Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,102,391 |
A→C |
S225S (TCT→TCG) |
wzxB ← |
putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,102,391 | 0 | A | C | 100.0%
| 838.8
/ NA
| 212 | S225S (TCT→TCG) | wzxB | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (107/105); total (107/105) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCAGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAA > CP009273/2102245‑2102536
|
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gggTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGAtgtg > 1:2738506/1‑150 (MQ=255)
gggTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGAtgtg > 2:2842236/1‑150 (MQ=255)
gTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGa > 2:1755220/1‑150 (MQ=255)
tataTTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGaa < 1:2329260/150‑1 (MQ=255)
atatTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGaaa > 1:2494598/1‑150 (MQ=255)
gCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATaaaa < 2:398015/150‑1 (MQ=255)
cTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATaaaaa > 2:1644061/1‑150 (MQ=255)
cTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATaaaaa < 2:298384/150‑1 (MQ=255)
cTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATaaaaa > 1:2647690/1‑150 (MQ=255)
ttGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAAc < 1:838165/150‑1 (MQ=255)
tGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACa < 2:2390936/150‑1 (MQ=255)
gTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGa > 2:3098432/1‑150 (MQ=255)
aTAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGaaaa > 1:296226/1‑150 (MQ=255)
aTAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGaaaa < 1:1242822/150‑1 (MQ=255)
tAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATATTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAAc < 2:1867690/150‑1 (MQ=255)
tAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAAc > 1:3782515/1‑150 (MQ=255)
ggATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCg > 2:2210914/1‑150 (MQ=255)
ggATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCg < 2:3367010/150‑1 (MQ=255)
ggATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCg > 1:2072394/1‑150 (MQ=255)
gATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGt > 1:2032223/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTc < 1:1527303/150‑1 (MQ=255)
tAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGc > 2:3586000/1‑150 (MQ=255)
aaTAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCt < 2:3762310/150‑1 (MQ=255)
aTAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTa < 2:372112/150‑1 (MQ=255)
tAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTaa > 2:2615496/1‑150 (MQ=255)
aGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTaaa > 1:2506732/1‑150 (MQ=255)
gAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGAc < 1:2510791/150‑1 (MQ=255)
aaGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGAca < 2:1818469/150‑2 (MQ=255)
gcgcGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGca > 1:2989821/1‑150 (MQ=255)
cgcgTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCAACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGAAAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGTAAATAAAAACATTAAAAACATCTACTAAAAATCTACGaac > 1:3255894/1‑150 (MQ=255)
ttCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTTCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTAt < 2:3087569/150‑1 (MQ=255)
ttCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAATCTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTAt > 2:702612/1‑150 (MQ=255)
tCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATg < 2:1296875/150‑1 (MQ=255)
ttATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTa < 1:2170658/150‑1 (MQ=255)
aGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGa > 1:1579669/1‑150 (MQ=255)
tATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATa < 1:177144/150‑1 (MQ=255)
aTTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAg > 1:2349947/1‑150 (MQ=255)
ttGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGc < 2:2349214/150‑1 (MQ=255)
cGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAAc > 2:1081179/1‑150 (MQ=255)
gCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACt < 1:1084135/150‑1 (MQ=255)
gCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACt < 1:1293550/150‑1 (MQ=255)
cATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACtt < 1:3194921/150‑1 (MQ=255)
tAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTAc < 1:1297906/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCaa < 1:2413882/150‑1 (MQ=255)
tCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATcc < 1:3580395/150‑1 (MQ=255)
aCGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCATGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTTGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCt < 2:2399090/150‑1 (MQ=255)
ggACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTc > 2:2636712/1‑150 (MQ=255)
ggACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTc > 2:1532326/1‑150 (MQ=255)
ggACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTc > 2:1204327/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCAt > 2:1938732/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCAt > 1:1049831/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCAt < 2:3416041/150‑1 (MQ=255)
cGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATg < 2:3754236/150‑1 (MQ=255)
gTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGa > 1:337183/1‑150 (MQ=255)
gTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGa > 2:3268864/1‑150 (MQ=255)
gTTGGACCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGa > 2:46502/1‑150 (MQ=255)
tGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGaac < 1:3708639/150‑1 (MQ=255)
ggTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGaaca < 1:2852320/150‑1 (MQ=255)
tCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGaacaac > 2:2535851/1‑150 (MQ=255)
cAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGa > 1:534788/1‑150 (MQ=255)
gATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATa > 1:3605592/1‑150 (MQ=255)
ataAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCt > 1:2793861/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAg < 2:1256276/150‑1 (MQ=255)
aaTCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGt < 1:665291/150‑1 (MQ=255)
cccAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCa > 1:3460777/1‑150 (MQ=255)
ccAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCaa < 2:2032223/150‑1 (MQ=255)
aGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCaata < 2:2337353/150‑1 (MQ=255)
gATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCaataat > 2:1982284/1‑150 (MQ=255)
ataataACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAAtt < 1:839822/150‑1 (MQ=255)
taataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTc < 1:1805932/150‑1 (MQ=255)
taataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAAACCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTc > 1:750835/1‑150 (MQ=255)
aataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTcc < 1:3259755/150‑1 (MQ=255)
aataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTcc < 1:3098432/150‑1 (MQ=255)
ataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCa > 1:1852259/1‑150 (MQ=255)
ataaCTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCa < 2:684477/150‑1 (MQ=255)
tATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAAc > 1:1752647/1‑150 (MQ=255)
tATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAAc > 1:109407/1‑150 (MQ=255)
aTTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAAcc < 1:765783/150‑1 (MQ=255)
tCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAg > 2:1376952/1‑150 (MQ=255)
cccGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGa > 2:332140/1‑150 (MQ=255)
ccGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGAt > 2:873767/1‑150 (MQ=255)
ccGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGAt < 2:3496140/150‑1 (MQ=255)
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GGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACA < SRR19973061.2859624/150‑1 (MQ=60)
CAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGACCAACGA > SRR19973061.502801/1‑150 (MQ=60)
CAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGA > SRR19973061.536206/1‑150 (MQ=60)
GATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATA > SRR19973061.3614825/1‑150 (MQ=60)
ATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCT < SRR19973061.2782258/150‑1 (MQ=60)
ATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCT > SRR19973061.2801040/1‑150 (MQ=60)
AATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGT < SRR19973061.667002/150‑1 (MQ=60)
ATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTG > SRR19973061.2920530/1‑150 (MQ=60)
CCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCA > SRR19973061.3469649/1‑150 (MQ=60)
GATAATAACTAGTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAAT < SRR19973061.3643441/150‑1 (MQ=60)
ATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATT < SRR19973061.842008/150‑1 (MQ=60)
TAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTC < SRR19973061.1810441/150‑1 (MQ=60)
TAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAAACCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTC > SRR19973061.752809/1‑150 (MQ=60)
AATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCC < SRR19973061.3106415/150‑1 (MQ=60)
AATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCC < SRR19973061.3268149/150‑1 (MQ=60)
AATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCC < SRR19973061.3107874/150‑1 (MQ=60)
ATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCA > SRR19973061.1856894/1‑150 (MQ=60)
TATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAAC > SRR19973061.109770/1‑150 (MQ=60)
TATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAAC > SRR19973061.1757045/1‑150 (MQ=60)
ATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACC < SRR19973061.767794/150‑1 (MQ=60)
ATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACC < SRR19973061.2678313/150‑1 (MQ=60)
TTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCA < SRR19973061.3595193/150‑1 (MQ=60)
CGTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATT > SRR19973061.3264514/1‑150 (MQ=60)
GTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTT > SRR19973061.1825291/1‑150 (MQ=60)
GTAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTT > SRR19973061.3725430/1‑150 (MQ=60)
TAGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTG > SRR19973061.390303/1‑150 (MQ=60)
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AGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGC > SRR19973061.197895/1‑150 (MQ=60)
AGAATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAAAGATAGCGAAACTTTACCAATCCAACCAACAAGAACAACAATAGCTAGTGCAAAAATTCCAGCAACCAGAATTGC > SRR19973061.197928/1‑150 (MQ=60)
AATATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCAC < SRR19973061.1675992/150‑1 (MQ=60)
TATAATCTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTT < SRR19973061.704440/150‑1 (MQ=60)
ATAAACTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTG < SRR19973061.627364/150‑1 (MQ=60)
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CTAATAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGA > SRR19973061.997788/1‑150 (MQ=60)
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TAGCCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAA > SRR19973061.3019061/1‑150 (MQ=60)
CCGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAAAAC < SRR19973061.100818/150‑1 (MQ=60)
CGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAAAACC < SRR19973061.2988597/150‑1 (MQ=60)
CGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAAAACC < SRR19973061.360684/150‑1 (MQ=60)
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ATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAGGATAATAACTATTCCCGTAGAATATAAACTAATAGCAGATGTGGAAATAAAAACATGAAAACCGTCTGCTAAAGATCGACGCACATTATGTAATGATAGCGTAACTTTACCAATCCAACCTTCATGAACAACGATAGCTAGTGCAATAATTCCAGCAACCAGATTTGCACTTGACTGAATAAAACC > CP009273/2102242‑2102540
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |