Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,411,701 |
T→A |
L381* (TTA→TAA) |
yfcC → |
putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,411,701 | 0 | T | A | 100.0%
| 744.7
/ NA
| 223 | L381* (TTA→TAA) | yfcC | putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (103/120); total (103/120) |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
TCCGCCTTAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGG > CP009273/2411554‑2411847
|
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cGCCTTAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAAt < 1:2248578/150‑1 (MQ=255)
gCCTTAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATa > 1:2653424/1‑150 (MQ=255)
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ccTTAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATAc < 1:1656939/150‑1 (MQ=255)
ttAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCa < 1:1407073/150‑1 (MQ=255)
ttAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCa > 2:2988310/1‑150 (MQ=255)
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gCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCa < 2:1619489/150‑1 (MQ=255)
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aCCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAAt < 1:710903/150‑1 (MQ=255)
aTGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGcc > 1:2928680/1‑150 (MQ=255)
aTGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGcc > 2:2812603/1‑150 (MQ=255)
gCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCAtt < 1:2532375/150‑1 (MQ=255)
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cTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTa < 1:2519582/150‑1 (MQ=255)
cTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTa < 1:3288545/150‑1 (MQ=255)
ttCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAg < 1:2158617/150‑1 (MQ=255)
ttCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAg < 1:2829895/150‑1 (MQ=255)
ccTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTc > 1:1064560/1‑150 (MQ=255)
cTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCt > 1:1694650/1‑150 (MQ=255)
cTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCt > 1:3684109/1‑150 (MQ=255)
cTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCt > 1:3610936/1‑150 (MQ=255)
tACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGa > 1:2834389/1‑150 (MQ=255)
gAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAAc > 2:3495955/1‑150 (MQ=255)
gAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAAc > 2:1069975/1‑150 (MQ=255)
aaGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAAcg < 2:3510302/150‑1 (MQ=255)
aGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAAcgc > 1:3738688/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGt < 1:319399/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTc < 2:1122420/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTc < 2:757942/150‑1 (MQ=255)
cgAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTcgcg > 2:3754451/1‑150 (MQ=255)
gAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCgg < 1:2120678/150‑1 (MQ=255)
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aaTGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGc > 2:2836426/1‑150 (MQ=255)
tgatgaTCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCt < 1:452666/150‑1 (MQ=255)
tgatgaTCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCt < 1:1970954/150‑1 (MQ=255)
gatgatCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTg > 2:2966770/1‑150 (MQ=255)
gCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATg > 2:2396220/1‑150 (MQ=255)
gCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATg > 1:3558646/1‑150 (MQ=255)
ccctgccctgCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGtt < 2:456295/150‑1 (MQ=255)
cctgccctgcTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTg < 1:20846/150‑1 (MQ=255)
cctgcTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCtt < 2:503384/150‑1 (MQ=255)
tgctgGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTcc > 1:2735316/1‑150 (MQ=255)
tgctgGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTcc > 1:3629867/1‑150 (MQ=255)
gctgGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCa < 2:2320943/150‑1 (MQ=255)
ctgGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAg > 1:1014978/1‑150 (MQ=255)
tggtggGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAgg > 1:1482959/1‑150 (MQ=255)
tggtggGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAgg < 1:1883801/150‑1 (MQ=255)
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tggGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCgg > 1:3317974/1‑150 (MQ=255)
tggGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCgg > 2:3803806/1‑150 (MQ=255)
ggTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTa < 2:526633/150‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTAttt < 1:1289462/150‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAGGGATTATGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTAttt > 2:1789246/1‑150 (MQ=255)
gCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAt < 2:2736581/150‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAt < 1:2988310/150‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAt > 2:173830/1‑150 (MQ=255)
ccAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAtt < 1:3448338/150‑1 (MQ=255)
ccAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAtt < 1:3549191/150‑1 (MQ=255)
cAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAttt < 1:2402266/150‑1 (MQ=255)
aaaGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATttc < 1:3013177/150‑1 (MQ=255)
aaGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATttct > 1:1447263/1‑150 (MQ=255)
aaGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATttct < 2:1219331/150‑1 (MQ=255)
aGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTa > 1:2488839/1‑119 (MQ=255)
aGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTa < 2:2488839/119‑1 (MQ=255)
gggATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATttcttc < 2:785758/150‑1 (MQ=255)
gggATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATttcttc < 1:2607940/150‑1 (MQ=255)
ggATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCg > 1:1048001/1‑150 (MQ=255)
ttttGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGa > 2:64382/1‑150 (MQ=255)
ctgctgGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTcc > 2:632617/1‑150 (MQ=255)
gTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCt > 2:2167479/1‑150 (MQ=255)
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GCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATG > SRR19973061.3567753/1‑150 (MQ=60)
GCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATG > SRR19973061.1833167/1‑150 (MQ=60)
CCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTT < SRR19973061.1675362/150‑1 (MQ=60)
CCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTG < SRR19973061.1937368/150‑1 (MQ=60)
CCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTG < SRR19973061.2835857/150‑1 (MQ=60)
CCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTG < SRR19973061.20926/150‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTT > SRR19973061.2555832/1‑150 (MQ=60)
CCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTT > SRR19973061.3766366/1‑150 (MQ=60)
TGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCC > SRR19973061.3639149/1‑150 (MQ=60)
TGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCC > SRR19973061.2742347/1‑150 (MQ=60)
TGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCC > SRR19973061.3639342/1‑150 (MQ=60)
TGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCC > SRR19973061.3639146/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAG > SRR19973061.1017562/1‑150 (MQ=60)
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TGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGG < SRR19973061.847546/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGG > SRR19973061.1486677/1‑150 (MQ=60)
GTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCG > SRR19973061.2857418/1‑150 (MQ=60)
TGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGG > SRR19973061.3326531/1‑150 (MQ=60)
TGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGG > SRR19973061.3326493/1‑150 (MQ=60)
TTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTT < SRR19973061.1292659/150‑1 (MQ=60)
TTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTT < SRR19973061.1291878/150‑1 (MQ=60)
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TCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTA > SRR19973061.2921517/1‑150 (MQ=60)
GCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAT < SRR19973061.2994780/150‑1 (MQ=60)
GCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAT < SRR19973061.2996024/150‑1 (MQ=60)
GCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAAT < SRR19973061.2996078/150‑1 (MQ=60)
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CCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATT < SRR19973061.3558278/150‑1 (MQ=60)
CAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTT < SRR19973061.2408398/150‑1 (MQ=60)
AAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTC < SRR19973061.3020956/150‑1 (MQ=60)
AAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCT > SRR19973061.1450917/1‑150 (MQ=60)
AGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTAagatcggaagagcacacgtctgaactccagt > SRR19973061.2495179/1‑119 (MQ=60)
GGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTTCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTC > SRR19973061.2641741/1‑150 (MQ=60)
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GGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCG > SRR19973061.1050686/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGAC < SRR19973061.2514185/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTT < SRR19973061.3423869/150‑1 (MQ=60)
GGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTC > SRR19973061.1037409/1‑150 (MQ=60)
TCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTG > SRR19973061.3789174/1‑150 (MQ=60)
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TGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGG < SRR19973061.1251073/150‑1 (MQ=60)
TGTAAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGG < SRR19973061.1251066/150‑1 (MQ=60)
AAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCAC > SRR19973061.2365573/1‑150 (MQ=60)
|
TTCCGCCTTAACGGCATGACGGTTAATACCATGGCTTCATCCTTTACCGAAGGGGCGCGAATGATGATCGCCCCTGCCCTGCTGGTGGGTTTCGCCAAAGGGATTTTGCTGCTGGTCGGTAATGGTGAAGCGGGTGATGCCAGCGTGTTAAATACCATCCTCAACAGCATTGCCAATGCCATTAGCGGTCTGGACAACGCGGTCGCGGCCTGGTTTATGTTGCTCTTCCAGGCGGTATTTAATTTCTTCGTGACGTCCGGTTCTGGTCAGGCGGCGTTAACCATGCCGTTACTGGCAC > CP009273/2411553‑2411850
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
