCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTc < 1:1282321/149‑1 (MQ=255)
cTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCa > 2:2961261/1‑149 (MQ=255)
ttCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAg > 1:507354/1‑149 (MQ=255)
cAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGt > 2:2415879/1‑149 (MQ=255)
cAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGt < 1:725428/149‑1 (MQ=255)
aGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGtt > 2:3885131/1‑149 (MQ=255)
aGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGtt > 2:1846017/1‑149 (MQ=255)
ccTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTtgtg < 2:1782131/149‑1 (MQ=255)
ttGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGACCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTc < 2:1203805/149‑1 (MQ=255)
tGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTcc < 2:363077/149‑1 (MQ=255)
tGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTcc < 1:390157/149‑1 (MQ=255)
tGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTcc < 2:1554790/149‑1 (MQ=255)
tGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTGGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTcn < 1:318839/149‑2 (MQ=255)
gCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTccc > 1:305682/1‑149 (MQ=255)
ccATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTACCa > 2:540795/1‑149 (MQ=255)
cATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCaa < 1:101484/149‑1 (MQ=255)
cATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCaa < 2:787028/149‑1 (MQ=255)
cATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCaa > 2:3426489/1‑149 (MQ=255)
aTCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAAc > 1:42356/1‑149 (MQ=255)
tcttctTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACg > 2:2755137/1‑149 (MQ=255)
ttcttTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCt > 2:3800093/1‑149 (MQ=255)
tttCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGa > 1:615980/1‑149 (MQ=255)
cAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACaa > 2:2519011/1‑149 (MQ=255)
aCGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATa < 2:3261270/149‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTGAGGTGAGAGGGTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATa < 2:1725192/149‑1 (MQ=255)
gggTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTg < 2:3331073/149‑1 (MQ=255)
aggtgagAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTgccgcc > 1:1300813/1‑149 (MQ=255)
gagaGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCa > 1:2799316/1‑149 (MQ=255)
gagGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATc > 2:1242398/1‑149 (MQ=255)
ggTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCa > 1:3435647/1‑149 (MQ=255)
ttCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGc > 2:3118664/1‑149 (MQ=255)
ttCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGc < 1:2199091/149‑1 (MQ=255)
ggACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTc > 2:3530807/1‑149 (MQ=255)
ggACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTc > 2:3529544/1‑149 (MQ=255)
ggACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTc > 2:3816188/1‑149 (MQ=255)
gACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCCTCCACGCCGTCt > 2:440530/1‑149 (MQ=255)
gACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCt > 1:2278430/1‑149 (MQ=255)
gTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTg > 1:386027/1‑149 (MQ=255)
gTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTg < 1:2108987/149‑1 (MQ=255)
ttCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGa > 1:2600750/1‑149 (MQ=255)
gtcgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATaa < 2:798028/149‑1 (MQ=255)
gtcgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATaa < 2:4064792/149‑1 (MQ=255)
tcgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAAc < 1:530831/149‑1 (MQ=255)
tcgCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCAAACACCCCCTCTTTGATaaa > 1:3825168/1‑148 (MQ=255)
ccGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATATCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGc < 2:914902/149‑1 (MQ=255)
tCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCAc > 2:2797094/1‑149 (MQ=255)
tCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCAc > 2:417468/1‑149 (MQ=255)
cGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACt < 2:2852225/149‑1 (MQ=255)
gATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACtt < 2:30070/149‑1 (MQ=255)
ttCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGAc < 2:2282549/149‑1 (MQ=255)
ttCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGAc > 2:1024346/1‑149 (MQ=255)
tGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtc < 1:3251048/149‑1 (MQ=255)
tGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtc > 1:1348996/1‑149 (MQ=255)
tGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCATCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtc < 1:2003578/149‑1 (MQ=255)
ggCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtct < 2:36225/149‑1 (MQ=255)
ggCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGtct > 1:1586847/1‑149 (MQ=255)
ctctTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCtt < 1:2724830/149‑1 (MQ=255)
ctTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCa < 2:2365157/149‑1 (MQ=255)
ctTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCa > 1:1146169/1‑149 (MQ=255)
ttGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCAcc > 2:3986544/1‑149 (MQ=255)
tGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTTATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGACGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCAccc < 1:2395068/149‑1 (MQ=255)
ggTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACccg > 1:1046666/1‑149 (MQ=255)
tGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACccgcc < 2:1350543/149‑1 (MQ=255)
tGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACccgcc > 2:3243646/1‑149 (MQ=255)
tGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACccgcc < 1:933207/149‑1 (MQ=255)
cccGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGt < 2:3075870/149‑1 (MQ=255)
ccGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGtt < 1:1129075/149‑1 (MQ=255)
cGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGttt > 1:1480519/1‑149 (MQ=255)
gATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGtttt > 2:567268/1‑149 (MQ=255)
aTCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTc > 1:429877/1‑149 (MQ=255)
tCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTcc > 1:3353551/1‑149 (MQ=255)
cACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCg < 1:2945849/149‑1 (MQ=255)
aCCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGt < 2:1595059/149‑1 (MQ=255)
ccATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTa > 2:2758116/1‑149 (MQ=255)
ccATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTa > 2:3709332/1‑149 (MQ=255)
aTCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTAcc > 1:3507829/1‑149 (MQ=255)
tctcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCAACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACCCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCg > 1:3331481/1‑149 (MQ=255)
ctcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGt < 1:1926174/149‑1 (MQ=255)
ctcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGt < 1:3964895/149‑1 (MQ=255)
tcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTc < 1:1893901/149‑1 (MQ=255)
tcCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTc < 2:3480707/149‑1 (MQ=255)
cTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaa > 1:278110/1‑149 (MQ=255)
cTGATCGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaa < 1:2415879/149‑1 (MQ=255)
gATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaaca > 1:3779392/1‑149 (MQ=255)
gATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaaca > 1:1357550/1‑149 (MQ=255)
gATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTcaaca > 2:4114248/1‑149 (MQ=255)
cGTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAg < 1:2556199/149‑1 (MQ=255)
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gTGAACGCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGc < 1:634513/149‑1 (MQ=255)
aCGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCt > 2:3189751/1‑149 (MQ=255)
aCGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCt > 2:2338606/1‑149 (MQ=255)
cGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTc < 2:627785/149‑1 (MQ=255)
cGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTc > 2:3145012/1‑149 (MQ=255)
gCTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCa < 2:3678250/149‑1 (MQ=255)
cTCATCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAg > 1:1645229/1‑149 (MQ=255)
aTCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTc > 2:668204/1‑149 (MQ=255)
tCCGGTAGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCa > 2:697803/1‑149 (MQ=255)
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GAACAATCTTCAGCCCTTTGCCATCTTCTTTCAGATCAACGCGGGTGAGGTGAGAGGTTTCCGGACGTTCGTCGCCGTCGATCTCTTCGTTGGCCTCTTTGGTGCGCCCGATCACCATCTCCTGATCGTGAACGCTCATCCGGTTGAGCTGCTTCAGGTTGTGTTCCCAACGCTGGACAAACACATAGCTGCCGCCCGCATCCACGCCGTCTTTGATAACCGCCACTTCGCGACGCGTCTCTTCACCCGCCGGGTTTTCCGTACCGTCAACAAAGCCGCTCAGGTCACGCT > CP009273/2543211‑2543501
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
