Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,658,679 |
G→T |
47.8% |
intergenic (+76/‑115) |
yfhR → / → csiE |
putative S9 family prolyl oligopeptidase/stationary phase inducible protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,658,679 | 0 | G | T | 47.8%
| 169.9
/ inf
| 284 | intergenic (+76/‑115) | yfhR/csiE | putative S9 family prolyl oligopeptidase/stationary phase inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/69); new base T (63/72); total (142/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CGATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTC > CP009273/2658531‑2658828
|
cGATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGa < 1:3194926/150‑1 (MQ=255)
gATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACCGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAatat > 2:1845443/1‑150 (MQ=255)
gATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAatat > 2:342942/1‑150 (MQ=255)
gATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAatat > 2:1853890/1‑150 (MQ=255)
gTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATgaga > 2:416371/1‑150 (MQ=255)
gTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATgaga > 2:517488/1‑150 (MQ=255)
cGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTc > 1:691962/1‑150 (MQ=255)
gATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCt < 2:1454276/150‑1 (MQ=255)
gATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCt < 1:714166/150‑1 (MQ=255)
gATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCt < 1:2469207/150‑1 (MQ=255)
tGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCtgt > 1:1955298/1‑150 (MQ=255)
ttATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGAc < 1:1629292/150‑1 (MQ=255)
ttATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGAc < 1:1945213/150‑1 (MQ=255)
aTCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGc > 2:1544585/1‑150 (MQ=255)
gcgAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTg > 2:3945919/1‑150 (MQ=255)
aaCAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCa > 1:307735/1‑150 (MQ=255)
aaCAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCa > 1:3286365/1‑150 (MQ=255)
aaCAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCa > 1:454230/1‑150 (MQ=255)
gATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACAt > 2:2384037/1‑150 (MQ=255)
ggtggACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTc < 2:3490861/150‑1 (MQ=255)
gtggACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCt > 1:1378353/1‑150 (MQ=255)
gtggACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCt > 1:1692748/1‑150 (MQ=255)
ggACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCtga > 1:3959287/1‑150 (MQ=255)
ccTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCa > 1:1776756/1‑150 (MQ=255)
tAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTc > 1:3635813/1‑150 (MQ=255)
aGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTcc < 2:2278579/150‑1 (MQ=255)
aGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTcc > 1:3894955/1‑150 (MQ=255)
gcgcGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTccc < 1:914720/150‑1 (MQ=255)
gcgTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGAGAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCtt < 2:1671218/150‑1 (MQ=255)
cgTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTc > 1:1861751/1‑150 (MQ=255)
gTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCg > 2:3088379/1‑150 (MQ=255)
tGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGcc > 2:3548359/1‑150 (MQ=255)
gAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCa < 2:2177425/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCAt > 2:4083663/1‑150 (MQ=255)
aGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTg < 2:1878668/150‑1 (MQ=255)
aGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTg > 2:1206021/1‑150 (MQ=255)
aaCTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAg > 1:1682836/1‑150 (MQ=255)
aaCTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAg < 2:665158/150‑1 (MQ=255)
aCTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGc < 2:181972/150‑1 (MQ=255)
aCTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATACACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAAATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGc < 2:2656684/150‑1 (MQ=255)
tAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCaa < 1:2261540/150‑1 (MQ=255)
tAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCAGTTCCTTGAGCaa > 1:2245984/1‑150 (MQ=255)
aCCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAAc < 2:1357953/150‑1 (MQ=255)
aCCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAAc < 2:1934715/150‑1 (MQ=255)
ccttGATAGCTAGCAAGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGTACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACtt < 1:2568318/147‑1 (MQ=255)
cATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACttt < 1:377414/150‑1 (MQ=255)
aTGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTa < 1:1580829/150‑1 (MQ=255)
