Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,727,416 |
C→A |
100% |
L39L (CTG→CTT) |
clpB ← |
protein disaggregation chaperone |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,727,416 | 0 | C | A | 99.0%
| 969.7
/ ‑0.1
| 303 | L39L (CTG→CTT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base A (172/126); total (175/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
CACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTA > CP009273/2727269‑2727562
|
cACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaag < 2:4119963/150‑1 (MQ=255)
ccAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagca > 1:4726074/1‑150 (MQ=255)
cAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagcag < 1:1080526/150‑1 (MQ=255)
cAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTaagcag < 2:5162339/150‑1 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATACAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAgg > 2:3328345/1‑150 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAgg > 1:769301/1‑150 (MQ=255)
aGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAgg > 1:4594902/1‑150 (MQ=255)
gATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAggg > 2:3509012/1‑150 (MQ=255)
cTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCt > 2:610521/1‑150 (MQ=255)
tgtgATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTc < 2:1230959/150‑1 (MQ=255)
tgtgATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTc > 1:99175/1‑150 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTCATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCAtt > 2:4336290/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTaaa < 1:536829/150‑1 (MQ=255)
tGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGa > 2:5128131/1‑150 (MQ=255)
ggACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGaa > 1:3867927/1‑150 (MQ=255)
cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTg > 1:3714481/1‑150 (MQ=255)
cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTg < 1:3101581/150‑1 (MQ=255)
aTCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 1:2721525/1‑150 (MQ=255)
tCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGt > 2:1796882/1‑150 (MQ=255)
caccacCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGtt > 2:895254/1‑150 (MQ=255)
caccacCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGtt < 2:2268186/150‑1 (MQ=255)
accaccAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTc > 2:3561334/1‑150 (MQ=255)
ccaccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg > 1:5053000/1‑150 (MQ=255)
aGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaaa > 2:3837440/1‑150 (MQ=255)
tACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAAtt > 1:4483446/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTg > 1:4891623/1‑150 (MQ=255)
cTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGt > 1:3267422/1‑150 (MQ=255)
ttCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGtt < 1:885757/150‑1 (MQ=255)
ttCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGtt < 2:2369500/150‑1 (MQ=255)
ttCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGtt < 1:2595066/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGt < 1:4694960/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 1:4074550/1‑150 (MQ=255)
cTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGGTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:4425066/1‑150 (MQ=255)
cGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGccc < 1:101803/150‑1 (MQ=255)
ggTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCg > 1:732758/1‑150 (MQ=255)
gTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGa > 2:3357730/1‑150 (MQ=255)
aaaCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGt > 2:1455762/1‑150 (MQ=255)
aaCGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTg < 2:534745/150‑1 (MQ=255)
cGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCa > 2:2002200/1‑150 (MQ=255)
gATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCaa > 1:2774749/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAg > 2:3041438/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAg > 1:5198696/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAg < 2:4486363/150‑1 (MQ=255)
tttAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGt < 2:4896329/150‑1 (MQ=255)
tAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCACGTGa > 2:474515/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAt > 1:4832280/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt < 1:2018839/150‑1 (MQ=255)
tGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg < 1:1624075/150‑1 (MQ=255)
gCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg > 1:5304432/1‑150 (MQ=255)
gCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg < 2:2467835/150‑1 (MQ=255)
tgattgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCa > 1:4506718/1‑150 (MQ=255)
gattgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCACGTGATTGGGCAt > 2:4567476/1‑150 (MQ=255)
attgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATc > 1:3817717/1‑150 (MQ=255)
tgatATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCgg > 2:4797723/1‑150 (MQ=255)
tatCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCaa > 1:19388/1‑150 (MQ=255)
tatCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCaa > 1:446639/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTgg > 2:3976034/1‑150 (MQ=255)
ggCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAAtt > 1:1429669/1‑150 (MQ=255)
aTTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGt < 1:440408/150‑1 (MQ=255)
aTTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGt < 2:3981258/150‑1 (MQ=255)
tATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCGTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAg < 2:400518/150‑1 (MQ=255)
aTGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGa < 2:3657907/150‑1 (MQ=255)
aGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATc < 1:1415286/150‑1 (MQ=255)
gCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATcc < 2:439844/150‑1 (MQ=255)
gCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATcc > 1:1714060/1‑150 (MQ=255)
gCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATcc < 2:3083819/150‑1 (MQ=255)
ggATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAg > 2:4959495/1‑150 (MQ=255)
ggATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAg > 1:1122189/1‑150 (MQ=255)
aTGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGAc > 2:1949627/1‑150 (MQ=255)
taataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCAt > 1:4167640/1‑150 (MQ=255)
aataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATa < 2:2891654/150‑1 (MQ=255)
aataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATa > 2:1777923/1‑150 (MQ=255)
aataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATa < 2:1385492/150‑1 (MQ=255)
ataaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATaa > 2:3404866/1‑150 (MQ=255)
taaAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAc < 1:2520668/150‑1 (MQ=255)
aaaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAct < 2:824852/150‑1 (MQ=255)
aaGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActc > 2:3679713/1‑150 (MQ=255)
aGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActcc < 2:1746483/150‑1 (MQ=255)
aGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAActcc < 1:1371997/150‑1 (MQ=255)
tAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCa < 2:28308/150‑1 (MQ=255)
tAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCa > 2:5069086/1‑150 (MQ=255)
tAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCa < 1:1811076/150‑1 (MQ=255)
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GATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCAT > SRR19973062.4712016/1‑150 (MQ=60)
ATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATC < SRR19973062.2280678/150‑1 (MQ=60)
ATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATC > SRR19973062.3837241/1‑150 (MQ=60)
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TGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGTTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGG > SRR19973062.3505945/1‑150 (MQ=60)
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ATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAG > SRR19973062.4188866/1‑150 (MQ=60)
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GCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCT < SRR19973062.1409169/150‑1 (MQ=60)
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AGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATT > SRR19973062.3096073/1‑150 (MQ=60)
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GCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACG > SRR19973062.2024394/1‑150 (MQ=60)
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TAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAC < SRR19973062.2535072/150‑1 (MQ=60)
TAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAC > SRR19973062.881255/1‑150 (MQ=60)
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AAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTC > SRR19973062.2074187/1‑150 (MQ=60)
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TAACCGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCA > SRR19973062.2797100/1‑150 (MQ=60)
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CGAACCCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAAC < SRR19973062.362131/150‑1 (MQ=60)
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CCCCTTCCTGATTAAGCAGGGCGCTCTTTATATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATC < SRR19973062.4617788/150‑1 (MQ=60)
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TCCTGATTAAGCAGGGCGCTAATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGT < SRR19973062.1865968/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTT < SRR19973062.868264/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTT < SRR19973062.868310/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTT < SRR19973062.4496350/150‑1 (MQ=60)
CTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTG > SRR19973062.2893815/1‑150 (MQ=60)
CTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTG > SRR19973062.5282994/1‑150 (MQ=60)
CTGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCAACGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTG > SRR19973062.5282645/1‑150 (MQ=60)
TGATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGC < SRR19973062.1908057/150‑1 (MQ=60)
TGATGAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGC < SRR19973062.2026061/150‑1 (MQ=60)
GATTAAGCTGGGCGCTCATTATATGAAGTGGTTCGTTATATTGGTTGTCGTGCCAGAGTGCTAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCTAGCTGGATTTTATTAGTAAGACGATCCAGTCGCATAACTCCTCCCCTAACGGATCAAAGTTGCT < SRR19973062.3522625/150‑1 (MQ=60)
GATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCT < SRR19973062.2263195/150‑1 (MQ=60)
ATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTA < SRR19973062.3077281/150‑1 (MQ=60)
ATTAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTA < SRR19973062.3945603/150‑1 (MQ=60)
TAAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACT < SRR19973062.4358612/150‑1 (MQ=60)
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GCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACT > CP009273/2727268‑2727564
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
