Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F98 I0 R1
|
799 |
294.1 |
9752082 |
92.2% |
8991419 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,063,530 |
A→C |
31.5% |
C78G (TGT→GGT) |
yihR ← |
mutarotase superfamily protein, YihR family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,063,530 | 0 | A | C | 31.5%
| 384.4
/ inf
| 311 | C78G (TGT→GGT) | yihR | mutarotase superfamily protein, YihR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (118/95); new base C (39/59); total (157/154) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.44e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
ACTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGAT > CP009273/4063381‑4063679
|
aCTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACa < 2:2887276/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAg > 1:1240423/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGc > 1:2793560/1‑150 (MQ=255)
ggcggcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCg > 2:4575115/1‑150 (MQ=255)
gcggcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGt > 1:2309612/1‑150 (MQ=255)
cggcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGtt < 1:1937597/150‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGAt < 2:1493763/150‑1 (MQ=255)
aaaGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATc > 1:1295315/1‑150 (MQ=255)
aaaGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATc > 1:2163734/1‑150 (MQ=255)
aaaGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATc > 1:134050/1‑150 (MQ=255)
gCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCgg > 1:4515647/1‑150 (MQ=255)
tGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGtt > 2:1601669/1‑150 (MQ=255)
gTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATTTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTc < 1:4198876/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTc < 2:3421503/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTc < 1:2203675/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTc < 2:2638558/150‑1 (MQ=255)
aGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGc < 2:2793560/150‑1 (MQ=255)
gggTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGcc < 1:3569158/150‑1 (MQ=255)
ggTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCa < 2:4663381/150‑1 (MQ=255)
ggTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCa > 1:366592/1‑150 (MQ=255)
ggTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGGTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCa < 2:1010705/150‑1 (MQ=255)
gTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCAc > 1:4268107/1‑150 (MQ=255)
tAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACg < 1:1537169/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCNGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACgg > 1:4469776/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACgg < 1:2396510/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGaa > 2:3245971/1‑150 (MQ=255)
tggtggCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATaa < 2:23689/150‑1 (MQ=255)
ggtggCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAg < 1:3399993/150‑1 (MQ=255)
ggtggCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAg < 1:3543456/150‑1 (MQ=255)
gtggCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGc > 2:2497789/1‑150 (MQ=255)
ggCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCAc > 2:2882031/1‑150 (MQ=255)
ggTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACttt > 1:480467/1‑150 (MQ=255)
cACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGAt > 1:3283476/1‑150 (MQ=255)
aCTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATg > 1:4086323/1‑150 (MQ=255)
aCTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATg > 1:885899/1‑150 (MQ=255)
cTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATgc < 1:333430/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATgcgc > 1:2022909/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGc > 2:1725942/1‑150 (MQ=255)
gCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGACCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCg > 1:3995253/1‑150 (MQ=255)
aGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCa > 1:2747747/1‑150 (MQ=255)
aGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCa > 1:927069/1‑150 (MQ=255)
aGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCa > 1:921066/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATctct < 1:750714/150‑1 (MQ=255)
gCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCAGTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGAGCCAGCGGCATCTCtt > 2:4722457/1‑150 (MQ=255)
aGGCAAGCAGCGCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATTGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCgg < 1:242124/150‑1 (MQ=255)
aGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCgg > 2:754534/1‑150 (MQ=255)
aGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCgg > 1:1179111/1‑150 (MQ=255)
ggCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCggg > 1:575984/1‑150 (MQ=255)
aaGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGttt < 1:1653377/150‑1 (MQ=255)
agcagcCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTtg < 2:3320927/150‑1 (MQ=255)
cagcCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTtgtg < 1:4653803/150‑1 (MQ=255)
cccGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCgg < 1:2901658/150‑1 (MQ=255)
ccGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCggg < 1:1769079/150‑1 (MQ=255)
cGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGATCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGa > 2:2419767/1‑150 (MQ=255)
gTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGAt < 1:2496973/150‑1 (MQ=255)
tGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATg < 2:3739904/150‑1 (MQ=255)
gAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGa > 2:1156371/1‑150 (MQ=255)
aaTAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGAc < 1:1012114/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGCTTTTGAACTATGGTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTGTGTGCGGGATGACTa > 2:3009437/1‑150 (MQ=255)
cGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAAt > 2:3134747/1‑150 (MQ=255)
cGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAAt < 1:3841500/150‑1 (MQ=255)
cTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGAc < 2:247346/150‑1 (MQ=255)
tGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAAcc < 1:4116077/150‑1 (MQ=255)
tGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAAcc < 1:687619/150‑1 (MQ=255)
tGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAAcc > 1:53603/1‑150 (MQ=255)
aaCTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCt < 1:4768732/150‑1 (MQ=255)
tATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGaa < 2:2560587/150‑1 (MQ=255)
aTGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGaaa > 1:3971792/1‑150 (MQ=255)
aTGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTGCCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGaaa < 2:4303274/150‑1 (MQ=255)
tGTTCATTAATGGGTAACTGATAGTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAg < 1:4699384/150‑1 (MQ=255)
gTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAgg < 2:4112123/150‑1 (MQ=255)
ttCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGt > 1:3193362/1‑150 (MQ=255)
tCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGACTAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGtt > 2:2027384/1‑150 (MQ=255)
aTTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTaa < 2:3612243/150‑1 (MQ=255)
ttAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAAt < 2:350205/150‑1 (MQ=255)
aaTGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTc < 2:1433925/150‑1 (MQ=255)
tGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAg < 2:2215665/150‑1 (MQ=255)
tAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAg < 2:4802369/150‑1 (MQ=255)
aaCTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGa > 1:956024/1‑150 (MQ=255)
aCTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGAc > 1:2412319/1‑150 (MQ=255)
cTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGAcc < 2:551310/150‑1 (MQ=255)
tGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCa < 1:1512621/150‑1 (MQ=255)
tGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCa > 1:872324/1‑150 (MQ=255)
tatTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCa < 2:4341617/150‑1 (MQ=255)
tatTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCa > 1:3217270/1‑150 (MQ=255)
ttCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCAcc < 2:393568/150‑1 (MQ=255)
ttCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCAcc > 1:4869314/1‑150 (MQ=255)
ttCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCAcc < 2:1618330/150‑1 (MQ=255)
tCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCg > 2:2763066/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCg < 2:4636482/150‑1 (MQ=255)
ccTGATAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTca > 2:134213/1‑150 (MQ=255)
aTAGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAAt < 2:1288407/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATg > 1:2725739/1‑150 (MQ=255)
aGCGGTAACCGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATg > 1:4586727/1‑149 (MQ=255)
aGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATgg > 2:4525919/1‑150 (MQ=255)
aGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATgg > 1:1613301/1‑150 (MQ=255)
cGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTc < 1:3790340/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGt < 1:2559629/150‑1 (MQ=255)
aGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGAt > 2:3891110/1‑150 (MQ=255)
aGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGAt < 2:3708037/150‑1 (MQ=255)
|
ACTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGAT > CP009273/4063381‑4063679
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