tGATCGCTAGAACGATAATCATTCACTAAACCATCTTTAGACATGCTAATCCACTGGTCATTACAGTTTAATATGAGAAAAATTATGTGACGATTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTAATTGAGAAAACTTTAg < 2:295819/150‑1 (MQ=255)
gCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTAtt < 1:4113692/150‑1 (MQ=255)
gCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTAtt < 2:3604459/150‑1 (MQ=255)
gCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTAtt < 2:1229719/150‑1 (MQ=255)
tAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCt > 1:1992776/1‑150 (MQ=255)
cACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTAt < 1:2148535/150‑1 (MQ=255)
cACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTAt > 1:2223352/1‑150 (MQ=255)
cGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCa > 1:1262805/1‑150 (MQ=255)
aTAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAAt < 1:1339360/150‑1 (MQ=255)
aTAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAAt > 2:3327685/1‑150 (MQ=255)
tAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAAtt > 2:808296/1‑150 (MQ=255)
tAATCATTCAAAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAAtt > 1:3761095/1‑150 (MQ=255)
aTCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTAt < 1:2794017/150‑1 (MQ=255)
tCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATg > 1:2058256/1‑150 (MQ=255)
tCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATg < 1:550794/150‑1 (MQ=255)
cATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGc > 2:1033431/1‑150 (MQ=255)
aTTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCt < 1:2454290/150‑1 (MQ=255)
aTTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCt < 1:354294/150‑1 (MQ=255)
ttCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCtt < 2:911295/150‑1 (MQ=255)
ttCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCtt < 2:3765519/150‑1 (MQ=255)
caAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATgg > 2:3029969/1‑150 (MQ=255)
aaaaCCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATggg < 1:641284/150‑1 (MQ=255)
aaaaCCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATggg > 1:2128329/1‑150 (MQ=255)
aaaCCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGga < 2:2011998/150‑1 (MQ=255)
aaaCCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGga > 2:3257588/1‑150 (MQ=255)
accaccTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGgaga < 1:2856200/150‑1 (MQ=255)
accaccTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGgaga > 1:3376116/1‑150 (MQ=255)
ccaccTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGAt > 1:2217770/1‑150 (MQ=255)
ccTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTa > 1:33025/1‑150 (MQ=255)
ttAAGACCTGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACa < 2:776187/150‑1 (MQ=255)
ttAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACa > 1:1042660/1‑150 (MQ=255)
tAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAg < 1:1197869/150‑1 (MQ=255)
aaGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAga < 1:2509691/150‑1 (MQ=255)
gACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAgatg > 2:1625594/1‑150 (MQ=255)
aCATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAgatga < 2:2697057/150‑1 (MQ=255)
tGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGc < 2:75735/150‑1 (MQ=255)
cTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCt > 1:2724782/1‑150 (MQ=255)
tAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTa > 1:236746/1‑150 (MQ=255)
aTCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACg < 2:3516288/150‑1 (MQ=255)
aTCCACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACg > 2:2793584/1‑150 (MQ=255)
ccACTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCt > 2:3923014/1‑150 (MQ=255)
cACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCtt > 1:372799/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTg < 1:2653080/150‑1 (MQ=255)
tGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCt > 1:2961028/1‑150 (MQ=255)
tGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCt > 2:3263391/1‑150 (MQ=255)
tGGTCAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCt > 1:1068282/1‑150 (MQ=255)
gTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTcc > 1:1202099/1‑150 (MQ=255)
cAGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACGTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTccac > 2:19129/1‑150 (MQ=255)
aGAACAGTTTAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTccacc < 1:983903/150‑1 (MQ=255)
tttAATATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTc < 2:2913376/150‑1 (MQ=255)
ttAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTcc < 2:2588862/150‑1 (MQ=255)
gATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTc < 2:2212138/150‑1 (MQ=255)
gATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTc < 1:3433/150‑1 (MQ=255)
|
CGATCGTCACGGCGATGTTTATCGCGAACAGATGGTGGACTTTATCCTTAGCGCGTTGAATCCGCAGAACTAACCCATGATCGCTAGCACGATAATCATTCACAAAACCACCTTAAGACATGCTAATCCACTGGTCAGAACAGTTTAAGATGAGAAAAATTCTGTGACGCTTGCCAACATTTCTGATGATTAGCATTCCCTTCGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTC > CP009273/2658531‑2658828
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
