Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
486,494 |
C→A |
5.8% |
R53S (CGC→AGC) |
ybaN → |
DUF454 family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 486,494 | 0 | C | A | 5.8%
| 1054.7
/ 26.8
| 274 | R53S (CGC→AGC) | ybaN | DUF454 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (121/137); new base A (8/8); total (129/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTG > CP009273/486345‑486643
|
gAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTAcc < 1:837567/150‑1 (MQ=255)
aaTCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCg > 2:2520951/1‑150 (MQ=255)
cATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTc < 2:1463532/150‑1 (MQ=255)
cATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTc < 1:3523817/150‑1 (MQ=255)
ttttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCAt < 1:467379/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATg > 1:1817753/1‑150 (MQ=255)
tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATg < 1:2488744/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATg > 1:2668354/1‑150 (MQ=255)
ttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATgg > 2:3459780/1‑150 (MQ=255)
aaTCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGtt < 1:1105098/150‑1 (MQ=255)
atcatcATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGttt < 2:4560489/150‑1 (MQ=255)
atcatcATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGttt < 2:161566/150‑1 (MQ=255)
catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTgg > 1:2810354/1‑150 (MQ=255)
atcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGc > 2:720858/1‑150 (MQ=255)
atcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGc > 1:2991063/1‑150 (MQ=255)
atTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGc < 1:2921801/150‑1 (MQ=255)
gtggctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCt < 1:3355896/149‑1 (MQ=255)
tggctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTa > 1:537876/1‑150 (MQ=255)
ctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCt < 1:2026442/150‑1 (MQ=255)
tggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTa > 1:1698407/1‑150 (MQ=255)
gctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACg < 2:2410557/150‑1 (MQ=255)
ggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGTCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTTGTTTCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTTCGttt < 2:117867/150‑1 (MQ=255)
ggTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTg > 1:591176/1‑150 (MQ=255)
ggTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTg < 1:2103280/150‑1 (MQ=255)
tAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGc < 1:2235408/150‑1 (MQ=255)
ggTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcat > 1:3125743/1‑150 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcatca < 1:3415697/150‑1 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcatca > 1:1443599/1‑150 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcatca < 1:1023492/150‑1 (MQ=255)
aCGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcatcat < 1:1034545/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATg > 2:1504289/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATg > 2:2460442/1‑150 (MQ=255)
cGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGcc > 2:3535337/1‑150 (MQ=255)
gTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcg < 2:2235970/150‑1 (MQ=255)
ggtattaccggtattaccGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcg < 2:129729/150‑1 (MQ=255)
tattaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcgcg < 1:3295228/150‑1 (MQ=255)
tattaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcgcg < 1:338582/150‑1 (MQ=255)
ttaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCgcggc > 1:4434759/1‑150 (MQ=255)
taccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCgcggcg > 2:800586/1‑150 (MQ=255)
gttttaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCTGCCTGGTGCTTTGCCAGTTCTTCCCCGCGCTTTCAAGCCTGGTTGCTGTACCGCTCTTGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTTGCAGAAACATCATGCGATGCCGCTCGGCGTCtaa < 2:502207/147‑1 (MQ=255)
accgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACcgcg > 1:1208448/1‑150 (MQ=255)
ccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCgg < 2:3254658/150‑1 (MQ=255)
cgacgaCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCggg < 1:2525109/150‑1 (MQ=255)
cgacgaCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCggg < 1:4590094/150‑1 (MQ=255)
cgacgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGa > 1:3609531/1‑150 (MQ=255)
cgacgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCAGGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGa < 2:3979787/150‑1 (MQ=255)
gacgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAt < 2:3922371/150‑1 (MQ=255)
gacgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAt < 1:2862086/150‑1 (MQ=255)
acgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAtt < 1:3953306/150‑1 (MQ=255)
acgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAtt < 1:1729074/150‑1 (MQ=255)
cgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAttt < 1:2196144/150‑1 (MQ=255)
gCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAtttt < 2:1487798/150‑1 (MQ=255)
gCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAtttt < 1:1186704/150‑1 (MQ=255)
gCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAtttt < 2:1652009/150‑1 (MQ=255)
cGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGc < 2:4507627/150‑1 (MQ=255)
cGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGc > 1:1342312/1‑150 (MQ=255)
gTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCt < 2:1707001/150‑1 (MQ=255)
gTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCt > 1:3569636/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTAttt < 1:1045895/150‑1 (MQ=255)
ccTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTAtttt < 2:3669439/150‑1 (MQ=255)
ctgctgGTGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTg > 1:810997/1‑150 (MQ=255)
gctgGCGGCCTGGTGCTTTGCCCATTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGATGTACCGATCAGGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTTATTATTTTGcg > 1:1645053/1‑149 (MQ=255)
ctgGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTc < 1:3773442/150‑1 (MQ=255)
ggcggcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCAc < 1:680819/150‑1 (MQ=255)
ggcggcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCAc > 1:2284644/1‑150 (MQ=255)
ggcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGtt > 1:1323578/1‑150 (MQ=255)
gcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGttt < 2:2106604/150‑1 (MQ=255)
gcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGttt < 1:2512131/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGc > 1:587132/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGc < 2:1588112/150‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCa < 1:1870550/150‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCa > 1:4331466/1‑150 (MQ=255)
gTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAt > 2:3137781/1‑150 (MQ=255)
tGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAtt > 1:2396708/1‑150 (MQ=255)
gCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAttt < 2:919316/150‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAgtt < 2:2895417/150‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCGGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAttt < 2:4186953/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTGTGCCATTtc > 2:2638848/1‑150 (MQ=255)
tttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct < 1:640479/150‑1 (MQ=255)
tttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct < 1:3140054/150‑1 (MQ=255)
tttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct < 2:4529354/150‑1 (MQ=255)
tttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct < 2:2982044/150‑1 (MQ=255)
tGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTctct < 1:366693/150‑1 (MQ=255)
cGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTgg > 2:603700/1‑150 (MQ=255)
ttcCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGt > 1:2180648/1‑150 (MQ=255)
ttcCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTCTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGt < 2:1908862/150‑1 (MQ=255)
cccGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCa < 2:2991063/150‑1 (MQ=255)
ccGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAg < 2:2887662/150‑1 (MQ=255)
cgcTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATg > 2:4004175/1‑150 (MQ=255)
cgcTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGAAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATg < 1:973866/150‑1 (MQ=255)
gcTTTCACGCCTGGTTGTTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGc > 1:4185403/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTg < 2:2786661/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTgc > 1:2712214/1‑150 (MQ=255)
tGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTgcgc > 1:555475/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGcatc < 2:591148/150‑1 (MQ=255)
gCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGcatcat > 2:2727023/1‑150 (MQ=255)
cTGTACCGCTCCTGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATg < 1:2452554/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTg > 1:3808687/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTg > 1:1235855/1‑150 (MQ=255)
cGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCACGTTGCTg < 2:1408188/150‑1 (MQ=255)
|
GAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTG > CP009273/486345‑486643
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
