Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,751,558 |
G→T |
100% |
T134T (ACC→ACA) |
yfjH ← |
CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,751,558 | 0 | G | T | 97.7%
| 734.9
/ 6.0
| 232 | T134T (ACC→ACA) | yfjH | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/3); new base T (107/119); total (110/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGT > CP009273/2751413‑2751701
|
gATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGt < 1:3189329/148‑1 (MQ=255)
tGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTaa < 2:2303352/148‑1 (MQ=255)
aaaTGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAgg < 1:231074/148‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGt < 2:1966563/148‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGt < 2:191705/148‑1 (MQ=255)
aTGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGtt < 2:1439330/148‑1 (MQ=255)
tGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGttt > 1:128384/1‑148 (MQ=255)
tttAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGaa < 2:2051090/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAAc < 2:2597747/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACtt < 1:410841/148‑1 (MQ=255)
gCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGAt < 2:1091607/148‑1 (MQ=255)
cAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGAtt < 2:1735806/148‑1 (MQ=255)
aaaCGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGAtt < 2:2950378/147‑1 (MQ=255)
aCGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGAtttt < 2:685781/148‑1 (MQ=255)
ttttcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTG‑AAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCa > 2:1367732/1‑148 (MQ=255)
tttcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCa > 2:923296/1‑148 (MQ=255)
tttcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCa > 1:2965037/1‑148 (MQ=255)
tcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGc > 2:494176/1‑148 (MQ=255)
tcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGc < 1:3317506/148‑1 (MQ=255)
tcattttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGc < 1:1573833/148‑1 (MQ=255)
ttttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCAtt < 2:1185524/148‑1 (MQ=255)
tttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTc < 1:507022/148‑1 (MQ=255)
tttcaGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTc < 2:1275242/148‑1 (MQ=255)
aGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGa > 2:2998994/1‑148 (MQ=255)
gACATGATAGATTTTCCCCACAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAg < 1:904058/148‑1 (MQ=255)
aTGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTg > 1:472125/1‑148 (MQ=255)
gATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGa > 1:2269537/1‑148 (MQ=255)
tAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATc > 2:478807/1‑148 (MQ=255)
tAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATc > 2:478915/1‑148 (MQ=255)
tAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATc > 1:3452227/1‑148 (MQ=255)
aGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCa > 2:3458337/1‑148 (MQ=255)
aGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCa > 1:3371902/1‑148 (MQ=255)
gATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCat > 1:2648798/1‑148 (MQ=255)
aTTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCata > 1:2233247/1‑148 (MQ=255)
ttttCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCatat < 1:2391904/148‑1 (MQ=255)
tttCCCCATAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCAtata < 2:3478532/148‑1 (MQ=255)
tttCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCAtata < 1:1867458/148‑1 (MQ=255)
tttCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCAtata < 1:91234/148‑1 (MQ=255)
ccAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCa > 2:1744932/1‑148 (MQ=255)
ccAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCa > 2:1491139/1‑148 (MQ=255)
ccAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCa < 2:2788201/148‑1 (MQ=255)
cAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGA‑TTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAgt < 1:465311/148‑1 (MQ=255)
aGAAAAAAGAGTTTGAGGCGAACATTCGGTTTGCCTTGAAAATTTCTTTAATGGAAATTGGCTCGATAAAAAGTTTTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGTTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAgt < 1:1217287/148‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAgtg > 2:2130664/1‑148 (MQ=255)
aaaaGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAt > 1:3358091/1‑148 (MQ=255)
aaaGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAtt < 1:2409824/148‑1 (MQ=255)
aaaGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTAATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAtt < 1:1006791/148‑1 (MQ=255)
agagATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAttct > 1:984473/1‑148 (MQ=255)
agagATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAttct > 2:2673493/1‑148 (MQ=255)
aTTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCt < 2:2138600/148‑1 (MQ=255)
gAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTa < 2:2295394/148‑1 (MQ=255)
gCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTAtct < 1:1457784/148‑1 (MQ=255)
aaCATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCa > 1:979340/1‑148 (MQ=255)
cATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGt > 2:2937740/1‑148 (MQ=255)
ggTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGccc < 1:3290146/148‑1 (MQ=255)
gtgtGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCa < 2:2851788/148‑1 (MQ=255)
tgtgCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCAt > 1:818204/1‑148 (MQ=255)
gCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCa > 2:3180030/1‑148 (MQ=255)
ccTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCAc > 2:114614/1‑148 (MQ=255)
aaaTGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATg > 2:3019218/1‑148 (MQ=255)
aaaTGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATg < 2:1711309/148‑1 (MQ=255)
aTGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGt > 1:3011061/1‑148 (MQ=255)
tGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTg > 2:2865454/1‑148 (MQ=255)
gTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGc > 2:3031242/1‑148 (MQ=255)
tCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGcc < 1:284209/148‑1 (MQ=255)
aTTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCtt < 1:1894279/148‑1 (MQ=255)
ttAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTg > 1:1299652/1‑148 (MQ=255)
ttAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTg > 1:2127438/1‑148 (MQ=255)
tAATGGAAAATGGATCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTCAGGTTAGACCTAATATTTTTACAGCATACTTGAGCAGGATCATATAATTCAGTGAATTATTCCTGGATCTCCAGTAGCCCCTTCACGGTATGGGGCCTTGt > 2:3281682/1‑148 (MQ=255)
aTGGAAAATGGCTCGATAACACGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGttt < 2:3063755/148‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCa < 2:1897863/148‑1 (MQ=255)
aaaTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAt > 1:297990/1‑148 (MQ=255)
aaaTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAt > 1:682832/1‑148 (MQ=255)
aaaTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAt > 1:298743/1‑148 (MQ=255)
aaTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATg > 2:1215719/1‑148 (MQ=255)
aTGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATgg < 2:1775855/148‑1 (MQ=255)
tGGCTCGATACCAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGt < 2:3279729/148‑1 (MQ=255)
ggCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTa > 2:784837/1‑148 (MQ=255)
cTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACa < 2:2677935/148‑1 (MQ=255)
cTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACa > 1:1189870/1‑148 (MQ=255)
cGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATc > 1:2895788/1‑148 (MQ=255)
aTAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGc > 1:1766573/1‑148 (MQ=255)
aTAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGc > 1:1669931/1‑148 (MQ=255)
tAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCa < 1:2673493/148‑1 (MQ=255)
aCAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAgg > 1:940115/1‑148 (MQ=255)
agagGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCAATGGTACATCGCAGGAat > 2:3297647/1‑148 (MQ=255)
gagGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAata > 2:3172575/1‑148 (MQ=255)
ggTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAAtata < 2:2061466/148‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATaa < 1:2862905/148‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATaa > 2:3499317/1‑148 (MQ=255)
tAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAAc < 1:1165291/148‑1 (MQ=255)
tAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAAc < 2:1392946/148‑1 (MQ=255)
tAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAAc > 2:152064/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAAcc > 1:75320/1‑148 (MQ=255)
aCGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTcac < 1:638633/148‑1 (MQ=255)
aCGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTcac < 1:375517/148‑1 (MQ=255)
tttCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACg > 1:2474572/1‑148 (MQ=255)
tttCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACg > 1:3208778/1‑148 (MQ=255)
tCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAg < 2:2175951/148‑1 (MQ=255)
tCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAg < 1:2430993/148‑1 (MQ=255)
|
GATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGT > CP009273/2751413‑2751701
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTACCT > CP009273/2751410‑2751705
|
CCCGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTG > SRR19973065.1169001/1‑150 (MQ=60)
CGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTA > SRR19973065.690336/1‑150 (MQ=60)
CGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTA > SRR19973065.2398566/1‑150 (MQ=60)
CGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTCGTA < SRR19973065.2178582/150‑1 (MQ=60)
GATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAA < SRR19973065.3208571/150‑1 (MQ=60)
GATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAA < SRR19973065.3208876/150‑1 (MQ=60)
TGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCTAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGG > SRR19973065.3047828/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTT < SRR19973065.232756/150‑1 (MQ=60)
AATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTT > SRR19973065.3082489/1‑150 (MQ=60)
AATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTT > SRR19973065.129490/1‑150 (MQ=60)
ATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTG < SRR19973065.1786125/150‑1 (MQ=60)
TGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGA < SRR19973065.2413948/150‑1 (MQ=60)
AAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAG < SRR19973065.413717/150‑1 (MQ=60)
CGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCC < SRR19973065.481250/150‑1 (MQ=60)
GTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCA > SRR19973065.2952301/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCA > SRR19973065.2983157/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCA > SRR19973065.786898/1‑150 (MQ=60)
TCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCAT < SRR19973065.3337741/150‑1 (MQ=60)
TCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATGGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCAT < SRR19973065.1584311/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATT < SRR19973065.2360133/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTC > SRR19973065.347526/1‑150 (MQ=60)
TTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTT < SRR19973065.510400/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTT < SRR19973065.3322458/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTT < SRR19973065.433073/150‑1 (MQ=60)
GACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCT < SRR19973065.2020290/150‑1 (MQ=60)
GACATGATAGATTTTCCCCACAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCT < SRR19973065.909879/150‑1 (MQ=60)
ACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTG < SRR19973065.2512766/150‑1 (MQ=60)
ACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTG > SRR19973065.475356/1‑150 (MQ=60)
ACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTG > SRR19973065.473143/1‑150 (MQ=60)
ACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTG > SRR19973065.2249486/1‑150 (MQ=60)
CATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGG > SRR19973065.533471/1‑150 (MQ=60)
ATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGA > SRR19973065.2283871/1‑150 (MQ=60)
GATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATC > SRR19973065.3473277/1‑150 (MQ=60)
ATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCA > SRR19973065.1689391/1‑150 (MQ=60)
ATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCA > SRR19973065.3392521/1‑150 (MQ=60)
TAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCAT > SRR19973065.2665128/1‑150 (MQ=60)
AGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATA > SRR19973065.2247456/1‑150 (MQ=60)
GATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATAT > SRR19973065.2812700/1‑150 (MQ=60)
GATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATAT < SRR19973065.3515113/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAA < SRR19973065.2406930/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.1879750/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.1074033/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.92582/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.1536329/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.837660/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAAT < SRR19973065.92100/150‑1 (MQ=60)
CAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGA‑TTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGT < SRR19973065.468517/150‑1 (MQ=60)
AGAAAAAAGAGTTTGAGGCGAACATTCGGTTTGCCTTGAAAATTTCTTTAATGGAAATTGGCTCGATAAAAAGTTTTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGTTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGT < SRR19973065.1225189/150‑1 (MQ=60)
AGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGT < SRR19973065.2287072/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAT > SRR19973065.3378619/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTAT > SRR19973065.3378709/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTC < SRR19973065.3325416/150‑1 (MQ=60)
AAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCT > SRR19973065.990487/1‑150 (MQ=60)
AAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCT > SRR19973065.991016/1‑150 (MQ=60)
AAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCT < SRR19973065.2424997/150‑1 (MQ=60)
AAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCT < SRR19973065.2675763/150‑1 (MQ=60)
AAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTAATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCT < SRR19973065.1013475/150‑1 (MQ=60)
AAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTT > SRR19973065.2868097/1‑150 (MQ=60)
GCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCC < SRR19973065.1467164/150‑1 (MQ=60)
CGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCA > SRR19973065.985837/1‑150 (MQ=60)
ATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGC > SRR19973065.2189906/1‑150 (MQ=60)
GGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCAT > SRR19973065.823583/1‑150 (MQ=60)
GGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCAT < SRR19973065.3310170/150‑1 (MQ=60)
TGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTC < SRR19973065.3366487/150‑1 (MQ=60)
GTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCA > SRR19973065.3468194/1‑150 (MQ=60)
AAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGG > SRR19973065.439118/1‑150 (MQ=60)
AAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGT > SRR19973065.3029501/1‑150 (MQ=60)
ATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGC > SRR19973065.389493/1‑150 (MQ=60)
TCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTT < SRR19973065.286082/150‑1 (MQ=60)
CATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTG > SRR19973065.1308213/1‑150 (MQ=60)
CATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTG > SRR19973065.2141129/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGT < SRR19973065.1906723/150‑1 (MQ=60)
ATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGT < SRR19973065.1906725/150‑1 (MQ=60)
ATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCC > SRR19973065.1191036/1‑150 (MQ=60)
GAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTCTGGTGCGTTGTTTCCCAT > SRR19973065.299913/1‑150 (MQ=60)
GAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAT > SRR19973065.300676/1‑150 (MQ=60)
GAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAT > SRR19973065.687366/1‑150 (MQ=60)
GAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCAT > SRR19973065.687371/1‑150 (MQ=60)
AATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGT > SRR19973065.1303991/1‑150 (MQ=60)
TGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTAC < SRR19973065.1271787/150‑1 (MQ=60)
TGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTAC < SRR19973065.1270897/150‑1 (MQ=60)
TGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTAC < SRR19973065.2425442/150‑1 (MQ=60)
GGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACA > SRR19973065.1198114/1‑150 (MQ=60)
GGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACA < SRR19973065.2883022/150‑1 (MQ=60)
GGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACA > SRR19973065.1197402/1‑150 (MQ=60)
GGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACA > SRR19973065.956898/1‑150 (MQ=60)
CTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATC > SRR19973065.1503828/1‑150 (MQ=60)
CTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATC > SRR19973065.769454/1‑150 (MQ=60)
CTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATC > SRR19973065.2913468/1‑150 (MQ=60)
CGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGC > SRR19973065.1681101/1‑150 (MQ=60)
CGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGC > SRR19973065.1778158/1‑150 (MQ=60)
GATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCA > SRR19973065.2844631/1‑150 (MQ=60)
TAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGG > SRR19973065.946323/1‑150 (MQ=60)
TAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGG > SRR19973065.1635489/1‑150 (MQ=60)
TAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGG < SRR19973065.2690059/150‑1 (MQ=60)
TAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCGTGTTTCCCATGGTACATCGCAGG > SRR19973065.946036/1‑150 (MQ=60)
AGAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATAT < SRR19973065.300536/150‑1 (MQ=60)
GAGGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATA < SRR19973065.3017367/150‑1 (MQ=60)
GGTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAAC < SRR19973065.1376769/150‑1 (MQ=60)
GTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACC > SRR19973065.1864618/1‑150 (MQ=60)
GTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACC > SRR19973065.76087/1‑150 (MQ=60)
GTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACC < SRR19973065.2880479/150‑1 (MQ=60)
GTAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACC > SRR19973065.324441/1‑150 (MQ=60)
TAAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCT < SRR19973065.1172734/150‑1 (MQ=60)
AAAAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTC > SRR19973065.60224/1‑150 (MQ=60)
AAACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCAC < SRR19973065.913175/150‑1 (MQ=60)
ACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACAC < SRR19973065.642814/150‑1 (MQ=60)
ACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACAC < SRR19973065.378137/150‑1 (MQ=60)
ACGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACAC < SRR19973065.2955558/150‑1 (MQ=60)
CGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACG > SRR19973065.2490151/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACG > SRR19973065.3228088/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACG > SRR19973065.2490066/1‑150 (MQ=60)
TTTCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAG > SRR19973065.2169277/1‑150 (MQ=60)
TCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTA < SRR19973065.2446368/150‑1 (MQ=60)
TCCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTA < SRR19973065.2446331/150‑1 (MQ=60)
CCTTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTAC < SRR19973065.2988483/150‑1 (MQ=60)
TTTGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTACCT < SRR19973065.161814/150‑1 (MQ=60)
|
CCCGATGAAATGCTTTAAAGGCAACGTTTTCATTTTCAGACATGATAGATTTTCCCCAGAAAAAAGAGATTGAGGCGAACATAAGGTGTGCCTTGAAAATGTCATTAATGGAAAATGGCTCGATAACAAGAGGTAAAAACGTTTCCTTGGTAAGGTTTGAACTTAGATTTTTCCAGCATTCTTGAGCTGGATCATATAATTCAGTGTATTCTTCCTTTATCTCCAGTTGCCCATTCACTGTATGGTGCCTTGTTTCCCATGGTACATCGCAGGAATATAACCTCACACGAGTACCT > CP009273/2751410‑2751705
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |