Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,632,012 |
C→A |
100% |
intergenic (‑1/+10) |
bamB ← / ← yfgM |
BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,632,012 | 0 | C | A | 99.2%
| 930.6
/ ‑1.7
| 280 | intergenic (‑1/+10) | bamB/yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base A (135/142); total (138/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
CTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGG > CP009273/2631866‑2632157
|
ccACGCCGTGGTCGGAGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACCTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGt < 2:3819544/149‑1 (MQ=255)
cGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTccc > 1:2128538/1‑149 (MQ=255)
ccGTGGTCGGCGTAAACTGTTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCctc < 1:4110498/149‑1 (MQ=255)
cGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCctct < 1:2100635/149‑1 (MQ=255)
tGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 1:3764148/149‑1 (MQ=255)
tGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 2:1792819/149‑1 (MQ=255)
tGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa > 2:2149343/1‑149 (MQ=255)
gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGa < 2:1015347/149‑1 (MQ=255)
tCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAt < 2:2006729/149‑1 (MQ=255)
tAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACaa > 1:562663/1‑149 (MQ=255)
aaCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAat < 2:4042011/149‑1 (MQ=255)
aCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAatt > 1:2083473/1‑149 (MQ=255)
tttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAt < 1:955208/149‑1 (MQ=255)
ttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAtt < 1:4783659/149‑1 (MQ=255)
tCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAttt < 2:272550/149‑1 (MQ=255)
tCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAttt < 2:1217906/149‑1 (MQ=255)
cAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAtttt < 1:1849456/149‑1 (MQ=255)
cAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAtttt < 2:3113552/149‑1 (MQ=255)
aCGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCa < 1:2524980/149‑1 (MQ=255)
aCGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCGCAGATGGACAAATTATTAATTTTCa < 2:1670047/149‑1 (MQ=255)
ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGACAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc > 2:3552406/1‑149 (MQ=255)
ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc < 1:401074/149‑1 (MQ=255)
ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc > 1:3547790/1‑149 (MQ=255)
ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc < 1:3134050/149‑1 (MQ=255)
ggCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGca < 1:2684862/149‑1 (MQ=255)
cAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatc < 1:1106938/149‑1 (MQ=255)
tGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAtt < 1:2989437/149‑1 (MQ=255)
tGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAtt < 1:57390/149‑1 (MQ=255)
ggggACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAttt < 2:786835/149‑1 (MQ=255)
gggACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTc > 2:2885426/1‑149 (MQ=255)
gACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGc < 2:3903303/149‑1 (MQ=255)
cATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTc < 2:4327688/149‑1 (MQ=255)
aTCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCa > 1:4240304/1‑149 (MQ=255)
aTCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCa < 2:538736/149‑1 (MQ=255)
tCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAg < 1:4063288/149‑1 (MQ=255)
cTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGATTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTACCTCTCATATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGt < 2:4203920/149‑1 (MQ=255)
ttACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGc < 1:1739197/149‑1 (MQ=255)
tACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGcc < 1:240179/149‑1 (MQ=255)
tACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGcc < 1:704799/149‑1 (MQ=255)
ccACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCACTTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCgg > 2:1017601/1‑149 (MQ=255)
ccACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCgg > 1:1921789/1‑149 (MQ=255)
cacaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGa < 1:1179160/149‑1 (MQ=255)
cacaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGa < 2:3214675/149‑1 (MQ=255)
acaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAg > 1:1404107/1‑149 (MQ=255)
acaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAg > 1:2388333/1‑149 (MQ=255)
aTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa > 2:3356848/1‑149 (MQ=255)
tcttctTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTaa < 1:4570242/149‑1 (MQ=255)
tcttctTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTaa < 2:160811/149‑1 (MQ=255)
ttcttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACa < 1:3218049/149‑1 (MQ=255)
cttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATc > 1:130763/1‑149 (MQ=255)
cttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATc > 1:2412524/1‑149 (MQ=255)
tcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGc > 1:4309576/1‑149 (MQ=255)
gCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtt < 1:4771106/149‑1 (MQ=255)
gCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtt > 2:2536208/1‑149 (MQ=255)
cTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCttt > 1:3377204/1‑149 (MQ=255)
cTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCttt > 1:3966731/1‑149 (MQ=255)
tAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCAc > 1:2772806/1‑149 (MQ=255)
aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTTCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCAGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc > 2:4069693/1‑149 (MQ=255)
aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc < 2:2090639/149‑1 (MQ=255)
aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc > 2:3033503/1‑149 (MQ=255)
aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc < 2:3742994/149‑1 (MQ=255)
gAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCtt > 1:3093899/1‑149 (MQ=255)
aaCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTACTTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 1:843604/1‑149 (MQ=255)
aaCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCACTTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCAGCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 1:958946/1‑149 (MQ=255)
aaCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc < 1:2567901/149‑1 (MQ=255)
aaCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 1:899464/1‑149 (MQ=255)
aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTcc > 2:624926/1‑149 (MQ=255)
gCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCAt > 2:1542237/1‑149 (MQ=255)
cGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGc > 1:1356409/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg > 1:1003656/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg > 2:603765/1‑149 (MQ=255)
ggTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCa < 1:842832/149‑1 (MQ=255)
ggTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAGTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCa < 2:4005640/149‑1 (MQ=255)
aCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCtt < 1:361079/149‑1 (MQ=255)
aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCtt > 2:2004054/1‑149 (MQ=255)
aGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTAt < 2:882890/149‑1 (MQ=255)
aGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTAt > 2:3292754/1‑149 (MQ=255)
gCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc < 1:2952277/149‑1 (MQ=255)
gCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc > 2:4600440/1‑149 (MQ=255)
gCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc > 2:1368592/1‑149 (MQ=255)
gTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc > 2:525502/1‑149 (MQ=255)
gTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc > 2:1926293/1‑149 (MQ=255)
cTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt < 1:2239135/149‑1 (MQ=255)
cagcagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTc < 2:2460852/149‑1 (MQ=255)
agcagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCa > 2:3674711/1‑149 (MQ=255)
gcagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAg < 1:2748465/149‑1 (MQ=255)
cagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGc > 2:2758744/1‑149 (MQ=255)
agTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCa > 2:1678549/1‑149 (MQ=255)
tAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAAt > 2:3172671/1‑149 (MQ=255)
tAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAAt > 2:1538928/1‑149 (MQ=255)
aTTTACACAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGc < 1:4174945/149‑1 (MQ=255)
aTTGACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGc < 2:1258200/149‑1 (MQ=255)
ttACGCAATGGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCtt < 2:4368131/149‑1 (MQ=255)
cGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcac < 2:2305734/149‑1 (MQ=255)
gCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcacc > 1:812455/1‑149 (MQ=255)
cAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcacca > 2:834/1‑149 (MQ=255)
gCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAg < 1:3797255/149‑1 (MQ=255)
cATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAgg < 1:2782352/149‑1 (MQ=255)
cATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAgg < 1:4410058/149‑1 (MQ=255)
cATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAgg > 2:1052318/1‑149 (MQ=255)
|
CTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGG > CP009273/2631866‑2632157
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > CP009273/2631865‑2632161
|
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGG < SRR19973071.3763537/150‑1 (MQ=60)
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGG < SRR19973071.3763479/150‑1 (MQ=60)
CTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGG > SRR19973071.943968/1‑150 (MQ=60)
TCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGT < SRR19973071.3526820/150‑1 (MQ=60)
CCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTC > SRR19973071.2735987/1‑150 (MQ=60)
CCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTC > SRR19973071.2736004/1‑150 (MQ=60)
ACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCC > SRR19973071.2136400/1‑150 (MQ=60)
CGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCT > SRR19973071.134112/1‑150 (MQ=60)
GCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTC < SRR19973071.204414/150‑1 (MQ=60)
GCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTC > SRR19973071.820203/1‑150 (MQ=60)
CCGTGGTCGGCGTAAACTGTTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCT < SRR19973071.4125120/150‑1 (MQ=60)
CGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTC < SRR19973071.2108381/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAG > SRR19973071.1020749/1‑150 (MQ=60)
TGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAG < SRR19973071.3777526/150‑1 (MQ=60)
GTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAT > SRR19973071.4264098/1‑150 (MQ=60)
GTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAT > SRR19973071.1883822/1‑150 (MQ=60)
TCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATG > SRR19973071.4098682/1‑150 (MQ=60)
GTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAA > SRR19973071.564792/1‑150 (MQ=60)
GTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAA > SRR19973071.564776/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAAT > SRR19973071.488199/1‑150 (MQ=60)
AACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATT > SRR19973071.2091151/1‑150 (MQ=60)
CTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCACTTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTAT > SRR19973071.589597/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTA < SRR19973071.2245640/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAT < SRR19973071.3198884/150‑1 (MQ=60)
TTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATT < SRR19973071.958680/150‑1 (MQ=60)
TTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATT < SRR19973071.1353936/150‑1 (MQ=60)
TTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTT < SRR19973071.4800473/150‑1 (MQ=60)
TTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTT < SRR19973071.4800523/150‑1 (MQ=60)
CAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTC < SRR19973071.2659493/150‑1 (MQ=60)
CAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTC < SRR19973071.1856308/150‑1 (MQ=60)
CAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTC < SRR19973071.4254549/150‑1 (MQ=60)
ACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCAT < SRR19973071.2534185/150‑1 (MQ=60)
ACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCAT < SRR19973071.4106117/150‑1 (MQ=60)
ACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCAT < SRR19973071.2534170/150‑1 (MQ=60)
CGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATC > SRR19973071.3560298/1‑150 (MQ=60)
CGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATC > SRR19973071.3560175/1‑150 (MQ=60)
GGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCT < SRR19973071.2772622/150‑1 (MQ=60)
GGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCT < SRR19973071.402218/150‑1 (MQ=60)
GGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCT < SRR19973071.402318/150‑1 (MQ=60)
GGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCT < SRR19973071.3145050/150‑1 (MQ=60)
GTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTG < SRR19973071.3480712/150‑1 (MQ=60)
TGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCA > SRR19973071.366285/1‑150 (MQ=60)
GGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACCAATTATTAATTTTCATCTGCAT > SRR19973071.2062798/1‑150 (MQ=60)
GGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCAT < SRR19973071.3991243/150‑1 (MQ=60)
GGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCAT < SRR19973071.2694460/150‑1 (MQ=60)
CAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCA < SRR19973071.1110838/150‑1 (MQ=60)
CAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCA > SRR19973071.2468267/1‑150 (MQ=60)
CAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCAGAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCA > SRR19973071.2760021/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATT > SRR19973071.2990550/1‑150 (MQ=60)
TGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTT < SRR19973071.3000131/150‑1 (MQ=60)
TGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTT < SRR19973071.57721/150‑1 (MQ=60)
TGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTT < SRR19973071.57670/150‑1 (MQ=60)
GGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTC > SRR19973071.4392325/1‑150 (MQ=60)
GGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCG < SRR19973071.893401/150‑1 (MQ=60)
CATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCA > SRR19973071.4255368/1‑150 (MQ=60)
TCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGT < SRR19973071.4077660/150‑1 (MQ=60)
CTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTG < SRR19973071.1397136/150‑1 (MQ=60)
TTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCC < SRR19973071.1745685/150‑1 (MQ=60)
TTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCC > SRR19973071.1296517/1‑150 (MQ=60)
TTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCC < SRR19973071.404560/150‑1 (MQ=60)
TTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCC < SRR19973071.404676/150‑1 (MQ=60)
TACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCG < SRR19973071.241098/150‑1 (MQ=60)
TACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCG > SRR19973071.2096786/1‑150 (MQ=60)
TACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCG < SRR19973071.707275/150‑1 (MQ=60)
ACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGG > SRR19973071.1928814/1‑150 (MQ=60)
CACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAG > SRR19973071.1409284/1‑150 (MQ=60)
CACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAG > SRR19973071.2396929/1‑150 (MQ=60)
CACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAG < SRR19973071.1183203/150‑1 (MQ=60)
CACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAG < SRR19973071.1183220/150‑1 (MQ=60)
CATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTA < SRR19973071.2668365/150‑1 (MQ=60)
ATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAA > SRR19973071.1556369/1‑150 (MQ=60)
ATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAA > SRR19973071.3014689/1‑150 (MQ=60)
ATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAA > SRR19973071.4786938/1‑150 (MQ=60)
TCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAAC < SRR19973071.4586528/150‑1 (MQ=60)
CTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACA < SRR19973071.3128694/150‑1 (MQ=60)
TTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACAT < SRR19973071.3229344/150‑1 (MQ=60)
TTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACAT < SRR19973071.3257579/150‑1 (MQ=60)
TCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATC > SRR19973071.2421232/1‑150 (MQ=60)
TCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATC > SRR19973071.131381/1‑150 (MQ=60)
CTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCG < SRR19973071.239960/150‑1 (MQ=60)
TTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGC > SRR19973071.4324817/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTACTTTCCGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.936470/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.3980641/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.4168148/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT < SRR19973071.4787953/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.3389189/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT < SRR19973071.4788291/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.578189/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTT > SRR19973071.3389134/1‑150 (MQ=60)
CTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTT < SRR19973071.848656/150‑1 (MQ=60)
CTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTCCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTT < SRR19973071.1762371/150‑1 (MQ=60)
CTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGGCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTT < SRR19973071.3930171/150‑1 (MQ=60)
TGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGACCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGAGCCGGAGTAACATCGCTTTTC > SRR19973071.2120361/1‑150 (MQ=60)
TTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCAC > SRR19973071.2782569/1‑150 (MQ=60)
GCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCT < SRR19973071.1247418/150‑1 (MQ=60)
CGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTT > SRR19973071.3104820/1‑150 (MQ=60)
CGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTT > SRR19973071.3104810/1‑150 (MQ=60)
GAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTACTTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTC > SRR19973071.846586/1‑150 (MQ=60)
GAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCACTTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCAGCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTC > SRR19973071.962428/1‑150 (MQ=60)
GAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTC > SRR19973071.962423/1‑150 (MQ=60)
GAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTC > SRR19973071.846174/1‑150 (MQ=60)
GAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTC > SRR19973071.902723/1‑150 (MQ=60)
AACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCC < SRR19973071.2577223/150‑1 (MQ=60)
AACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCC > SRR19973071.2840887/1‑150 (MQ=60)
ACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCC > SRR19973071.3797216/1‑150 (MQ=60)
CAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCA < SRR19973071.970719/150‑1 (MQ=60)
CCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGC > SRR19973071.1361406/1‑150 (MQ=60)
CGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCA > SRR19973071.1178096/1‑150 (MQ=60)
AAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACG > SRR19973071.1007305/1‑150 (MQ=60)
GGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCAC > SRR19973071.2379088/1‑150 (MQ=60)
GGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCAC < SRR19973071.845933/150‑1 (MQ=60)
GGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCAC < SRR19973071.845810/150‑1 (MQ=60)
AACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTT < SRR19973071.4516541/150‑1 (MQ=60)
AACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCAGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTT < SRR19973071.4240817/150‑1 (MQ=60)
ACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTG < SRR19973071.362242/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCT < SRR19973071.2888186/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCT < SRR19973071.821826/150‑1 (MQ=60)
AAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTA > SRR19973071.1407105/1‑150 (MQ=60)
AAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTA < SRR19973071.240166/150‑1 (MQ=60)
AAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTA > SRR19973071.2270534/1‑150 (MQ=60)
GCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCA < SRR19973071.2962850/150‑1 (MQ=60)
GCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCAGAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCA < SRR19973071.2963339/150‑1 (MQ=60)
AGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCNNTTGCATAGGGTCCCTCNCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTNACGCCTNCTTCCCNTGNACTACGCGCACCTTGCTTATCACC < SRR19973071.76843/150‑1 (MQ=60)
AGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACC > SRR19973071.38232/1‑150 (MQ=60)
AGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACC < SRR19973071.76828/150‑1 (MQ=60)
AGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACC < SRR19973071.1924807/150‑1 (MQ=60)
GTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCT > SRR19973071.1839449/1‑150 (MQ=60)
CCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTT > SRR19973071.3748607/1‑150 (MQ=60)
CCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCACATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTT < SRR19973071.2232518/150‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTG < SRR19973071.2247394/150‑1 (MQ=60)
TGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGC > SRR19973071.4325630/1‑150 (MQ=60)
TGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGC > SRR19973071.4303584/1‑150 (MQ=60)
TGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGC > SRR19973071.2105806/1‑150 (MQ=60)
AGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAG > SRR19973071.4470631/1‑150 (MQ=60)
GCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGC < SRR19973071.2758192/150‑1 (MQ=60)
GCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGC < SRR19973071.358405/150‑1 (MQ=60)
GCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGC < SRR19973071.3114557/150‑1 (MQ=60)
AGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAA > SRR19973071.492983/1‑150 (MQ=60)
ATTTACACAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCT < SRR19973071.4189807/150‑1 (MQ=60)
ACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCAC < SRR19973071.2545432/150‑1 (MQ=60)
CGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACC > SRR19973071.815212/1‑150 (MQ=60)
GCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGG < SRR19973071.3810750/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973071.2792130/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT > SRR19973071.408009/1‑150 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973071.2791473/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973071.2412567/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973071.4425581/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973071.2412785/150‑1 (MQ=60)
AGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > SRR19973071.4231224/1‑150 (MQ=60)
AGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > SRR19973071.4231178/1‑150 (MQ=60)
|
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > CP009273/2631865‑2632161
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
