Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,818,738 |
C→A |
72.5% |
D153Y (GAC→TAC) |
ves ← |
cold‑ and stress‑inducible protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,818,738 | 0 | C | A | 72.5%
| 315.6
/ 217.6
| 256 | D153Y (GAC→TAC) | ves | cold‑ and stress‑inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/29); new base A (110/76); total (151/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.58e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCAT > CP009273/1818591‑1818885
|
aGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGt < 1:2053304/150‑1 (MQ=255)
aGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGt > 1:2421503/1‑150 (MQ=255)
gCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTggtaggta < 2:4248285/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGgtaggtag > 1:2547218/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCCGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGt > 2:4830248/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGt > 1:1613273/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGt < 1:971591/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGt > 1:2288313/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAAGTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGt > 2:2896929/1‑150 (MQ=255)
gctTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGc > 1:5119224/1‑150 (MQ=255)
tttCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCaa < 1:3540262/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAAtt > 2:2803166/1‑150 (MQ=255)
ccGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAAttt < 1:2325455/150‑1 (MQ=255)
tAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGAGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGTTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTTCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCg > 2:1954757/1‑150 (MQ=255)
cTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGccc < 1:1493834/150‑1 (MQ=255)
aaaTTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTg > 2:4021951/1‑150 (MQ=255)
aaaTTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCACTTTATCGCCCAGTTg > 1:1113348/1‑150 (MQ=255)
aaaTTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTg > 1:2388466/1‑150 (MQ=255)
aaTTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGc > 1:4574496/1‑150 (MQ=255)
aaTTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGc > 1:3677311/1‑150 (MQ=255)
aCTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACg < 1:5110053/150‑1 (MQ=255)
cTGAAATTGATCCGGCGAATGACCAGCTAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGc < 1:41052/150‑1 (MQ=255)
tGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGcc > 1:1031339/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGAGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGcccc > 1:2036849/1‑150 (MQ=255)
aCTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCg > 1:4418336/1‑150 (MQ=255)
cTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGt > 2:173635/1‑150 (MQ=255)
ttGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGtt < 1:5075881/150‑1 (MQ=255)
cGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACcaa > 2:1030467/1‑150 (MQ=255)
gAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAac < 2:1319343/150‑1 (MQ=255)
gAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAac < 2:694947/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAAcaccac > 2:3304507/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAAcaccac > 2:1952387/1‑150 (MQ=255)
cAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCAccc > 1:2895626/1‑150 (MQ=255)
aGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCACTTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCAcccc > 2:2138531/1‑150 (MQ=255)
aGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACACACACCAcccc > 2:3312254/1‑150 (MQ=255)
aGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCAcccc > 1:3892667/1‑150 (MQ=255)
aGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCAcccc < 1:2466046/150‑1 (MQ=255)
cGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCccgc > 1:4983902/1‑150 (MQ=255)
gAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCccgcc > 2:1791860/1‑150 (MQ=255)
gCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCcgccgc < 1:3413205/150‑1 (MQ=255)
tGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGc > 1:1834441/1‑150 (MQ=255)
tGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGc > 2:3418962/1‑150 (MQ=255)
aTTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCa > 2:1422112/1‑150 (MQ=255)
tttCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGGAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCaa < 2:3528215/150‑1 (MQ=255)
ttCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCaaa > 1:1785398/1‑150 (MQ=255)
ttCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCaaa > 2:3801479/1‑150 (MQ=255)
tCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAg < 2:4492349/150‑1 (MQ=255)
cTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGgta > 1:1344067/1‑150 (MQ=255)
tGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGgtag > 2:3094242/1‑150 (MQ=255)
gAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGgtagt < 2:4699508/150‑1 (MQ=255)
gAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGgtagt < 1:4319063/150‑1 (MQ=255)
acaacaGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTaa > 2:3046494/1‑150 (MQ=255)
acaacaGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCTCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTaa < 2:514294/150‑1 (MQ=255)
aacaGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAac > 2:4926210/1‑150 (MQ=255)
aacaGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAac > 2:261105/1‑150 (MQ=255)
aGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAATGGTAGTAAacgta > 2:1965768/1‑150 (MQ=255)
aGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAacgta > 2:725220/1‑150 (MQ=255)
aCCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGTCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTc < 1:4660740/150‑1 (MQ=255)
aCCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTc > 1:4732253/1‑150 (MQ=255)
cTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCgg > 2:80890/1‑150 (MQ=255)
ttGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGc > 1:536910/1‑150 (MQ=255)
gCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCaa > 2:2980546/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAAt > 1:3282595/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAAt > 2:585462/1‑150 (MQ=255)
ttGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCt < 2:3659704/150‑1 (MQ=255)
tGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTg > 1:2187933/1‑150 (MQ=255)
tGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTg > 1:3013322/1‑150 (MQ=255)
gTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGa < 1:1329846/150‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACtt > 1:2826486/1‑150 (MQ=255)
aaaGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACtt < 1:673097/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACttt < 2:4526116/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACttt > 2:3711378/1‑150 (MQ=255)
cGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGcc > 2:2075794/1‑150 (MQ=255)
cGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTGCGcc > 2:1113679/1‑150 (MQ=255)
gtgtGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAg > 2:4930266/1‑150 (MQ=255)
gtgCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGAc < 1:420459/150‑1 (MQ=255)
tctgccATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATc > 2:4572634/2‑150 (MQ=255)
ctgccATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATcc < 2:3485281/150‑1 (MQ=255)
gccATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAg < 2:4574496/150‑1 (MQ=255)
gccATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAg < 1:3304251/150‑1 (MQ=255)
ccATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTAGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAgg < 2:2036849/150‑1 (MQ=255)
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TAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATC > CP009273/1818590‑1818886
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |