Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,727,416 |
C→A |
100% |
L39L (CTG→CTT) |
clpB ← |
protein disaggregation chaperone |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,727,416 | 0 | C | A | 98.1%
| 674.8
/ 3.3
| 210 | L39L (CTG→CTT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (120/86); total (122/88) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGC > CP009273/2727271‑2727560
|
ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag > 1:1383906/1‑148 (MQ=255)
ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag > 2:2689063/1‑148 (MQ=255)
cAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagc < 1:3612103/148‑1 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagca > 1:2586598/1‑148 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagca < 1:3535110/148‑1 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagca > 1:1812993/1‑148 (MQ=255)
gATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagcag < 1:1989935/148‑1 (MQ=255)
tCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAggg > 1:1031210/1‑148 (MQ=255)
tCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAggg > 2:932950/1‑148 (MQ=255)
tCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAggg < 2:1933563/148‑1 (MQ=255)
ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgc > 1:1642217/1‑148 (MQ=255)
ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgc > 1:413028/1‑148 (MQ=255)
cTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGgcg < 2:504280/148‑1 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCa > 1:2791962/1‑148 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCa > 2:833145/1‑148 (MQ=255)
aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAt > 2:3225483/1‑148 (MQ=255)
aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAt < 2:614248/148‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAt > 1:1138098/1‑148 (MQ=255)
cTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTaaa < 2:868846/148‑1 (MQ=255)
gACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGa < 1:1069708/148‑1 (MQ=255)
caccacCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 1:3771808/1‑148 (MQ=255)
caccacCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 2:1855320/1‑148 (MQ=255)
ccaccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGtt < 2:3719345/148‑1 (MQ=255)
ccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGa > 1:2434079/1‑148 (MQ=255)
ccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGa > 1:592750/1‑148 (MQ=255)
caGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGAt < 1:7671/148‑1 (MQ=255)
gTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaa < 1:1756811/148‑1 (MQ=255)
tACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaaa > 1:3270610/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTACATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 2:2120641/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 2:2661735/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 1:3365215/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 2:2832778/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 1:1198841/1‑148 (MQ=255)
cTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTg < 2:576586/148‑1 (MQ=255)
cTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTg > 2:481686/1‑148 (MQ=255)
ttCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTgg < 2:864740/148‑1 (MQ=255)
tCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGt > 2:2915876/1‑148 (MQ=255)
tCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGt > 1:2333701/1‑148 (MQ=255)
tCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACACCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGt < 1:2138395/148‑1 (MQ=255)
cAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGtt < 1:2629655/148‑1 (MQ=255)
aCCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGt < 1:3637470/148‑1 (MQ=255)
cTGCGGTTAACGATTTAATGCCTTATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCTAACCCCCTTCCTGATTAAGCATGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCg < 1:2461823/148‑1 (MQ=255)
tGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGt > 2:757678/1‑148 (MQ=255)
cGGTAAACGATTTTATGCCTGATTGATATCTGTGCTCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCTACCGCCCTTCCATATTAAGCTGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATTAATTGGTTGTCGTGc < 2:2741110/148‑1 (MQ=255)
tAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCg > 2:3215739/1‑148 (MQ=255)
tAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCg > 1:2691664/1‑148 (MQ=255)
aaCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAg < 1:1605630/148‑1 (MQ=255)
aCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGt < 2:3051220/148‑1 (MQ=255)
aCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGt > 1:1653239/1‑148 (MQ=255)
cGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTg < 2:947963/148‑1 (MQ=255)
cGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTg < 2:1780106/148‑1 (MQ=255)
cGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTg < 2:12652/148‑1 (MQ=255)
aTTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATGAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCa > 2:3635092/1‑148 (MQ=255)
tttAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCaa < 2:2271423/148‑1 (MQ=255)
tttAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCaa > 1:719549/1‑148 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGa < 1:2721696/148‑1 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGa > 1:686046/1‑148 (MQ=255)
tGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAt > 1:947400/1‑148 (MQ=255)
tGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAt > 1:1915671/1‑148 (MQ=255)
tGCCTGATTGATATCTGAGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAt < 1:387938/148‑1 (MQ=255)
gCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt > 2:1691685/1‑148 (MQ=255)
ccTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAATGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg > 2:1490217/1‑148 (MQ=255)
cTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg < 1:3787571/148‑1 (MQ=255)
gattgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGc < 2:1642221/148‑1 (MQ=255)
tgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATc > 1:2881397/1‑148 (MQ=255)
tgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATc > 1:3245407/1‑148 (MQ=255)
cTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAag > 2:2583786/1‑148 (MQ=255)
tgtgCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAaga < 1:3471553/148‑1 (MQ=255)
gcAACTGGTCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAg < 2:546491/148‑1 (MQ=255)
ggCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGaa < 1:664397/148‑1 (MQ=255)
ggCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGaa < 1:1110039/148‑1 (MQ=255)
gCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAt < 1:1888548/148‑1 (MQ=255)
aTTTTTGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACAGAAACCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCTCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATATATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATttatta < 1:1459525/148‑1 (MQ=255)
tATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTa < 1:305164/148‑1 (MQ=255)
tATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTa < 2:1195182/148‑1 (MQ=255)
gCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGa < 2:2069005/148‑1 (MQ=255)
gCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGAt < 2:1777588/148‑1 (MQ=255)
gATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCa < 1:2249202/148‑1 (MQ=255)
tGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGa > 1:1973434/1‑148 (MQ=255)
tGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGa < 1:1229130/148‑1 (MQ=255)
gTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGAc > 2:1829904/1‑148 (MQ=255)
ataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCAt > 2:1073543/1‑148 (MQ=255)
taaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATa < 2:1338667/148‑1 (MQ=255)
taaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATa > 2:449573/1‑148 (MQ=255)
aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc > 2:3343976/1‑148 (MQ=255)
ggACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActc > 1:2517071/1‑148 (MQ=255)
tAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACtcctcc < 2:3771808/148‑1 (MQ=255)
aaCCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTccc < 1:1171100/148‑1 (MQ=255)
ccGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCAt > 2:309129/1‑148 (MQ=255)
aaCCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATAGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAAc > 2:3310718/1‑148 (MQ=255)
aCCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACg > 2:3704151/1‑148 (MQ=255)
aCCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACg > 2:2005562/1‑148 (MQ=255)
aCCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACg > 2:742580/1‑148 (MQ=255)
cccccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACgg > 2:3389407/1‑148 (MQ=255)
cccccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACgg < 2:2522184/148‑1 (MQ=255)
ccccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGa > 1:2056613/1‑148 (MQ=255)
cccTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGAt < 2:3586452/148‑1 (MQ=255)
ttCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCaa > 1:3144141/1‑148 (MQ=255)
ttCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCaa > 1:836177/1‑148 (MQ=255)
ccTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAg > 2:1586094/1‑148 (MQ=255)
|
CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGC > CP009273/2727271‑2727560
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTAC > CP009273/2727267‑2727563
|
CGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTA < SRR19973069.3249307/150‑1 (MQ=60)
CGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTA < SRR19973069.3249087/150‑1 (MQ=60)
CACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAG > SRR19973069.1393560/1‑150 (MQ=60)
CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCA > SRR19973069.1825734/1‑150 (MQ=60)
CCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCA > SRR19973069.2603823/1‑150 (MQ=60)
CATATCCTGTGGTGGCTGGACATCAGCACCAGTTCCTTCAACATGCTGTAAACGATTTTATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAAGTGTCCAGCATTTATGCCTGAGTATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.1438641/150‑1 (MQ=60)
CAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.3635764/150‑1 (MQ=60)
CAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.2466933/150‑1 (MQ=60)
CAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.3787577/150‑1 (MQ=60)
CAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.1889929/150‑1 (MQ=60)
CAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAG < SRR19973069.3635691/150‑1 (MQ=60)
AGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGG > SRR19973069.2083348/1‑150 (MQ=60)
AGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGG < SRR19973069.3558020/150‑1 (MQ=60)
GATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGTCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGG > SRR19973069.550324/1‑150 (MQ=60)
GATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGG < SRR19973069.2003806/150‑1 (MQ=60)
GATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGG < SRR19973069.2003312/150‑1 (MQ=60)
GATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGG > SRR19973069.1038349/1‑150 (MQ=60)
ATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGC > SRR19973069.1653508/1‑150 (MQ=60)
ATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGC > SRR19973069.1653512/1‑150 (MQ=60)
ATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGC > SRR19973069.416051/1‑150 (MQ=60)
CTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCT < SRR19973069.1566654/150‑1 (MQ=60)
GTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCA > SRR19973069.2810527/1‑150 (MQ=60)
TGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAT > SRR19973069.1146045/1‑150 (MQ=60)
TGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAT > SRR19973069.1146968/1‑150 (MQ=60)
CTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATG < SRR19973069.314940/150‑1 (MQ=60)
TGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGA > SRR19973069.1492550/1‑150 (MQ=60)
GACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAG < SRR19973069.363682/150‑1 (MQ=60)
GACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAG < SRR19973069.1077166/150‑1 (MQ=60)
GACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAG > SRR19973069.3165374/1‑150 (MQ=60)
ATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGG > SRR19973069.3796306/1‑150 (MQ=60)
ACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTC > SRR19973069.3318589/1‑150 (MQ=60)
ACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTC < SRR19973069.2439244/150‑1 (MQ=60)
CACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGA > SRR19973069.596779/1‑150 (MQ=60)
CACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGA > SRR19973069.2450489/1‑150 (MQ=60)
CAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAA < SRR19973069.7788/150‑1 (MQ=60)
AGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAA > SRR19973069.3292027/1‑150 (MQ=60)
GTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAT < SRR19973069.1769186/150‑1 (MQ=60)
TACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATT > SRR19973069.1207083/1‑150 (MQ=60)
TACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATT > SRR19973069.3387068/1‑150 (MQ=60)
TACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATT > SRR19973069.3387228/1‑150 (MQ=60)
TACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATT > SRR19973069.3387317/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGT > SRR19973069.2349582/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGT > SRR19973069.2349501/1‑150 (MQ=60)
TCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACACCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTG < SRR19973069.2153082/150‑1 (MQ=60)
CAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGT < SRR19973069.395987/150‑1 (MQ=60)
CAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGT < SRR19973069.2647262/150‑1 (MQ=60)
AACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTC > SRR19973069.2544341/1‑150 (MQ=60)
ACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCG < SRR19973069.3661267/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGTTAACGATTTAATGCCTTATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCTAACCCCCTTCCTGATTAAGCATGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTG < SRR19973069.2478355/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTG < SRR19973069.2478421/150‑1 (MQ=60)
GGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCG > SRR19973069.2709832/1‑150 (MQ=60)
GGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCG > SRR19973069.2709701/1‑150 (MQ=60)
AAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGT > SRR19973069.1664673/1‑150 (MQ=60)
AACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTG < SRR19973069.1616434/150‑1 (MQ=60)
AACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTG < SRR19973069.121231/150‑1 (MQ=60)
CGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCA > SRR19973069.1620595/1‑150 (MQ=60)
GATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAA > SRR19973069.724617/1‑150 (MQ=60)
ATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAG > SRR19973069.1082387/1‑150 (MQ=60)
ATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAG > SRR19973069.674607/1‑150 (MQ=60)
TAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGA > SRR19973069.690840/1‑150 (MQ=60)
TAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGA > SRR19973069.690833/1‑150 (MQ=60)
AATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAT > SRR19973069.953780/1‑150 (MQ=60)
AATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAT > SRR19973069.1928872/1‑150 (MQ=60)
AATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAT > SRR19973069.3828259/1‑150 (MQ=60)
ATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATT < SRR19973069.2739930/150‑1 (MQ=60)
TGCCTGATTGATATCTGAGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTG < SRR19973069.390784/150‑1 (MQ=60)
CTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGC < SRR19973069.3812136/150‑1 (MQ=60)
GATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCAT > SRR19973069.1121518/1‑150 (MQ=60)
ATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATC > SRR19973069.2900324/1‑150 (MQ=60)
ATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATC > SRR19973069.1351272/1‑150 (MQ=60)
ATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATC > SRR19973069.3266650/1‑150 (MQ=60)
TGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGG > SRR19973069.647153/1‑150 (MQ=60)
GATAACTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGC > SRR19973069.2355813/1‑150 (MQ=60)
ATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCA > SRR19973069.836188/1‑150 (MQ=60)
TGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGC < SRR19973069.3494003/150‑1 (MQ=60)
TGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGC > SRR19973069.537791/1‑150 (MQ=60)
GCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAG < SRR19973069.1065178/150‑1 (MQ=60)
CAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTG < SRR19973069.1910904/150‑1 (MQ=60)
CAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTG < SRR19973069.3811249/150‑1 (MQ=60)
AACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGG > SRR19973069.3290378/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGG > SRR19973069.1182361/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGG > SRR19973069.1184035/1‑150 (MQ=60)
ACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGA > SRR19973069.2638658/1‑150 (MQ=60)
TGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACGAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAT < SRR19973069.2947525/150‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATT < SRR19973069.1774924/150‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATT < SRR19973069.1117783/150‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATT < SRR19973069.668908/150‑1 (MQ=60)
GCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTT < SRR19973069.1901655/150‑1 (MQ=60)
GCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTT > SRR19973069.3707671/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACAGAAACCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCTCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATATATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGT < SRR19973069.1469708/150‑1 (MQ=60)
TTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAA > SRR19973069.1721118/1‑150 (MQ=60)
TATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAG < SRR19973069.307222/150‑1 (MQ=60)
TATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAG < SRR19973069.1941058/150‑1 (MQ=60)
TGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGAC < SRR19973069.939278/150‑1 (MQ=60)
GCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACG < SRR19973069.731827/150‑1 (MQ=60)
AGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATC > SRR19973069.2807053/1‑150 (MQ=60)
GGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAG > SRR19973069.3552007/1‑150 (MQ=60)
GATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGA > SRR19973069.1987148/1‑150 (MQ=60)
GATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGA < SRR19973069.2264367/150‑1 (MQ=60)
GATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGA < SRR19973069.2264366/150‑1 (MQ=60)
ATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGAC > SRR19973069.2875868/1‑150 (MQ=60)
TGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACG < SRR19973069.1237514/150‑1 (MQ=60)
TAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAC > SRR19973069.265047/1‑150 (MQ=60)
AAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTC > SRR19973069.2533820/1‑150 (MQ=60)
AACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCAT < SRR19973069.1179223/150‑1 (MQ=60)
ACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATA > SRR19973069.2942511/1‑150 (MQ=60)
ACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGA > SRR19973069.2070860/1‑150 (MQ=60)
ACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGA > SRR19973069.2070879/1‑150 (MQ=60)
CCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGAT > SRR19973069.2054288/1‑150 (MQ=60)
CCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATC < SRR19973069.1868267/150‑1 (MQ=60)
CCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATC > SRR19973069.751859/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAA > SRR19973069.3164711/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAA > SRR19973069.842058/1‑150 (MQ=60)
TTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAG < SRR19973069.2655099/150‑1 (MQ=60)
ATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTA < SRR19973069.3121727/150‑1 (MQ=60)
ATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTA > SRR19973069.3501306/1‑150 (MQ=60)
TTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTAC < SRR19973069.2662829/150‑1 (MQ=60)
|
CGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTAC > CP009273/2727267‑2727563
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |