Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,951,334 |
C→A |
T352T (ACG→ACT) |
torY ← |
TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,951,334 | 0 | C | A | 99.6%
| 741.8
/ NA
| 222 | T352T (ACG→ACT) | torY | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (135/86); total (135/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CGGTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGCGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGT > CP009273/1951187‑1951479
|
gTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTa < 2:1303971/150‑1 (MQ=255)
gTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTa > 1:884776/1‑150 (MQ=255)
gctgcCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTaaa < 2:393853/150‑1 (MQ=255)
ctgcCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGCATCACTGTTTCTCGGTAATAACTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTaaaa > 2:2649933/1‑150 (MQ=255)
gcCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATg < 1:1964989/150‑1 (MQ=255)
gcCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATg < 1:3181174/150‑1 (MQ=255)
aTGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATCCCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGCGTTAAATTGTcct < 2:1729932/150‑2 (MQ=255)
aTGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCa < 2:832167/150‑1 (MQ=255)
aTGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCa < 2:3389033/150‑1 (MQ=255)
aTGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCa < 1:498664/150‑1 (MQ=255)
tCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGtt < 2:3314324/150‑1 (MQ=255)
caccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGtt < 2:1224691/150‑1 (MQ=255)
caccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGtt > 1:2675900/1‑150 (MQ=255)
accaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGttt < 1:1170861/150‑1 (MQ=255)
caGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTc < 1:981427/150‑1 (MQ=255)
aGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCg > 2:686125/1‑150 (MQ=255)
aGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCg > 1:2982556/1‑150 (MQ=255)
aGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCg < 1:2702947/150‑1 (MQ=255)
cgcTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCt > 1:573510/1‑150 (MQ=255)
cTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCa > 1:3651844/1‑150 (MQ=255)
cTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCa > 2:2522972/1‑150 (MQ=255)
aGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCACAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCt < 2:2295338/150‑1 (MQ=255)
gCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTg < 2:1838071/150‑1 (MQ=255)
cAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTc > 1:403266/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCg > 1:3069455/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCg > 2:3229619/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCg < 2:2686515/150‑1 (MQ=255)
aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCg > 1:140690/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCg > 2:2361707/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTg < 1:3723050/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGc > 1:1834848/1‑150 (MQ=255)
ccGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGcc < 1:278638/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGcc < 1:278833/150‑1 (MQ=255)
gtgtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAt > 1:3322987/1‑150 (MQ=255)
aataaATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCttt > 2:503947/1‑150 (MQ=255)
ataaATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACGTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTg < 1:120578/150‑1 (MQ=255)
aaaTTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGc > 1:81860/1‑150 (MQ=255)
aTTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCaa > 1:1455015/1‑150 (MQ=255)
tCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATg > 1:1733786/1‑150 (MQ=255)
cACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATgg > 2:2603767/1‑150 (MQ=255)
cACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATgg > 2:1859624/1‑150 (MQ=255)
cGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTATCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCACCATTCCTTTGGCAATGGAc < 2:3174704/150‑1 (MQ=255)
gTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACg > 2:3503179/1‑150 (MQ=255)
tCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACgg > 1:1980844/1‑150 (MQ=255)
ttGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGcc > 2:3012118/1‑150 (MQ=255)
ttAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACg > 1:460931/1‑150 (MQ=255)
aaCTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGT‑CAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgtg > 1:710345/1‑150 (MQ=255)
cTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgtgt > 2:1966591/1‑150 (MQ=255)
ttCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTa < 2:1396440/150‑1 (MQ=255)
cctccCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAAt > 2:1001635/1‑150 (MQ=255)
cctccCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAAt > 2:3415696/1‑150 (MQ=255)
ctccCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCGGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATg < 1:162621/150‑1 (MQ=255)
ctccCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATg < 1:1436840/150‑1 (MQ=255)
cccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGt < 2:2033173/150‑1 (MQ=255)
cccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGt < 2:1659915/150‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTc < 1:746536/150‑1 (MQ=255)
ccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTc > 1:3621769/1‑150 (MQ=255)
tGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTcgg > 2:1079890/1‑150 (MQ=255)
cAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCggcggc > 1:1310258/1‑150 (MQ=255)
cAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCggcggc > 2:1702360/1‑150 (MQ=255)
aaCGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCa > 1:1388328/1‑150 (MQ=255)
cGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATAACAAAGGCGTTGTACAGGAAATACCGAGTTAAAAATTCCAGAACGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGTACTGCCACGCATAGACGGTGTAATGTTCGGCGTCAAt > 1:2539647/1‑150 (MQ=255)
aGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAg < 1:2019355/150‑1 (MQ=255)
aGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATAGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAg > 2:1595401/1‑150 (MQ=255)
ggATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAgg > 2:1966128/1‑150 (MQ=255)
aTCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAgggg > 1:109261/1‑150 (MQ=255)
aTCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAgggg > 1:3080298/1‑150 (MQ=255)
aTCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAgggg > 1:3492226/1‑150 (MQ=255)
tCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGc < 1:1972151/150‑1 (MQ=255)
cACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCa > 2:77409/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCAt > 2:2249430/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATg < 1:2208427/150‑1 (MQ=255)
cTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATg > 1:3301091/1‑150 (MQ=255)
tGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGa > 2:408715/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGAc > 2:2204549/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGAc > 1:3292318/1‑150 (MQ=255)
tctcGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAAc < 1:2037750/150‑1 (MQ=255)
tcGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCa < 2:1393548/150‑1 (MQ=255)
cGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAg < 1:3398428/150‑1 (MQ=255)
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ggTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAgc > 2:69417/1‑150 (MQ=255)
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CCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTC > SRR19973061.3631035/1‑150 (MQ=60)
CCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTC < SRR19973061.748496/150‑1 (MQ=60)
CTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCG > SRR19973061.2445354/1‑150 (MQ=60)
CTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCG < SRR19973061.1157971/150‑1 (MQ=60)
TCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGG < SRR19973061.2372894/150‑1 (MQ=60)
CAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGC > SRR19973061.1313538/1‑150 (MQ=60)
AACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCA > SRR19973061.1391843/1‑150 (MQ=60)
CGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATAACAAAGGCGTTGTACAGGAAATACCGAGTTAAAAATTCCAGAACGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGTACTGCCACGCATAGACGGTGTAATGTTCGGCGTCAAT > SRR19973061.2546110/1‑150 (MQ=60)
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GAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATA > SRR19973061.493470/1‑150 (MQ=60)
AGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAG < SRR19973061.55983/150‑1 (MQ=60)
AGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAG < SRR19973061.2024429/150‑1 (MQ=60)
GGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGG < SRR19973061.35233/150‑1 (MQ=60)
GATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGG > SRR19973061.2558652/1‑150 (MQ=60)
ATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGG > SRR19973061.109623/1‑150 (MQ=60)
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TCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGC > SRR19973061.262843/1‑150 (MQ=60)
TCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGC < SRR19973061.1977130/150‑1 (MQ=60)
TCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGC < SRR19973061.1977088/150‑1 (MQ=60)
CACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCA > SRR19973061.2040940/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCAT > SRR19973061.2683125/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCAT > SRR19973061.773409/1‑150 (MQ=60)
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CTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATG > SRR19973061.3309589/1‑150 (MQ=60)
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GTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGAC > SRR19973061.3300795/1‑150 (MQ=60)
TCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAAC < SRR19973061.2042866/150‑1 (MQ=60)
CGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAG < SRR19973061.3407153/150‑1 (MQ=60)
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GGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGC < SRR19973061.1274688/150‑1 (MQ=60)
AATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCA > SRR19973061.2609365/1‑150 (MQ=60)
ATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAC > SRR19973061.342187/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATA > SRR19973061.3021978/1‑150 (MQ=60)
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GTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAG < SRR19973061.1971046/150‑1 (MQ=60)
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TACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGT < SRR19973061.3637279/150‑1 (MQ=60)
ACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTT < SRR19973061.3237924/150‑1 (MQ=60)
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GAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATT > SRR19973061.1544473/1‑150 (MQ=60)
GAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATT > SRR19973061.1544406/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTG > SRR19973061.2183268/1‑150 (MQ=60)
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AGCGGTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGCGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTG > CP009273/1951185‑1951483
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
