Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
576,998 |
G→T |
100% |
pseudogene (189/309 nt) |
aaaD → |
pseudogene; DLP12 prophage; tail fiber assembly protein family;Phage or Prophage Related |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 576,998 | 0 | G | T | 100.0%
| 817.4
/ NA
| 247 | pseudogene (189/309 nt) | aaaD | pseudogene; DLP12 prophage; tail fiber assembly protein family;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (129/118); total (129/118) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCA > CP009273/576851‑577143
|
tGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTAt > 1:1563612/1‑150 (MQ=255)
gTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATg < 2:4905587/150‑1 (MQ=255)
gTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATg < 2:376275/150‑1 (MQ=255)
ccGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTCTggg > 2:4373365/1‑150 (MQ=255)
ccGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGATATggg > 2:2948950/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGc > 2:1978536/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGc < 1:4165732/150‑1 (MQ=255)
cgcCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAg < 1:1046985/150‑1 (MQ=255)
cgcCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAg > 2:2145783/1‑150 (MQ=255)
cgcCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAg > 2:2629639/1‑150 (MQ=255)
ccGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCg < 1:1051079/150‑1 (MQ=255)
gggCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGAc < 1:5133342/150‑1 (MQ=255)
ggCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGAca < 2:2788970/150‑2 (MQ=255)
cTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTAc > 1:3343577/1‑150 (MQ=255)
gCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATcc > 2:2537086/1‑150 (MQ=255)
gCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATcc < 1:575230/150‑1 (MQ=255)
gCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATcc < 1:3449353/150‑1 (MQ=255)
cTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCg > 2:1588741/1‑150 (MQ=255)
cTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCg > 2:4529834/1‑150 (MQ=255)
cACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTCCATCCggg > 2:4586002/1‑148 (MQ=255)
cACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTg > 1:4972899/1‑150 (MQ=255)
cACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTg < 1:42171/150‑1 (MQ=255)
tCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGa < 2:3222669/150‑1 (MQ=255)
aGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAt > 2:120323/1‑150 (MQ=255)
gCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAtgt < 1:1802692/150‑1 (MQ=255)
ccGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAtgtg < 1:3597166/150‑1 (MQ=255)
ccGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAtgtg < 2:4427399/150‑1 (MQ=255)
cGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATgtgg < 2:2120509/150‑1 (MQ=255)
ggAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATgtggt > 1:87130/1‑150 (MQ=255)
ggAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATgtggt > 1:756411/1‑150 (MQ=255)
gAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATgtggtg < 2:1109727/150‑1 (MQ=255)
aGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGa < 2:1819759/150‑1 (MQ=255)
gCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGaa < 2:1641149/150‑1 (MQ=255)
ccACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCTGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAg < 1:696692/150‑1 (MQ=255)
cacaGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGt > 1:4918221/1‑150 (MQ=255)
cgccgTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCg < 1:394723/150‑1 (MQ=255)
gccgTTGAATGGGCGGATGCTAATTCCTATCTCCCGAAAGAAGCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCCTGAATGCTCTGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCgt < 2:104035/150‑1 (MQ=255)
ccgTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCgtg > 1:673532/1‑150 (MQ=255)
ccgTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCgtg < 2:1941608/150‑1 (MQ=255)
gTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTCTCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTc < 2:3653164/150‑1 (MQ=255)
gTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTc > 1:4632524/1‑150 (MQ=255)
gAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGt > 2:3051412/1‑150 (MQ=255)
aTGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTa < 2:5000082/150‑1 (MQ=255)
gggCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTAtt < 1:2210020/150‑1 (MQ=255)
aTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAAtgctgc < 1:4335069/150‑1 (MQ=255)
tctcCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGTTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGgtgt < 2:3551343/150‑1 (MQ=255)
tcCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGttt < 1:2439617/150‑1 (MQ=255)
tcCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGttt < 1:2649939/150‑1 (MQ=255)
cccGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGGGAATGGGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTCTTCCAACATGCTGCTGGGTGTTTa > 1:4390506/1‑150 (MQ=255)
cGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATg > 2:2353533/1‑150 (MQ=255)
gAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGc > 1:3073049/1‑150 (MQ=255)
aaGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCt > 1:1720500/1‑150 (MQ=255)
aaGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCt > 1:3126411/1‑150 (MQ=255)
aGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCCTGACTGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTa < 2:1371299/150‑1 (MQ=255)
gAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTAc < 2:3811799/150‑1 (MQ=255)
gAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTAc < 2:2484614/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACt < 1:1484501/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACt > 1:1237420/1‑150 (MQ=255)
tCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACttt > 2:4122790/1‑150 (MQ=255)
tCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACttt > 1:841290/1‑150 (MQ=255)
cATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATag > 2:1699597/1‑150 (MQ=255)
cATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATag > 2:393920/1‑150 (MQ=255)
aTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATaga > 2:2048791/1‑150 (MQ=255)
tACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATagag > 1:4413806/1‑150 (MQ=255)
aCCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGc > 1:2032011/1‑150 (MQ=255)
aCCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGc > 1:144071/1‑150 (MQ=255)
ccAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCa > 1:3038030/1‑150 (MQ=255)
cAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCAt < 1:4696891/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCAt > 1:4741545/1‑150 (MQ=255)
aGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTAGTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATa > 2:4988726/1‑150 (MQ=255)
aaGGGAGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACAACCGTGAGGTGACTGTGGTGAAGTCTGCCCGAGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAagc > 2:1490292/1‑150 (MQ=255)
gggCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAagcag > 2:544171/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAgcg < 1:1216887/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAgcg < 1:2084368/150‑1 (MQ=255)
cTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCaa > 1:3855865/1‑150 (MQ=255)
tGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAac < 2:824086/150‑1 (MQ=255)
tGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAac > 2:143459/1‑150 (MQ=255)
gggAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAaca > 2:4539140/1‑150 (MQ=255)
aaaCACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAccc > 2:3006634/1‑150 (MQ=255)
aaCACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGTAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCt < 1:4643341/150‑1 (MQ=255)
acacTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCtt > 2:34881/1‑150 (MQ=255)
acacTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCtt > 2:492636/1‑150 (MQ=255)
acacTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCtt < 2:2307296/150‑1 (MQ=255)
acacTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCtt > 2:4673046/1‑150 (MQ=255)
cacTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTa > 2:783107/1‑150 (MQ=255)
acTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAACTGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTAt < 2:1410625/150‑1 (MQ=255)
tGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTc < 1:3942984/150‑1 (MQ=255)
tGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTc < 2:71975/150‑1 (MQ=255)
gCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTcc < 2:4287731/150‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCa > 1:1469257/1‑150 (MQ=255)
ccTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAg > 2:5069016/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTg < 2:4188991/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTg < 1:3728298/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTg < 1:2774848/150‑1 (MQ=255)
cGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTc > 2:2803376/1‑150 (MQ=255)
cGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTc > 2:2179031/1‑150 (MQ=255)
ggCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGt > 1:2725034/1‑150 (MQ=255)
ccATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTgg > 2:131206/1‑150 (MQ=255)
catcatGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGc < 1:1001663/150‑1 (MQ=255)
tGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGttt < 2:693629/150‑1 (MQ=255)
|
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCA > CP009273/576851‑577143
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCAACA > CP009273/576851‑577146
|
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTAT > SRR19973063.1568426/1‑150 (MQ=60)
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTAT > SRR19973063.1568415/1‑150 (MQ=60)
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTAT > SRR19973063.3134983/1‑150 (MQ=60)
CCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGG < SRR19973063.2763355/150‑1 (MQ=60)
CGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGC < SRR19973063.4179054/150‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAG < SRR19973063.1050156/150‑1 (MQ=60)
CCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCG < SRR19973063.1054261/150‑1 (MQ=60)
GGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGAC < SRR19973063.5149853/150‑1 (MQ=60)
GGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACT > SRR19973063.1991529/1‑150 (MQ=60)
GGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACT < SRR19973063.2832069/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTAC > SRR19973063.312767/1‑150 (MQ=60)
CTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTAC > SRR19973063.3354235/1‑150 (MQ=60)
GCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCC < SRR19973063.3460317/150‑1 (MQ=60)
GCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCC < SRR19973063.576925/150‑1 (MQ=60)
TCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGT > SRR19973063.3220208/1‑150 (MQ=60)
CACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTG > SRR19973063.4988973/1‑150 (MQ=60)
CACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTG < SRR19973063.42331/150‑1 (MQ=60)
CACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTG > SRR19973063.1762541/1‑150 (MQ=60)
CACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGAGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTG > SRR19973063.295194/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGA < SRR19973063.1221304/150‑1 (MQ=60)
CTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAG > SRR19973063.1243195/1‑150 (MQ=60)
TTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTG < SRR19973063.687150/150‑1 (MQ=60)
CAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAA > SRR19973063.4967250/1‑150 (MQ=60)
GCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGT < SRR19973063.1808284/150‑1 (MQ=60)
CCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTG < SRR19973063.3608708/150‑1 (MQ=60)
GGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGT > SRR19973063.87427/1‑150 (MQ=60)
GGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGT > SRR19973063.758474/1‑150 (MQ=60)
GGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGT > SRR19973063.758614/1‑150 (MQ=60)
GAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCTGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTG < SRR19973063.105316/150‑1 (MQ=60)
GAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTG < SRR19973063.3439827/150‑1 (MQ=60)
CCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCTGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAG < SRR19973063.698740/150‑1 (MQ=60)
CACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGT > SRR19973063.4934100/1‑150 (MQ=60)
CAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCT < SRR19973063.4326062/150‑1 (MQ=60)
CAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCT < SRR19973063.3405030/150‑1 (MQ=60)
AGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTG > SRR19973063.3526848/1‑150 (MQ=60)
AGAACGCCGTTGAATGGTATGATGCTAATTACTATATCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGTGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGGTACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTG < SRR19973063.5148306/150‑1 (MQ=60)
CCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCC > SRR19973063.2053210/1‑150 (MQ=60)
CGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCG < SRR19973063.2669732/150‑1 (MQ=60)
CGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCG < SRR19973063.395845/150‑1 (MQ=60)
CCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTG > SRR19973063.1543919/1‑150 (MQ=60)
CCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTG > SRR19973063.675502/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTC > SRR19973063.4647327/1‑150 (MQ=60)
TGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGG > SRR19973063.3784761/1‑150 (MQ=60)
GAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGT > SRR19973063.1451968/1‑150 (MQ=60)
GAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGT > SRR19973063.754727/1‑150 (MQ=60)
GGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATT < SRR19973063.2216985/150‑1 (MQ=60)
GCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGGATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCC < SRR19973063.4666998/150‑1 (MQ=60)
GCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCC < SRR19973063.4667008/150‑1 (MQ=60)
ATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGC < SRR19973063.4348883/150‑1 (MQ=60)
TATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGT < SRR19973063.3891470/150‑1 (MQ=60)
CTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTT < SRR19973063.1153127/150‑1 (MQ=60)
TCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTT < SRR19973063.2658413/150‑1 (MQ=60)
TCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTT < SRR19973063.2447412/150‑1 (MQ=60)
TCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTT > SRR19973063.1071350/1‑150 (MQ=60)
CCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTA > SRR19973063.4404647/1‑150 (MQ=60)
CCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGGGAATGGGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTCTTCCAACATGCTGCTGGGTGTTTA > SRR19973063.4404564/1‑150 (MQ=60)
CCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTAT < SRR19973063.4798072/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGC > SRR19973063.3082920/1‑150 (MQ=60)
AAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCT > SRR19973063.3136477/1‑150 (MQ=60)
AAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCT > SRR19973063.1725750/1‑150 (MQ=60)
AATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACT < SRR19973063.1489044/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACT > SRR19973063.2323267/1‑150 (MQ=60)
AATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACT > SRR19973063.1241110/1‑150 (MQ=60)
TCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTT > SRR19973063.843721/1‑150 (MQ=60)
TCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTT < SRR19973063.442328/150‑1 (MQ=60)
TCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTT > SRR19973063.843876/1‑150 (MQ=60)
TCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGAGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTT > SRR19973063.843763/1‑150 (MQ=60)
CCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTA > SRR19973063.667230/1‑150 (MQ=60)
CGCATACCATGAATTGCGATGTGAAACAATGCCCTTTCAGCGGTCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTTAAGTCTGCCCGTGTCGGTTTTTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTAT < SRR19973063.422290/150‑1 (MQ=60)
CGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTAT > SRR19973063.5040432/1‑150 (MQ=60)
GCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATA > SRR19973063.1028090/1‑150 (MQ=60)
GCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATA > SRR19973063.361769/1‑150 (MQ=60)
TACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAG > SRR19973063.4427966/1‑150 (MQ=60)
TACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAG > SRR19973063.4427979/1‑150 (MQ=60)
ACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGC > SRR19973063.2038363/1‑150 (MQ=60)
ACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGC > SRR19973063.144515/1‑150 (MQ=60)
CCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCA > SRR19973063.3047739/1‑150 (MQ=60)
CAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCAT > SRR19973063.4756643/1‑150 (MQ=60)
CAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCAT > SRR19973063.4756513/1‑150 (MQ=60)
CAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCAT < SRR19973063.4711865/150‑1 (MQ=60)
GGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAACGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAA < SRR19973063.1483662/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAG < SRR19973063.138296/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCG < SRR19973063.1220531/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCG < SRR19973063.2090879/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCG > SRR19973063.4323694/1‑150 (MQ=60)
CTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAA > SRR19973063.3868126/1‑150 (MQ=60)
TGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAAC < SRR19973063.543711/150‑1 (MQ=60)
GGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAC > SRR19973063.4349172/1‑150 (MQ=60)
GAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACC < SRR19973063.2032130/150‑1 (MQ=60)
AAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTCGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAACC > SRR19973063.4926750/1‑150 (MQ=60)
AACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGTAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCT < SRR19973063.4658173/150‑1 (MQ=60)
AACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCT < SRR19973063.4658079/150‑1 (MQ=60)
CACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTA > SRR19973063.2499584/1‑150 (MQ=60)
CACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTA < SRR19973063.2136968/150‑1 (MQ=60)
CACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTA > SRR19973063.2499582/1‑150 (MQ=60)
TGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTC < SRR19973063.3955593/150‑1 (MQ=60)
TGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTC < SRR19973063.3955595/150‑1 (MQ=60)
CCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCA > SRR19973063.1473749/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCA > SRR19973063.1473771/1‑150 (MQ=60)
TTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTG < SRR19973063.2783787/150‑1 (MQ=60)
TTCAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTG < SRR19973063.3740211/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGC < SRR19973063.3673864/150‑1 (MQ=60)
CGGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTC < SRR19973063.3892354/150‑1 (MQ=60)
GGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCG > SRR19973063.2187941/1‑150 (MQ=60)
GGGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCG < SRR19973063.1658030/150‑1 (MQ=60)
GGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGT > SRR19973063.2733830/1‑150 (MQ=60)
GGCCATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGT > SRR19973063.3060690/1‑150 (MQ=60)
CATCATGACTGCTAGGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCGGCTGGCTTCGTGGC < SRR19973063.61707/150‑1 (MQ=60)
CATCATGAATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGC < SRR19973063.1004683/150‑1 (MQ=60)
AATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTC < SRR19973063.4072486/150‑1 (MQ=60)
AATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGACTTCCCGTGTCGGTAATTCCAAAATGCAGCTGGGTGTTTATGACTACTTAATAGAGCATAAGAAGCGCAACACCCAAAATACAGCTGGCTTAGAGGCTGTTTTC > SRR19973063.823670/1‑150 (MQ=60)
ATGCTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCA < SRR19973063.3991381/150‑1 (MQ=60)
CTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCAACA > SRR19973063.2399835/1‑150 (MQ=60)
CTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCAACA > SRR19973063.3559461/1‑150 (MQ=60)
CTATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCAACA > SRR19973063.3559842/1‑150 (MQ=60)
|
TGTCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTCCAGCTGGCTTCGTGGCTGTTTTCAACA > CP009273/576851‑577146
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
