Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,632,012 |
C→A |
100% |
intergenic (‑1/+10) |
bamB ← / ← yfgM |
BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,632,012 | 0 | C | A | 95.6%
| 868.7
/ 27.4
| 271 | intergenic (‑1/+10) | bamB/yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/5); new base A (125/134); total (132/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT > CP009273/2631865‑2632158
|
gCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAgg > 1:2548916/1‑150 (MQ=255)
ccACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTc > 1:3440502/1‑150 (MQ=255)
ccGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCAGAGGGTCCctct > 2:3530532/1‑150 (MQ=255)
cGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCtctc < 1:411054/150‑1 (MQ=255)
cGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCtctc < 1:2977281/150‑1 (MQ=255)
cGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCtctc > 2:2175690/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 1:331607/150‑1 (MQ=255)
gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 2:1373613/150‑1 (MQ=255)
gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAt < 2:3203358/150‑1 (MQ=255)
tCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATg < 1:4195476/150‑1 (MQ=255)
cGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATgg > 1:3744514/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATgg > 1:3106709/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATgg < 2:586551/150‑1 (MQ=255)
ggCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGa > 2:3456750/1‑150 (MQ=255)
gCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGAc < 1:2183026/150‑1 (MQ=255)
gCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGAc < 2:1825217/150‑1 (MQ=255)
aaCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAatt > 1:1934766/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAatta > 2:3251034/1‑150 (MQ=255)
cAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTc < 2:314022/150‑1 (MQ=255)
aCGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCAt > 1:1098434/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc < 2:1226038/150‑1 (MQ=255)
gTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGTCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTg > 1:4049004/1‑150 (MQ=255)
gTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTg < 2:1112224/150‑1 (MQ=255)
ttGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGc < 1:2939277/150‑1 (MQ=255)
tGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTCACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGca > 1:955207/1‑150 (MQ=255)
tGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGca < 2:1020592/150‑1 (MQ=255)
ggCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcat < 1:4332541/150‑1 (MQ=255)
ggCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcat < 1:4512018/150‑1 (MQ=255)
gCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatc < 1:2368895/150‑1 (MQ=255)
gCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatc < 2:2345501/150‑1 (MQ=255)
aaTGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatcat > 1:776033/1‑150 (MQ=255)
tGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAttt > 1:3507975/1‑150 (MQ=255)
ggACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGc > 1:2898786/1‑150 (MQ=255)
gACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCt < 1:1178068/150‑1 (MQ=255)
aCATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTc < 1:484585/150‑1 (MQ=255)
cTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTg < 2:2855613/150‑1 (MQ=255)
ttACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGGTCAGTGcc > 2:1995765/1‑150 (MQ=255)
ttACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGcc < 2:1814024/150‑1 (MQ=255)
ttACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGcc > 2:3884185/1‑150 (MQ=255)
tACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCg < 1:2053009/150‑1 (MQ=255)
caTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa < 2:47380/150‑1 (MQ=255)
cttcttCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACa > 1:2462583/1‑150 (MQ=255)
tcttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATc > 1:3940010/1‑150 (MQ=255)
cttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCg < 2:4564260/150‑1 (MQ=255)
cTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtttt > 2:2778662/1‑150 (MQ=255)
tGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTc < 2:1667773/150‑1 (MQ=255)
tGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTc > 2:716556/1‑150 (MQ=255)
ttAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCAc > 1:4485110/1‑150 (MQ=255)
ttAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCAc < 1:1219330/150‑1 (MQ=255)
tAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGTGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATTGACAAATTATTAATTTTCATCTGAATCCTTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACg < 1:463998/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc > 1:4259347/1‑150 (MQ=255)
cAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTg < 1:3804805/150‑1 (MQ=255)
cAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTg < 1:1833787/150‑1 (MQ=255)
cAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTg > 2:4352934/1‑150 (MQ=255)
aGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGc > 2:1383683/1‑150 (MQ=255)
cGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCtt < 1:3164354/150‑1 (MQ=255)
aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc > 1:34770/1‑150 (MQ=255)
aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc > 2:3953459/1‑150 (MQ=255)
cAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCa < 1:1198703/150‑1 (MQ=255)
aGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCAt < 2:3004631/150‑1 (MQ=255)
aGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCAt < 2:2835085/150‑1 (MQ=255)
gCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCAc > 1:3820740/1‑150 (MQ=255)
cTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACt > 2:2670398/1‑150 (MQ=255)
ttAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTa > 2:4517837/1‑150 (MQ=255)
aaaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg < 1:162389/150‑1 (MQ=255)
aaaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg > 1:3647846/1‑150 (MQ=255)
aGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACgcgc > 2:1536550/1‑150 (MQ=255)
ggTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCAc < 1:4407364/150‑1 (MQ=255)
tAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCt < 1:175906/150‑1 (MQ=255)
tAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCt < 2:3614558/150‑1 (MQ=255)
tAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCt > 1:898439/1‑150 (MQ=255)
ggAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCt > 2:2117203/1‑150 (MQ=255)
gAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCtt < 1:2690597/150‑1 (MQ=255)
aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTa > 2:2137723/1‑150 (MQ=255)
aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTa > 2:3708445/1‑150 (MQ=255)
aaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAAATTCATCTGCATCAATTAGCTCAGTGCCCGAGAAAAATCGCTGTTCAAGCCTGCTTCCCATGCACTAAGCTCACCTTGCTTAt > 2:4274360/1‑150 (MQ=255)
aGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc < 2:529429/150‑1 (MQ=255)
gTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCt < 1:1776215/150‑1 (MQ=255)
gTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCt > 2:1315206/1‑150 (MQ=255)
tCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCtt < 2:332697/150‑1 (MQ=255)
ccTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt > 1:1051129/1‑150 (MQ=255)
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TAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTGATCACCTTTGCTCAGCAATG > SRR19973073.3181988/1‑150 (MQ=60)
TTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTC < SRR19973073.986081/150‑1 (MQ=60)
ACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCAC < SRR19973073.3688509/150‑1 (MQ=60)
ACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCAC < SRR19973073.3688435/150‑1 (MQ=60)
CGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACC > SRR19973073.2513682/1‑150 (MQ=60)
CAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCAC > SRR19973073.1846821/1‑150 (MQ=60)
GCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGG < SRR19973073.1583606/150‑1 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT > SRR19973073.1652722/1‑150 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT > SRR19973073.544965/1‑150 (MQ=60)
CATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGT < SRR19973073.885380/150‑1 (MQ=60)
ATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTC < SRR19973073.1747902/150‑1 (MQ=60)
ATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTC < SRR19973073.1747892/150‑1 (MQ=60)
ATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTC < SRR19973073.1576952/150‑1 (MQ=60)
AGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG < SRR19973073.2592984/150‑1 (MQ=60)
AGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG < SRR19973073.2593033/150‑1 (MQ=60)
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GTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > CP009273/2631863‑2632161
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |