Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
631,020 |
G→T |
Q336K (CAG→AAG) |
ybdN ← |
PAPS reductase‑like domain protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 631,020 | 0 | G | T | 100.0%
| 639.5
/ NA
| 192 | Q336K (CAG→AAG) | ybdN | PAPS reductase‑like domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (90/102); total (90/102) |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
AGTTCTTCGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTGATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGATTGTCAT > CP009273/630873‑631166
|
aGTTCTTCGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTAt > 1:331906/1‑150 (MQ=255)
gTTCTTCGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTtata < 1:2497554/150‑1 (MQ=255)
gTTCTTCGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTtata > 1:2368905/1‑150 (MQ=255)
cttcGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCa > 2:3755874/1‑150 (MQ=255)
ttcGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAg > 1:1490424/1‑150 (MQ=255)
tttGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGGGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCaga > 2:664119/1‑148 (MQ=255)
ttGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCaaat > 1:2469191/1‑150 (MQ=255)
tgtgGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCaaata < 1:1084854/150‑1 (MQ=255)
tgGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCaaataaa < 2:3045185/150‑1 (MQ=255)
ggggCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCaaataaat > 2:573863/1‑150 (MQ=255)
gggCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATg < 2:2570107/150‑1 (MQ=255)
gCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGc < 1:2716025/150‑1 (MQ=255)
aaaTGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGAt > 2:3584681/1‑150 (MQ=255)
aaTGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGAtt > 2:3260280/1‑150 (MQ=255)
aaTGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGAtt > 1:3671660/1‑150 (MQ=255)
aTGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGAttt < 1:3144706/150‑1 (MQ=255)
gATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTa > 1:2213680/1‑150 (MQ=255)
tAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTAtt < 2:1072000/150‑1 (MQ=255)
tAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTAtt < 2:50461/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTg < 1:193414/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTg > 2:3749468/1‑150 (MQ=255)
aTGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGc > 2:1009961/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCg < 2:574585/150‑1 (MQ=255)
cGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTaa < 1:2735076/150‑1 (MQ=255)
cGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTaa < 1:2212183/150‑1 (MQ=255)
gACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAAt < 2:416357/150‑1 (MQ=255)
cacCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGc < 1:1100934/150‑1 (MQ=255)
tAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCt > 2:1652516/1‑150 (MQ=255)
tCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGtt < 1:1645053/150‑1 (MQ=255)
tCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGtt < 1:3539981/150‑1 (MQ=255)
gTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGtttt < 1:1050446/150‑1 (MQ=255)
aTTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTc > 2:113616/1‑150 (MQ=255)
tGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCg < 1:2448724/150‑1 (MQ=255)
aGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGc < 1:874466/150‑1 (MQ=255)
tAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCAt > 2:1050027/1‑150 (MQ=255)
tAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCAt < 2:2299900/150‑1 (MQ=255)
tAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCAt < 1:3017123/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATg < 1:3599004/150‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGTGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCt < 2:1275216/150‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCt > 1:3723794/1‑150 (MQ=255)
aCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTa < 2:217473/150‑1 (MQ=255)
aCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTa > 1:16268/1‑150 (MQ=255)
aCTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTa > 1:1764067/1‑150 (MQ=255)
tttGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCC‑TTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTg < 1:1589175/150‑1 (MQ=255)
tGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGa < 1:2553469/150‑1 (MQ=255)
gCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGag < 2:147068/150‑1 (MQ=255)
gCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGag > 1:1282039/1‑150 (MQ=255)
cATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGagc > 1:2647636/1‑150 (MQ=255)
tatCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGagcag < 2:3400475/150‑1 (MQ=255)
tatCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGagcag < 2:1520628/150‑1 (MQ=255)
tatCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGagcag > 1:298674/1‑150 (MQ=255)
tCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAgcagca < 2:3138850/150‑1 (MQ=255)
gccgccAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCaata < 1:3260280/150‑1 (MQ=255)
ccgccAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCaataa < 2:3504377/150‑1 (MQ=255)
gccAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATg < 1:649957/150‑1 (MQ=255)
gccAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATg > 2:186465/1‑150 (MQ=255)
cAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCa < 2:24502/150‑1 (MQ=255)
aggaggGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCat > 1:418557/1‑150 (MQ=255)
ggaggGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTACGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCata > 2:1404102/1‑150 (MQ=255)
gaggGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCatat > 2:2375401/1‑150 (MQ=255)
aggGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATAtt > 2:1369544/1‑150 (MQ=255)
ggggATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTc < 2:1777863/150‑1 (MQ=255)
gggATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCt < 2:2802260/150‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATTATGCATATTCTTg < 1:2693952/150‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCATTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTg < 1:1305629/150‑1 (MQ=255)
tatCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGcc < 1:3375927/150‑1 (MQ=255)
atCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCa > 1:1222285/1‑150 (MQ=255)
tCTTTCGCGCCAAGGGCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAg < 1:3302323/150‑1 (MQ=255)
cTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGt < 2:3340739/150‑1 (MQ=255)
cTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGt > 1:538202/1‑150 (MQ=255)
ttCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCt < 2:1522619/150‑1 (MQ=255)
gcCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATg > 2:914759/1‑150 (MQ=255)
cAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTACTGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGtt > 1:3452522/1‑150 (MQ=255)
aaTGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTc > 1:2130240/1‑150 (MQ=255)
aTGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCt < 2:2213634/150‑1 (MQ=255)
tCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGc > 2:79793/1‑150 (MQ=255)
cccTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCtt > 1:3260811/1‑150 (MQ=255)
ccTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTg > 1:1444239/1‑150 (MQ=255)
tGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAgg < 2:617888/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGa < 2:192049/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGa < 2:190729/150‑1 (MQ=255)
cTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGAt < 2:457895/150‑1 (MQ=255)
cTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGAt < 2:238994/150‑1 (MQ=255)
tGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGAtt > 1:990610/1‑150 (MQ=255)
gggTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGAttt > 1:2062014/1‑150 (MQ=255)
ggTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGAtttt < 1:2903657/150‑1 (MQ=255)
gTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTc > 1:2859326/1‑150 (MQ=255)
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ATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCA > SRR19973061.1225334/1‑150 (MQ=60)
TCTTTCGCGCCAAGGGCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAG < SRR19973061.3310822/150‑1 (MQ=60)
CTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGT > SRR19973061.1226061/1‑150 (MQ=60)
CTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGT > SRR19973061.539622/1‑150 (MQ=60)
TTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTAGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCT < SRR19973061.549993/150‑1 (MQ=60)
CGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAA > SRR19973061.3319105/1‑150 (MQ=60)
CAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTACTGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTT > SRR19973061.3461381/1‑150 (MQ=60)
CAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTT < SRR19973061.1844156/150‑1 (MQ=60)
AATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTC > SRR19973061.2135588/1‑150 (MQ=60)
AATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTC > SRR19973061.3005519/1‑150 (MQ=60)
ATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCT < SRR19973061.652603/150‑1 (MQ=60)
CCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTT > SRR19973061.3269206/1‑150 (MQ=60)
CCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTT > SRR19973061.3644991/1‑150 (MQ=60)
CCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTG > SRR19973061.1447902/1‑150 (MQ=60)
CCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTG > SRR19973061.1447884/1‑150 (MQ=60)
CTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGA < SRR19973061.3443790/150‑1 (MQ=60)
TGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATT > SRR19973061.993138/1‑150 (MQ=60)
GGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTT > SRR19973061.2067204/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTT < SRR19973061.2911106/150‑1 (MQ=60)
GGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTT < SRR19973061.932679/150‑1 (MQ=60)
GTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTC > SRR19973061.2866645/1‑150 (MQ=60)
TGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGA > SRR19973061.664199/1‑150 (MQ=60)
GGAACCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGC > SRR19973061.1647317/1‑150 (MQ=60)
CCTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCAT > SRR19973061.2501981/1‑150 (MQ=60)
CTCGATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATA > SRR19973061.1455526/1‑150 (MQ=60)
ATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAA > SRR19973061.2639852/1‑150 (MQ=60)
ATGCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAA > SRR19973061.729921/1‑150 (MQ=60)
GCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATG > SRR19973061.440700/1‑150 (MQ=60)
GCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATG < SRR19973061.2883686/150‑1 (MQ=60)
GCCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATG < SRR19973061.843835/150‑1 (MQ=60)
CCTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGA < SRR19973061.2443129/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGAT > SRR19973061.2671376/1‑150 (MQ=60)
TTTTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGATT < SRR19973061.3168094/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGATTGT > SRR19973061.3350715/1‑150 (MQ=60)
TCTTATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCTGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCAAATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGATTGTCAT > SRR19973061.1148413/1‑150 (MQ=60)
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ATAGTTCTTCGATTTTGTGGGGCTAAATGATAATGCCCGACACCAGTAATCGTTATTGAGTAAAACTTTGCATATCCGCCGCCAGGAGGGGATATCTTTCGCGCCAATGTCCCCTTGCTGGGTTTGTGGAACCTCGATGCCTTTTTTCTGATACCAGTGCAAATAAATGGCGATTTTATTGCGGTAATGCTCAGCTGTTTTTTCCGGCATGCTATTGAGCAGCAATAATGCATATTCTTGCCAGTCTAAATGTTCTGGCTTGAGGATTTTCCGATGCCCATAGAAATGATTGTCAT > CP009273/630871‑631166
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |